前列腺癌易感位点rs2252004的eQTL和meQTL研究

目的：全基因组关联性研究（GWAS）发现rs2252004与前列腺癌的易感性相关,本研究拟进一步探讨rs2252004参与前列腺癌发生的可能分子生物学机制。方法：运用TCGA公共数据库中的基因型、甲基化、基因表达数据,采用线性回归分析rs2252004基因型与其上下游1 Mb区域CpG位点的甲基化水平及相关基因表达的关联性。结果：rs2252004与FGFR2基因上的3个CpG位点的甲基化水平显著相关（cg25294906,P=0.031;cg03552039,P=0.042;cg16499947,P=0.049）。而FGFR2在50例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中表达差异有统计学意义（P=9.3×10-11）。与GG基因型相比,rs2252004 GT基因型的前列腺癌患者的FGFR2基因表达量显著降低（P=0.007）。此外,GT/TT基因型与GG基因型患者的FGFR2表达量差异有统计学意义（P=0.006）。结论：rs2252004可能通过影响FGFR2甲基化水平,进而调控FGFR2基因的表达,从而参与前列腺癌的发生。     

GSTP1基因表达及甲基化与前列腺癌复发风险研究

目的探究谷胱苷肽S转移酶P1(glutathione S transferase pi,GSTP1)基因表达及甲基化水平与前列腺癌复发风险的关系。方法利用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库,分析前列腺癌组织中GSTP1基因表达及甲基化水平,采用t检验、单因素及多因素logistic回归探讨GSTP1基因与前列腺癌复发的关联性。结果前列腺癌GSTP1基因表达量与前列腺癌的复发显著相关,校正后的相对危险度(odds ratio,OR)为0.63,P=0.039;此外,相对于非复发组,GSTP1基因启动子区有5个CpG位点在复发组中均呈现高甲基化状态,且能显著增加前列腺癌复发风险。结论 GSTP1基因表达与前列腺癌复发显著相关,可能是通过GSTP1启动子区CpG位点的高甲基化进而减低GSTP1基因的表达,从而影响前列腺癌的复发。