以c-MET为抗癌靶点的海洋小分子虚拟筛选

目的：运用计算机虚拟筛选技术和分子动力学模拟寻找海洋小分子库(SWMD)中抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂。方法：利用schrodinger中Ligand Docking模块对海藻代谢物数据库(SWMD)和PDB网站检索的c-MET蛋白（PDB：2rfs）进行基于受体的分子对接筛选,采用对接得分前十的结果,利用Swiss ADME网站进行成药性分析。最后将最好的结果用Gromacs进行分子动力学模拟。结果：分子对接结果显示打分前十的化合物都能与蛋白有较好的结合效果和对接姿势,蛋白与化合物之间的相互作用主要以氢键作用为主。分子动力学结果显示配体能在受体的结合口袋中稳定存在,同时具备较为稳定的对接构象。结论：基于分子对接技术和分子动力学虚拟筛选潜在的抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂,为研发抗癌海洋药物提供科学指导与理论依据。