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目的探讨核仁蛋白16(NOP16)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。 方法收集并比较癌症基因组图谱数据库(TCGA)中445例LUAD和54例正常肺组织样本NOP16 mRNA表达水平的差异,收集、验证并比较基因表达综合数据库(GEO)中226例LUAD和20例正常肺组织样本NOP16 mRNA表达水平的差异;采用Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis H检验比较不同临床病理特征的LUAD患者NOP16 mRNA表达水平的差异;通过Kaplan-Meier法评估NOP16在LUAD中的预后价值;采用基因集富集分析(GSEA)探讨NOP16在LUAD中可能参与的生物学通路;通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库评估NOP16 mRNA表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞(TIICs)的关系。 结果在LUAD中NOP16 mRNA表达水平明显高于正常肺组织(P<0.01),且不同临床分期、T分期、N分期的LUAD患者NOP16 mRNA表达水平均差异有统计学意义(均P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析表明NOP16 mRNA的高表达与LUAD患者的不良预后相关(P<0.05)。GSEA显示在NOP16高表达组,核糖体、DNA复制、错配修复、p53信号通路被显著富集(P<0.05,FDR<0.25)。在LUAD中,NOP16 mRNA表达水平与B细胞(r=-0.22)、CD4+ T细胞(r=-0.25)、CD8+ T细胞(r=-0.12)、中性粒细胞(r=-0.18)、巨噬细胞(r=-0.27)和树突状细胞(r=-0.25)的浸润丰度均呈负相关(均P<0.01)。 结论NOP16有望成为LUAD诊断和预后评估的生物标志物以及免疫治疗的新靶点。 相似文献
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目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2?FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得生物素标记蛋白,用链酶亲和素包裹的磁珠对生物素标记的蛋白进行富集,随后运用液相色谱?串联质谱(liquid chromatography?tandem mass spectrometry,LC?MS/MS)鉴定,并对数据进行生物信息学分析,筛选差异蛋白。结果:成功构建稳定高表达APEX2?FBL细胞系;Western blot结果显示,通过APEX2邻近标记技术获得大量生物素标记蛋白;质谱鉴定出837个差异蛋白,且生物学过程多与核仁相关。结论:利用邻近生物素标记技术结合质谱分析是一种可行的鉴定核仁相关蛋白的方法。 相似文献
3.
HCV NS5A反式调节蛋白13(HCV NS5A trans-regulated protein13,NS5ATP13)又称核螺旋体磷酸化蛋白1(nucleolar and coiled-body phosphoprotein1,NOLC1)或核仁磷酸化蛋白140(nucleolar phosphoprotein140,Nopp140), 相似文献
4.
利用核仁蛋白B23的单克隆抗体以及间接免疫荧光和蛋白质免疫印迹方法,研究了血清饥饿的NIH3T3成纤维细胞受血诱导重新进入增殖周期后,核仁蛋白B23含量的变化,以及有丝分裂期和间期NIH3T3细胞中B23蛋白含量的差异。结果发现,生长至汇合状态的细胞在无血清培养液中培养24h后,检测到的B23蛋白含量较低,加入10%小牛血清能够引起细胞内B23蛋白含量显著增加,而且在加入血清6h后就已发生。结果还 相似文献
5.
肿瘤病人T细胞核仁嗜银蛋白和辅助性T细胞亚群变化 总被引:6,自引:1,他引:6
目的 探讨肿瘤病人外周血单个核细胞 (PBMC)中T细胞核仁嗜银蛋白 (AgNORs)变化和辅助性T(Th)细胞亚群变化的关系及其临床意义。方法 PBMC经多克隆T细胞活化剂刺激 ,以图像分析法检测AgNORs区面积与细胞核仁面积的百分比 (I.S % ) ;PBMC被离子霉素和佛波醇酯活化 5h后 ,以酶联免疫斑点法 (ELISPOT)检测γ干扰素 (IFNγ)和白细胞介素 4(IL 4)产生细胞的频度( % ) ;以离子霉素加佛波醇酯刺激 2 4h ,用ELISA试剂盒检测培养上清液中的IFNγ 和IL 4水平。结果86例肿瘤病人和 44名正常人 ,PBMC中活化T细胞AgNORs表达分别为 ( 4 90± 1 2 0 )I S %和 ( 7 82±1 2 8)I S % ,肿瘤组下降非常显著 (P <0 0 5 ) ;肿瘤组PBMC中Th2细胞频度显著上升 ,Th/Th2比值显著下降 ;同时 ,肿瘤组PBMC产生IFNγ 和IL 4水平发生相应变化 ,变化方式与Th亚群变化相似 ;肺癌转移组与未转移组、复发组与未复发组相比 ,Th1细胞数、Th1/Th2之比和IFNγ 的产生下降非常显著 ;在肿瘤组AgNORs表达与Th1细胞频度、Th1/Th2比值、IFNγ 产生和肿瘤病人生活质量评分呈正相关。结论 肿瘤病人PBMC中T细胞表达AgNORs下降 ,与患者Th1细胞功能下降呈正相关。 相似文献
6.
