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1.
真菌是药物先导结构的重要来源,得益于基因组测序技术的飞速发展,生物信息学分析发现真菌中存在大量次级代谢产物基因簇。而这些基因簇在常规实验室培养条件下往往不表达代谢产物,被称之为“沉默”基因。同时,随着天然产物分离技术在日益进步,结构新颖的天然产物发现的几率却在减少。因此如何借助基因组数据分析并激活沉默的基因簇,“解密”天然产物的宝藏,挖掘真菌潜在的代谢潜能成为研究热点。本文主要介绍了基因组导向的丝状真菌沉默生物合成基因簇的激活策略。  相似文献   
2.
目的:研究弥漫大B细胞淋巴瘤中甲基化诱导沉默基因1(TMS1)基因启动子甲基化及其与弥漫大B细胞淋巴瘤不同细胞起源类型之间的相关性。方法:应用免疫组织化学方法检测40例弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡包埋组织中CD10、Bcl6和MUM1的表达,并进一步区分生发中心与非生发中心B细胞起源类型;甲基化特异性PCR技术检测TMS1基因启动子甲基化状态。结果:弥漫大B细胞淋巴瘤40例中,生发中心B细胞起源16例,非生发中心B细胞起源24例。弥漫大B细胞淋巴瘤14例中存在TSM1/ASC基因异常甲基化,其中生发中心B细胞起源2例(12.5%),非生发中心B细胞起源12例(50.0%),两者阳性率比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论:TSM1基因启动子甲基化在弥漫大B细胞淋巴瘤中常见,且对非生发中心B细胞起源发生进展更为重要。  相似文献   
3.
Fy(a-b-)的基因定型   总被引:1,自引:1,他引:0  
目的 介绍新的Duffy沉默基因 (FY)检测方法 ;探讨该方法在输血学和人类学中的意义。 方法 首先采用文献介绍的聚合酶链反应 限制性酶切片短长度多态性 (PCR RFLP)方法[6] 检测样品的Duffy基因型 ,然后对可能含有FY基因的基因型个体用笔者设计的PCR RFLP法检测其是否存在FY基因。结果 在所有可能含有FY基因的辽宁汉族人基因型中未发现FY基因。结论 中国辽宁汉族人群中FY频率极低或辽宁汉族人群与黑人的FY等位基因有不同的遗传背景 ;用PCR RFLP法检测Duffy血型 ,可直接判定基因型而不是表现型 ,避免血清学检测引起的误差。  相似文献   
4.
目的 构建Wnt信号通路抑制因子Dickkopfl(DKKl)、骨硬化蛋白Sclerostin( Sost)基因沉默重组腺病毒载体,观察其对MG63细胞增殖、碱性磷酸酶(ALP)活性和钙离子浓度影响作用。方法设计出特异性针对DKKl、Sost和无关对照序列 (Scr),构建DKKl、Sost沉默重组腺病毒载体,用qPCR法和蛋白印记(Western blot)法选出沉默效率最好的扩增DKK1、Sost沉默重组腺病毒载体,并用荧光显微镜观察计算病毒滴度。MG63细胞被分成空白对照组、沉默DKKl(Ad-shDKKl)组、沉默 Sost(Ad-shSost)组、沉默DKK1 + Sost( Ad-shDKKl + Ad-shSost)组4组,分别用优选出的沉默效率最好的shDKKl和shSost腺病毒载体转染MG63细胞,采用四甲基偶氮唑蓝微量酶反应比色法(MTT)检测观察细胞增殖、考马斯亮蓝蛋白定量法测定ALP 活性、流式分析法测定钙离子浓度。结果 ①DKK1 pAd-shDKKl-1和Sost pAd-GFP-shRNA-2沉默效率最高;②与空白对照组对比,沉默DKK1组、沉默Sost组、沉默DKK1 + Sost组的细胞光吸收值(OD)、ALP活性测定值均升高,而钙离子浓度均降低, 以沉默DKK1 +Sost组变化最明显,组间比较具有统计学差异(P<0.01和P<0.05)。结论 DKK1、Sost沉默可促进MG63细胞增殖、提高ALP活性,降低钙离子浓度,尤以二者同时沉默时的作用最强。  相似文献   
5.
