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1.
2.
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC| ≥1 并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。  相似文献   
3.
目的探讨孤儿核受体NURR1表达上调对前列腺癌细胞基因表达谱的影响。 方法构建NURR1过表达载体,通过慢病毒感染方式上调前列腺癌LNCaP细胞中NURR1的表达水平。通过免疫细胞化学染色检测NURR1蛋白的表达,通过基因表达谱芯片分析NURR1过表达组和对照组LNCaP细胞的mRNA、lncRNA表达水平的变化。通过KEEG和GO分析探讨NURR1过表达对相关信号通路和功能的影响。 结果NURR1基因在LNCaP细胞过表达,与对照组比较共有515个基因发生差异表达,其中上调的mRNA238个,下调的mRNA195个;上调的lncRNA54个,下调的lncRNA28个。差异表达的mRNA和lncRNA主要在于细胞分子功能的改变,其中视网膜结合功能、铁离子结合能力、神经轴突调控以及氧化还原过程、细胞外区域的细胞学组成改变最为显著。细胞因子与细胞因子受体的相互作用以及调节干细胞多能性的有关信号通路都发生显著性改变。 结论NURR1基因的上调表达对前列腺癌细胞mRNA以及lncRNA表达谱显著改变,可能与其促进前列腺癌进展的功能有关。  相似文献   
4.
Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) is a tyrosine kinase receptor that plays a carcinogenic role in breast cancer (BC) through gene amplification, mutation, or overexpression. Traditional methods of HER2 detection were divided into positive (immunohistochemistry (IHC) 3+/fluorescence in situ hybridization (FISH) amplification) and negative (IHC 2+/FISH−, IHC 1+, IHC 0) according to the dichotomy method. Anti-HER2-targeted therapies, such as trastuzumab and pertuzumab, have significantly improved the prognosis of HER2-positive patients. However, up to 75% to 85% of patients remain HER2-negative. In recent years, with the rapid development of molecular biology, gene detection technology, targeted therapy, and immunotherapy, researchers have actively explored the clinicopathological characteristics, molecular biological characteristics, treatment methods, and HER2 detection methods of HER2-low/zero breast cancer. With the clinical efficacy of new anti-HER2 targeted drugs, accurate classification of breast cancer is very important for the treatment choice. Therefore, the following review summarizes the necessity of developing HER2 detection methods, and the clinicopathological and drug treatment characteristics of patients with HER2-low/zero, to light the dawn of the treatment of breast cancer patients with HER2-low/zero expression.  相似文献   
5.
6.
《Acta histochemica》2022,124(1):151821
The identification of the best reference gene is a critical step to evaluate the relative change in mRNA expression of a target gene by RT-qPCR. In this work, we evaluated nineteen genes of different functional classes using Real Time Human Reference Gene Panel (Roche Applied Sciences), to identify the internal housekeeping genes (HKGs) most suitable for gene expression normalization data in human cell lines. Normal cell lines CCD-19LU (lung fibroblast), HEK-293 (epithelial cell of embryonic kidney), WI-26 VA4 (lung fibroblast), and human cancer cells, BT-549 (breast cancer), Hs 578T (breast cancer), MACL-1 (breast cancer), HeLa (cervical carcinoma), U-87 MG (glioblastoma/astrocytoma), RKO-AS45–1 (colorectal carcinoma), and TOV-21G (ovarian adenocarcinoma) were cultivated according to manufacturer’s protocol. Twelve candidate reference genes were commonly expressed in five cell lines (CCD-19Lu, HEK-293, RKO-AS45–1, TOV-21G, and U-87 MG). To verify the expression stability, we used the RefFinder web tool, which integrates data from the computational programs Normfinder, BestKeeper, geNorm, and the comparative Delta-Ct method. The ACTB was the most stable reference gene to the CCD-19Lu and HEK-293 cells. The best combination of HKGs for the RKO-AS45–1 and TOV-21G cell lines were B2M/GAPDH and PBGD/B2M, respectively. For the U-87 MG cells, GAPDH and IPO8 were the most suitable HKGs. Thus, our findings showed that it is crucial to use the right HKGs to precise normalize gene expression levels in cancer studies, once a suitable HKG for one cell type cannot be to the other.  相似文献   
7.
8.
