基于全基因组关联研究的中国人群肺癌风险预测模型

目的 联合使用遗传因素和吸烟信息构建中国汉族人群的肺癌风险预测模型。方法 基于中国汉族人群全基因组关联研究(GWAS)数据,根据样本地区来源将样本分为训练集(南京与上海:1 473 名病例vs. 1 962 名对照)和测试集(北京与武汉:858 名病例vs. 1 115 名对照)。系统整理已报道肺癌易感位点,在训练集中用逐步后退法筛选具有独立效应的位点,并通过加权法估算个体遗传得分用于建模。在训练集中分别构建基于吸烟信息、遗传得分和联合使用吸烟与遗传信息的3 种风险预测模型(吸烟模型、遗传效应模型和联合模型),并根据受试者工作特征(ROC)曲线、曲线下面积(AUC)、净分类指数(NRI)和整体鉴别指数(IDI)评价模型对肺癌风险预测的效能。对于构建的模型,进一步在测试集中进行验证。结果 在训练集中,联合模型、吸烟模型和遗传效应模型AUC分别为0.69(0.67~0.71)、0.65(0.63~0.66)和0.60(0.59~0.62)。在训练集和测试集中联合模型的风险预测效能高于吸烟模型或遗传模型,差异有统计学意义(P<0.001)。重分类结果显示,联合模型与吸烟模型相比,在训练集中NRI 增加4.57%(2.23%~6.91%),IDI 增加3.11%(2.52%~3.69%)。在测试集中,NRI和IDI 分别增加2.77%和3.16%。结论 遗传得分可以显著提高肺癌传统风险模型的预测效能。联合使用遗传因素和吸烟信息构建的中国汉族人群肺癌风险预测模型可用于筛选中国汉族人群中肺癌发病的高危人群。     

精神分裂症中拷贝数变异的研究新进展

精神分裂症(schizophrenia,MIM 181500)是最严重精神疾病之一,在世界范围发病率为1%左右.为双生子、家系、寄养子的研究结果,提供了强有力的证据,表明精神分裂症是一种复杂的遗传疾病,遗传因素对精神分裂症的影响大约占了73%～90%.随着现代芯片技术的发展,基于"常见疾病常见变异"模型的全基因组研究为我们认识精神分裂症的遗传机制提供了新的视野,与此同时拷贝数变异作为一种新型的遗传标记在精神分裂症的遗传学研究中崭露头角.与精神分裂症显著关联的1q21.1、15q11.2、15q13.3、16p11.2、16p13.1、22q11、NRXN1等位点的罕见拷贝数变异在不同的研究中得到了反复验证;罕见拷贝数变异的增加极大增加了患病风险;精神分裂症遗传学研究中的"常见疾病罕见变异"的理论正在形成.     

