基于TCGA、THPA、GEO数据库挖掘PTTG1在乳腺癌中的表达及预后意义

目的:通过对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)、人类蛋白组图谱(The Human Protein Atlas，THPA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(Gene Expression Omnibus，GEO)数据库的数据挖掘，探索垂体肿瘤转化基因1（pituitary tumor-transforming gene 1，PTTG1）在乳腺癌中的表达及预后意义。方法:从TCGA、THPA和GEO数据库提取PTTG1在乳腺癌及正常组织中mRNA和蛋白水平的变化和患者临床病理资料，GEO在线预后分析数据库Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com)检索PTTG1乳腺癌预后的相关性。结果:在数据库中，PTTG1 mRNA和蛋白水平在乳腺癌队列中表达显著高于正常乳腺组织(P<0.01)；PTTG1 mRNA在不同的分子亚型中表达存在显著差异(P<0.05)；PTTG1 mRNA在ER和PR阳性乳腺癌患者组织中表达显著低于ER和PR阴性乳腺癌患者(P<0.05)；PTTG1 mRNA在进展期乳腺癌患者组织中表达显著高于早期乳腺癌患者(P<0.05)；PTTG1 mRNA随着乳腺癌患者组织学分级程度升高而降低(P<0.05)。PTTG1低表达乳腺癌患者的预后显著好于其高表达患者(P<0.001)；PTTG1高表达的ER和PR阳性、HER-2阴性乳腺癌患者的预后均显著差于其低表达者(P<0.05)。PTTG1高表达乳腺癌样本富集到细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、细胞周期、自然杀伤细胞介导细胞毒性、Toll样受体信号通路和T细胞受体信号通路等相关基因集。结论:PTTG1 mRNA和蛋白在乳腺癌组织中高表达，PTTG1 mRNA表达与乳腺癌预后相关且在不同分子分型的乳腺癌中具有不同的预后监测意义，可以作为乳腺癌预后判断的标志物。     

41．运用蛋白组技术鉴定人类全唾液蛋白质组分

人体唾液中的多种有效蛋白成分在维护口腔黏膜健康中起着重要的作用。与其他体液相比较，唾液具有易获取、易储存和转运的特点，因此，将唾液应用于全身健康监控、疾病早期诊断相关的生物学研究中具有重要意义。     

胰岛素样生长因子Ⅰ抑制氧化型低密度脂蛋白诱导内皮细胞凋亡的体外试验

目的:胰岛素样生长因子Ⅰ作为重要的促细胞生长因子之一,其对内皮细胞凋亡影响的报道不多.实验拟验证和探讨胰岛素样生长因子Ⅰ对氧化型低密度脂蛋白诱导人脐静脉内皮细胞凋亡的抑制作用及可能机制.方法:实验于2006-12/2007-07在华中科技大学同济医学院协和医院心血管疾病研究所完成.①实验材料及分组处理:取人新鲜脐带(产妇或家属签署知情同意书)分离培养人脐静脉内皮细胞,分为: 胰岛素样生长因子Ⅰ组(1×10-9 mmol/L)、氧化型低密度脂蛋白(200 mg/L) 胰岛素样生长因子Ⅰ组(1×10-9 mmol/L)、氧化型低密度脂蛋白(200 mg/L)组、正常对照组.分别在细胞培养24 h后加入.②实验评估:采用四甲基偶氮唑盐法测定细胞活力;DAPI细胞核荧光染色法观察细胞凋亡的形态学变化及细胞凋亡率的测定;并进行内皮细胞 caspase-3活性的检测.结果:①氧化型低密度脂蛋白可明显抑制人脐静脉内皮细胞增殖,胰岛素样生长因子Ⅰ与氧化型低密度脂蛋白共同加入后,细胞增殖率明显上升(P ＜ 0.05).②氧化型低密度脂蛋白可诱导人脐静脉内皮细胞发生凋亡,而加入胰岛素样生长因子Ⅰ刺激后细胞凋亡率降低(P ＜ 0.05).③caspase-3活性检测表明与对照组相比,氧化型低密度脂蛋白能明显上调caspase-3的表达,而胰岛素样生长因子Ⅰ 氧化型低密度脂蛋白组caspase-3活性则降低(P ＜ 0.05).结论:胰岛素样生长因子Ⅰ对氧化型低密度脂蛋白诱导的人脐静脉内皮细胞凋亡具有抑制作用,可能与其下调caspase-3蛋白表达有关.     

