咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%）,其次是鼻拭子标本（34.3%）,咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%, N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义（P均＞0.05）,一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4）,因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。     

2015年郑州市食源性致病菌监测结果分析

目的了解我市市售食品中主要食源性致病菌污染状况,为食品安全风险评估提供基础资料。方法依照《2015年河南省食品安全风险监测方案》要求,随机采集市售10类食品,按照食品安全国家标准GB4789-2010和《监测网工作手册》方法对采集样品进行主要致病菌分离鉴定。结果全年共监测260份样品,45份样品中检出致病菌,总检出率为17.31%,其中有2份样品同时检出2种致病菌,共检出47株致病菌。结论我市食源性致病菌污染较重,应加强市售食品的监测和对食品经营部门管理,防止食源性疾病的发生。     

咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%）,其次是鼻拭子标本（34.3%）,咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%, N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义（P均＞0.05）,一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4）,因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。     

2017年郑州市食源性疾病病原学监测结果分析

目的 了解郑州市2017年食源性疾病的流行趋势及病原学特性,为食源性疾病诊断提供病原学证据,提高食源性疾病暴发的早期识别、预警和防控能力。方法 对2017年郑州市哨点医院上送的食源性疾病病例标本进行病原学检测及分析。结果 2017年郑州市2家哨点医院共采集504份病例标本,检出165株食源性致病菌,总检出率为32.74%（165/504）。其中沙门菌检出率为19.84%（100/165）,致泻性大肠埃希菌检出率为11.11%（56/165）,志贺菌检出率为1.39%（7/165）,诺如病毒检出率为0.40%（2/165）。5岁以下年龄组病原检出率最高,检出率为41.35%（98/237）。结论 郑州市食源性疾病主要以沙门菌、致泻性大肠埃希菌和志贺菌感染为主。今后应进一步扩大监测覆盖面和病原菌种类,并加强食品安全教育与宣传力度。