NGS检测乙型肝炎病毒耐药基因突变情况及其临床意义

目的检测乙型肝炎患者的HBV YMDD突变情况,探究下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)检测HBV耐药基因突变的可行性及患者性别与其YMDD突变的相关性,并为临床用药提供参考。方法运用NGS测序技术对收集的100例临床样本进行HBV YMDD突变的检测,并与临床检测金标准Sanger测序法的测序结果进行比对。结果运用NGS检测100例HBV样本,其中YMDD野生型88例,HBV YMDD耐药基因突变12例,与Sanger测序法的测序结果完全相符。结论本研究结果显示,NGS技术可用于HBV耐药基因突变检测,患者性别与HBV耐药突变无明显相关性。     

HCV 3b亚型全长序列测定及基线耐药相关置换的分析

目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然后通过生物信息学方法分析HCV全长序列、病毒基因分型以及针对直接抗病毒药物(DAA)的基线RAS。结果NGS获得8.4 Gb原始测序数据,序列数(reads)超过56 M。经生物信息学分析获得HCV全长序列,平均测序深度为488007,基因分型结果为3b亚型。病毒氨基酸序列里含有12个RAS,分别是NS3区域的Y56H、Q80K、Q80R、A156G,NS5A区域的M28G、Q/A30G、Q/A30K、L31F、L31M、Y93H,以及NS5B区域的S282T和V321A,其中位于NS5A区域的Q/A30K和L31M属于高丰度RAS(99.16%和98.37%),其余10个RAS丰度较低(<0.5%)。结论NGS用于HCV 3b亚型的全长序列检测和基因分型,最终鉴定出基线RAS,对于HCV 3b的流行病学研究和DAA治疗方案的制订有重要意义。     

液体活检分析技术研究进展

液体活检是一种利用人体体液获取疾病信息的技术,可实现对肿瘤的动态监测,具有巨大的临床应用前景。肿瘤液体活检主要包括对外周血中肿瘤相关的循环核酸、细胞外囊泡和循环肿瘤细胞的检测。该文主要对循环肿瘤DNA、细胞外囊泡及循环肿瘤细胞的检测技术作简要综述。     

下一代测序技术在胚胎植入前遗传学检测中的应用

以下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)为代表的基因组学技术的迅猛发展给全面深度的染色体筛查和基因诊断提供了机会.NGS也迅速应用于胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)和胚胎植入前遗传学筛查(preimplantation genetic screening,PGS)临床检测中,成为常规检测技术,经济与可靠使其具有更广阔的应用前景.单细胞全基因组扩增(whole genome amplification,WGA)技术的进步使得NGS在PGD和PGS的临床应用中能够更加全面了解植入前胚胎的遗传学信息,可以检测到更加细微的差异;基于NGS技术的PGS和PGD将给移植成功率和试管婴儿(in-vitro fertilization,IVF)出生率带来明显提升.本文主要介绍PGD/PGS的定义、传统的PGD/PGS检测技术,单细胞全基因组扩增技术以及NGS在PGD/PGS中的应用.     

非小细胞肺癌组织中ALK、ROS1、RET融合基因检测方法的比较

非小细胞肺癌在恶性肿瘤中的发病率和死亡率中高居榜首,是中国首要的一个公共卫生问题.近年出现的分子靶向药能显著改善非小细胞肺癌患者的生存质量,因此对患者突变基因的准确检测显得尤为重要.目前临床上检测非小细胞肺癌患者ALK、ROS1、RET融合基因的主要方法有荧光原位杂交、免疫组织化学、逆转录聚合酶链反应以及新兴起的下一代测序,但这4种方法优缺点各异.本文通过比较这几种常见的检测方法,为融合基因检测方法的选择提供参考.     

