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1.
目的对蒙药复方协日嘎-4进行网络药理学研究,探索其治疗前列腺增生、前列腺癌等疾病的活性成分和作用靶点,运用计算机网络药理学技术对协日嘎-4所含化学成分的作用机制进行分析。方法通过中国知网,万方数据库等数据库筛选蒙药复方协日嘎-4所含化合物信息,通过Pubmed、Super Target、Drug Bank、TTD(Therapeutic Targets Database)等数据库收集蒙药协日嘎-4中化学成分对应的靶点,通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、IPA(Ingenuity Pathway Analysis)等数据库收集相关信号通路,采用Cytoscape软件建立多成分-多靶点和多成分-多靶点-多疾病网络模型。结果药物与靶点之间存在的相关性为潜在靶点的探索提供了一条新途径。筛选结果显示蒙药复方协日嘎-4中有33种化合物与12种生物靶标存在网络交互作用,他们之间的相关性,揭示了网络药理学"多成分""多靶点"的特征。同时化合物与靶点连接最终共同作用于疾病即良性前列腺增生和前列腺癌,建立了蒙药复方协日嘎-4化学成分-靶点-疾病网络模型。通过数据库筛选得到两条主要信号通路,雄激素受体(AR)信号通路和Wnt/β-连环蛋白(Wnt/β-catenin)信号通路。结论本文建立了一条"疾病-靶点-药物"的蒙药复方网络药理学的研究模式,为蒙药的研究和发展提供了新的思路和方法。  相似文献
2.
目的:基于网络药理学筛选中药葛根抗高脂蛋白血症的活性成分,预测葛根抗高脂蛋白血症的潜在作用靶点及信号通路,探讨其作用机制.方法:采用TCM数据库收集葛根的化学成分;采用Drugbank数据库基于结构相似性原理,筛选与葛根药效分子结构相似的药物,并预测其作用靶点;采用OMIM数据库筛选高脂蛋白血症的相关蛋白.借助STRING数据库和Cytoscape 3.6.0软件构建疾病蛋白-靶点网络、药物活性成分-靶点-疾病蛋白网络.通过网络拓扑分析和聚类分析法预测葛根治疗高脂蛋白血症的关键蛋白.通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)对靶点进行通路富集分析,预测葛根抗高脂蛋白血症的关键信号通路.结果:葛根抗高脂蛋白血症的主要活性成分有7种,即4-甲氧基葛根素、黄豆苷、大豆黄素4'-7二葡萄糖苷、蝙蝠葛碱、γ-谷甾醇和甲基对羟基肉桂.葛根治疗高血蛋白脂症有20个潜在作用靶点,即酪氨酸蛋白激酶(Src)、核因子κB(NF-κB)、过氧化物体增殖物激活受体(PPARs)、雌激素受体α(Esr1)、芳香烃受体(AHR)、载脂蛋白A(APOAⅠ、APOAⅡ、APOAⅤ)、载脂蛋白B(APOB)、载脂蛋白C(APOCⅠ、APOCⅡ)、载脂蛋白E(APOE)、低密度脂蛋白受体(LDLR)、脂蛋白脂肪酶(LPL)、三磷酸腺苷结合盒转运蛋白A1(ABCA1)、溶血磷脂酸(LPA)、糖基磷脂酰肌醇高密度脂蛋白结合蛋白1(GPIHBP1)、纤维蛋白原A(FGA)、细胞色素P450(Cyp158A2)和雄激素受体(AR).KEGG通路有8条,主要是PPAR信号转导通路.结论:采用网络药理学筛选出葛根治疗高脂蛋白血症的7种可能的药效分子,通过活性成分-靶点-疾病网络特征分析,得到20个潜在治疗靶点和8条相关通路,借此预测葛根可能通过PPARs、AR、LDLR等受体和相关蛋白调节胆固醇、甘油三酯和低密度脂蛋白(LDL)的代谢,以发挥抗高脂蛋白血症的作用.  相似文献
3.
目的 阐明冠心七味片的药效物质,探索其药效成分的潜在靶点.方法 采用融合了口服可利用度预测、类药性评估、主成分分析、分子对接模拟,以及药效分子-靶点-疾病网络分析等方法为一体的网络药理学模型,研究冠心七味片所含中药组分和靶点间的相互作用.结果 冠心七味片的18个主要药效分子与治疗冠心病的41个靶点其有高网络度,且与分子对接计算得出的18个潜在靶点具有较强的结合能.筛选出的7个冠心七味片关键靶点与冠心病的治疗密切相关.结论 筛选出冠心七味片中18个可能的药效分子和7个关键作用靶点,初步阐明了冠心七味片多成分、多靶点、协同作用的分子机制.  相似文献
4.
目的 从系统水平研究石菖蒲治疗神经退行性疾病的有效成分和作用机制.方法 采用计算机网络药理学方法,从中药系统药理学数据库中筛选石菖蒲治疗神经退行性疾病的活性成分,并构建药物-靶标-疾病网络.结果 通过网络药理学方法筛选出石菖蒲活性成分20种,显示该中药化学成分和作用靶点与阿尔茨海默病、抑郁症和帕金森综合征等神经退行性疾病之间存在一定的联系.结论 通过网络药理学方法构建的石菖蒲网络可以将该中药化学成分的聚类、差异以及有效成分与相关靶标及疾病的复杂分子作用机制可视化.  相似文献
5.
