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目的获得三叉苦Melicope pteleifolia转录组信息特征。方法以三叉苦幼苗根、茎、叶混合样品为对象,采用二代高通量测序平台Illumina HiSeq~(TM) 2000进行转录组测序并进行系统的生物信息学分析。结果转录组测序分析共获得47 045 040条高质量序列(clean reads),Trinity de novo组装获得67 956条unigenes,平均长度787 nt。BLAST分析显示分别有42 749(61.92%)、31 152(45.84%)、26 563(39.0 9%)、17 481(25.72%)条unigenes在NR、Swiss-port、KOG、KEGG数据库得到注释信息,参与生物过程、细胞组分和分子功能3个GO类别的47个小组,共9807条unigenes注释到130个KEGG代谢通路中,筛选到19条次生代谢通路,KOG功能分类分析获得25个不同的KOG功能类群。预测共有高等植物转录因子56个家族;借助MISA软件发现7 748个SSRs,三碱基重复SSRs数量最丰富,有4 117个,出现频率为53.1%,五碱基重复SSRs相对较少,占2.2%。结论利用高通量测序技术和生物信息分析获得三叉苦转录组信息特征,为后续三叉苦功能基因的挖掘、次生代谢途径解析及其调控机制研究奠定基础。 相似文献
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目的:建立首乌藤配方颗粒的HPLC指纹图谱,并对其主要的共有峰进行成分归属,为其质量控制提供科学依据。方法:采用HPLC方法,测定了不同厂家的15批首乌藤配方颗粒的HPLC指纹图谱,色谱条件:Waters XBridge~(TM)shield RP18 C_(18)色谱柱,流动相乙腈-0.1%乙酸水溶液,流速1.0 m L·min~(-1),柱温30℃,检测波长271 nm,进样量15μL。结果:建立了首乌藤配方颗粒的指纹图谱,采用"中药色谱指纹图谱相似度评价系统"计算处理,通过HPLC指纹图谱分析,确定了首乌藤配方颗粒8个共有峰,并确认6个特征峰,分别为没食子酸,原儿茶酸,儿茶素,2,3,5,4'-四羟基二苯乙烯-2-O-β-D-葡萄糖苷,大黄素,大黄素甲醚。对照指纹图谱色谱峰丰富,分离度高,匹配确定了主要特征峰,15批首乌藤配方颗粒样品指纹图谱与对照指纹图谱相似度均0.86,相似度高,可实现首乌藤配方颗粒化学成分全面和整体的评价,能较好控制首乌藤配方颗粒的质量。结论:该方法简单、准确、重复性好,可以为首乌藤配方颗粒质量控制和评价提供参考。 相似文献
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初步研究并对比红景天破壁饮片﹑常规饮片和传统粉末对正常小鼠肠道菌群的影响。分别给药灌胃小鼠14 d后取小鼠粪便进行传统细菌培养和PCR-DGGE(聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳)分析。细菌培养结果表明1/8剂量破壁饮片组的肠球菌和大肠杆菌的数量比常规饮片组和传统粉末组少,而乳酸杆菌和双歧杆菌显著增加(P<0.05)。PCR-DGGE结果表明,1/8剂量破壁饮片组肠道菌群的多样性系数(H)和物种丰度(S)高于其他各组,物种丰度(S)与正常组对比具有极显著意义(P<0.01),与常规饮片组和传统粉末组相比具有显著性意义(P<0.05),组内相似度也较高。长期服用1/8剂量破壁饮片会有一定的调节肠道的作用,且很可能是通过促进乳酸杆菌和双歧杆菌等益生菌的生长来进行调节,所形成的肠道菌群群落也会更稳定。 相似文献
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【目的】研究以白木香[Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg]根为外植体的愈伤组织诱导条件。【方法】选择白木香2种来源的根,考察不同灭菌条件、不同激素浓度组合对愈伤组织诱导的影响。【结果】实生苗根以0.01 mg/mL的HgCl2溶液灭菌3 min最佳,适合诱导愈伤组织的培养基为MS+0.1 mg/L 2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D)+0.1 mg/L 6-苄氨基嘌呤(6-BA);无菌苗根在添加1.0 mg/L萘乙酸(NAA)和0.8 mg/L 6-BA的MS培养基上可达到最高的愈伤组织诱导率。【结论】获得了2种来源白木香根的愈伤组织;单独使用生长素2,4-D时诱导率较低,添加6-BA后可显著提高愈伤组织的诱导率和生长势。 相似文献
