BET bromodomain蛋白小分子抑制剂研究进展

组蛋白赖氨酸乙酰化的识别是组蛋白乙酰化参与表观遗传调控的关键步骤,乙酰化的组蛋白赖氨酸可以被bromodomains(BRDs)结构域所特异性的识别,从而招募染色质调控因子到特定区域,协同完成基因表达调控。其中作用于bromodomain and extra-terminal(BET)蛋白家族的BRD结构域的小分子抑制剂在抗炎和抗肿瘤方面显示出巨大的潜力。本文通过对与BET bromodomain靶点相关的疾病、BET bromodomain结构、BET bromodomain小分子抑制剂的化学结构分类及其构效关系等多方面进行总结,为设计和开发高活性的BET bromodomain小分子抑制剂提供参考依据。     

基于分子对接方法的木犀草素和罗汉松脂素与p38α激酶的分子作用机制研究

摘要：目的:研究络石藤中化合物木犀草素和罗汉松脂素与p38α之间的分子相互作用机制。方法:以p38α激酶抑制剂SB-203580、BIRB-796为阳性对照化合物,利用分子对接技术研究木犀草素和罗汉松脂素与p38α激酶在三维空间上的相互作用。结果:所有化合物均以非共价键方式与靶酶活性位点结合,形成生氢键、疏水等相互作用。SB-203580与p38α激酶的对接结合能为-9.0 kcal·mol-1,BIRB-796的对接能量为-11.0 kcal·mol-1,木犀草素对接能量-8.8 kcal·mol-1,罗汉松脂素对接能量为-8.2 kcal·mol-1,木犀草素、罗汉松脂素与p38α激酶活性位点处的结合强度与SB-203580相近,两者可竞争性阻碍该靶酶活性位点与腺嘌呤核苷三磷酸（ATP）的结合从而抑制该靶酶上调炎症因子水平的生物学活性。结论:木犀草素和罗汉松脂素应该是络石藤中抗风湿作用的活性代表成分,从分子间相互作用层面证实两者可抑制p38α激酶生物学活性从而起到抗炎作用,也给新型p38α激酶抑制剂的研发提供参考。