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1.
目的 从腹泻树鼩的粪便样本中分离和鉴定病毒。方法 树鼩腹泻粪便样本分别接种Vero、LLC-MK2和KMB17细胞,经连续传代,观察记录细胞病变,并对培养上清进行透射电镜检查、病毒RNA-PAGE胶电泳分析、轮状病毒鉴别筛查、S1全长基因片段扩增和生物信息学分析。结果 树鼩腹泻粪便样品在KMB17、Vero 和LLC-MK2细胞上经连续3代次传代后,均能产生细胞病变。进一步经电镜检查、病毒RNA的聚丙烯酰胺凝胶电泳分析和轮状病毒鉴别筛查,推测其为呼肠孤病毒。病毒基因组全长S1基因扩增、序列测定和分析结果表明,KMB17培养上清中获得的病毒与I型原型株T1L同源性最高,核苷酸和氨基酸同源性分别为85%和90%,因此该病毒定义为呼肠孤病毒I型。而LLC-MK2和Vero细胞上清中的病毒S1基因与III型原型株T3D核苷酸和氨基酸同源性分别为85%和92 %,因此为III型病毒。S1基因的遗传进化分析表明,本研究的分离株已经进化适应了树鼩。结论 本研究首次通过3种基质细胞和S1基因片段特异性引物从同一粪便样品中分离和鉴定了2个不同基因型呼肠孤病毒,对今后树鼩和其它宿主呼肠孤病毒的分离鉴定有一定的指导意义。  相似文献   
2.
目的:了解重庆地区近年来丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)基因型分布、演变和可能的临床意义,为更好防治丙型肝炎提供依据。方法:回顾性研究2010年1月至2013年12月期间在重庆医科大学附属第二医院就诊并有基因分型结果的丙型肝炎患者的基因型分布,并与该地区其它文献报道的数据相比较,探讨基因型演变的可能影响因素。结果:共收集941例HCV感染者,检出4种基因型、9种基因亚型,成功进行基因分型有857例(均为单一基因型,分型率91.1%)。其基因型分布为:1a 30例(3.5%)、1b 238例(27.8%)、2a 42例(4.9%)、2b 1例(0.1%)、3a 132例(15.4%)、3b 244例(28.5%)、3k 6例(0.7%)、6a124例(14.5%)、6b 40例(4.7%)。与5年前的结果比较发现HCV 1b、2a亚型明显下降,3型、6型比例上升,差异具有统计学意义。结论:3b、1b型为目前重庆地区丙型肝炎患者感染HCV的主要基因型,3a、6a型亦占有较大比例,提示重庆地区HCV流行的基因型呈现多样性。  相似文献   
3.
目的:调查重庆地区梅毒螺旋体基因亚型的分布,初步探讨基因亚型与临床相关性。方法:收集2010年6月至2013年10月重庆地区421例梅毒标本,用巢式PCR检测梅毒螺旋体DNA多聚酶I基因(DNA polymerase I gene,polA),然后扩增阳性标本酸性重复蛋白基因(acid repeat protein,arp)和苍白密螺旋体重复家族基因(treponema pallidum repeat,tpr)及TP0548基因,分别根据Pillay标准基因分型和三基因分型法进行分型,利用双侧Fisher’s exact test进行数据统计分析,初步探讨不同基因亚型与血清固定、梅毒复发和吉海反应的相关性。结果:163例标本polA PCR检测阳性,arp、tpr基因和TP0548基因亚型分别以14型、d型和f型为主。正规驱梅治疗12月后,32例患者血清固定,其中tpr基因d型(11例)、a和b型(各2例)和f型(1例);3例患者梅毒复发,其中TP0548基因c型(2例)和f型(1例);8例发生吉海反应,其中14f/f(4例),14d/f(3例)和未分型(1例)。结论:重庆地区梅毒螺旋体以14、d和f型为优势型。梅毒血清固定可能与tpr基因b型相关,14f/f基因型的二期梅毒患者易发生苄星青霉素治疗后的吉海反应。  相似文献   
4.
Background Osteoarthritis (OA) is the most common form of human polyarthritis.Many genetic factors have been implicated in OA.It was reported that a polymorphism in the gene of interleukin-6 (IL-6) was associated with OA of knee.The aim of this study was to determine whether functional IL-6 promoter-174G/C (rs1800795) polymorphisms confer susceptibility to knee OA.Methods A meta-analysis was conducted on the association between the IL-6 polymorphism and knee OA.Electronic search at PubMed,EMBASE,Weipu database,and Wanfang database was conducted to select studies.Case-control studies containing available genotype frequencies of IL-6-174G/C were chosen,and odds ratio (OR) with 95% confidence interval (C/) was used to assess the strength of this association.Results A total of seven studies involving 6 464 subjects (knee OA 3 331 and controls 3 133) were considered in this study.The results suggested that the variant genotypes were not associated with knee OA risk in all genetic models (additive model:OR=1.144,95% CI 0.934-1.402,P=0.194; recessive model:OR=1.113,95% CI 0.799-1.550,P=0.526;dominant model:OR=1.186,95% CI 0.918-1.531,P=0.191).A symmetric funnel plot,the Begg's test (P >0.05),suggested that the data lacked publication bias.Conclusions This meta-analysis does not support the idea that rs1800795 genotype is associated with increased risk of knee OA.However,to draw comprehensive and more reliable conclusions,further prospective studies with larger numbers of participants worldwide are needed to examine the association between rs1800795 polymorphism and knee OA.  相似文献   
5.
