通过宏基因组学研究肠道微生物对结直肠癌患者影响的最新进展

人类肠道微生物已越来越受到医学界的广泛关注,人类肠道微生物不仅在人类健康方面,而且在人类疾病的发生和发展方面都有很大的作用。人们不断发现微生物与癌症之间的联系,特别是肠道微生物群和肠道肿瘤之间的联系。宏基因组学作为微生物研究的一种重要研究方法,在微生物与结直肠癌研究中发挥越来越重要的作用。近年来,通过宏基因组学研究肠道微生物菌群的变化为结直肠癌的发生和发展提供了新的见解,并且强调了癌症微生物群中宿主-微生物和微生物间相互作用的重要性。本综述回顾了通过宏基因组学研究肠道微生物与结直肠癌之间的关系,希望为癌症预防、诊断和治疗提供新的机会。     

布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析

目的 探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法 采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank 上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3 286 167 bp, 预测3 371个基因,GC含量57.25%。通过注释COG库,对应基因有2 560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2 544个基因,共参与33类代谢通路。结果 综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关。结论 通过分析发现, A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因。本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路。     

冠心病血瘀证基因组学研究进展＊

目的 系统综述冠心病血瘀证基因组学研究的方法和内容。方法 计算机检索Medline、Cochrane Central Register of Controlled Trials、中国知网、万方数据库，查找冠心病血瘀证基因组学的临床研究，按照制定的纳入排除标准，由2名研究人员独立筛选文献，任何分歧通过协商一致或通过第3名研究人员来解决。结果 最终纳入34项研究，其中与冠心病血瘀证密切相关的基因组学研究类型包括基因多态性、差异基因的表达、基因的甲基化修饰，涉及的生物学功能有血管内皮损伤、血液流变学改变、炎症反应与免疫调节、血管平滑肌增殖、血脂水平等，采用的技术方法有聚合酶链式反应（Polymerase chain reaction，PCR）、飞行时间质谱技术（Time-of-flight mass spectrometry，TOF-MS）、基因芯片杂交测序（Gene Chip）等。结论 基因组学研究可阐明冠心病血瘀证的生物学基础，为冠心病血瘀证的病机演变提供更好的依据，更有助于从分子水平实现个体化治疗，从而进一步提高临床疗效。     

不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析

目的: 分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法: 将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库，利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析，并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果： 肺泡灌洗液病毒群落组成中，指环病毒科占主体地位（19.4%），其次为圆环病毒科（11.0%），藻去氧核糖核酸病毒科（11.0%），人类内源性递转录病毒科（10.2%），痘病毒科（4.9%），逆转录病毒科（3.2%），帚状病毒科（2.3%），小RNA病毒科（0.6%）；并发现了4株序列较长的细环病毒，根据细环病毒开放阅读框1进行系统进化分析，显示其与已知的细环病毒在核酸水平上有一定的差异。通过对细环病毒及鼻病毒阳性样本的筛选，发现细环病毒阳性率为11.3%，鼻病毒阳性率为10.0%。结论： 应用病毒宏基因组学技术成功解析出不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落组成，病毒群落中指环病毒科占比最高，其中细环病毒因发热导致的炎性环境以及患者免疫力低下而大量增殖。     

阴虚体质理论与科学实证

阴虚体质以虚热表现为特征,在偏颇体质中位列第4。从形成原因、生理及心理特征、在人群中的分布规律、发病倾向、调体方药等方面,结合近10年来在阴虚体质方面的研究成果作为实证依据,对阴虚体质的理论进行梳理。发现了阴虚体质研究中的优势与不足,为进一步开展阴虚体质相关研究提供参考。     

泰勒斯的思索

正2020年7月16日,《新英格兰医学杂志》(NEJM)发表了替格瑞洛和阿司匹林治疗急性缺血性卒中或TIA预防卒中和死亡(Acute Stroke or Transient Ischaemic Attack Treated With Ticagrelor and ASA for Prevention of Stroke and Death,THALES)试验的结果(图1)。作为氯吡格雷用于急性非致残性脑血管事件高危人群(Clopidogrel in High-risk Patients with Acute Non-     

2018年系统性红斑狼疮研究新进展

【摘要】 系统性红斑狼疮是一种主要累及中青年女性的复杂自身免疫疾病，临床表现多样，发病机制复杂。对于系统性红斑狼疮的研究一直是国内外自身免疫疾病领域的热点，本文主要综述2018年系统性红斑狼疮的基因组学与临床研究取得的新成果和进展。     

宏基因组学测序诊断曼氏裂头蚴病1例

患者于2000年无明显诱因发现下腹部游走性包块，20年来多次就诊，未明确病因。2020年8月11日发现包块游走于左侧腋前，微创手术取出不完整白色虫体3段，用宏基因组学测序鉴定虫体，明确诊断为曼氏裂头蚴病。2021年10月21日经手术取出完整虫体，患者康复出院；随访患者身体状况良好，全身未发现新包块。     

变形链球菌基因组研究进展

随着人类基因组计划的完成,基因组学已运用于口腔医学研究,主要表现在对口腔致病微生物的基因组学研究.龋病是口腔的常见病多发病,变形链球菌是其主要致病菌,本文就变形链球菌的基因组研究进展作一综述.     

新生儿人双埃柯病毒的检测及遗传特性分析

目的: 了解人双埃柯病毒（human parechovirus,HPeV）在新生儿中的流行情况。方法：采集新生儿血液、粪便及鼻咽分泌物样本各95份,共计285份样本。将其中45份新生儿粪便样本分为5组,利用病毒宏基因组学方法进行文库构建,再经高通量测序检测HPeV。通过Geneious软件拼接获取HPeV全基因组,并对该毒株进行遗传特性解析。依据HPeV衣壳蛋白序列设计巢氏PCR引物,利用巢氏PCR对285份样本进行流行病学调查。结果：5个文库分别检测出248 534、277 432、398 756、475 408、130 634条病毒序列,将原始数据上传至NCBI 序列读长档案（sequence read archive,SRA）数据库;在文库newbornfeces41获得一株HPeV全基因组,经鉴定属于HPeV-1,重组分析显示该毒株由HPeV-1和HPeV-5重组产生,命名为newborn_zjlh;HPeV流行病学调查显示6份粪便样本阳性,血液及鼻咽分泌物样本检测均为阴性。结论：本研究显示HPeV可在新生儿中流行,主要是肠道感染。