LncRNAs作为ceRNAs在肺癌中的研究进展

长链非编码RNAs(Long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度在200~100000bp的非编码RNAs,蛋白编码能力缺乏或有限。近几年的研究表明,lncRNAs可通过竞争内源性RNAs(Competing endogenous RNAs,ceRNAs)的机制参与肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡,在肿瘤的发生发展中发挥重要的调控作用。而肺癌是发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,严重威胁人类健康和生命安全。因此本文就lncRNAs形成的ceRNAs网络调控机制在肺癌方面的研究进行简要综述,为肺癌的诊断及治疗提供依据。     

基于Apriori算法与网络药理学的藏医治疗肝胆疾病用药规律及机制分析＊

目的 挖掘藏医治疗肝胆疾病的用药规律，寻找核心药组，并预测核心药组的潜在靶点，以探讨核心药组治疗肝胆疾病的作用机制。方法 收集藏医药典籍中治疗肝胆疾病处方，采用SPSS软件进行Apriori算法关联规则分析得到藏医治疗肝胆疾病的核心药组。检索中药系统药理学分析平台（TCMSP）、Therapeutic Target Database （TTD）、Genecards、Metascape等数据库进行基因本体（GO）和KEGG富集分析。结果 共纳入607首方剂，数据挖掘得到藏医治疗肝胆疾病的核心药组为蒂达-洪连-波棱瓜子。收集到核心药组56个活性成分，作用于47个关键靶点，预测出1194条生物过程、49个细胞组成、54个分子功能以及226条信号通路。结论 藏医在治疗肝胆疾病中主要以“清赤巴热”为核心，所使用方剂中的药物多以苦味为主；核心药组治疗肝胆疾病可能是通过缓解体内氧化应激、降低炎症表达以及调节胆汁酸肝肠循环等作用机制。     

髓母细胞瘤调强放疗计划中AAA算法与PBC算法的对比研究

目的比较瓦里安Eclipse治疗计划系统中的PBC算法和AAA算法在儿童颅内髓母细胞瘤的逆向调强放射治疗中的剂量学差异。方法随机选取15例术后和行全中枢放疗后的髓母细胞瘤患者,分别采用PBC算法和AAA算法设计调强放射治疗技术,并比较两种算法获得的靶区的剂量分布,包括靶区均匀指数HI、靶区适形指数CI、靶区最大剂量、靶区最小剂量、靶区平均剂量以及危及器官包括脑干、垂体、晶体、视神经的受照剂量的差异。结果 PTVmin、V95,脑干max、脑干mean和左视神经max在PBC与AAA两种算法中差异无统计学意义(P≥0.05);PTVmax、PTVmean,靶区适形指数CI、靶区均匀指数HI,其它危及器官以及机器输出量MU两种算法差异有统计学意义(P 0.05)。结论 PBC算法比AAA算法中能够更好地满足临床要求,对髓母细胞瘤患者在进行术后和全中枢二维普通放疗后期进行的调强放疗计划设计时推荐选用PBC算法。     

基于数据挖掘的中医药治疗新型冠状病毒肺炎用药规律研究

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情发展迅速,危害严重,目前尚无特效药,而中医药在此疫情中发挥了积极的作用。该研究通过收集国家、各省、自治区和直辖市发布的诊疗方案,及中国知网、万方、维普三大数据库相关文献报道,全面系统整理现代中医治疗COVID-19的处方,并通过中医传承辅助平台V2.5,确定处方中用药的四气、五味、归经、使用频次、药物之间的关联规则及形成的新处方等。最终纳入有效处方96首,其中四气主要集中在温、寒、平,五味主要集中在苦、辛、甘,归经主要集中在肺、胃、脾经;使用高频次药物为甘草、杏仁、生石膏等;高频次药物组合为生石膏-杏仁,生石膏-甘草,甘草-杏仁等;核心组合有葶苈子-杏仁-生石膏,藿香-生姜-厚朴,麦冬-杏仁-黄芩等;形成新处方葶苈子、杏仁、生石膏、藿香、生姜、厚朴,麦冬、杏仁、黄芩、五味子、西洋参等。从药性到高频药物及新处方可以看出,我国现代中医治疗COVID-19的整体治则为扶正祛邪,兼顾气阴。     

基于3种数据挖掘模型分析16 618例含附子中成药的处方用药规律

目的:通过数据挖掘分析某院含附子的中成药处方,从中医辨证论治的角度分析该类中成药的临床用药特征规律,探究数据挖掘在中医药处方分析中的应用前景。方法:抽取2017年11月至2018年10月某院门诊含附子成分的中成药处方,从患者基本情况、中医疾病、中医证候等方面回顾分析该类中成药的临床使用情况,采用Microsoft Office Excel 2016进行基本统计,并结合Microsoft SQL Server Analysis Services 2012的3种数据挖掘算法解析处方用药特征。结果:某院使用含附子中成药共8种,14岁以下患者用该类药最多,其中小儿肺咳颗粒用量最大,中医疾病多为咳嗽、感冒、咳喘,中医证型多为寒热错杂证、风痰证、外感风邪。温补肾阳的中成药处方包含金匱肾气丸、龙鹿胶囊、尪痹胶囊、桂附地黄丸,中医疾病多为痹症、眩晕、虚劳等,证型主要为肝肾不足、肾虚血瘀、脾肾不足。决策树分析显示使用含附子的中成药处方具有年龄分布特点,其中中医疾病及证型为主要决策点;聚类分析根据该类处方患者年龄、性别、中西医诊断、中医证型将中成药处方分为10类;关联性分析显示小儿肺咳颗粒联用情况最多,但关联度不高,金匱肾气丸、芪苈强心胶囊、龙鹿胶囊和尪痹胶囊有各自的强关联用药。结论:数据挖掘算法纳入多因素分析临床处方的应用更接近中医临床辩证论治思维,结合基础统计可知某院含附子的处方整体用药符合中医辨证论治的特点。     

