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1.
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC| ≥1 并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。  相似文献   
2.
目的 克隆菊花脑芳樟醇合酶基因CnTPS1的全长编码序列,利用原核系统表达融合蛋白,为进一步研究该基因在菊花脑萜类合成中的功能提供理论依据。方法 以菊花脑基因组数据为基础,设计特异性引物,PCR扩增CnTPS1的全长编码序列,利用生物信息学分析软件分析序列特征。利用qRT-PCR技术分析CnTPS1基因在不同组织中的基因表达量。构建原核表达载体,体外诱导目的蛋白表达。结果 CnTPS1编码序列全长1749bp,编码582个氨基酸;基因表达模式分析表明该基因在茎和管状花中表达量较高;原核表达系统能诱导出67.58kDa大小的蛋白。结论 首次从菊花脑中克隆得到一个芳樟醇合酶基因CnTPS1,运用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、结构特征等进行了分析预测,分析了该基因的组织表达模式,并在原核表达系统中成功诱导表达出目标蛋白,这些结果将为菊花脑萜类合酶基因的功能以及萜类物质生物合成途径的解析提供理论依据。  相似文献   
3.
4.
目的 探究大学生微信朋友圈人格、自我呈现策略和情绪表达间的关系。方法 采用社交网络自我呈现策略问卷、艾森克人格问卷简式量表、伯克利情绪表达问卷,对随机抽取的371名大学生进行调查。结果 ⑴外倾型人格总分与真实自我呈现策略总分呈正相关(r=0.170,P=0.001),与正性情绪表达呈正相关(r=0.166,P=0.001),与情绪表达强度呈正相关(r=0.184,P=0.001),真实自我呈现策略与正性情绪表达呈正相关(r=0.239,P=0.001)。⑵真实自我呈现策略在外倾型人格与正性情绪表达的关系中存在部分中介效应。结论 371名大学生的外倾型人格、真实自我呈现策略与正性情绪表达关系密切,真实自我呈现策略在外倾型人格与正性情绪表达的关系中存在部分中介效应。  相似文献   
5.
目的:探讨不同分期结直肠癌患者肿瘤组织内CD73表达分布情况及其与患者临床病理参数、预后之间的关系。方法:选取2012年1月至2013年6月于本院就诊并行手术治疗的结直肠癌患者共60例作为研究对象,于术中取其肿瘤组织和癌旁组织样本,使用免疫组化法检测收集的所有样本中CD73分布与表达情况,并分析CD73与结直肠癌患者临床病理参数及预后的关系。结果:TNM分期越高的结直肠癌患者病灶组织CD73阳性率越高(P<0.05),癌旁组织中CD73阳性率明显低于结直肠癌患者(P<0.05);CD73在结直肠癌中的阳性表达率与年龄、组织分化程度无相关(P>0.05);与浸润深度、淋巴结转移和临床分期有重要联系(P<0.05);CD73表达阳性组术后存活时间明显短于阴性组(P<0.05);疾病复发率明显高于阴性组(P<0.05);阳性组5年存活率也明显低于阴性组(P<0.05),提示CD73呈阳性高表达的结直肠癌患者预后往往较差。结论:CD73在结直肠癌患者肿瘤组织中的表达量明显升高,可作为评估患者预后的独立预测因子,临床医师可根据结直肠癌患者病理组织中CD73表达量对其预后进行判断和评估,具有推广价值。  相似文献   
6.
目的:构建miR-513a-5p慢病毒过表达载体,转染人骨肉瘤细胞株,观察miR-513a-5p对人骨肉瘤细胞放疗敏感性的影响。方法:PCR法扩增人miR-513a-5p基因,克隆入pLentis-CMV-GFP-MCS-PGK-PURO载体获得重组质粒pLentis-miR513a,双酶切鉴定并测序后将正确的重组质粒和对照质粒转染293FT细胞制备慢病毒,分别转染骨肉瘤HOS和U2OS细胞,qRT-PCR法及荧光显微镜鉴定转染结果。克隆形成实验、MTT法检测miR-513a-5p高表达HOS和U2OS细胞在X射线照射下细胞存活情况。结果:双酶切及测序结果确定成功构建miR-513a-5p慢病毒载体pLentis-miR513a。qRT-PCR结果提示,转染骨肉瘤细胞株后miR-513a-5p表达显著升高。克隆形成实验结果显示miR-513a-5p高表达后骨肉瘤细胞在X射线照射下细胞增殖减慢。MTT结果提示miR-513a-5p高表达骨肉瘤细胞经X射线照射后细胞存活减少。结论:成功构建了miR-513a-5p慢病毒载体,建立了高效稳定表达miR-513a-5p的骨肉瘤细胞株,高表达miR-513a-5p能显著增加X射线照射后骨肉瘤细胞的放疗敏感性。  相似文献   
7.
目的分析探讨肿瘤标志物检验在胃癌诊断中的临床价值。方法选择在本院进行治疗的胃癌患者40例,将其列为观察组,选取体检健康者40例,将其列为普通组,具体的选择时间为2018年2月-2019年2月,对两组患者的CEA、CA72-4、CA19-9水平及阳性表达率进行比较分析。结果观察组患者CEA、CA72-4、CA19-9明显高于普通组,差异具有统计学意义(P<0.05)。观察组患者的肿瘤标志物阳性表达率明显高于普通组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论肿瘤标志物在胃癌的诊断中具有非常重要的意义,肿瘤标志物对胃癌患者的诊断较为确切,利于患者的确诊及后期治疗,从而提高患者的生命及生活质量。  相似文献   
8.
目的克隆大花胡麻草环烯醚萜合酶基因(CgIS),并进行表达分析。方法以大花胡麻草根、茎、叶转录组中唯一的CgIS基因序列为基础,采用RT-PCR技术从大花胡麻草幼叶克隆CgIS基因,并进行组织特异性表达分析。结果大花胡麻草CgIS基因(GenBank登录号MH794270)全长1 185 bp,编码394个氨基酸;CgIS蛋白相对相对分子质量44 670,理论pI为6.17;该蛋白属于孕酮5β-还原酶(P5β-R)家族成员,可能定位于细胞质;该蛋白无信号肽,为亲水稳定蛋白,主要由α-螺旋(40.61%)和无规则卷曲(46.70%)构成;该蛋白具有SDR(短链脱氢酶/还原酶)和P5βR蛋白保守结构域;CgIS蛋白与芝麻SiIS蛋白亲缘关系最近;CgIS基因主要在叶中表达。结论克隆了CgIS基因,并对其进行表达分析,为进一步研究该基因的功能和环烯醚萜类的生物合成途径奠定基础。  相似文献   
9.

