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1.
目的 应用生物信息学及系统药理学的方法探索可干预肾透明细胞癌的潜在化学成分以及含有目的成分的中草药。方法 首先借助GEO基因表达谱数据分析筛选得到肾透明细胞癌与癌旁正常组织的差异基因,同时分析得到差异基因的生物学功能,接着构建差异基因的蛋白互作网络,进一步分析差异基因的在TCGA及GTEx背景数据库中的表达及预后价值,得到目标基因后借助CTD数据库挖掘与目标基因相关化合物,剔除非天然化合物后经TCMSP工具寻找含有天然化合物的中草药。结果 得到肾透明细胞癌与癌旁正常组织的差异基因共有357个上调基因,353个下调基因,富集生物过程包括氧化还原过程、排泄、对药物的反应等,分子功能包括蛋白质均二聚活性、运输活动、受体结合等,细胞定位在细胞外泌体、质膜的组成部分、顶质膜等。在KEGG信号中富集到PPAR信号通路、碳代谢、甘氨酸,丝氨酸和苏氨酸的代谢等信号通路,利用cytohuba基于degree筛选排名前20的基因为核心基因,有明确差异以及有预后意义的BUB1、C3、KIF20A、RRM2、TOP2A基因确定为目标探究与其相关的化合物72个,包含每种化合物的中草药至少一种。结论 基于生物信息学挖掘到多种中草药可以影响目标基因从而干预肾透明细胞癌。  相似文献   
2.
目的:研究寒水石化灰小剂的抗癌活性、免疫调节作用及抗菌活性。方法:利用血清药理学方法制备寒水石化灰小剂的含药血清,MTT 法观察含药血清对体外培养的S180 腹水瘤细胞和人食道癌细胞增殖率的影响及对小鼠脾淋巴细胞转化的影响,牛津杯法测定寒水石化灰小剂体外的抗菌活性。结果:寒水石化灰小剂含药血清抑制S180 和人食道癌细胞增殖,对人食道癌细胞的抑制与5-氟尿嘧啶(5-Fu)有协同作用;诱导小鼠脾淋巴细胞转化率降低,但对5-Fu 所致的小鼠脾细胞转化率降低有抑制作用;汤剂浓度在0.25 g·mL-1 以上表现有抗菌活性。结论: 体外实验表明,寒水石化灰小剂能抑制S180 腹水瘤细胞和人食道癌细胞增殖,显著逆转免疫抑制剂体外诱导的小鼠脾细胞转化率降低,抗菌活性尚待进一步研究。  相似文献   
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