[目的]探讨临床常用药对苦参与蛇床子治疗皮肤瘙痒的协同作用机制.[方法]基于网络药理学方法对苦参与蛇床子进行靶标预测与分析,建立中药—化合物骨架—靶标网络,揭示瘙痒治疗靶标、 预测靶标、 中药及其化学组分之间的相互作用关系.复制脂多糖(LPS)诱导的小鼠巨噬细胞RAW264.7炎症反应模型,观察苦参和蛇床子的协同抗炎作用.[结果]苦参与蛇床子可能协同作用于组胺受体、 大麻受体以及蛋白激活受体等瘙痒治疗靶标.苦参与蛇床子可能通过共同调控炎症相关通路(TLR信号通路、 趋化因子信号、FcεRI信号通路)与神经相关通路(神经营养因子信号通路)抑制瘙痒.通过活性研究发现,苦参中的黄酮部位与蛇床子中的香豆素部位存在显著的协同抗炎活性(P<0.05),表明这两组分可能在抑制炎症诱导的瘙痒过程中起到重要的作用.[结论]该方法可阐明苦参和蛇床子药对抗瘙痒作用的分子机制,对探索中药现代化和新药发现有重要意义.  相似文献
6.
  目的:探索骨关节炎(OA)治疗中药的核心配伍及其可能作用机制。  方法:检索中国生物医学文献数据库中治疗OA的中药复方,采用Access 2003建立药物数据库,运用复杂网络方法建立药物配伍网络,以网络相对中心度较高的前5味药作为治疗OA的核心配伍。查找中药主要有效成分的人类活性靶蛋白和OA相关基因,采用通路分析软件(IPA)分析平台对中药及OA分子网络进行整合分析。  结果:共纳入复方208首,牛膝、当归、甘草、杜仲和白芍构成核心配伍;去重后的靶蛋白共97个,OA相关基因365个。相关度评分较高的OA和中药分子网络功能均涉及结缔组织、骨骼和肌肉疾病、炎症和代谢性疾病。网络整合分析显示:TP53、PTPN1、RELA、DNMT1、NFκB1和VDR是OA和中药分子网络共同直接作用的分子;OA基因相关经典通路中,与中药靶蛋白相关度较高的通路有28条细胞免疫通路、17条凋亡通路、11条细胞生长与增殖通路。  结论:中药核心配伍从机体免疫、凋亡、细胞增殖、代谢等多个方面综合发挥对OA的治疗作用。  相似文献
7.
网络分析技术是网络药理学研究中的核心技术,通过整合多种学科理论技术对网络药理学研究中相关的分子网络进行多角度多层次的信息挖掘,以准确、客观地查询出能够产生特定药理作用的成分或成分组合、药物或药物组合,以及具有特定生理功能的关键节点、模块等,从而为新药研发、药物作用机制揭示、疾病机制阐释、生物标志物指明等提供有指导价值的信息,尤其对于以阿尔茨海默病为代表的复杂性疾病研究意义更加突出。本文对近年来网络药理学研究中常用的网络分析技术进行了综述。  相似文献
8.
网络构建技术是网络药理学研究中的基础技术,也是核心技术。通过整合来源于实验、数据库和计算预测等的包含药物、疾病及生物分子等在内的用于网络构建的相关数据,采用复杂网络构建技术进行药物作用相关、疾病相关和生物分子相关的网络模型构建,尤其对于以阿尔茨海默病为代表的复杂疾病分子网络的构建,为进一步重要靶标的辨识、发病机制和药物作用机制的阐释、指导药物开发,以及药物重定位等打下基础。本文就网络药理学研究相关的药物组网络、疾病组网络和分子相互作用组网络等的构建及其可视化技术进行综述。  相似文献
9.
目的 挖掘天麻钩藤饮治疗高血压疾病的潜在作用靶标,为进一步研究该方治疗高血压疾病的机制提供思路.方法 构建天麻钩藤饮的数据库;构建基于疾病的靶标-靶标网络,通过网络分析方法关键靶标,并在此基础上构建相应的化学成分-靶标-疾病核心网络.结果 该复方对肿瘤、循环系统和精神行为障碍等疾病具有潜在的治疗作用;网络挖掘分析得到COX-2和ADRB2两个关键靶标,在此基础上构建了天麻钩藤饮化学成分-靶标-疾病核心网络.结论 网络分析方法有助于挖掘天麻钩藤饮治疗高血压疾病的潜在作用靶标,为深入研究其作用机制提供参考.  相似文献
10.
缺血性脑卒中严重危害人类健康,给社会、家庭带来沉重负担.长期以来,在传统药物及现有的治疗手段上,难以达到满意的疗效.神经血管单元[1]将缺血后脑保护的目标从过去单一的神经保护提升到对神经细胞、血管等整体结构式的保护.  相似文献
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