结直肠癌中差异性表达的外泌体lncRNA功能富集及通路分析

  目的  通过探讨差异性表达的外泌体lncRNA及其调控的信号通路在结直肠癌发生、发展中的作用,以期为结直肠癌的诊断和治疗提供新的靶点。  方法  使用R软件线性回归模型软件包limma包进行差异表达分析,根据筛选阈值得到显著差异表达的lncRNA和mRNA;通过计算差异表达lncRNA与mRNA皮尔逊相关性系数,获得其之间协同表达关系,通过相关系数筛选存在正向协同表达的lncRNA-mRNA关系对;分别对lncRNA的协同表达mRNA进行GO功能和KEGG通路富集分析,以间接预测lncRNA的功能。  结果  在32例健康志愿者和12例结直肠癌患者中筛选出差异性表达的外泌体lncRNA共202个、mRNA共1 014个。验证出差异性表达的lncRNA-mRNA关系对10个。对lncRNA协同表达的mRNA进行功能富集显示,差异性表达的外泌体lncRNA可能与B细胞受体信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、抗原处理与呈递信号通路和NOD样受体信号通路活化密切相关。  结论  深入探索外泌体lncRNA在结直肠癌中的差异性表达、功能富集及通路活化,有助于为结直肠癌的治疗提供新思路,为诊断提供新靶点。      

miR-133b通过靶向调控EGFR影响食管鳞癌的侵袭、转移

目的 探讨miR-133b在食管鳞癌侵袭、转移过程中的作用及机制.方法 使用生物信息学工具预测miR-133b的靶基因;双荧光素酶报告基因实验验证miR-133b对靶基因表皮生长因子受体(EGFR)的直接靶向调控作用;细胞增殖实验、划痕实验和Transwell实验检测miR-133b的不同表达对食管鳞癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;qRT-PCR验证miR-133b与EGFR在食管鳞癌组织中的表达,并分析miR-133b与食管鳞癌临床病理特征之间的关系.结果 生物信息学工具预测EGFR为miR-133b的靶基因,双荧光素酶报告基因实验证实 miR-133b可与 EGFR 3'UTR片段结合;体外实验通过上调食管鳞癌细胞中miR-133b的表达使细胞的增殖受阻(ECA109:P＜0. 05,KYSE150:P＜0. 01);细胞的迁移(ECA109:P＜0. 01,KYSE150:P＜0. 01)和侵袭能力(EC5A109:P＜0. 01,KYSE150:P＜0. 01)显著减弱.在食管鳞癌组织中 miR-133b与 EGFR的表达呈负相关性( P＜0. 01),且miR-133b的表达与食管鳞癌的TNM分期、淋巴结转移显著相关 (P均＜0. 05).结论 miR-133b可能通过下调EGFR的表达,抑制食管鳞癌的增殖、侵袭和转移,在食管鳞癌的演进中起负调控作用.     

腹腔镜与传统开腹直肠全系膜切除术治疗直肠癌的疗效对比研究

目的:探讨腹腔镜下直肠癌根治术的安全性、可行性及中长期生存率。方法:回顾性分析2010年1月至2013年12月新疆医科大学附属肿瘤医院收治的472例直肠癌患者,按手术方式分为腹腔镜组(243例)及开腹组(229例);比较两组患者临床资料及术后随访结果。结果:腔镜组手术时间与开腹组比较差异无统计学意义［(237±42.5) min vs (232±40.4) min,P＞ 0.05］;腔镜组术中出血量［(48±19.3) ml vs (109±29.3) ml］、术后恢复排气中位时间［3(1～9) d vs 4(2～12) d］优于开腹组（均P＜ 0.05）。两组在切除标本长度、远切缘距肿瘤下缘距离、肿瘤大小、清扫淋巴结数目及预防性造瘘率方面差异均无统计学意义(均P＞ 0.05)。中位随访40(1～83)个月,腹腔镜组、开腹组中位随访时间分别为41(1～80)个月、40(1～83)个月,随访期内两组局部复发率、远处转移率差异无统计学意义;两组总生存率、总无瘤生存率及Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期患者总生存率、无瘤生存率差异无统计学意义(均P＞ 0.05)。结论:腹腔镜直肠癌根治术是安全、可行的术式,具有满意的近期疗效,可达到与开腹手术相同的中长期生存率。     

X射线容积成像系统配准方式对中下段食管癌放疗体位验证的影响

目的 探讨X射线容积成像系统不同配准方式对中下段食管癌放射治疗中摆位误差的影响,为食管癌放射治疗提供参考。方法 随机选取63名中下段食管癌患者,对其首次治疗时XVI系统获取的重建图像,分别选择灰度配准和骨性配准方式进行系统自动配准,得到2种方法在x（左右）、y（头脚）、z（前后）方向的3个平移误差和3个旋转误差值并进行统计分析。结果 灰度配准在x、z方向的平移误差小于骨性配准（x方向t=-2.78,z方向t=-2.15,P <0.05）,在y方向差异无统计学意义（P> 0.05）。3个旋转方向配准误差值均小于1°且灰度配准小于骨性配准,但差异无统计学意义（P> 0.05）。结论 对于中下段食管癌放疗建议选择灰度配准,实际工作中在自动配准后还应经人工确认或微调,同时除平移误差外也应关注旋转误差。     