冠心病心绞痛及其治疗相关标记物筛查及验证

目的:通过标记技术对血清中心绞痛蛋白标志物进行筛查。方法:利用液相色谱质谱技术进行血清中蛋白酶解产物的分离测定,分别测定了健康组、疾病零点(0w)和两周(2w)、治疗零点和两周等五组临床血清样本,通过蛋白搜索比较、聚类分析及定量分析观察对蛋白表达谱的影响。结果:健康组,疾病0周,疾病2周的总蛋白数分别为605个,661个,656个,稳定的共有蛋白108个;健康组,给药0周,给药2周的总蛋白数分别为579个,621个,488个,稳定的共有蛋白210个。通过相对量的比较,与疾病本身相关的差异蛋白71个,治疗相关的差异蛋白为63个。结论:筛查比较结果显示,与冠心病心绞痛作用相关的主要是炎症、心肌缺血或心脏疾病标记物;血管蛋白;心衰与重塑相关蛋白等三个相关方面的蛋白,其蛋白上调的水平较高,而在银杏叶片治疗后,分布在作用为信号蛋白;生长与分化相关蛋白;细胞骨架蛋白;血管蛋白等方面的蛋白差异较为明显。     

坐骨神经切断对猫脊髓前角蛋白组表达的影响

用蛋白组学方法探讨猫双侧坐骨神经切断后脊髓前角蛋白组表达变化,找出差异蛋白。用二维凝胶电泳法获得脊髓前角蛋白组的考马斯亮蓝染色图谱,PDQuest软件对蛋白点进行定量分析。结果显示:在凝胶图谱中平均检测到382个蛋白点。损伤组与正常组比较后检测到11个明显差异蛋白。经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱和串联质谱技术鉴定差异蛋白。其名称分别为:蛋白二硫键异构酶、磷酸苷油酸变位酶1、热休克蛋白70、ATP合成酶α链、丙酮酸脱氢酶β亚基、载脂蛋白A前体、肌球蛋白调节轻链异构体b/2、三磷酸苷油醛脱氢酶等。本实验鉴定了外周神经损伤后与脊髓前角变化相关的蛋白分子,为了解运动神经元轴突损伤所致的胞体蛋白组变化奠定了基础。     

摄入不同剂量大豆蛋白干预高胆固醇模型大鼠的血脂水平

目的：探讨膳食大豆蛋白摄入的不同剂量和时程对高血浆胆固醇模型大鼠血清胆固醇及有关血脂指标的影响。方法：实验于2004—02／05在沈阳医学院预防医学系进行，用含50g／kg猪油，10g／kg胆固醇和2．5g／kg胆盐的高脂饲料喂饲健康Wistar雄性大鼠，经2周诱发高血浆胆固醇以后，测血清总胆固醇，总三酰甘油，高密度脂蛋白胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇浓度。然后，按体质量和血清胆固醇浓度均衡的原则，将36只动物随机分为4组，分别喂饲含有200g／k大豆蛋白、200g／kg酪蛋白、300g／kg大豆蛋白和300g／k酪蛋白的纯合成高脂饲料，并于实验第4周和第8周结束时采血，测定指标同前。实验结果用SPSS统计软件进行方差分析。结果：经2周诱导高血脂后，实验模型大鼠的血清总胆固醇水平为(4．55&;#177;1．25)mmol／L(n=36)，而喂饲正常饲料的阴性对照鼠仅为(2．30&;#177;0．18)mmol／L(n=8)，升高了近2倍。又经4周喂饲含有处理因素的饲料后，200g／k异大豆蛋白组、200g／kg酪蛋白组、300g／k异大豆蛋白组和300g／kg酪蛋白组大鼠的血清总胆固醇水平分别为(2．51&;#177;0．31)，(3．45&;#177;0．67)，(2．59&;#177;0．22)，(3．67&;#177;0．87)mmol／L：低密度脂蛋白胆固醇为(1．21&;#177;0．16)，(1．67&;#177;0．32)．(1．25&;#177;0．10)．(1．78&;#177;0．43)mmol／L，与同水平酪蛋白组相比，大豆蛋白组动物的血清总胆固醇，低密度脂蛋白胆固醇和高密度脂蛋白胆固醇浓度极显著降低(P&;lt;0．01)。继续喂饲上述饲料4周后，各组动物的血清总胆固醇水平分另Ⅱ为(3．08&;#177;0．56，4．16&;#177;1．50，3．31&;#177;0．78，4．46&;#177;0．97)mmol／L；低密度脂蛋白胆固醇为(1．46&;#177;0．27．1．99&;#177;0．73，1．58&;#177;0．39．2．14&;#177;0．47)mmol／L，与同水平酪蛋白组相比，大豆蛋白组动物的血清总胆固醇，低密度脂蛋白胆固醇和高密度脂蛋白胆固醇浓度显著降低(P&;lt;0．05)。实验期间各组动物血清总三酰甘油水平不受大豆蛋白摄入的影响。结论：同摄入酪蛋白相比，膳食大豆蛋白可显著降低高血浆胆固醇模型大鼠的血清总胆固醇，高密度脂蛋白胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇浓度，且摄入时程的长短对其作用影响不大。大豆蛋白摄入对血清总三酰甘油浓度无作用，摄入含200g／kg或300g／kg大豆蛋白饲料的降血清胆固醇作用基本相同。     