Background Preeclampsia,characterized by hypertension and proteinuria,is a multifactorial disease associated with shallow invasion of trophoblast cells and inadequate spiral artery remodeling.Trophoblast and tumor cells have similar invasion mechanism.Prostasin is closely related to tumor development,invasion and metastasis and influences blood pressure through activating epithelial sodium channel.The effect of prostasin on the pathogenesis of preeclampsia remains unclear.This study investigated the association of prostasin gene at rs12597511 with severe preeclampsia.Methods A single nucleotide polymorphism,rs12597511,was tested with polymerase chain reaction and restrictionfragment length polymorphism analyses in 179 severe preeclampsia patients and 222 normal pregnant women.Results The frequencies of TC + CC genotypes were significantly higher in severe preeclampsia group compared with in control group (the adjusted odds ratio was 2.030,95% confidence interval 1.195-3.449,P=0.009).The C allele of rs12597511 was present significantly more often among women with severe preeclampsia (P=0.001).Genotyping analysis showed that the C allele of rs12597511 could confer a risk for severe preeclampsia.Conclusion The higher frequency of C allele of prostasin gene at rs12597511 is associated with severe preeclampsia.  相似文献   
6.
目的了解北京市5岁以下婴幼儿轮状病毒腹泻患者的流行特点。方法2011年1月至12月在北京市3家医院肠道门诊收集输液两次以上5岁以下腹泻患者病例604例,采集粪便标本,应用酶联免疫吸附试验检测轮状病毒抗原,阳性标本用半巢式反转录PCR进行基因分型。结果604例标本中96例轮状病毒抗原阳性,阳性率为15.89%。秋冬季为A组轮状病毒腹泻的发病高峰,其中11月份A组轮状病毒阳性率最高(55.56%,30/54)。轮状病毒腹泻主要发生于3—23月龄患者(93.76%,90/96)。对轮状病毒抗原阳性标本进行G/P分型,G分型以G3+G9型混合感染占第一位(37.50%,36/96),其它型别主要有G3型(28.12%,27/96),G1型(11.46%,11/96),G9型(9.38%,9/96),G2型(8.33%,8/96)。P分型以P8型为主要优势株(86.46%,83/604),其次为P4型(10.42%,10/96)。最常见的G/P基因型组合为G3+G9/[P8](36.46%,35/96),其次为G3/[P8](26.04%,25/96),GI/[P8](11.46%,11/96),G9/[P8](9.38%,9/96),C2/[P4](8.33%,8/96)。结论A组轮状病毒是北京市婴幼儿腹泻的主要病原之一,2011年主要流行株基因型组合为G3+G9/P[8]。  相似文献   
7.
背景:microRNAs(miRNAs)的单核苷酸多态性(SNPs)可以通过改变miRNAs的加工处理、转录及表达,从而促进癌症的发生发展。我们推测前体miRNAs常见的多态性,甚至可以说,整体性与  相似文献   
8.
郭珊 《国际病毒学杂志》2011,18(2):63-64,后插1
1 巨细胞病毒的型别多样性及分型方法概述人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)属于疱疹病毒β亚科,为线状双链DNA病毒,其DNA链全长超过240kb,是最大的疱疹类病毒.虽然HCMV大部分的基因序列高度保守,但部分位点的基因存在不同程度的变异,如编码CXC趋化因子UL146、编码Ⅰ型膜糖蛋白的UL139和编码不同包膜糖蛋白的基因都高度可变.  相似文献   
9.
目的 了解河北省婴幼儿腹泻患者轮状病毒的感染特点及基因型别的变迁情况.方法 2007 -2010年在河北卢龙县医院和卢龙县妇幼保健院收集5岁以下腹泻住院病例1643例的粪便标本,采用酶联免疫吸附试验( ELISA)检测轮状病毒抗原,阳性标本用多重反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行基因分型.结果 1643例标本中8...  相似文献   
10.
目的 探讨肿瘤坏死因子(TNF)A-863C/A基因型与慢性牙周炎和冠心病的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法分别检测慢性牙周炎(Chronic periodontitis,CP)组、冠心病(Coronary heart Disease,CHD)组、慢性牙周炎合并冠心病(CP+CHD)组以及健康对照...  相似文献   
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