MEK1及其突变体的曲美替尼结合轨迹马尔可夫模型分析

MEK1是Ras-Raf-MEK-ERK通路中重要的信号分子,在肿瘤发生中发挥着重要的作用。通路中的Raf、MEK1等基因发生突变导致通路被持续活化被认为是导致肿瘤无限增殖的重要原因之一。曲美替尼能有效地抑制MEK1的活性,MEK1结构中α螺旋的消失会降低曲美替尼的治疗效果。该研究通过PCCA+聚类算法、马尔可夫模型和通量分析等方法,对E203K突变体和曲美替尼的作用轨迹进行分析,研究发现E203K、P124S和野生型MEK1在与曲美替尼作用时,C166-S181部分靠近曲美替尼的一端会发生解旋变为氢键转角,而远端螺旋则不会发生解旋。