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1.
食管鳞癌血清WCX2蛋白芯片诊断模型的研究   总被引:21,自引:1,他引:20  
目的 分析食管鳞癌血清蛋白表达谱的改变 ,筛选并建立食管鳞癌血清标志物诊断模型。方法 采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱 (SELDI TOF MS)技术分析 199例食管鳞癌患者和 10 6名性别、年龄匹配的健康人血清 ,获得WCX2蛋白芯片表达图谱。用BiomarkerPattern软件分析食管癌差异蛋白并初步建立诊断模型。扩大样本量 ,通过盲法分析进一步验证诊断模型。结果 在分子量 0~ 5 0 0 0 0范围内 ,共检测到 92个差异蛋白峰 ,其中 34个差异有显著意义 (P <0 0 5 )。建立了由 12个差异蛋白组成的食管鳞癌诊断模型 ,其敏感性为 91 5 % (5 4 / 5 9) ,特异性为86 9% (5 3/ 6 1)。扩大样本盲法验证结果其敏感性为 85 % (119/ 14 0 )、特异性为 84 4 % (38/ 4 5 )。结论 由 12个差异表达蛋白及其特定组合构成的诊断模型可以区分食管鳞癌与健康人  相似文献
2.
表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-Ms)技术是近年兴起的蛋白质组学研究前沿技术,其标准化和质量控制是其顺利应用到临床的关键。我们对SELDI-TOF-MS检测样本采集与制备、试剂的选择与保存、实验仪器的校准与维护;实验结果重复性验证与分析;数据处理与分析的标准化方法的选择、SELDI-TOF-MS技术系统标准化进行探讨和评价。  相似文献
3.
传染性非典型肺炎患者血清蛋白质指纹图谱分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
目的 探索表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI)在传染性非典型肺炎又称[严重急性呼吸综合征(SARS)]早期诊断中的应用价值。方法 用SELDI检测SARS患者组和对照组血清,建立诊断模型,然后进行单盲模型验证。结果 通过检测37例SARS患者和74名健康对照者血清,发现早期SARS患者血清中有4种特异性蛋白质荷比峰(M/Z)-3939.08、4137.71、8136.64和11514.20,其中4137.71下调,另3种上调,并以此建立SARS诊断模型,对37例SARS患者和73名对照者血清进行单盲检测,敏感性为97.3%(36/37),特异性为91.8%(67/73)。结论 用SELDI可从早期SARS患者中筛选出4个特异蛋白质荷比峰,以此建立的诊断模型可配合临床对SARS患者进行早期诊治。  相似文献
4.
目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和生物信息学分析技术寻找脑脊液中能鉴别脑膜瘤和其他脑良性肿瘤及脑外伤诊断的新标志物。方法收集14例脑膜瘤、9例其他脑良性肿瘤和27例轻度脑外伤患者的脑脊液标本,用H4蛋白芯片和SELDI-TOF-MS检测蛋白质谱的表达。用Biomarker PattemsTM Software分析软件进行数据处理,建立区分脑膜瘤和脑外伤患者脑脊液中蛋白质谱差异表达模型和区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液中蛋白质谱差异表达模型;并用2个模型对各2例脑膜瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤患者进行盲法交叉验证。结果用5个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和脑外伤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为98%(49/50).敏感性为100%(14/14),特异性为96.3%(26/27),阳性预测率为93.3%(14/15),阴性预测率为100%(27/27)。用4个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为96%(48/50),敏感性为100%(14/14),特异性为94.4%(34/36),阳性预测率为92.3%(14/16),阴性预测率为100%(34/34)。盲法交叉验证,第一个模型能将脑肿瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤全部正判,第二个模型将1例脑外伤误判。结论用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息学技术初步建立的区分脑膜瘤与脑外伤和其他脑良性肿瘤的脑脊液蛋白差异表达模型,为寻找脑膜瘤中新的肿瘤标志物进行蛋白质组学研究开辟了一条新的途径。  相似文献
5.
Insulin resistance may be modeled in H-411E liver cells in tissue culture with the use of the cytokine tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) and insulin. This tissue-culture model nicely mimics IR in human type 2 diabetes mellitus. After incubation of liver cells in tissue culture with INS alone, TNF-alpha alone, and TNF-alpha plus insulin, as well as a control sample, liver-cell extracts were separated on 2D polyacrylamide-gel electrophoresis on the basis of isoelectric point and molecular weight. We analyzed the gel images with the use of PD Quest software (Bio-Rad Laboratories, Hercules, Calif) to identify differentially expressed protein spots (ie, up or down with insulin vs down or up with TNF-alpha plus insulin). In separate experiments, phosphorus-32 incorporation/autoradiography and phosphoprotein staining were used to characterize treatment-induced phosphorylations. Affected protein spots were identified with the use of peptide fingerprinting and matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry. The first series of experiments identified 6 differentially expressed proteins: eukaryotic translation initiation factor-3, subunit 2, regulator of G-protein signaling-5, superoxide dismutase, protein disulfide isomerase A6, proteasome subunit-alpha type 3, and regucalcin. In addition, we observed changes in the phosphorylation of protein disulfide isomerase A6. A second series of experiments identified 7 additional proteins with significantly altered differential expression: cell-division protein kinase-4, kinogen heavy chain, carbonic anhydrase-7, E 3 ubiquitin protein ligase, URE-B1; Rab GDP dissociation inhibitor-beta, Rab GDP dissociation inhibitor-beta2, and MAWDBP. It can be seen that differentially expressed proteins, affected by treatment with insulin or with TNF-alpha plus insulin, include regulators of translation, protein degradation, cellular Ca ++ , G-proteins, and free-radical production. Although one cannot detail the mechanism or mechanisms of TNF-alpha induced IR from this data alone, it is easy to relate all of these proteins to a role in insulin signal transduction and, hence, insulin resistance.  相似文献
6.