赵玲  杨鹰 《第三军医大学学报》2011,33(22):2361-2365
目的观察沉默乙酰肝素酶(heparanase,HPA)基因对人卵巢癌SKOV3细胞的增殖及侵袭能力的影响。方法构建针对HPA基因的shRNA慢病毒载体,感染人卵巢癌SKOV3细胞。实验设计分为未转染组、实验转染组(选择3个靶点设计HPA-shRNA-1、HPA-shRNA-2、HPA-shRNA-3序列)、空白转染组;转染后,采用荧光定量PCR、Western blot方法检测HPA在基因水平和转录后蛋白水平的沉默效率;使用流式细胞仪检测细胞周期变化,CCK-8法检测细胞增殖情况,基质凝胶侵袭实验检测细胞侵袭能力变化。结果①构建的shRNA慢病毒载体感染卵巢癌SKOV3细胞后,见HPA-shR-NA-1和HPA-shRNA-2序列的HPA基因和蛋白水平均显著下降(P<0.05),而HPA-shRNA-3序列在其表达上无降低,为无效转染序列;②实验转染组中有效转染序列HPA-shRNA-1、HPA-shRNA-2组中均见细胞G1期比例增加[分别为(69.69±3.87)%、(66.29±4.06)%],细胞增殖受到抑制[分别为(1.77±0.13)、(1.74±0.27)],穿膜细胞数显著减少[分别为(22.40±5.02)、(23.42±5.72)],与未转染组及空白转染组之间相比有明显差异(P<0.05)。结论干扰HPA基因后,对卵巢癌细胞的增殖及侵袭能力有明显的抑制作用,其作用机制与HPA的基因和蛋白表达下调有关。  相似文献   
6.
玫瑰孢链霉菌是重要抗生素达托霉素的产生菌。基因组挖掘发现该菌具有丰富的次级代谢产物合成潜力,激活沉默次级代谢产物生物合成基因簇,发现了10多种具有多种生物活性的次级代谢产物。本文回顾了玫瑰孢链霉菌次级代谢产物的研究进展,以及激活这些沉默生物合成基因簇的研究策略。这些研究为其他链霉菌基因组挖掘提供了有效的思路和方法学参考。  相似文献   
7.
目的研究2株海洋真菌Penicillium janthinellum HK1-6与Trichoderma reesei HK1-12共培养体系中的次级代谢产物变化及其抗菌活性。方法采用代谢组学方法分析共培养中的差异化合物,采用高效液相法对共培养中的青霉酸进行定性及定量分析,采用带毒培养基法和滤纸片法评价青霉酸的抗真菌及抗人类致病细菌活性。结果有97个差异化合物仅在真菌HK1-6与HK1-12共培养体系产生;真菌HK1-6在共培养刺激下分泌青霉酸的产量增加,较HK1-6纯培养时提高约1.2倍;青霉酸对真菌HK1-12和5株人类致病细菌均具有较强抗菌作用。结论共培养策略可以激活真菌某些沉默的代谢途径或提高某些代谢产物的产量,是挖掘海洋真菌次级代谢产物的有效途径。  相似文献   
8.
9.
楼秀余 《中国保健营养》2012,(20):4694-4695
从人类基因组的进化历史长河的角度上来分析,人体调节血糖的水平往往偏向于高血糖的现象,这是因为低血糖对身体的伤害远远超过了高血糖的危害,血糖过低瞬间可致人晕倒,而高血糖对机体的造成生存危害往往需要15-20年的时间才能表现出来,因此血糖短时间适当地偏高有利于人类的生命活动和生存。现代医学对此类疾病的诊断,只停留在对个体血糖水平和体重指标的简单统计进行判断,而没有对"为什么"血糖升高或体重超标,以及血糖升高或体重超标对人体健康产生的危害程度作出评估。2010年上海舒泽生物科技研究所的科技人员研究表明:除了少见的极度肥胖和高血糖对人体健康有明显影响外,轻、中程度的高血糖和肥胖对身体不一定会造成危害;许多人基因组中本身就存在胰岛素抵的"Ⅱ型糖尿病"基因或导致肥胖的"节俭基因"基因,只是在摄入过多食物等环境因素作用下,激活了这些沉默基因表达罢了。  相似文献   
10.
《中国抗生素杂志》2009,45(5):411-417
Streptomyces roseosporus is an important industrial producer of the first line antibiotic daptomycin. Genome mining has revealed a large cryptic secondary metabolism gene clusters. Several activation strategies have been applied to this strain and allowed the identification of over 10 secondary metabolites. This paper focuses on recent advances in the strategies for activating cryptic gene cluster in S. roseosporus by genomics  相似文献   
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