基于全基因组测序的耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药基因、毒力因子及同源性分析

摘要：目的 通过应用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不 动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法 收集该院2020年1月至3月 重症监护病房(Intensive care unit, ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株，通过二代测序平台进行全基因组测序, 应用 基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology, CGE)ResFinder 4. 0软件分析其耐药基因型，并应用MORPHEUS在线制作 热图，应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria, VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子，应用MLST软件检测菌 株的ST型，应用Kaptive软件检测荚膜型，应用CSI Phylogeny 1. 4软件及FigTree v1. 4. 4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree, MLT)以分析其同源性。结果 11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药，而对阿米卡星、左氧 氟沙星耐药的菌株株数较少。11株CRAB共检测出18种耐药基因，11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因blaOXA-23和blaOXA-66，β-内酰 胺酶耐药基因以blaTEM-1D和blaADC-25为主，大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因。11株CRAB均携 带多种毒力因子，包括外膜孔蛋白、脂多糖、生物膜、外排泵、磷脂酶和效应蛋白等，如OmpA、Lps、Csu、Pga、Ade、Plc、 Bas、Bau、Ent、Hem、Aba、Bfm、Pbp和Kat等。11株CRAB均为ST2-K22型，同源性分析结果显示C组内同源性关系相近，存 在院内传播的可能。结论 该院CRAB的耐药性、毒力特征复杂多样，同源性分析显示该院存在1种优势克隆株，该克隆株有医 院内传播的风险。     

论文中阿拉伯与汉字数字的使用规律

1阿拉伯数字使用规则:(1)凡是可以使用阿拉伯数字且很得体的地方,均应使用阿拉伯数字。(2)公历世纪、年代、年、月、日、时刻必须使用阿拉伯数字。年份不能简写。例如:2021年不能写成21年。日期的表示采用全数字式写法。例如:2020年2月18日写作2020-02-18或20200218或2020.02.18。日的时间表示:如下午3时9分38秒写作:15:09:38。(3)计量单位前的数字和统计表中的数值一律使用阿拉伯数字。(4)引文标注中的版次、卷号、期号、页码等使用阿拉伯数字。(5)多位数的阿拉伯数字不能拆开转行。(6)多位数和小数分节,从小数点起向左向右3位数空半个阿拉伯数字(1/4汉字)的空隙,不用千分撇","分节法。     

基于超声影像组学的乳腺癌预测模型的诊断性能研究

目的评估并比较基于不同机器学习算法建立的乳腺癌超声影像组学预测模型的诊断性能。 方法回顾性收集2017年1月至2019年4月就诊皖南医学院第一附属医院、有明确病理结果的乳腺肿块病例828例，以2018年8月31日为节点将其分为训练集（526例）和验证集（302例），提取肿块的超声影像组学特征并进行特征筛选，运用k最近邻（kNN）、逻辑回归（LR）、朴素贝叶斯（NB）、随机森林（RF）和支持向量机（SVM）5种机器学习算法分别建立预测模型，使用重复交叉验证方法做内部验证，计算比较各模型的敏感度、特异度、阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV），并实施外部验证，绘制ROC曲线并比较ROC曲线下面积（AUC）以评价模型的鉴别诊断性能，绘制校准曲线评价模型校准度。 结果从提取的109个影像组学特征中筛选出19个特征建立了5种机器学习算法模型。在内部验证中，5种模型的敏感度、特异度、PPV、NPV比较，总体差异均有统计学意义（P均＜0.001）。LR模型的特异度、PPV、NPV中位数分别为0.769、0.816、0.778，3项指标均高于其他4种模型；敏感度中位数为0.824，高于kNN、RF和SVM模型。此外，SVM模型的特异度、PPV、NPV中位数分别为0.706、0.774、0.759，虽均低于LR模型，但均高于其他3种模型。在外部验证中，LR、SVM、RF、kNN和NB的AUC依次为0.890、0.832、0.821、0.746和0.703，其中LR与SVM的AUC差异有统计学意义（P=0.012）；此外，各模型在校准性能上表现并不一致，LR和SVM模型的校准曲线显示乳腺癌实际概率与预测概率之间的一致性较好。 结论以超声影像组学特征为基础，运用不同机器学习算法建立的乳腺癌超声预测模型，均表现出较高的诊断性能，其中LR模型表现最为突出；选择合适的机器学习算法有助于进一步提高预测模型的诊断性能，提供更加准确的量化预测结果。     

