糖尿病肛瘘lncRNA芯片分析及CNC图搭建＊

目的 研究糖尿病肛瘘创面特异表达LncRNA与mRNA基因功能之间调控网络。方法 用基因芯片技术对糖尿病肛瘘创面和普通肛瘘创面组织中差异性表达的LncRNA及mRNA进行基因表达谱检测，筛选的标准为2倍差异及P < 0.05,再进行差异表达分析，然后对差异表达的mRNAs进行KEGG通路分析及Pathway Map展示，挑选出显著mRNA指标，将这些显著mRNA指标进行q-PCR验证，得到有意义的阳性指标，再将阳性指标与差异LncRNA交集得出LncRNA-mRNA共表达网络，并基于LncRNA-mRNA共表达网络挑选出不同LncRNA进行功能验证。结果 将芯片标准化后分析差异表达的长链非编码RNA和mRNA，发现上调差异有502个，下调差异有1204个；mRNA分析发现上调差异621个，下调差异505个，KEGG通路分析发现上调和下调的通路均有10条；通过分别对上调、下调最明显的通路进行Pathway Map展示，挑选出显著mRNA指标8个：BMP2、IFNB1、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7、SMAD9、β-actin，分别将其进行q-PCR验证，得到有意义的阳性指标个5个：BMP2、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7，将5个阳性指标和差异LncRNA交集得出LncRNA-mRNA共表达网络，并基于LncRNA-mRNA共表达网络挑选出不同LncRNA进行功能验证。结论 挑选出的20个LncRNA（NR_125383、T323486、ENST00000582334、TCONS_00018312、ENST00000418393、TCONS_00017190、TCONS_00019532、ENST00000601559、ENST00000566575、NR_109882、NR_026913、T301537、NR_109774、ENST00000415536、ENST00000610000、ENST00000412485、ENST00000573220、T175957、ENST00000580756、TCONS_00014747）所调控的mRNA居于LncRNA-mRNA共表达网络，其在各个领域当中均有不同程度的报道，为后续的功能和机制研究提供了方向和重点，为加速慢性难愈合和创面愈合的研究提供了新的思路，为开发促愈药物提供基础研究借鉴。     

糖尿病肛漏创面应用美洲大蠊提取液的lncRNA高通量测序及维恩图分析＊

目的 基于高通量测序及维恩图预测美洲大蠊提取液促进糖尿病肛漏创面愈合的顺、反式lncRNA及Pathway。方法 选取湖南中医药大学第二附属医院收治的糖尿病肛漏患者术后创面12例，利用高通量测序技术检测6例术后创面组（A组）和6例术后创面应用美洲大蠊提取液创面组（B组）中lncRNAs和mRNAs表达，进行GO分析和KEGG通路分析，构建lncRNA-mRNA的共表达网络图，并通过Cis-及Trans-预测与创面愈合相关lncRNA。结果 实验组差异表达的lncRNAs2242个（上调649个，下调1593个），mRNAs有13186个（上调5162个，下调8024个）。GO分析发现差异表达的lncRNA-cis主要富集在表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等；差异表达的lncRNA-trans主要富集在细胞代谢过程、蛋白质结合、细胞内部分等。通过KEGG通路分析，筛选出与本研究相关的3条通路：IBD、MAPK signaling pathway、AMPK signaling pathway；lncRNA靶标基因预测中最终筛选出3个lncRNA（ENST00000443364、ENST00000576797、ENST00000620167），进行PCR验证，lncRNAENST00000443364、ENST00000576797与芯片结果一致。结论 美洲大蠊提取液可能通过lncRNAENST00000443364、ENST00000576797顺式及反式调控靶标基因，影响表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等功能以及影响IBD、MAPK signaling pathway、AMPK signaling pathway促进糖尿病肛漏创面愈合。