hsa-miR-150-5p的生物信息学分析

目的探讨hsa-miR-150-5p在其基因家族的进化关系及可能介入的生物学过程。方法利用人类miRNA表达数据库(HMED)获得hsa-miR-150-5p在不同组织和疾病中特异性表达丰度信息,运用miRBase、Clustalw2和MEGA5.0分析软件获取hsa-miR-150-5p的染色体定位、碱基序列比对特征和进化规律等基本信息,通过miRDB、PicTar和TargetScan进行靶基因预测,采用基因本体(GO)和代谢通路富集分析(KEGG)对靶基因的生物学功能注释分析,进一步认识hsa-miR-150-5p的生物学功能。结果通过同源性搜索在miRBase数据中获得miR-150基因家族成员的序列36条,分布于23个物种。多序列比对发现miR-150基因家族成员序列碱基保守性很高,其中有16个碱基完全保守,6个碱基相对保守。进化分析表明人类的miR-150与青鳉、三文鱼、钳鱼、斑马鱼的分子系统进化关系较远,与其他18个物种的进化关系较近。对miRDB、PicTar和TargetScan预测的靶基因进行交集后共得到25个靶基因,GO分析结果显示靶基因参与多个信号通路的调节,包括转录因子、锌指蛋白、Toll样受体信号通路的转导蛋白、ATP偶联的离子型通道受体和细胞因子信号传导抑制蛋白等。结论 hsa-miR-150-5p在多种组织和疾病中表达,分布具有组织特异性,可能在机体的多种生理、病理过程中发挥重要作用,并可能通过调控多个靶基因而参与各个信号通路调节。     

三磷酸腺苷结合盒转运蛋白G2与痛风/高尿酸血症

三磷酸腺苷结合盒转运蛋白G2 (ABCG2)是ABC转运蛋白超家族成员之一,编码基因位于4号染色体上,为定位于细胞膜的转运蛋白,在肝、肾、肠等组织广泛表达,具有转运尿酸的功能,其功能异常会导致尿酸排泄减少.目前已经发现,多种单基因多态性影响ABCG2的尿酸转运功能,从而引起高尿酸血症和痛风.所以研究ABCG2靶点药物意义重大,但仍需进一步研究.     

丙肝患者血清 HCV RNA拷贝数与HCV Ab定量和肝脏功能损伤程度的关系

目的 对丙型肝炎患者丙肝病毒RNA（HCV RNA）、丙肝病毒抗体（HCV Ab）和肝功能指标定量结果进行统计分析,并探讨HCV RNA与HCV Ab和肝功能指标间的关系,为丙肝患者诊断和治疗提供参考依据。方法 收集342例丙肝患者血清,采用实时荧光定量PCR技术检测HCV RNA拷贝数,采用化学发光技术检测HCV Ab浓度,分别采用速率法、免疫比浊法、溴甲酚紫法和重氮盐法检测血清ALT、AST,PA,ALB和TBIL、DBIL的活性或浓度。结果 342例研究对象中,HCV RNA拷贝数以N×10⁶ IU/mL为主,占48.7%;而N×10³ IU/mL和N×10⁴ IU/mL最少,分别占4.3%和7.4%。在HCV RNA拷贝数小于1×10³ IU/mL组中,HCV Ab浓度较其他组低,而HCV RNA拷贝数在N×（10³~10⁷）IU/mL组间时,HCV Ab浓度差异无统计学意义（P>0.05）;当HCV Ab浓度大于10 S/CO时,HCV RNA阳性率升高,可达88.7%。与HCV RNA拷贝数小于N×10³ IU/mL相比,大于N×10⁴ IU/mL的丙肝患者血清ALT、AST、ALB和PA异常率增加（P<0.05）,而血清DBIL和IBIL差异无统计学意义（P>0.05）。结论 丙肝病毒主要损伤肝细胞及其合成功能,联合检测HCV Ab和HCV RNA拷贝数对丙型肝炎的诊断和治疗具有重要的意义。     

KRAS、NRAS及BRAF基因突变与结直肠癌肝转移的关系

  目的  探讨KRAS、NRAS和BRAF基因突变与结直肠癌肝转移的关系。  方法  收集川北医学院附属医院2019年1月至2021年10月结直肠癌组织标本246例,基于ARMS法和荧光PCR技术进行KRAS、NRAS和BRAF基因突变检测,收集患者临床资料并分析KRAS、NRAS和BRAF基因突变与肝转移的关系。  结果  在246例结直肠癌患者中,KRAS、NRAS和BRAF突变率分别为45.93%（113/246）、6.10%（15/246）和4.87%（12/246）。NRAS基因突变与同时性结直肠癌肝转移相关,在NRAS突变组结直肠癌确诊时出现肝转移的频率较高（P = 0.005）,但随着病程时间延长,1 a内发生肝转移的频率在NRAS突变组和野生组无统计学意义（P = 0.155）,多因素Logistic回归分析显示NRAS突变是同时性结直肠癌肝转移的独立危险因素（OR = 9.974,P = 0.008）。KRAS和BRAF突变与肝转移无明显相关性（P > 0.05）。  结论  NRAS基因突变的结直肠癌患者早期较易出现肝转移,对其进行检测不仅在靶向治疗中具有重要的指导作用,在早期肝转移评估中也具有重要的临床指导价值。     