背景与目的:口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是头颈部鳞状细胞癌中最普遍的亚型,其发病机制尚不清楚。核仁蛋白8(nucleolar protein 8,NOL8)作为RNA结合蛋白(RNA-binding protein,RBP),在多种肿瘤的发生、发展中发挥关键作用,但其在OSCC中的作用尚不清楚,本研究旨在探讨NOL8在OSCC中的表达水平,并研究其对OSCC细胞增殖、迁移、侵袭和上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的影响。方法:利用基因表达谱交互分析2(gene expression profiling interactive analysis 2,GEPIA2)、肿瘤免疫评估资源(tumor immune estimation resource,TIMER)、阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析(the University of Alabama at Birmingham cancer data analysis portal,UALCAN)及RNA相互作用数据库(the... 相似文献
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本实验选用SD雌性大鼠幼仔,出生第9日龄注射丙酸睾丸酮制作雄激素致不孕大鼠,第80日龄灌服补肾中药水溶液2周,第100日龄心脏灌注处死,采用光镜,透射电镜、银交染色法和新生物素-生物复合法,分别测量核体组成区嗜银蛋白,增殖前期细胞核仁抗原,观察肾上腺皮质的形态学变化。结果显示:在调节性腺轴动能过程中,包括了肾上腺的调整。补肾中药水溶液能够使增生的肾上腺网状带恢复正常;细胞内增多的脂滴数和核仁组成区 相似文献
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目的探讨乳腺癌组织中的核仁蛋白(PES1)、Ki-67蛋白表达与乳腺癌发生发展的关系。方法乳腺癌术后病理学标本及其癌旁组织标本85例,采用免疫组化染色技术检测两组标本中的PES1蛋白、Ki-67表达,按照乳腺癌病理学类型、组织学分级、临床分期、淋巴结转移情况进行分层分析。结果乳腺癌癌组织中的PES1蛋白、Ki-67蛋白阳性表达率分别为82.35%、64.71%,癌旁组织分别为37.65%、22.35%,两组比较差异有统计学意义(P0.05);乳腺癌组织中PES1蛋白、Ki-67蛋白表达无明显的相关关系(Spearman秩相关系数=0.175,P0.05);PES1蛋白在不同TNM分期、是否发生淋巴结转移的乳腺癌癌组织中表达差异有统计学意义(P0.05);Ki-67蛋白在不同组织学分级、是否发生淋巴结转移的乳腺癌癌组织中表达差异有统计学意义(P0.05)。结论 PES1、Ki-67表达对乳腺癌的发生及发展具有密切关系。 相似文献
9.
运用核仁蛋白组成区嗜银蛋白染色术检测了5例正常胎盘,1例合体细胞子宫内膜炎,22例葡萄胎,10例恶性葡萄胎,2例胎盘部位中间型滋养细胞肿瘤和19例绒癌,发现恶性滋养细胞肿瘤的AgNOR/核均数明显高于良性滋养细胞肿瘤(P<0.001),细胞滋养细胞中的AgNOR/核均数亦明显高于合体滋养细胞(P<0.001).同时发现良恶性滋养细胞肿瘤的AgNOR颗粒分布类型也不同,良性病变以弥漫型为主,而恶性病变以颗粒型为主,表明主要用于细胞遗传学的AgNOR技术在肿瘤病理学上有广泛的应用价值. 相似文献
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目的 探讨核仁蛋白9(NOL9)在肝癌中的表达和对肝癌细胞增殖的影响,进一步阐明NOL9在肝癌中表达上调的分子机制。方法 选择7例肝癌患者的手术标本(癌组织和癌旁组织),通过蛋白免疫印迹法和反转录-实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测NOL9在癌组织和癌旁组织中的表达水平;分别转染小干扰RNA(si-RNA)到肝癌Huh7和HCCLM3细胞,采用RT-qPCR、蛋白免疫印迹法、细胞集落形成实验、细胞计数试剂盒-8(CCK-8)分析差异;利用TCGA数据库肝癌数据评估NOL9 mRNA表达水平和启动子的甲基化水平,同时评估NOL9和DNA甲基异位擦除蛋白家族(TET1、TET2和TET3)转录水平的相关性;采用RT-qPCR和蛋白免疫印迹法检测DNA去甲基化试剂5-Aza-Dc处理后Huh7和HCCLM3细胞中NOL9表达水平的变化;5-Aza-Dc预处理后再转染si-RNA,采用细胞集落形成实验和CCK-8分析细胞增殖的差异。结果 NOL9在肝癌组织中表达上调;敲低NOL9能抑制肝癌Huh7和HCCLM3细胞增殖以及细胞集落形成(P均<0.01);肝癌中NOL9启动子甲基化与... 相似文献
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