基于加权基因共表达网络的膀胱尿路上皮癌预后及疗效相关基因筛选

目的构建加权基因共表达网络分析（weighed gene co-expression network analysis,WGCNA）,鉴定出膀胱尿路上皮癌（bladder urothelial carcinoma,BLCA）中与预后及治疗效果相关的基因,并分析其在肿瘤相关通路中的活性。方法在癌症基因组图谱数据库获取膀胱尿路上皮癌的转录组测序及相应临床数据;选择年龄、性别、身高、体重、人种、生存时间、吸烟年数、治疗效果、病理分级、TNM分期及淋巴结浸润为临床表型进行加权基因共表达网络分析;利用R语言进行生存分析;利用GSCALite工具进行肿瘤相关的通路活性分析;利用基因表达汇编数据库中的GSE13507和GSE3167数据集进行验证。结果本研究鉴定出与预后及治疗效果均显著相关的基因模块及模块关键基因GPHN、CPSF2、PRMT5、EIF2S1、KLC1、SLC39A9、SRP54及CNIH,上述8个基因在肿瘤相关通路中有一定活性。结论GPHN、CPSF2、PRMT5、EIF2S1、KLC1、SLC39A9、SRP54及CNIH基因在BLCA中与预后及治疗效果均显著相关,并且参与了肿瘤相关通路,可能成为BLCA的生物标志物或潜在治疗靶点。     

rs798766 C＞T多态性与膀胱癌易感性的Meta分析

目的 对rs798766 C>T多态性与膀胱癌易感性的关联进行Meta分析.方法 在Pubmed与百度学术数据库中检索相关病例对照研究,根据纳入与排除标准进行筛选.提取研究基本情况,提取或计算T等位基因比值比ORCT+TT vs.CC及其95 %可信区间,进行Meta分析.结果 共纳入9项病例对照研究,涉及10 647名膀胱癌患者与53 588名健康对照.Meta分析有显著异质性(I2=75 %,P<0.1),合并结果为1.34[1.19,1.51].亚组分析结果显示,亚洲人与白人的合并结果无显著差异(χ2=0.65,P=0.42).漏斗图对称,无发表偏倚.结论 rs798766 C>T多态性增加膀胱癌易感性.