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目的旨在了解浙闽地区人群恙虫病东方体感染的基因型,并分析其基因变异。
方法从浙闽地区5例散发恙虫病发热期患者血中分离病原体并进行细胞培养;提取感染细胞DNA,巢式PCR扩增完整恙虫病东方体56-kD型特异性抗原(TSA)基因和热休克蛋白基因(groESL)并测序;采用MEGA 7.0软件,进行序列比对和系统发育分析。
结果病原学确认5例恙虫病患者,并分离到恙虫病东方体菌株。序列比对表明,5菌株中有2株的56-kD TSA基因和groESL基因100%一致,另2菌株的此二个基因序列一致性亦为100%,分别将两组菌暂时命名为浙江-1型和浙江-2型。56-kDa TSA基因比对和系统发育分析表明,浙江-1型和浙江-2型分别与台湾-A基因型和Gilliam-C基因型亲缘较近(98.45%和98.50%),但有明显变异;另1株菌Wuj/2014与台湾-A基因型高度相似(99.94%)。56-kDa TSA基因各基因型支系的时间树分析表明,台湾-A基因型、浙江-1型和浙江-2型3支系与祖先的分歧时间相对其他原型株晚,尤其是浙江-2型,说明这些基因型或亚型在恙虫病东方体的进化过程中出现较晚。
结论本研究病例所感染恙虫病东方体基因型不同,可能为未被认识的新的基因亚型,迫切需要进行全基因组测序确认,并探讨其基因变异与人恙虫病严重程度间的关系。 相似文献
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本文旨在了解浙江省大盘山脉鼠类感染巴贝西原虫的流行病学情况。捕获大盘山脉磐安县区域的鼠类共231份,取肝脾标本进行PCR检测。所检测到的PCR阳性结果进行序列测定,并进行分析。从231份鼠肝脾标本中检测发现3例DNA阳性片段,来自针毛鼠和社鼠。核酸序列分析显示与巴贝西原虫DNA片段高度相似。利用PCR方法检测到巴贝西原虫DNA,提示浙江大盘山脉存在鼠类感染巴贝西原虫的状况。 相似文献
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目的用聚合酶链反应(PCR)检测浙江省淳安县鼠中感染巴贝西原虫的情况。方法利用PCR方法检测淳安县106份鼠肝、脾标本,对检测到的阳性片段,进行序列测定和分析。结果 PCR检测结果显示,3份标本呈阳性,其中2份来自黄胸鼠,1份来自褐家鼠;PCR产物序列与巴贝西原虫高度相似,相似率均为99%。结论浙江省淳安县鼠类中检测到巴贝西原虫DNA片段,提示该地区可能有巴贝西原虫感染。 相似文献
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2003年Kawahara等[1]从日本Mikura岛野生褐家鼠中分离得到新埃立克体.在此之前,已有研究在荷兰蓖子硬蜱和中国广州褐家鼠中检测到相似的16S rRNA[2,3].2010年,瑞士首次报道在1例患淋巴细胞白血病的发热患者血中检测到米库尔新埃立克体16S rRNA基因[4],之后德国2例严重发热患者被确诊为米库尔新埃立克体感染[5].2008年在中国浙江野生啮齿动物中也检测到米库尔新埃立克体16S rRNA基因(GenBank登录号:HM439431).本研究对浙江省动物米库尔新埃立克体的自然感染状况及分子生物学特性进行分析. 相似文献
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目的初步了解巴尔通体在浙江省鼠群中携带状况及流行特征,为制定预防措施提供依据。方法 2009年8月于浙江省磐安县捕鼠101只,提取其肝、脾DNA后,选择巴尔通体属rpoB基因进行PCR扩增,并对所得产物进行测序及进一步的系统进化分析。结果 2009年在磐安县捕获的101只鼠中肝脾标本检出巴尔通体rpoB基因阳性1例,其中黄胸鼠中巴尔通体分离率为4.3%;此分离株与格雷汉巴尔通体(GenBank序列号:AB426694.1)处于同一进化分支上(自展值为96%)。结论在浙江省鼠群中存在巴尔通体感染,分离株种属为格雷汉巴尔通体。 相似文献
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浙江省在鼠中检测到埃立克体及无形体DNA片段并测序分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:了解鼠中自然感染埃立克体及无形体的状况。方法:用巢式PCR扩增鼠中埃立克体属及嗜粒细胞无形体属16S rDNA的5′末端片段,对阳性产物克隆后测序。结果:在浙江省金华市金东区捕到鼠128只。在黄毛鼠中检到阳性4份,阳性率为3.125%,并对其进行克隆后测序。与Genbank上比对分析,三份与牛埃立克体相同基因区最为接近,属无形体科,无形体属。一份与反刍动物埃立克体相同基因区最为接近,属无形体科,埃立克体属。均为国内首次报道。结论:初步认为浙江省存在埃立克体及无形体病原。黄毛鼠可能为埃立克体及无形体宿主,尚需进一步调查。 相似文献
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