基于网络药理学与GEO 差异基因芯片数据分析复方苦参注射液治疗宫颈癌的机理和分子靶点

目的 利用网络药理学结合GEO基因芯片分析的方法,研究复方苦参注射液治疗宫颈癌的靶点和分子机制。方法 首先利用TCMSP、TCMID、SwisstargetpredicitionTCMIP等数据库筛选收集复方苦参注射液的化合物和靶点。然后利用GEODataset数据库获取宫颈癌芯片数据,再通过R软件获得其差异基因,同时绘制火山图和热图。再利用R软件对复方苦参注射液靶标基因与GEO差异基因取交集,作为复方苦参注射液治疗宫颈癌的潜在作用靶标,通过string数据库和Cytoscape3.7.2软件对交集基因进行蛋白相互作用网络富集分析并图示化,利用Cytoscape3.7.2软件制作药物-化合物-靶点-疾病网络图。最后利用R语言的clusterfiler程序包对复方苦参注射液治疗宫颈癌的潜在作用靶标进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果 复方苦参注射液治疗宫颈癌候选活性成分共计178个,包括苦参碱、槐定碱、右旋异苦参碱等;118个潜在作用靶标,包括OPN、MMP-9、SIRT1、VEGFR-3等;135条通路,包括PI3K-Akt、apelin/APJ、P38MAPK、NF-kB、AMPK等信号通路。分子对接表明苦参碱与3个关键候选靶蛋白（CCND1、CDK1、MMP-9）有较好的结合性。结论 研究揭示了复方苦参注射液在治疗宫颈癌中化合物、作用靶标和作用机制,丰富其临床与实验应用的理论基础。     

基于网络药理学和分子对接方法探讨雷公藤对狼疮性肾炎的效毒作用机制

目的基于网络药理学和分子对接方法探讨雷公藤治疗狼疮性肾炎的效毒作用机制。方法通过TCMSP、Uniprot、STITCH等数据库查询雷公藤的化合物分子及其主要靶点,并与狼疮性肾炎相关基因做对比,获得药物靶点与疾病相关的共有基因,构建药物与疾病之间的网络关系。通过String数据库获取潜在作用靶标之间的相互作用关系,利用Cytoscape软件构建中药-成分-疾病网络。运用Clusterprofiler程序分别进行GO基因富集分析和KEGG通路富集分析。结果从雷公藤中筛选得到44个候选活性成分,包括雷公藤甲素、雷公藤多苷、雷公藤红素等;潜在作用靶标228个,其中治疗靶标152个,毒性靶标76个。GO富集分析结果显示,治疗靶标主要与细菌来源分子的反应(response to molecule of bacterial origin)、对脂多糖的反应(responsetolipopolysaccharide)、胞浆钙离子浓度的正调控(positiveregulationofcytosoliccalciumion concentration)等有关。治疗狼疮性肾炎的相关基因参与通路共125条,具有潜在不良反应的相关基因通路共130条。分子对接结果表明,5α-benzoyl-4α-hydroxy-1β, 8α-dinicotinoyl-dihydro-agarofuran、triptofordin B1、triptofordinine A2与SYK有较好的结合性。结论基于网络药理学方法和分子对接挖掘雷公藤对狼疮性肾炎治疗靶点和毒性靶点、治疗作用通路和毒性作用通路,为研究雷公藤对狼疮性肾炎效毒作用机制提供了新的研究方法。     

中医药治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征用药规律

目的:基于近十年来中医治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(OSAHS)的文献研究,分析目前治疗的主选药物,以及中医对OSAHS病机与治法的共识,为临床治疗及用药提供依据。方法:检索数据库中2009年至2018年期间OSAHS的相关文献,采用Excel软件输入并统计描述。结果:在治疗OSAHS的过程中,用药频数居于前7位的中药依次为半夏、茯苓、陈皮、石菖蒲、白术、川芎、郁金; 使用的中药中主要是以祛痰化湿药和活血化瘀药为主; 药物归经以肺经、脾经、肝经为主; 药物药性温热和寒凉频次相同; 药物药味以辛、苦为主。结论:OSAHS最常见的证候是痰湿和痰瘀互结,以祛痰化湿和活血化瘀药为主,中医药治疗OSAHS有较好的疗效。     

基于网络药理学及分子对接研究黄连温胆汤治疗Z综合征作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨黄连温胆汤治疗Z综合征的可能作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及中药成分数据库(TCMID)筛选并收集黄连温胆汤的活性成分及其对应靶标。利用Uniprot数据库获取药物活性成分对应靶标的基因,并与通过人类基因组注释数据库(GeneCards)和《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)所获得的人Z综合征(OSAS合并MS)相关基因进行比较,获得黄连温胆汤与Z综合征重合的潜在作用靶标基因。使用Cytoscape3.7.2软件绘制黄连温胆汤的"疾病-药物-成分-靶标-通路"网络图。通过String数据库获取潜在作用靶标之间的相互作用数据表,然后导入Cytoscape3.7.2软件构建靶蛋白质相互作用网络图。然后基于bioconductor提供的人类基因注释数据库org.Hs.eg.db,利用R语言的clusterfiler程序包对黄连温胆汤治疗Z综合征的潜在作用靶标进行GO分类富集分析和KEGG通路富集分析。结果:得到黄连温胆汤治疗Z综合征有134个候选活性成分,包括木犀草素、槲皮素、黄芩素、小檗碱、黄芩苷等;65个潜在作用靶标,包括AKT1、IL6、VEGFA和MMP-9等;116条通路,包括MAPK,核因子-κB,PI3K-Akt,Toll样受体等信号通路。分子对接表明,木犀草素、槲皮素、黄芩素可与3个关键候选靶蛋白(IL-6、AKT1、MMP-9)有较好的结合性。结论:黄连温胆汤可能通过作用于IL6、VEGFA和MMP-9等靶标及MAPK,核因子-κB,PI3K-Akt,Toll样受体等信号通路干预Z综合征的发生发展。