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1.
目的:调查从中国病人血清中分离的戊型肝炎美丽(HEV)基因型。方法:应用聚合酶链反应法(PCR)和直接测序法对从中国14个城市检测到的45株HEV开放读码框架2(ORF2)的部分基因序列(nt6461-6860及nt5994-6294)进行分析。结果:45株HEV中,41株(91%)与缅甸株属同一个基因型,与中国代表株HEV核苷酸序列的同源性均在98%以上。仅4株与3个HEV原型株差异较大,与缅甸株/中国株同源性为77%-80%,与墨西哥株的同源性为74%-76%,与新发现的美国株/猪(US/Swine)HEV的同源性为74%-77%;基因进化树分析表明,该4株HEV可能为一新基因型的2个不同亚型,它们与原型墨西哥株、缅甸株和美国株/猪HEV明显不同。结论:中国戊型肝炎患中,多数国原型株HEV,仅少数感染新基因型HEV。  相似文献
2.
2009年新型甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析   总被引:10,自引:2,他引:8       下载免费PDF全文
目的:探讨2009年新型甲(A)型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因与世界各地不同年代分离的A/H1N1代表株HA基因的进化关系。方法:从NCBI数据库下载2009年新型A/H1N1亚型流感病毒的HA基因序列以及以往流行的人、猪和禽的A/H1N1亚型流感病毒参考序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA4.0)软件进行序列比对和构建系统进化树,并分别比较2009年新型甲型H1N1流感病毒HA基因与北美地区、欧洲地区、亚洲地区A/H1N1流感病毒HA基因编码蛋白的氨基酸序列。结果:不同时期人A/H1N1亚型流感病毒代表株HA基因进化分析显示:2009年新型A/H1N1流感病毒HA基因与1976~2007年北美地区分离的7株人A/H1N1亚型流感病毒具有较高的同源性,与欧洲和亚洲地区的同源性较低。不同种属间A/H1N1亚型流感病毒HA基因进化分析显示:2009年新型A/H1N1流感病毒HA基因与1998和2007年北美地区分离的A/H1N1猪流感病毒的HA基因进化关系较近,与欧洲及亚洲地区分离的A/H1N1猪流感病毒及A/H1N1禽流感病毒进化关系较远。氨基酸比对结果显示2009年新型A/H1N1流感病毒HA基因的重要抗原位点与北美地区分离的A/H1N1猪流感病毒相近,与欧洲和亚洲地区分离的A/H1N1猪流感病毒及人类流感病毒疫苗株相比变化较大。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒HA基因可能是北美地区甲型H1N1猪流感病毒长期进化并与该地区人A/H1N1流感病毒部分基因片段重排的结果,对人H1N1甲型流感病毒疫苗可能并不敏感。  相似文献
3.
热休克蛋白的研究进展   总被引:8,自引:0,他引:8  
热休克蛋白(HSP).又称应激蛋白(SP)是当增高的热度、病原体、细胞因子(IL-1、IL-2等)、理化有害因素刺激伤害生物细胞时(包括原核细胞及真核细胞),激活HSP基因,编码合成的一类生物进化上最保守的蛋白。此蛋白与一些基本的细胞功能有关,如蛋白转运、折叠和装配.因此也被称作“分子伴侣”(moleeular chaperone).由于HSP具有特殊的生物学特性,已引起众多国家研究的兴趣和重视.成为当今热门研究课题之一。  相似文献
4.
目的:探讨2009年新型甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因的进化及NA基因编码蛋白抗原性、酶活性位点、糖基化位点变异情况。方法:从NCBI基因库检索获得43株不同年代不同地域甲型流感病毒NA基因序列,用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA 4.0)软件进行基因进化分析和氨基酸序列分析。结果:2009年新型甲型H1N1流感病毒与禽H5N1流感病毒NA基因的同源性达到85%,潜在抗原位点氨基酸分布相同;所有毒株的酶活性中心位点高度保守,但糖基化位点有变异。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA基因可能来源于禽H5N1流感病毒;神经氨酸酶抑制剂治疗有效。  相似文献
5.
