全心电生理建模及体表电位标测图的仿真

虚拟心脏建模是连接心脏宏观和微观研究的有效手段之一。本研究利用微型计算机和可视人断层数据,通过图像增强、组织分割和三维重建,建立了分辨率为0.5 mm×0.5 mm×0.5 mm的心脏结构和胸前表面几何模型;以单细胞动作电位仿真为基础,使用改进的规则型算法,基于惠更斯原理的各向同性和各相异性波面型算法,分别完成了特殊传导系统、心房和心室电活动的仿真,时间精度可达1 ms;结合双域模型理论,使用偶极子等效心脏的电活动,同时结合躯体模型,完成了心脏电活动到体表心电的映射,进行正常和异常情况下体表电位标测图(BSPM)及12导联心电图的仿真。通过此模型得到的由窦房结起搏的体表12导联心电图,满足正常心电的诊断标准,证明了模型的真实性和可靠性,为进一步探讨传导和起搏异常的体表心电建立基础。     

C '散点图:一种描述氨基酸结构差异的新方法

研究氨基酸结构对蛋白质结构预测具有重要意义.目前主要采用二面角来描述氨基酸的几何结构,但是角度的方法比较抽象,并且难量化地评估结构差异的程度.提出一种描述氨基酸结构差异的新方法——C'散点图.这种方法用散点图的形式在三维坐标图上显示羧基碳原子C'的相对坐标,以描述氨基酸结构的多样性,比目前广泛使用的二面角方法更加直观,在分析多肽片段中氨基酸结构多样性方面具有较高的可视性和便利性.同时通过计算散点图上原子间的最远距离,该方法可望使量化衡量氨基酸结构差异性成为可能.C'散点图对进一步深化氨基酸结构分析具有重要意义.     

基于深度学习的肺腺癌肿瘤突变负荷的预测

肿瘤突变负荷(TMB)与非小细胞肺癌(NSCLC)的免疫治疗疗效呈正相关,并且在近期的相关研究中,肿瘤突变负荷对靶向治疗及化疗的疗效也有一定的预测作用。因此,提出一种融合注意力机制的Inception深度学习模型(CAIM),用于对TCGA数据库中的非小型细胞肺癌中的肺腺癌的病理切片进行识别。首先,对数据样本进行切分,裁剪成小切片;然后送入到深度学习模型中,通过卷积学习图像特征,再与注意力机制结合进一步加强特征的提取;最后通过对小切片预测信息的整合,自动判别肺腺癌病理切片TMB值的高低。数据集由337张肺腺癌病理组织切片组成,其中高TMB值的数据271张,低TMB值的数据实验66张。结果表明,所提方法的性能平均曲线下面积(AUC)为0.82,明显高于图像分类方法残差网络(ResNet)的AUC值0.66。研究结果对临床实践中肿瘤突变负荷的检测和辅助诊断具有重要意义。     

中国部分省市人群生理常数与心理状况调查(下)

生理常数调查结果体质调查结果表明,河北、浙江和广西壮族自治区的成年人群为例,已显示出一定的差异。3省区男性成年人身高、体重、体重指数(BMI) 3项分别为:河北(169．5±6．1)cm(n=2444) (66．6±10．0)kg、(23．1±3．1)kg／m~2;浙江(168．3±6．6)cm(n=1993)、(63．1±9．3)kg (n=1585)、(22．2±2．7)kg／m~2(n=1984);广西(164．0±6．1)cm(n=1319)、(58．9±8．9)kg     

大鼠心肌缺血再灌注损伤时细胞色素P-450含量变化

本实验复制大鼠缺血再灌注损伤及缺血预处置模型 ,通过观察心肌组织中细胞色素Ｐ450 (ＣＰ450 )含量及室性心律失常严重程度 ,探讨ＣＰ450在心肌缺血再灌注损伤及缺血预处置中的作用。方法 :采用结扎冠状动脉左前降支 60ｍｉｎ和完全放松 30ｍｉｎ的方法复制心肌缺血再灌注损伤模型 :采用缺血 5ｍｉｎ/再灌注 5ｍｉｎ两次造成缺血预处置。雄性Ｗｉｓｔａｒ大鼠 ,随机分为 5组 :( 1 )假手术对照组 (ｃｏｎｔｒｏｌ,ｎ =6) ;( 2 )缺血再灌注组 (Ｉ/Ｒ ,ｎ =6) ;( 3)ＣＰ450抑制后缺血再灌注组 (ＣＬＯ ,ｎ =6) ;给予细胞色素Ｐ450单氧化酶抑制…     