Maspin在鼻咽癌癌变和转移中的作用研究

目的：研究Maspin(mammary serine protease inhibitor)在鼻咽上皮癌变和鼻咽癌转移中的作用。方法：用免疫组织化学染色检测30例正常鼻咽黏膜上皮组织,24例鼻咽上皮鳞状化生组织、14例非典型增生鼻咽上皮、10例原位鼻咽癌和50例浸润性鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)组织中表达水平变化;同时检测了189例不同转移潜能NPC组织中Maspin的表达,分析其表达水平与NPC临床病理特征和患者预后的关系。结果：Maspin在原位癌和浸润性NPC组织中的表达分别显著低于正常鼻咽黏膜上皮组织、鼻咽上皮鳞状化生组织(P<0.05)。在有转移NPC组织中的表达明显低于无转移NPC组织(P<0.001),在颈部淋巴结转移癌组织中的表达明显低于原发癌(P<0.05)。Maspin表达水平与NPC的淋巴结转移、远处转移、临床分期以及NPC患者的总生存期负相关,是一个NPC预后判断的独立因素。结论：Maspin可能是一个与NPC发生、发展和转移相关的抑制蛋白,Maspin低表达的NPC患者预后差。     

lncRNA DLEU2转录调控因子的生物信息学分析

  目的  探讨lncRNA DLEU2转录调控因子的结构特征及其与lncRNA DLEU2结合位点。  方法  利用生物信息学工具分析lncRNA DLEU2转录调控因子的理化性质、结构、跨膜区、信号肽和亚细胞定位,预测转录因子与lncRNA DLEU2的结合位点。  结果  等电点分析表明转录调控因子CTCF、MAX、ELF1、YY1、USF1等电点小于7.0,POLR2A、FOXA1、BHLHE40、CEBPB、ATF3等电点大于7.0;脂溶指数分析显示,上述10个转录调控因子的脂溶指数均小于100,均为疏水性蛋白;不稳定指数分析结果显示,本研究中10个转录调控因子的不稳定指数大于40,均为不稳定蛋白;上述所有转录调控因子二级结构均由α-螺旋、无规则卷曲和扩展链结构3种形式组成;上述转录调控因子中并未发现跨膜蛋白和信号肽结构;亚细胞定位分析发现,除YY1定位为细胞质中,其他转录因子均位于细胞核;同时预测出上述10个转录调控因子与lncRNA DLEU2的结合位点。  结论  lncRNA DLEU2转录调控因子呈现多样性特征,可能有助于对lncRNA DLEU2转录表达调控机制的深入研究,研究结果将有助于开展基于lncRNA DLEU2相关癌症治疗药物的筛选。      

肺癌根治术后无瘤生存期及相关影响因素分析

目的 总结肺癌根治术后的无瘤生存情况,探讨其相关影响因素及治疗对策.方法 回顾性分析我院2001年1月～2004年12月222例行根治术的I A～ⅢA期肺癌患者的临床资料,评价指标为无瘤生存率.运用Kaplan-Meier生存曲线分析,Log-Rank检验和Cox多因素分析,对影响预后的因素进行单因素和多因素分析.结果 全组中位无瘤生存时间为43.1个月,1年、2年、3年无瘤生存率分别为72.2%、55.1%和52.5%.单因素分析示病理类型、p-TNM分期、术后化疗为影响无瘤生存的因素,多因素分析显示p-TNM分期、术后化疗为肺癌根治术后无瘤生存期的独立影响肉素.结论 肺癌根治术后的无瘤生存率与p-TNM分期及术后辅助化疗密切相关.早期诊断、早期治疗,辅以规范的术后化疗,才能使行根治术的肺癌患者取得更长的无瘤生存期.     

盐酸埃克替尼联合1α,25-二羟基维生素D3对人肺腺癌A549细胞增殖及EGFR表达的影响

目的:研究盐酸埃克替尼和1α,25-二羟基维生素D3单药及联合用药对人肺腺癌A549细胞增殖及表皮生长因子受体(EGFR)表达的影响?方法:盐酸埃克替尼和1α,25-二羟基维生素D3单药及联合用药处理A549细胞后,用CCK-8法检测细胞增殖抑制率的变化;用Western blot法及RT-PCR法分别检测细胞EGFR蛋白及EGFR mRNA表达的变化?结果:与单药盐酸埃克替尼组和1α,25-二羟基维生素D3组相比,联合用药组具有更强的细胞增殖抑制作用(P均< 0.05);联合用药组及1α,25-二羟基维生素D3单药组EGFR蛋白及EGFR mRNA表达水平较阴性对照组及盐酸埃克替尼单药组有明显升高(P均< 0.05)?结论:盐酸埃克替尼与1α,25-二羟基维生素D3联合用药对人肺腺癌A549细胞具有协同抗增殖作用;其机制可能与1α,25-二羟基维生素D3升高了EGFR mRNA及EGFR蛋白的表达,从而更有利于盐酸埃克替尼发挥抗肿瘤作用有关?     

吉西他滨联合奈达铂治疗难治性小细胞肺癌的临床观察

目的观察和评价吉西他滨联合奈达铂治疗难治性小细胞肺癌的疗效和毒副反应。方法入组经病理证实的难治性小细胞肺癌患者28例。予吉西他滨1000mg·m-2,静脉滴注2h,第1、8天;奈达铂80mg·m-2,第1天,每3周重复,至少接受2周期化疗。结果全组28例均可评价疗效,有效率为25．0％（7／28）,疾病控制率为67．9％（19／28）,中位疾病进展时间为3．4个月,中位生存期为6．9个月。治疗相关主要毒副反应为中性粒细胞减少及血小板减少,Ⅲ、Ⅳ度中性粒细胞减少发生率为35．7％（10／28）,Ⅲ、Ⅳ度血小板减少发生率为32．1％（9／28）。结论吉西他滨联合奈达铂治疗难治性小细胞肺癌疗效显著,毒副反应可以耐受,值得进一步临床研究。