陈霄  吴小颖  安明 《天津医药》2022,50(12):1254-1258
目的 探讨长链非编码RNA SRY-box转录因子21反义RNA 1(lncRNA SOX21-AS1)对卵巢癌细胞增殖和转移能力的影响及其作用机制。方法 选取卵巢癌组织和其邻近的癌旁组织各75例,另选取卵巢癌细胞株SKOV3、A2780、OVCR3和人卵巢正常上皮细胞HOSE作为实验对象,实时荧光定量PCR法检测lncRNA SOX21-AS1在组织和细胞中的表达。根据是否干扰lncRNA SOX21-AS1表达将细胞分为si-NC组和si-SOX21-AS1组。MTS实验和平板克隆实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞转移能力,TOP/FOP荧光素酶实验和Western blot实验检测细胞中Wnt/β-catenin信号通路活性和相关蛋白表达水平。结果 与癌旁组织相比,lncRNA SOX21-AS1在卵巢癌组织中的表达上调(P<0.05)。与卵巢正常上皮细胞HOSE相比,lncRNA SOX21-AS1在卵巢癌细胞中的表达上调,SKOV3中最高(P<0.05)。与FIGO分期Ⅰ-Ⅱ期、无淋巴结转移的患者相比,FIGO分期Ⅲ-Ⅳ期、有淋巴结转移患者lncRNA SOX21-AS1相对表达水平升高(P<0.05)。干扰lncRNA SOX21-AS1表达可抑制卵巢癌细胞增殖和转移能力、抑制Wnt/β-catenin信号通路活性并降低Wnt/β-catenin信号通路各蛋白的表达水平(P<0.05)。结论 lncRNA SOX21-AS1在卵巢癌组织和细胞中高表达,干扰lncRNA SOX21-AS1的表达可抑制卵巢癌细胞增殖和转移能力。  相似文献   
9.
目的 探讨脑星形胶质细胞瘤羧肽酶E(CPE)的表达及其病人预后的关系。方法 选取2011年3月至2012年3月手术切除并经术后病理证实的脑星形胶质细胞瘤86例,免疫组织化学染色检测组织CPE表达水平,根据染色强度分为高表达和低表达。随访截止2022年3月,记录总生存时间(OS)。结果 86例中,毛细胞型(WHO分级Ⅰ级)20例,弥漫型(WHO分Ⅱ级)22例,间变型(WHO分Ⅲ级)26例。WHO分级Ⅲ级星形细胞瘤CPE高表达率[65.00%(13/20)]明显高于WHO分级Ⅰ级[45.45%(10/22)]、Ⅱ级[34.62%(9/26)]星形细胞瘤(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,CPE低表达是星形胶质细胞瘤患存预后不良的独立影响因素(HR=3.000;95% CI 1.274~4.462;P<0.001)。生存曲线分析显示CPE低表达组中位OS[12个月(9~38个月)]明显低于高表达组[18个月(14~44);P<0.05]。结论 随WHO分级升高,星形胶质细胞瘤CPE表达水平逐渐降低,CPE低表达与脑星形胶质细胞瘤不良生存预后有关。  相似文献   
10.
目的 克隆菊花脑芳樟醇合酶基因CnTPS1的全长编码序列,利用原核系统表达融合蛋白,为进一步研究该基因在菊花脑萜类合成中的功能提供理论依据。方法 以菊花脑基因组数据为基础,设计特异性引物,PCR扩增CnTPS1的全长编码序列,利用生物信息学分析软件分析序列特征。利用qRT-PCR技术分析CnTPS1基因在不同组织中的基因表达量。构建原核表达载体,体外诱导目的蛋白表达。结果 CnTPS1编码序列全长1749bp,编码582个氨基酸;基因表达模式分析表明该基因在茎和管状花中表达量较高;原核表达系统能诱导出67.58kDa大小的蛋白。结论 首次从菊花脑中克隆得到一个芳樟醇合酶基因CnTPS1,运用生物信息学方法对其编码蛋白的理化性质、结构特征等进行了分析预测,分析了该基因的组织表达模式,并在原核表达系统中成功诱导表达出目标蛋白,这些结果将为菊花脑萜类合酶基因的功能以及萜类物质生物合成途径的解析提供理论依据。  相似文献   
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