大鼠羊水双向电泳样品不同处理方法的比较

目的 比较羊水样品2-d电泳的不同处理方法,以建立相对简单、重复性好、检出效率高的2-d电泳方法.方法 提取孕17天正常大鼠羊水,分别采用三氯乙酸-丙酮沉淀法(方案1)、三氯乙酸-丙酮沉淀法联合白蛋白和IgG去除试剂盒(方案2)gt超滤膜浓缩法联合白蛋白和IgG去除试剂盒(方案3)三种方法处理羊水,之后进行双向电泳分离、胶体染色、软件分析和质谱检测.结果 方案1、2和3分别检测到的蛋白点为253±28、749±32和782±27个,方案1与方案2和方案3比较差异均具有统计学意义(P<0.05);方案2与方案3比较,差异具有统计学意义(P<0.05).方案1、2和3检测的相对分子质量>50000蛋白点分别为57±14,45±13和41±14个,差异无统计学意义;方案1、2和3检测的相对分子质量<50 000蛋白点分别为196±29,702±35,735±29个,方案1与方案2和方案3比较差异均具有统计学意义(P<0.05);方案2与方案3比较,差异具有统计学意义(P<0.05).结论 采用超滤膜和去除高丰度蛋白预处理羊水标本可去除高丰度蛋白,提高低丰度蛋白含量,是研究羊水蛋白组的有效方法.     

尿蛋白组型可预测糖尿病性肾病

美国马萨诸塞州总医院和哈佛医学院的Ravi Thadhani及其同事在Diabetes Care上的一项报告称，尿蛋白组型可预测正常蛋白尿2型糖尿病患者的糖尿病性肾病。     

细胞角蛋白检测在皮肤上皮性肿瘤诊断中的应用

细胞角蛋白是上皮细胞的主要骨架蛋白，皮肤不同类型上皮细胞表达不同的细胞角蛋白组型。当上皮组织发生瘤变甚至癌变后，仍然表达与正常组织基本相同的细胞角蛋白类型。检测分析细胞角蛋白类型，在皮肤上皮性肿瘤的诊断和鉴别诊断中具有重要意义。     

中国生物化学与分子生物学会临床应用生物化学与分子生物学分会成立

为了促进基础生物医学与分子生物学研究成果在临床医学中的应用，使基因组和蛋白组研究能够迅速应用于临床重大疾病的防治，为人类健康服务。中国生物化学与分子生物学会根据生物医学与临床医学领域多位知名专家教授的建议，根据中国生物化学与分子生物学会设立分支机构的规定，经第八届常务理事会第五次会议讨论，决定成立“临床应用生物化学与分子生物学分会”，该分会挂靠在解放军总医院。