蛋白电泳凝胶放置时间对蛋白丰度的影响分析

目的利用高分辨力的双向电泳技术检测蛋白电泳后凝胶中的蛋白含量随时间推移的损失情况。方法用双向电泳蛋白裂解液提取鼠疫EV菌株(无毒疫苗株)全菌蛋白并定量。取800μg EV蛋白,平行进行两块双向电泳凝胶电泳,电泳结束后一块凝胶立刻固定并染色,另一块凝胶4℃放置8h后固定并染色,使用ImageMaster 2DElite软件比较分析两块凝胶蛋白点数量及蛋白丰度。结果相比直接固定染色的凝胶,8h后固定染色的凝胶中蛋白点扩散丢失严重,比电泳后直接固定凝胶少346个蛋白点,且部分相邻蛋白点发生融合,含量在20~350ng的低丰度蛋白65.9%因蛋白扩散丢失。结论蛋白凝胶放置8h后大量低丰度蛋白由于扩散会丢失,并直接影响后续免疫印迹、质谱鉴定等实验结果的可靠性。     

针对不同基因靶点的胃黏膜标本幽门螺杆菌PCR检测敏感性分析

目的分析针对3种不同基因靶点的胃黏膜标本幽门螺杆菌PCR检测的敏感性,评价PCR方法从胃黏膜标本中检测幽门螺杆菌用于临床诊断的价值。方法采集320例13C呼气试验阳性患者的胃黏膜标本,用针对ureA、ca-gA和vacA基因的3对引物进行PCR检测,同时进行幽门螺杆菌分离培养。分别对3对引物的PCR结果相互进行Kappa一致性检验,并比较组合PCR与培养结果。结果幽门螺杆菌培养的阳性率为81.88%(262/320);ureA、cagA和vacA PCR扩增阳性率分别为56.25%(180/320)、58.13%(186/320)和81.56%(261/320),组合PCR阳性率为90.94%。ureA、cagA和vacA PCR结果经一致性检验,Kappa值分别为0.209、0.137、0.129,检测结果具有互补性。结论单一基因PCR扩增的敏感性较低且不同基因扩增效果间的一致性较差。3对引物组合使用可提高PCR方法的敏感性,幽门螺杆菌检出率高于培养法,具有一定的实际应用价值。     

标本运输状态对幽门螺杆菌检出率的影响

目的比较胃黏膜标本运输状态对幽门螺杆菌(Hp)检出率的影响,为Hp分离前胃黏膜标本的保存、运输方法的选择提供科学依据。方法随机抽取快速尿素酶检测阳性胃黏膜标本72份,分别保存于含有20%甘油的脑心浸液中。根据标本到达实验室的状态分为3组:完全溶解液体状态组(20份),部分冻融状态组(32份)和冰冻状态组(20份)。所有标本都来源于13C呼气试验(13C UBT)阳性患者。标本经研磨后接种于哥伦比亚和Karmali 5%脱纤维羊血琼脂培养基,置37℃微需氧环境(5.0%O2,10.0%CO2,85.0%N2)培养3~11 d。挑取单菌落,进行革兰染色检查及生化和PCR鉴定,比较3组标本Hp检出率差异。结果冰冻状态组标本Hp检出率95.0%(19/20),完全溶解液体状态组Hp检出率为15.0%(3/20),部分溶解状态组Hp检出阳性率59.4%(19/32),三组Hp检出率差异有统计学意义(P<0.05)。结论冻融胃黏膜标本Hp检出率显著降低。     

羊种布鲁氏菌16M不同生物型及非典型株间微孔蛋白的结构变化规律

羊种布鲁氏菌16M不同生物型及非典型株间微孔蛋白结构存在着规律性的变化。光滑型菌外膜上的脂多糖不同程度的脱落导致16M光滑型向16M中间过渡型与粗糙型转变,表现为16M中间型与粗糙型微孔蛋白SDS-PAGE电泳谱型与16M光滑型的谱型基本相同,仅有清晰程度与单体迁移的改变。与此对照羊种光滑型布鲁氏菌微孔蛋白自身的变异,是羊种布鲁氏菌在光滑型基础上向非典型株转变的原因。     