目的 用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析食管癌高发区自然人群中贲门癌和正常对照血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立高发区贲门癌血清蛋白指纹图诊断模型并探究其临床价值。方法 采用CMIO蛋白芯片及SELDI-TOF-MS技术对34例贲门癌和38例正常对照者血清蛋白指纹图谱进行检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统(ZUCI-Protein Chip Data Analyze System)软件包分析,建立贲门癌蛋白指纹图诊断模型,并用留-法交叉验证作为评估模型、判别效果的方法。结果通过软件包运算,用3个质荷比峰(5643.45793、8570.82126、15940.1533m/z)建立了贲门癌蛋白指纹图诊断模型,其准确度93.06%,敏感度85.29%,特异度100%,阳性预测值100%。结论 本组建立的诊断模型可以有效区分贲门癌和健康人,为肿瘤高发区贲门癌的诊断与筛查提供了一条崭新途径。  相似文献
7.
乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱检测及其临床意义   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和蛋白质芯片检测乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱,初步探讨筛选候选肿瘤标志物建立的诊断模型在乳腺癌诊断中的临床意义。方法用SELDI-TOF-MS技术及配套蛋白质芯片检测49例乳腺癌和37例非乳腺癌疾病患者的血清蛋白质指纹图谱,并运用SPSS10.0软件判别分析处理数据和筛选标志物,以建立诊断模型。结果6个蛋白质峰[8611、16827、25711、28931、25485和2437质荷比(m/z)]组合构建的诊断模型Ⅰ鉴别乳腺癌和非乳腺癌疾病的敏感性为81.6%(40/49),特异性为78.4%(29/37)。6个蛋白质峰(4470、10854、19193、3883、2011和7470m/z)组合的诊断模型Ⅱ鉴别Ⅰ期乳腺癌与非乳腺癌疾病的敏感性为80.0%(12/15),特异性为89.2%(33/37)。5个蛋白质峰(2726、27014、2247、4477和19333m/z)组合的诊断模型Ⅲ鉴别Ⅰ期与Ⅱ~Ⅳ期乳腺癌的敏感性为91.2%(31/34),特异性为93.3%(14/15)。结论SELDI-TOF-MS在乳腺癌的诊断尤其是早期诊断、术前分期及候选肿瘤标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步深入研究。  相似文献
8.
Thioredoxin-1 (Trx-1) is a small redox protein that is overexpressed in many human tumors, where it is associated with aggressive tumor growth and decreased patient survival. Trx-1 is secreted by tumor cells and is present at increased levels in the plasma of cancer patients. PX-12 is an irreversible inhibitor of Trx-1 currently in clinical development as an antitumor agent. We have used SELDI-TOF mass spectroscopy to measure plasma Trx-1 from patients treated with PX-12 during a phase I study. Mean plasma Trx-1 levels at pretreatment were significantly elevated in the cancer patients at 182.0 ng/mL compared with 27.1 ng/mL in plasma from healthy volunteers. PX-12 treatment significantly lowered plasma Trx-1 in cancer patients having the highest plasma Trx-1 pretreatment levels. High-plasma vascular endothelial growth factor (VEGF) levels have been correlated to decreased patient survival. PX-12 treatment also significantly lowered plasma VEGF levels in cancer patients with high pretreatment VEGF levels. SELDI-TOF mass spectrometry identified seven additional plasma proteins whose levels decreased after PX-12 administration, one of which was identified as a truncated form of transthyretin. The results of this study suggest that the lowering of elevated levels of plasma Trx-1 in cancer patients may provide a surrogate for the inhibition of tumor Trx-1 by PX-12. Furthermore, PX-12 decreases plasma VEGF levels that may contribute to the antitumor activity of PX-12.  相似文献
9.
目的探讨3D K-空间Kz轴数据不对称填充方法在3D TOF脑动脉MRA的应用价值.方法 40例患者行Kz轴K-空间数据不对称填充的3D TOF脑动脉MRA(Turbo MRA)及Kz轴K-空间数据对称填充的3D TOF脑动脉MRA(常规MRA),在3D源图像和MIP图像上比较二种方法的影像质量、成像时间及显示血管的能力.结果 Kz轴不对称K-空间填充3D TOF脑动脉MRA与Kz轴对称K-空间填充3D TOF脑动脉MRA相比,影像质量指标(S/N、C/N、Rz)、采集时间TA、血管显示能力等均有显著性差异(P<0.01).结论 Kz轴K-空间不对称填充3D TOF脑动脉MRA与常规3D TOF脑动脉MRA相比成像质量更佳,显示血管更多,节约采集时间44%.  相似文献
10.
飞行时间质谱技术在食管鳞癌血清学诊断中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:用蛋白质质谱分析法寻找食管鳞状细胞癌相对特异的生物标志物。方法:用金属亲和表面(IMAC3)芯片和表面增强激光解析/电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测44例食管鳞癌患者、42例正常人血清的蛋白质质谱。应用Bio-marker Pattem软件建立决策树分类模型,经交叉验证得到该分类模型对测试组病变人群的诊断率。结果:用食管鳞癌患者与正常人质荷比为M9479.43的一种蛋白质建立的决策树分类模型,在学习模式下44例食管鳞癌患者中有43例被正确诊断,42例正常人有40例被诊断正常,诊断准确率为96.5%(83/86),敏感性和特异性分别为97.7%(43/44)、95.2%(40/42);在检测模式下44例食管鳞癌患者中有42例被正确诊断,42例正常人中有40例被正确分组,敏感性和特异性分别为95.4%(42/44)、95.2%(40/42)。结论:该方法可快速、准确检测食管鳞癌,敏感性、特异性高。  相似文献
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