南充市体检人群高尿酸血症患病率及影响因素分析

目的了解四川省南充市常规体检人群高尿酸血症(HUA)患病率的变化趋势,并分析HUA相关危险因素。方法根据对2015年1月至2017年8月在四川省南充市川北医学院附属医院的29823名常规体检人群体检结果,进行统计学分析,计算体检人群HUA的患病率,并分析血尿酸水平与各项生化指标的相关性。结果所有体检人群的平均血尿酸水平为(335.31±90.03)μmol/L,HUA总体患病率为19.5%,男性患病率28.3%,明显高于女性7.8%(P0.001)。结果显示HUA患者的Urea、Crea、TG、TC、apoB1、LDL-C、VLDL-C均高于正常人群,而HDL-C、apoA1则低于正常人群(均P0.05)。血尿酸水平与GLU、Urea、Crea、TG、TC、apoB1、LDL-C、VLDL-C、HCY、hsCRP等水平成正相关,与LP(a)、HDL-C、apoA1成负相关。Logistic回归分析显示,GLU、HDL-C、VLDL-C水平是HUA的保护因素,男性、Crea、TG、apoA1、LDL-C、HCY、hsCRP水平是HUA的危险因素。结论四川省南充地区HUA患病率较高,可能为严重危害该地区人群健康的潜在性疾病,应高度重视与积极预防。     

甲基转移酶样因子3 通过调控GLUT4-mTORC1 轴影响食管鳞状细胞 癌细胞的糖酵解及增殖

目的：探讨甲基转移酶样因子3（METTL3）在食管鳞状细胞癌（ESCC）组织和细胞中的表达水平及其对ESCC 细胞糖 酵解和增殖能力的影响和潜在的分子机制。方法：基于TCGA 数据库分析METTL3 在ESCC 细胞中的表达及可能的富集通路。 收集2021 年1 月至2021 年6 月间在北川医学院附属医院外科手术切除的34 例ESCC 组织及相应癌旁组织,采用免疫组化法验证 ESCC 组织中METTL3 的表达。采用CCK-8 法和平板克隆形成实验检测干扰METTL3 后ESCC 细胞增殖能力的变化,利用比色 法检测干扰METTL3 后ESCC 细胞总RNA 中m6A 的表达水平,采用甲基化RNA 免疫沉淀定量PCR（MeRIP-qPCR）检测METTL3 对葡萄糖转运蛋白4（GLUT4）基因mRNA 的m6A 修饰水平的影响,采用WB 和qPCR 等技术探索METTL3 参与ESCC 细胞糖酵解 的生物学机制。结果：METTL3 在ESCC 组织以及细胞中均呈高表达（均P<0.001）。干扰METTL3 表达后,ESCC 细胞的增殖能 力明显减弱、细胞内总RNA 的m6A 修饰水平显著降低（均P<0.001）。此外,干扰METTL3 可显著抑制KYSE150 和TE-1 细胞中 GLUT4 基因mRNA 的m6A 修饰水平（均P<0.01）,并通过下调GLUT4 的表达抑制葡萄糖的摄取以及乳酸的释放（均P<0.01）,最 终下调mTORC1 通路活性并抑制ESCC 细胞的增殖;在干扰METTL3 的ESCC 细胞同时联合运用mTORC1 通路抑制剂显示有协 同的抗癌作用。结论：METTL3 介导的m6A 修饰通过调控GLUT4-mTORC1 信号轴影响ESCC 细胞的糖酵解及增殖。     

高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建

目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建。方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子。利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系。通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析。利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调。差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路。基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点。结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切...     

长链非编码RNA THOR在食管鳞状细胞癌中的表达及作用机制研究

目的:探究睾丸相关的高保守的致癌长链非编码RNA(LncRNA THOR)在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的表达及对ESCC细胞功能的影响.方法:利用生物信息学结合qRT-PCR分析LncRNA THOR在ESCC中的表达情况.在ESCC细胞系TE1中,siRNA沉默LncRNA THOR后,使用CCK-8和划痕试验分别检测细胞增殖及迁移,qRT-PCR和Western blot检测IGF2BP1依赖基因GLI-1和MYC mRNA及蛋白质的表达.结果:UALCAN分析结果显示,LncRNA THOR在食管癌患者的表达显著高于正常人.qRT-PCR验证发现LncRNA THOR在ESCC组织的表达显著高于癌旁组织,在ESCC细胞系TE1和EC109中显著高于正常人食管鳞状上皮细胞HET-1A.在TE1中敲减LncRNA THOR后,CCK8实验显示细胞增殖被抑制,划痕实验显示细胞迁移能力降低.qRT-PCR和Western blot实验显示GLI-1和MYC mRNA及蛋白质都显著下调.结论:Ln-cRNA THOR在ESCC癌组织和细胞中的表达显著升高,沉默LncRNA THOR可以抑制ESCC细胞增殖及迁移,暗示LncRNA THOR可能作为ESCC治疗的新靶标.