两种不同手术入路方案在Ⅰ~Ⅱ期乳腺癌患者中的手术效果对比及其对乳头乳晕区感觉乳房美观性的影响

目的探讨2种不同手术入路方案在Ⅰ~Ⅱ期乳腺癌患者中的影响。方法选取郑州大学附属郑州中心医院2018年9月至2020年12月期间93例Ⅰ~Ⅱ期乳腺癌患者为研究对象,按不同术式分为2组,对照组46例给予乳腺+腋窝双切口入路,观察组47例给予环乳晕单切口入路手术方案治疗。对比2组患者术后指标。结果观察组的手术时间短于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);观察组的并发症发生率4%(2/47)低于对照组17%(8/46),差异有统计学意义(P<0.05);观察组双乳对称性评分及综合美学效果评分均高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论环乳晕单切口入路的手术方案能够提高术后患者乳房美观性,降低手术时间及术后并发症发生率。     

艾立布林治疗晚期乳腺癌疗效和安全性的多中心真实世界研究

目的探讨真实世界艾立布林治疗晚期乳腺癌的疗效及安全性。方法选取2019年12月至2020年12月就诊于北京市朝阳区三环肿瘤医院、山东省肿瘤医院、北京大学肿瘤医院、包头市肿瘤医院、中国医科大学附属盛京医院及中国医学科学院肿瘤医院的晚期乳腺癌患者。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log rank检验, 多因素分析采用Cox回归模型。结果 77例患者中位无进展生存时间为5个月, 客观缓解率(ORR)为33.8%, 疾病控制率(DCR)为71.4%。三阴性乳腺癌患者ORR为23.1%, DCR为57.7%;Luminal型乳腺癌患者ORR为40.0%, DCR为77.8%;人表皮生长因子受体2过表达型乳腺癌患者ORR为33.3%, DCR为83.3%。艾立布林为一线至二线治疗患者的ORR为50.0%, DCR为66.7%;三线至四线治疗患者的ORR为29.4%, DCR为76.5%;五线至十一线治疗患者的ORR为28.6%, DCR为71.4%。艾立布林单药治疗组患者的ORR为40.0%, DCR为66.0%;联合化疗或靶向治疗组患者的ORR为22.2%, DCR为81.5%。在辅助治...     

“互联网+医疗”背景下全生育周期服务体系构建研究△

“互联网+医疗”在实现改善人民群众就诊体验和提高优质资源利用效率等方面具有积极作用。作者介绍了某三级妇幼保健院在国家推进“互联网医院”政策的背景下，以互联网、大数据等技术为依托，自主更新业务体系、重构发展模式，加快内部流程的优化与再造，构建全生育周期服务体系的实践，分析了全生育周期服务体系的初步成效及存在不足，在此基础上提出关于进一步优化全生育周期服务体系的看法和建议。     

征订启事

《临床误诊误治》杂志为中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊、中国生物医学核心期刊、美国化学文摘数据库来源期刊。本刊大16开全铜版纸彩印。专栏设置富有特色,内容丰富具可读性,丰富的病例报告为临床各专科医生提高临床诊疗实践水平极有帮助。欢迎您订阅2022年《临床误诊误治》杂志,可通过邮局订阅(邮发代号18-46)或邮局直接汇款订阅。每月22日出版,每期定价20元,每年定价240元。地址:河北省石家庄市中山西路398号;邮编:050082;电话:0311-80720899。