蛋白质分析中生物信息学的应用

生物信息学是生物学与计算机科学及应用数学等学科相互交叉形成的一门新兴学科。它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,进而达到揭示数据所蕴涵的生物学意义的目的,被认为是21世纪生物学的重要组成部分。生物信息学涵盖生物数据库、生物学软件、生物大分子模拟三方面内容。在后基因组时代的蛋白质组分析中,生物信息学必将会扮演重要角色。     

基于openFDA的诺西那生不良反应真实世界研究

目的：基于FDA公共数据开放项目（openFDA）中诺西那生不良事件的数据,分析研究诺西那生的不良反应,为临床安全用药提供参考。方法：收集2016年1月1日至2020年12月31日美国FDA不良事件报告系统（FAERS）中诺西那生相关的不良事件（AE）报告,提取报告数排名前50位不良事件报告,采用报告比值比法（ROR）和比例报告比值法（PRR）挖掘诺西那生不良反应风险信号。结果：设定时段内FAERS共收到以诺西那生为首要怀疑药物的不良事件报告3 497例,对报告数排名前50位不良事件进行药物不良反应风险信号分析,检测出35个不良反应风险信号,其中30个为说明书中未收录的不良事件。不良事件报告数前5位的不良事件依次为头痛、腰穿后综合征、发热、感染性肺炎、呕吐。不良反应风险信号强度排名前5位的依次为腰穿后综合征、脑脊液漏、鼻病毒感染、尿蛋白检出、呼吸道合胞病毒感染。结论：利用诺西那生不良事件的真实世界数据深入分析其潜在的不良反应,提示临床予以关注及进一步进行安全性评价。其中尿蛋白检出不良反应风险信号强度高,建议在每次给药前进行尿蛋白检测。     

持续性心房颤动心室律的昼夜节律变化

目的从持续性心房颤动心电图的心室律变化动力学的角度,探讨心房颤动的心电信号中心室律昼夜节律的变化规律,为心房颤动的治疗提供有意义的思路。方法用时域、近似熵和分形分析对31份24h的心房颤动Holter心电图和18份正常人的24h Holter心电图的心室律及其昼夜节律进行了分析。结果心房颤动患者的心室率的SDA、RMSSD和近似熵的24h均值显著地高于正常组,但是都表现出冥想的类似的昼夜节律。心房颤动的心室率的分形指数显著低于正常人,而表现出近似白噪的动力学特性,并且失去了昼夜节律。结论心房颤动的心室律在时域和近似熵上具有和正常人类似的昼夜节律,而其分形特性则不具有正常人所具有的昼夜节律。     

用于电穿孔效应实验的亚微秒脉冲电源

针对肿瘤细胞电穿孔效应的实验需求,用幅值可调的高压直流电源为电容充电,具有一定时间延时的两路TTL信号分别控制串联的两个IGBT模块的通与断状态,以便从电容放电曲线中截取适当脉宽电脉冲的方法,研制了一台输出脉冲电压0.5～3.5kV连续可调,脉宽300～800ns准连续可调,重频1～400Hz连续可调的亚微秒脉冲电源。实验测试结果表明,这种脉冲电源性能稳定可靠,可用于恶性肿瘤电穿孔实验。     

致病疟原虫分子功能注释二级数据库的构建

为对疟原虫致病分子机制研究过程中产生的高通量实验数据快速高效地进行功能注释,构建致病疟原虫分子功能注释二级数据库。本数据库基于J2EE技术、MySQL和MVC三层体系架构,利用Web Services和Hibernate等技术实现其主要框架,通过调用Fisher’s精确检验R程序包对Gene Ontology和Pathway的注释结果进行富集效应分析,并调用Graphviz工具对蛋白质相互作用结果进行图形化描述。致病疟原虫分子功能注释二级数据库提供多入口的分子注释类型,使Gene Ontology、Pathway及蛋白质相互作用注释信息以图形化界面直观显示。该数据库为疟原虫致病分子机制研究提供良好的高通量数据分析工具,可有效促进疟原虫基因功能、信号通路及疟疾疫苗抗原筛选等方面的研究。