乙肝标志物定量测定试剂盒的性能验证及临床应用评价

目的验证乙型肝炎病毒血清标志物(HBV-M)定量测定试剂盒的定量分析性能,并与Abbott的HBV-M试剂进行比对,以评价其临床应用价值。方法本研究根据WS/T 420-2013的验证方法,对HBV-M定量检测试剂盒的精密度、正确度和线性(测量区间)进行验证,然后与Abbott的试剂同步测定临床样本,并对两种试剂的检测结果进行统计分析,以评价其临床应用价值。结果本研究按照WS/T 420-2013的方法进行验证,HBV-M定量检测试剂盒标示的精密度、正确度和线性(测量区间)是可靠的,与Abbott试剂的结果对比,两者的总符合率分别为HBs Ag 99.25%、抗HBs 98.63%、HBe Ag100%、抗HBe 98.77%及抗HBc 100%。HBs Ag和抗HBs项目的样本测值相关系数R2值分别为0.973和0.979,2种试剂的检测结果无显著性差异(P>0.05)。结论本研究评估的HBV-M定量检测试剂盒,能满足临床定量检测的需求,且能达到进口试剂的性能水平,具有较高的临床应用价值。     

Notch信号通路在肿瘤微环境中的调控作用

摘 要：肿瘤细胞与肿瘤微环境（tumor microenvironment，TME）之间通过多种信号通路相互作用，其中Notch信号被认为是重要的信号通路之一。现已证实Notch信号与TME之间的相互作用参与调节肿瘤的血管生成、肿瘤干细胞干性的维持、免疫细胞的浸润和对治疗的抗性。此外，Notch信号还介导许多分子的分泌，影响TME中的细胞功能。大量研究表明，Notch信号在TME中的作用与不同肿瘤中Notch的促癌和抑癌特性有关。该综述讨论了Notch信号在调节TME不同组分之间的相互作用中发挥的重要作用，还从治疗的角度讨论了Notch―TME相互作用的结果。     

海南黎族人群乙肝感染情况与风险因素分析

目的:了解海南黎族人群乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)的感染情况并分析其相关风险因素。方法:于2014 年7 月至2015 年10 月采用随机抽样的方法选取1 595 名海南白沙黎族居民作为研究对象,获得其基线资料和风险因素等流行病学资料,采用化学发光法检测血浆的乙肝核心抗体(HBcAb),用t 检验分析HBcAb 阳性组与阴性组之间年龄的差异,用单因素卡方检验和多因素Logistics 回归分析年龄、性别及相关风险因素对HBcAb 的影响。结果:该人群HBcAb 的阳性率为71.8%(1 145/1 595)。男性与女性的阳性率差异无统计学意义( 2 =0.134,P =0.715)。各年龄组之间HBV 感染率的差异有统计学意义(F =540.769,P<0.001)。其中,12 ~ 17 岁组的HBV 感染率(11.9%)显著低于其他各年龄组,18 ~ 23 岁组(28.0%)显著高于12 ~17 岁组,但显著低于其余(>23 岁)年龄组(>85%)。多因素Logistics 回归分析显示饮酒和纹身均是该人群HBV 感染的独立风险因素( 2 =169.833,P<0.001; 2 =11.354,P =0.001)。结论:海南黎族人群的HBV 感染率较高,年龄、饮酒和纹身是该人群感染的独立风险因素。     

量子点作为荧光探针的生物应用进展

量子点作为一种新型的荧光纳米材料,因其量子效应,宽激发光谱及高摩尔消光系数等优点引起了广泛关注,近年来,随着水溶性量子点制备技术的发展,其生物学应用也愈发广泛。本文简述量子点的结构和特性,及水溶性量子点作为荧光探针在生物成像、体外诊断及其他方面的生物学应用,对磁珠量子点在体外诊断的应用、量子点在快速诊断中的应用、量子点的双标记、量子点在光激化学发光法的初步应用作重点论述。另外本文还对其应用的高通量、自动化、多元化作一展望。     

Notch信号通路在感染过程中对免疫应答的调控作用

感染启动的先天性和适应性免疫应答依赖于巨噬细胞、树突状细胞以及T细胞等对病原体的识别与控制。Notch信号是一种高度保守的信号通路,通过相邻细胞间配受体结合被激活,进而协调细胞的重要生命过程。目前已证实Notch信号通路参与多种免疫细胞发育、分化、成熟和激活,并在感染性疾病中发挥重要作用。本文综述Notch信号通路在不同病原体感染过程中的免疫调控作用及其与其他通路的相互作用,并讨论在感染性疾病中以Notch信号为靶点的治疗方法及面临的挑战。