家蝇乙酰胆碱酯酶基因的克隆与序列分析   总被引:7,自引:0,他引:7  
目的克隆家蝇Ace基因并进行表达,并对家蝇AChE序列进行分析,为利用基因工程进行酶改造提供必要的参考. 方法结合已有的文献资料,利用生物信息学方法对家蝇AChE的序列进行分析,包括密码子偏爱性、系统发生、三维结构预测等. 结果成功克隆家蝇Ace基因,并利用同源模建方法获得了家蝇AChE的三维结构,以果蝇AChE为参考,判断了家蝇AChE应属于AChE 2家族. 结论根据所得家蝇AChE的三维模型从理论上分析了因AChE中一个氨基酸突变导致家蝇产生有机磷抗性的可能原因,并为半理性改造家蝇乙酰胆碱酯酶提供了三维模型.  相似文献
6.
2009年新型甲型H1N1流感病毒全基因组序列重组分析   总被引:6,自引:2,他引:4       下载免费PDF全文
目的:分析2009年流行的新型甲型流感病毒(A/H1N1)全序列的基因重组现象。方法:从NCBI基因数据库下载2009年新型甲型流感病毒(A/H1N1)全基因组序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA 4.0)软件对8条基因序列进行拼接和比对,分析2009年爆发株与历史流行株序列间的同源性;同时采用Simplot 3.5.1软件分析新型流感病毒A/H1N1基因重组现象。结果:2009年3月以来爆发的新型A/H1N1病毒株聚合酶B1(polymerase B1,PB1)基因来自于人H3N2,其同源性为93.7%;聚合酶B2 (polymerase B2,PB2)和聚合酶A (polymerase A,PA)与禽H5N1同源性较高,同源性分别为89.0%、89.9%;血凝素(hemagglutinin,HA)、核蛋白(nucleoprotein,NP)和非结构蛋白(non-structural protein,NS)与北美地区猪H1N1同源性较高,同源性分别为91.7%、93.1%和93.1%;神经氨酸酶(neuraminidase,NA)和基质蛋白(matrix protein,MP)与欧洲地区猪H1N1同源性较高,同源性分别为90.5%、95.5%。全基因序列同源性分析发现2009年新型A/H1N1病毒与北美地区猪H1N1病毒同源性最高,为83.9%。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒可能是人H3N2、北美地区猪H1N1、欧洲地区猪H1N1、禽H5N1的基因重排病毒。  相似文献
7.
SARS病毒基因及蛋白系统分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
目的:分析比较SARS病毒与冠状病毒科中病毒基因和蛋白的同源性。方法:利用互联网、分子生物学软件对SARS病毒与冠状病毒科中病毒基因和蛋白同源性分析,构建蛋白进化树。结果:SARS病毒在某些区域基因序列与冠状病毒存在相当大的差异,具有自身比较保守的基因组序列结构。SARS病毒的三个结构蛋白(S、M和N)中与同科其他病毒存在很高的同源性;不同地域SARS病毒的基因序列存在差异。结论:SARS病毒不是其他冠状病毒的变异体,而是一种与冠状病毒类似,可能早已经独立存在,此前未被人类所认识的新病毒。  相似文献
8.
脑苷脂类化合物是一类广泛存在于菌类、植物类、动物类及海洋生物组织细胞膜中含量很低的内源性生物活性物质。本文就近年来发现的脑苷脂类化合物的化学结构特点与生物进化相关性、脑苷脂类的生物合成与体内转化、生物活性与药理作用、应用前景等方面的研究进行综述和展望,为此类活性成分的深入研究提供参考。  相似文献
9.
小鼠peroxiredoxin基因家族的生物信息学分析   总被引:4,自引:1,他引:3  
目的分析小鼠peroxiredoxin基因家族的基因组结构和进化.方法利用已经公布的小鼠基因组数据库,采用BLAST程序检索该基因家族各成员的编码基因和假基因,并利用Cluster W软件进行序列联配,绘制其分子进化树.结果分析表明该家族半数成员具有多个假基因序列,为返转座类型假基因.这些假基因的形成时间有先后,所具有返转座假基因的典型结构也各不相同.分析该家族的进化表明PrxⅠ-Ⅳ有共同的祖先,归为一个亚类,而PrxⅤ和Ⅵ与前者的相似性较差,归为另一个亚类.结论该家族每个成员长期进化所形成的多样性提示其功能具有独特性.  相似文献
10.
甲基化遁逸与保守氨基酸的进化   总被引:4,自引:3,他引:1  
甲基化造成的大量C→T转换,为进化提供了源源不断的突变,而同时其所编码的氨基酸则逐渐丧失了遗传上的保守性。与此相反,由G至A的原发性转换可能甚少,相应密码子所对应的氨基酸则相对稳定,从而使可避免甲基化的GDN和DGN三联密码成为保守氨基酸进化的必要条件。  相似文献
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