转染试剂及幽门螺杆菌对AGS细胞形态的影响

目的:探讨不同的转染试剂对AGS细胞形态的影响,观察这些转染试剂能否像幽门螺杆菌那样引起AGS细胞蜂鸟状改变．方法:用多聚阳离子转染试剂(多聚乙酰亚胺、梭华-Sofast)和改良的脂类转染试剂 (Effectene Transfection Reagent)分别转染AGS 细胞,观察细胞形态的变化．用幽门螺杆菌 26695菌株攻击AGS细胞,观察细胞形态的变化并与经转染试剂作用的细胞进行形态比较．结果:幽门螺杆菌攻击后4 h能引起AGS细胞发生蜂鸟状改变．两种多聚阳离子转染试剂也均能引起AGS细胞发生蜂鸟状改变,与幽门螺杆菌引起的细胞形态改变相似,大部分细胞拉长,并且不受是否转染DNA的影响．此种变化在转染4 h时便出现,与试剂剂量的增加呈正相关．当PEI的剂量为10 μL时,细胞出现凋亡,15μL时凋亡加重．改良的脂类转染试剂对 AGS细胞的形态未产生影响．结论:在研究引起AGS细胞形态改变的因素时,不宜选择多聚阳离子转染试剂;多聚阳离子引起的AGS细胞形态改变与幽门螺杆菌引起的AGS细胞形态改变之间是否存在关系值得进一步研究．     

幽门螺杆菌免疫兔血清抗体特异性分析

对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)抗原、抗体的研究是Hp分型、检测及疫苗开发的基础.Hp免疫血清的制备已成为常规技术,但血清制备过程中的各种因素均可能影响免疫血清的抗体谱,从而引起同类研究间因所用Hp抗体不同导致的结果的差异.本研究对Hp全菌免疫的兔血清抗体谱加以分析,讨论坳免疫血清制备中存在的一些问题和应对方法.     

幽门螺杆菌CagA对AGS细胞RNA转录相关磷酸化蛋白的影响

目的研究幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，H.pylori）细胞毒素相关蛋白A（CagA）作用后人胃腺癌上皮细胞（AGS）RNA转录相关蛋白磷酸化的变化情况，进一步揭示CagA的致病机制，为寻找生物标记蛋白奠定基础。方法采用金属离子亲和吸附富集技术富集H.pylori、H.pylori CagA缺失株（H.pylori△CagA）与AGS细胞相互作用4h、以及培养相同时间的AGS细胞的磷酸化蛋白，利用二维凝胶电泳技术分离磷酸化蛋门，ImageMaster 2D分析软件比较分析识别差异蛋白，4700型MALDI源蛋白分析器确认蛋白。结果CagA致使AGS细胞的7个RNA相关的磷酸化蛋白出现差异表达，其中1个磷酸化蛋白表达量上调、4个磷酸化蛋白表达量下调、2个新出现磷酸化的蛋白。hnRNP D0 127位的苏氨酸及137位的丝氨酸发生了磷酸化。结论CagA作用后，致使hnRNP D0蛋白磷酸化。AGS细胞与RNA转录相天蛋白磷酸化的变化，呈现出诱导细胞凋亡、增殖及有利于细胞免疫逃逸的趋势。     

中国幽门螺杆菌基因组多样性与种群结构分析

目的 了解中国幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,HP）基因组特征及种群结构。方法 利用中国不同地域不同疾病分离的10株HP的基因组序列,并整合公共数据库中其他地域的HP基因组数据,通过比较基因组和生物信息学方法分析中国HP的基因组与种群结构特征。结果 中国HP核心基因为1 203个。菌株特异基因为19～32个,这些基因可能与中国HP在不同地域、不同疾病宿主中的适应性进化有关。基因组变异较大区域主要集中在编码限制修饰系统的基因和编码四型分泌系统的基因。基于核心基因组单核苷酸多态性（SNP）的种群分析确定中国菌株均属于hpEastAsia群,hspEAsia亚群,且不同地域菌株具有地域聚集性特点。在3株中国HP基因组序列中发现了前噬菌体序列,携带噬菌体组装所需的必要元件。结论 基于核心基因组SNP分析中国菌株均属于hpEastAsia群,hspEAsia亚群,且具有地域聚集性。为深入挖掘中国不同地域不同疾病相关HP的遗传特征及研究噬菌体在HP进化与致病中的作用奠定了基础。     

利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征

目的 为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析。方法 根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tilingCustomArrayTM 90K芯片,设计DNA芯片。芯片包含已测序菌株 ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列。对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点。结果 中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇。基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征。结论 通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测。