不同证型高血压肾病中药组方的用药规律

目的探讨不同证型高血压肾病中药组方的用药规律。方法随机抽取2年内肾病科门诊高血压中药处方共1 209张,复杂网络结合BK算法挖掘其核心处方。结果发现4种主要证型(脾肾两虚、脾虚血瘀、肝肾阴虚、脾虚湿热),其核心处方中各有10种药味。结论数据挖掘可用于分析中药组方规律,本研究所得核心处方为高血压肾病的治疗提供了参考。     

基于动态时间规整算法的药用植物叶片识别方法

通过动态时间规整算法实现在没有训练集的情况下,对比药用植物叶片进行药用植物的识别与鉴定。该方法较机器学习模式实现更加简单,可以应用在基础的药用植物分类学习过程中,具有较高的实际应用价值。     

真实世界中银杏叶滴丸治疗冠心病与脑梗死的合并用药方案研究＊

在真实世界中应用银杏叶滴丸治疗冠心病、脑梗死的基础上，对其合并用药信息采用社区发现算法（Louvain算法）进行复杂网络分析，挖掘其合并用药规律。在冠心病的临床用药方面，银杏叶滴丸常合并应用的西药主要有阿司匹林、氯吡格雷、阿托伐他汀、氨氯地平、单硝酸异山梨酯等，合并应用的中药以注射用灯盏花素、注射用丹参多酚酸盐为主；其合并用药组合主要有阿司匹林 + 单硝酸异山梨酯/阿托伐他汀/氨氯地平/曲美他嗪、氯吡格雷 + 注射用丹参多酚酸盐/匹伐他汀/氨氯地平/阿托伐他汀、阿托伐他汀 + 氨氯地平。在脑梗死的联合用药方面，银杏叶滴丸常合并应用的西药主要有阿司匹林、阿托伐他汀、氨氯地平、氯吡格雷、硝苯地平等，合并应用的中药以注射用灯盏花素、疏血通注射液为主；其联合用药组合主要有阿司匹林 + 氨氯地平/阿托伐他汀/疏血通注射液/硝苯地平、阿托伐他汀 + 氯吡格雷/氨氯地平、注射用灯盏花素 + 阿司匹林/奥拉西坦。本研究中的数据来源于真实世界，对临床医生的诊疗具有一定的参考意义。     

基于真实世界中刺五加注射液应用于心血管病的复杂网络分析＊

为分析真实世界刺五加注射液治疗心管病的联合用药治疗方案，提取全国19家三甲医院信息系统（HIS）数据库中使用刺五加注射液治疗心血管疾病患者的一般信息、中西医诊断信息、医嘱记录，采用Tabu算法挖掘不同子结构之间的关系，并用复杂网络分析将结果可视化。全国19家医院5904例患者纳入分析，优效人群为2595，占44%。刺五加注射液治疗心血管疾病常与西药的抗心绞痛药、抗心律失常药、心血管扩张药、抗血栓药、降血脂药及中药祛瘀剂联合应用，使用频次最高的是单硝酸异山梨酯和中药的速效救心丸。优效人群的联合用药方案中不仅有对症治疗，还有针对基础病的用药，在临床中取得较为理想的疗效。通过对不同子结构之间关系的深入分析，可以为联合用药以及研发用药提供支持和借鉴。     

肺腺癌竞争内源性RNA网络的综合分析:基于肿瘤基因组图谱数据库

目的:基于肿瘤基因组图谱数据库（TCGA）架构肺腺癌（LUAD）竞争内源性RNA（ceRNA）网络，鉴定潜在的生存关联性生物标志物，并确定特异性治疗的小分子药物。方法:依据纳入研究标准，利用Edger软件筛选LUAD组织与正常组织(mRNA、lncRNA和miRNA)差异表达的基因。通过miRcode、miRDB、TargetScan和miRanda数据库对差异表达的RNA之间的关系进行分析，构建ceRNA网络。采用Kaplan-Meier方法分析ceRNA网络中的RNA表达量与生存预后的关系，通过富集分析对网络中的mRNA基因功能和调控通路进行分析。通过Cmap数据库筛选治疗LUAD的特异性小分子药物。利用D-lnc软件确定与关键的lncRNA相关的特异性小分子药物。结果:mRNAs(ELAVL2和PBK)、miRNAs(miR-13和miR-210)和lncRNAs(AP002478.1、DSCAM-AS1、LINC00269、LINC00470和LINC00483)与总生存期(OS)关系密切。喜树碱和甲萘醌有可能逆转LUAD的状态。卡铂、多西紫杉醇、帕比司他被确定为与关键lncRNA密切相关的药物。结论:ceRNA网络在LUAD中发挥重要作用，多种差异表达RNA与LUAD预后相关，可能成为潜在的肿瘤诊断标志物和治疗靶点。