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目的:通过分析肺鳞癌及癌旁组织差异表达基因,初步筛选潜在生物标志物。方法:从公共基因表达数据库(GEO)下载肺鳞癌的芯片数据集。利用R语言limma包对原始数据进行预处理并筛选差异表达基因,通过R语言的clusterProfiler包对差异表达基因进行GO和KEGG分析。利用STRING在线软件分析差异基因表达蛋白之间的相互作用,并通过Cytoscape筛选关键基因,进而用GEPIA在线软件验证关键基因的表达情况。结果:通过分析共得到734个差异表达基因,其中290个基因在肺鳞癌中上调,444个基因下调。GO分析显示差异表达基因主要参与的生物过程包括细胞外结构组织、体液水平调节、中性粒细胞介导的免疫应答等。KEGG分析显示差异表达基因主要富集在补体系统、细胞周期、DNA复制等信号通路。通过蛋白互作分析筛选出的关键基因包括PCNA、FOS、PTPRC、MMP9、CDK1、CCL2、IL6、GMPS、CCNB1、TOP2A。经验证PCNA、MMP9、CDK1、GMPS、CCNB1、TOP2A在肺鳞癌中表达增高,FOS、PTPRC、CCL2、IL6在癌组织中表达降低。结论:通过生物信息学筛选差异表达基因和信号通路可能有助于肺鳞癌的分子机制研究,筛选得到的核心基因可能成为肺鳞癌的诊断及治疗靶点。  相似文献   
2.
摘要:目的:探讨索拉菲尼在调控Y盒结合蛋白1(YB1)表达以及影响肾癌细胞系SW839的增殖、趋化和侵袭中的作用。 方法:构建慢病毒介导的YB1干扰载体pLKO.1-shYB1,建立YB1降表达的稳定SW339细胞系;用不同浓度的索拉菲尼处理SW839细胞后,western blot验证YB1的干扰效率以及索拉菲尼对YB1蛋白质表达水平的影响;MTT实验、Transwell趋化实验和Matrigel侵袭实验分别检测YB1基因敲减和索拉菲尼处理对SW839细胞增殖、趋化和侵袭能力的影响。 结果:成功构建YB1降表达的稳定细胞系SW839-shYB1;western blot检测结果发现,SW839-shYB1组YB1蛋白表达水平低于SW839-scr(阴性对照)组和SW839组(P<0.05);与SW839组相比,4、8 μmol/L索拉菲尼处理组YB1蛋白质的表达水平均下降(P<0.05)。MTT实验结果表明,敲减YB1基因(t分别为6.13、4.61和17.18)或经8、12、16 μmol/L索拉菲尼作用后(t分别为4.04、7.54和16.38)SW839细胞的增殖能力降低(P均<0.05);Transwell结果表明,与对照组比较,经表皮生长因子(EGF)诱导后,SW839 shYB1组和索拉菲尼处理组的细胞趋化能力降低(t分别为11.52和17.94,P均<0.05),侵袭能力亦降低(t分别为6.64和4.83,P均<0.05)。 结论:YB1在调节肾癌细胞系SW839的增殖、趋化和侵袭中起重要作用,索拉菲尼可能通过抑制SW839细胞中YB1表达来抑制肾癌细胞的增殖、趋化和侵袭。  相似文献   
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YB-1普遍存在于原核和真核生物细胞中,作为信号分子参与许多胞内信号传导通路,例如E2F通路、P13K/Akt/mTOR通路及MAPK通路的调节,在转录调节、翻译调控、mRNA选择性剪接、DNA的修复、细胞增殖和再生等过程中发挥多种重要的生物学功能。研究证实YB—1在前列腺癌、乳腺癌、肺癌和卵巢癌等多种肿瘤中异常表达,且在肿瘤细胞核内异常聚集,YB-1的异常表达与肿瘤的预后相关。YB-1在肿瘤的发生、演进、转移、肿瘤细胞耐药、肿瘤治疗及预后中都发挥着极为重要的作用,下面就YB-1对细胞增殖的影响做-综述。  相似文献   
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目的:探究提高钛合金骨植入材料的抗菌性及生物相容性的有效方法。方法:本文以3D打印的多孔钛合金为支架,将负载有庆大霉素的明胶填充于其中以制备复合骨植入材料;通过红外吸收光谱、水溶性及体外药物释放测试评价不同载药量对明胶稳定性的影响;利用细菌黏附、细菌活性以及抑菌圈实验分析该复合材料的抗菌性能;采用细胞活性实验评价该材料的生物相容性。结果:不同载药量下明胶的耐水性均达到6 d,药物释放效应可维持到明胶完全溶解;载药量的提升能更有效地抑制大肠杆菌(E. coli)和金黄色葡萄球菌(S. aureus)的生长,在载药量为8 mg/mL的情况下,两种细菌的抑菌圈最大;细胞毒性分析发现不同载药量对成骨细胞的活性无显著影响(P>0.05)。结论:此复合骨植入体材料具有良好的体外抑菌性能及生物相容性。  相似文献   
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