Objectives

Anti–programmed cell death 1 (PD-1)/programmed death ligand 1 (PD-L1) immunotherapy has demonstrated success in the treatment of advanced NSCLC. Recently, PD-1/PD-L1 blockade also has demonstrated interesting results in small trials of neoadjuvant treatment in stage IB to IIIA NSCLC. In addition, several clinical trials using anti–PD-1/PD-L1 immunotherapy as an adjuvant or neoadjuvant treatment in patients with resectable stage NSCLC are ongoing. However, few analyses of anti–PD-1/PD-L1 immunotherapy–related biomarkers in early-stage squamous cell lung carcinoma (SqCLC) have been reported. In this study, we evaluated PD-L1 protein expression, tumor mutation burden, and expression of an immune gene signature in early-stage SqCLC, providing data for identifying the potential role for patients with anti–PD-1/PD-L1 treatment in early-stage SqCLC.

Methods

A total of 255 specimens from patients with early-stage SqCLC were identified within participating centers of the Strategic Partnering to Evaluate Cancer Signatures program. PD-L1 protein expression by immunohistochemistry was evaluated by using the Dako PD-L1 22C3 pharmDx kit on the Dako Link 48 auto-stainer (Dako, Carpinteria, CA). Tumor mutation burden (TMB) was calculated on the basis of data from targeted genome sequencing. The T-effector and interferon gamma (IFN-γ) gene signature was determined from Affymetrix gene chip data (Affymetrix, Santa Clara, CA) from frozen specimens.

Results

The prevalence of PD-L1 expression was 9.8% at a tumor proportion score cutoff of at least 50%. PD-L1 mRNA and programmed cell death 1 ligand 2 mRNA positively correlated with PD-L1 protein expression on tumor cells (TCs) and tumor-infiltrating immune cells. PD-L1 protein expression on tumor-infiltrating immune cells was correlated with the T-effector and IFN-γ gene signature (p < 0.001), but not with TMB. For TCs, all of these biomarkers were independent of each other and neither PD-L1 protein expression, TMB, or T-effector and IFN-γ gene signatures were independently prognostic for patient outcomes.

Conclusions

Evaluation of PD-L1 expression, TMB, and T-effector and IFN-γ gene signatures in the cohort with early-stage SqCLC found them to be independent of each other, and none was associated with overall survival. Our results also support the hypothesis that PD-L1 expression is regulated by an intrinsic mechanism on TCs and an adaptive mechanism on immune cells.  相似文献   
10.
目的探讨中药六味地黄丸干预绝经后骨质疏松患者的分子机制并分析预测其靶标和药物作用通路。方法检索并下载GEO中与采用六味地黄丸干预绝经后骨质疏松症的微阵列基因表达数据集。通过获取的基因表达数据集,分析六味地黄丸干预前后绝经后骨质疏松症患者血液中差异表达基因变化,并将这部分差异表达基因与在绝经后骨质疏松症患者和正常绝经女性血液中差异表达的基因取交集,获得两对比组中共同差异表达的基因。通过基因本体论数据库(GO)对获得的共同差异表达基因分别从生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞组分(CC)三方面进行功能富集分析;利用京都基因和基因组百科全书数据库(KEGG)进行通路富集分析。利用生物通用交互数据集库(BioGRID)分析获得与共同差异表达基因产物互作的蛋白质,并构建蛋白质-蛋白质互作关系(PPI)网络,采用Cytoscape软件实现蛋白质-蛋白质互作关系网络的可视化。应用中医药数据库(BATMAN-TCM)对六味地黄丸主要中药成分的靶标基因进行预测。结果六味地黄丸干预后,得到1 350个差异表达基因,其中上调表达基因322个,下调表达基因1 027个。58个共同差异表达基因与六味地黄丸干预绝经后骨质疏松的分子机制相关,六味地黄丸干预后43个基因下调,15个基因上调。六味地黄丸主要中药成分的10个共同差异表达基因靶标为ESR1, FGFR2, MED1, PGR, PRKCB, PTGS1, PTGS2, TRIM24, VDR, WNT4。与六味地黄丸干预组差异表达基因对比分析,ATF2, FBXW7以及RDX基因在干预后呈现显著差异表达。结论 ATF2, FBXW7和RDX基因为参与六味地黄丸干预绝经后骨质疏松分子调控机制的关键基因。六味地黄丸主要中药成分的10个共同靶标基因中,ESR1, FGFR2, MED1, WNT4为六味地黄丸干预治疗绝经后骨质疏松等相关内分泌疾病的潜在调控基因。  相似文献   
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