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阳春砂不同栽培品种种子的比较研究 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]全面认识阳春砂的种子特性,从种子上寻找阳春砂不同栽培品种的差异.[方法]以阳春砂2个主流栽培品种长果、圆果以及选育申品种春选的种子为材料,对种子进行形态、气味和色泽等常规检查,测定千粒质量、含水量、成熟度、饱满度、生活力等参数,进行种子发芽试验,统计不同品种种子的发芽情况.[结果]长果和圆果种子差异较小,而春选... 相似文献
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基于多维数据分析的中成药信息管理系统药品分类方法 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]运用多维数据分析法对新分类法下的中成药临床应用进行分析,观察中成药信息管理系统中的药品分类方式在规范临床应用和科学管理方面的作用.[方法]应用OLAP(联机分析处理)技术对中成药信息管理进行多维数据分析,从数据库中抽取新分类法下的中成药数据并建立多维数据集,多角度、多层次地考察数据对象,并分析其在临床用药过程中... 相似文献
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通过文献研究和市场调查,阐明中药配方颗粒国内外市场获得了较好发展,产业的规模和效益都在提高,产品逐步得到医生和患者接受,在医院诊疗中占据了越来越重要的地位.与国外市场相比,国内市场的发展相对缓慢,原因主要包括对中药配方颗粒与饮片是否等效的质疑和价格比较高等问题,进而提出加强临床应用研究以检验其疗效、加快推行电子调配方式... 相似文献
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目的考察鸡血藤断面树脂环纹数与其药材品质之间的相关性。方法醇溶性浸出物含量按照《中国药
典:一部》(2015 年版)附录XA 法测定;采用高效液相色谱法测定原儿茶酸、儿茶素、表儿茶素、芒柄花素及
染料木素的含量及建立高效液相色谱(HPLC)指纹图谱,用SPSS 对其环纹数与醇溶性浸出物及5 个化学成分进
行相关性分析。结果醇溶性浸出物的含量在3 环左右时达到一个峰值,后随着环纹数的增加,变化趋势有所
不同。不同树脂环纹数药材中原儿茶酸、儿茶素及表儿茶素的含量差异较大,而芒柄花素与染料木素的含量差
异较小,其中儿茶素与表儿茶素、芒柄花素与染料木素在不同树脂环纹药材中的动态变化趋势较为一致;除
1 环样品外,同一植株不同环纹数的药材样品具有较高的相似度;环纹数与醇溶性浸出物及5 个化学成分之
间无显著相关性。结论各指标性成分的含量与树脂环纹数之间没有一定的相关性,鸡血藤横切面的树脂环
纹数的多少不可以作为评判药材质量优劣的直观依据,但以3 环以上入药为宜。 相似文献
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目的研究三桠苦Melicope ptelefolia茎枝的化学成分。方法采用硅胶柱色谱法、凝胶Sephadex LH-20柱色谱、重结晶等技术进行分离纯化,通过NMR、ESI-MS等现代谱学方法鉴定化合物结构。结果从三桠苦茎枝石油醚部位和醋酸乙酯部位分离得到11个化合物,分别鉴定为大黄素甲醚(1)、豆甾-3,5-二烯-7-酮(2)、β-谷甾酮(3)、(24R)-乙基-3β,5α,6β-三羟基胆甾烷(4)、dihydroxanthyletin(5)、正二十烷酸甲酯(6)、大黄素(7)、(+)-marmesin(8)、rudicoumarin C(9)、3-(2′,3′-二羟基)异戊基-7-羟基香豆素(10)、4-甲基喹啉酮(11)。结论化合物1~11均为三桠苦植物中首次分离得到,其中化合物10为新化合物,命名为三桠苦素D。 相似文献
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适合中药材DNA条形码分析的DNA提取方法的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 建立适合中药材DNA条形码分析的DNA提取方法.方法 以6种富含次生代谢物质的药用顽拗植物为材料,对7种DNA提取方法进行比较.结果 CTAB法3对中药材具有通用性,操作简便、快速,提取的DNA浓度和合格率比其他对照方法高,能满足DNA条形码PCR扩增的要求.该方法主要特点:(1)用3%的CTAB浓度代替常用的2%CTAB;(2)采用1%的PVP与0.2%β-巯基乙醇共同去除杂质和防止DNA降解;(3)采用10000 r/min离心15 min去除蛋白质等杂质.结论 CTAB法3是适合中药材DNA条形码研究的DNA提取方法. 相似文献