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1.
目的组学数据信息多样且体量庞大,变量间关系错综复杂。相关分析有助于在海量数据间找到有效关联对,是转化医学和系统生物学研究中常用手段之一。元基因组学和代谢组学2大组学平台由于具备整体系统性分析的功能,广泛应用到了菌群和代谢物的相关研究中。元基因组学和代谢组学数据的来源、结构和特点各不相同,需科学选取相关分析方法进行高质量跨组学研究。方法选取4种典型的相关分析方法(2种经典方法和2种元基因组数据专用方法),设计仿真数据集和实验数据集,对各方法的性能进行测试和比较。结果仿真和真实数据结果显示,CCLasso的相关系数最小,误差百分比最大,所找到的相关对数目最少;SparCC的结果与CCLasso相反;Pearson与Spearman结果介于两者之间,较为中立。结论对于元基因组学与代谢组学数据的相关分析,CCLasso方法较为严格,易得到假阴性结果;SparCC方法较为宽松,易得到假阳性结果;Pearson和Spearman结果介于两者之间。建议研究者结合研究目标和侧重点确定具体方法。  相似文献   
2.
跟骨骨折是最常见的后足骨折,通过国内外医师学者的长期研究,其在诊治方面有了长足的进步。近年来,加速康复外科(ERAS)理念的引入,更加规范了跟骨骨折围手术期的处理流程,有助于提高治疗效果,改善患者治疗体验。本共识以ERAS理念为指导,以循证医学证据为基础,经全国创伤骨科专家讨论形成。本共识从多模式镇痛、术前宣教、围手术期饮食管理、手术微创操作等ERAS涉及的多个方面进行推荐,为治疗此类骨折提供参考。  相似文献   
3.
目的 本研究采用代谢组学技术和方法,研究健康成人口服黄芪汤前后血浆代谢谱的变化,为黄芪汤的药效研究提供依据和参考。方法 联合采用气相色谱质谱和液相色谱质谱两个平台,结合单变量和多变量统计分析方法,考察服用黄芪汤前后人体血浆中内源性代谢物的波动情况。结果 主成分分析和正交偏最小二乘法判别分析结果均显示,服药前和服药后2h,人体血浆代谢谱有明显的分离趋势,内源性代谢物发生了显著的波动。借助单维和多维统计分析方法,筛选出了49种服药前后的差异代谢物。黄芪汤中的主要成分芒柄花素及其代谢产物芒柄花素葡萄糖苷的水平在服药后均显著升高。色氨酸、苯丙氨酸和胆酸等物质显著降低。结论 服用黄芪汤后人体氨基酸代谢、脂肪代谢、糖类代谢和胆酸代谢均有波动,这些代谢物与肝病和糖尿病的防治有紧密关联。  相似文献   
4.
目的 比较类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者及痛风性关节炎(gout arthritis,GA)患者与正常对照组之间血清代谢谱的差异,构建两种关节炎共有和特有代谢物的贝叶斯网络模型。方法 采用液相色谱质谱和气相色谱质谱技术检测27例RA患者及34例GA患者和60例正常对照者血清代谢产物,识别RA及GA的潜在生物标志物;构建基于贪婪搜索算法的两种关节炎特有和共有代谢物的贝叶斯网络图。结果 RA及GA组与正常对照组血清代谢物存在明显差异,基于单元及多元统计方法,RA组筛选出34个差异代谢物,GA组筛选出41个差异代谢物,其中两种关节炎共有的差异代谢物14个;基于上述代谢物构建的贝叶斯网络揭示了不同代谢物之间可能存在的因果关系。结论 相比于代谢组学传统的多元统计学方法,贝叶斯网络能良好反映疾病差异代谢物之间存在的因果关系,在代谢组学中具有较好的应用前景。  相似文献   
5.
目的 探索线粒体DNA3243A>G (mt.3243A>G)突变糖尿病患者和正常对照外周血单个核细胞(PBMC)表面形貌和力学性能差异。方法 采集5例mt.3243A>G突变糖尿病患者和5例年龄、性别匹配的正常对照外周血2ml,然后利用聚蔗糖-泛影葡胺(Ficoll-hypaque)密度梯度离心法分离出PBMC。应用原子力显微镜(AFM)对突变患者和正常对照的PBMC进行表面形貌和力学性能测量。结果 运用AFM测量和分析发现,在表面形貌方面,mt.3243A>G突变糖尿病患者的PBMC高度(0.73±0.24μm vs 2.49±1.17μm,P=0.011)低于正常对照组;但其表面粗糙度(Ra:161.8±33.2nm vs 66.4±16.3nm,P=0.000;Rq:202.2±40.9nm vs 85.4±17.1nm,P=0.000)高于正常对照组。在力学性能方面,mt.3243A>G突变糖尿病患者PBMC黏附力约比正常对照组高3倍(779.6±190.0pN vs 161.1±83.1pN,P=0.000)。与正常对照组相比,mt.3243A>G突变糖尿病患者PBMC杨氏模量(138.3±77.2kPa vs 421.4±140.0kPa,P<0.01)显著增加,病变细胞表面硬度增加。结论 本研究利用AFM从单细胞水平上揭示了mt.3243A>G突变糖尿病患者PBMC的表面形貌和力学性能变化,有助于加深对该疾病病理生理机制的理解。  相似文献   
6.
肱骨近端骨折是创伤骨科最常见的骨折之一,国外文献报道其发生率占全身骨折的4%~5%,国内文献报道约占2.5%。大多数肱骨近端骨折是老年人低能量骨质疏松性骨折,主要由平地摔倒所致,男女比为2~3∶1。随着人口结构的老龄化,其发病率呈快速上升趋势,在近30年移位骨折占所有肱骨近端骨折的比例上升了50%。饮食中低钙摄入、骨质疏松等均会增加肱骨近端骨折的风险,其他危险因素还包括亚健康状态、髋部骨折家族史、糖尿病、视力减退及神经肌肉功能减退等。  相似文献   
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