基于全转录组的心力衰竭预测标志物

目的 挖掘基于转录组的预测心力衰竭（heart failure,HF）的标志物。方法 本课题组开发了一个基于全转录组的HF预测标志物,整理转录本对应的蛋白质的氧原子含量,然后计算转录本蛋白质氧原子含量与转录本表达水平的相关性,通过随机森林模型训练预测模型。结果 对于训练集,预测模型5折交叉验证的准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为83.6%、85.8%和81.5%。训练集的准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为77.8%、80.0%和75.0%。在另外一个单独寻找的测试集,准确率、阳性预测值和阴性预测值分别为86.8%、86.7%和87.5%。结论 本课题组开发的基于全转录组的HF预测标志物具有非常稳定的预测性能,而且准确率高,可以用于HF预测。