中国汉族2型糖尿病人群中UCP基因单核苷酸多态性与视网膜病变的关联分析

背景 研究发现血糖水平的短期升高可对细胞和组织造成长期损害,这种损伤可能存在代谢记忆现象,合理管理血糖代谢记忆对糖尿病并发症的预防有重要作用,但其机制尚未完全阐明,推测糖尿病患者中糖尿病视网膜病变(DR)的发生可能与相关机制有关.解偶联蛋白(UCPs)可减少线粒体活性氧(ROS)的生成,可能与DR发病相关. 目的 探讨中国汉族2型糖尿病人群中DR与UCP基因单核苷酸多态性(SNPs)之间的关系.方法 采用横断面研究方法和整群抽样法,于2014年11月至2015年1月在上海市新泾社区对1 875例确诊为2型糖尿病的患者进行流行病调查,收集受检者的基本信息、眼科检查和血生物化学检验结果,采集每例患者的全血2 ml以提取DNA.采用Sequenom平台将UCP1基因的8个SNPs位点、UCP2基因的3个SNPs位点及UCP3的7个SNPs位点选为标记位点以检测基因型,采用SAS和SHEsis软件计算Hardy-Weinberg平衡、碱基型和基因型频率,评估各位点SNPs与DR之间的关系. 结果 受检的1 875例2型糖尿病患者中530例患DR,占28.27％.UCP2基因的rs660339位点和UCP3基因的rs1626521位点、rs668514位点的检出率低,UCP2基因rs632862位点次要等位碱基频率＜0.01,UCP3基因的rs15763位点不符合Hardy-Weinberg平衡,故均不纳入分析.在纳入分析的13个SNPs位点中,仅有UCP1基因的2个SNPs位点与DR发病有关,其中与非糖尿病视网膜病变(NDR)患者比较,DR患者rs10011540的G碱基频率增加[P=O.03,OR=1.31,95％可信区间(C1)=1.03～1.67],rs3811787的T碱基频率下降(P=0.04,OR=0.86,95％ CI=0.75 ～0.99).基因型分析发现,DR患者UCP1基因的rs3811790位点纯合子C/C和A/A频率明显多于NDR患者,杂合子C/A频率少于NDR患者,差异均有统计学意义(P＜0.01).Logistic回归分析提示,在排除了血糖水平和糖尿病病程的影响因素后,rs10011540和rs3811787位点SNPs仍是DR发病的独立影响因素.结论 中国汉族2型糖尿病患者UCP1基因rs10011540和rs3811787位点SNPs与DR发病相关.     

精神分裂症研究新希望:人体诱导多能干细胞

精神分裂症是一种严重神经发育障碍,主要表现为阳性症状(幻觉、妄想、行为紊乱)、阴性症状(思维散漫、情感淡漠、意志减退)和认知损害(注意缺陷、记忆减退、执行功能损害).预计全球18岁以上人群精神分裂症的患病率为1.1％,患者预期寿命比一般人群短10年,10％的患者最终自杀.目前普遍认为多基因遗传和环境因素交互作用是精神分裂症的基本病因,预计遗传度达到80％以上,但确切的遗传机制及遗传与环境因素的交互作用尚不完全清楚,临床上也缺乏客观生物学诊断指标和特效个性化治疗.以往主要依赖脑成像、药理学、死后病理学和动物模型研究,这些研究都因条件限制或混杂因素影响,难以真实客观地解释人类精神分裂症的复杂致病机制.     

医学大数据使用安全及伦理问题探讨

在医学大数据使用过程中安全与共享似乎不可调和,一味强调数据安全或共享,会走向两个极端,阻碍相关科学的发展和进步;而数据共享时绕不开伦理审查。如何在满足安全和伦理的要求下,实现数据互联互通和共享,是当前亟须解决的问题。在分析医学大数据使用过程中安全和伦理问题的基础上,探讨数据安全与共享的关系,提出在不断完善安全技术和法律法规的同时应加强伦理审查和监督,来实现数据互联互通和共享,使医学大数据的使用效益最大化,以加快我国医疗大数据产业化的发展。     

ZNF804A基因多态性与维吾尔族首发精神分裂症患者精神症状严重程度的关联研究

目的了解锌指蛋白804A基因(ZNF804A)基因rs13009002、rs72893068、rs61739291 3个位点的基因多态性，并分析与维吾尔族首发精神分裂症患者精神症状严重程度的关系。方法于2015年7月至2018年6月，选取新疆维吾尔自治区喀什、和田精神卫生机构及新疆医科大学第一附属医院精神科收治的937例维吾尔族首发精神分裂症患者以及937名健康体检者为病例组和对照组。采用PANSS评估病例组精神症状的严重程度。采用高通量基因测序技术对两组ZNF804A基因rs13009002、rs72893068、rs61739291 3个位点进行测序分析，并对关联位点进行性别比较，比较基因多态性与精神症状严重程度。结果两组受试者rs72893068和rs61739291位点的基因型和基因频率比较，差异无统计学意义(P>0.05)。两组受试者rs13009002位点G基因频率为92.2%(1 728/1 874)，高于对照组的90.2%(1 690/1 874)，差异有统计学意义(χ²=4.798,P<0.05)。两组受试者rs13009002位点显...