广东新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子进化与变异

目的 揭示广东地区2009-2011年新型H1N1病毒血凝素基因(HA)进化特征及抗原表位变异特征.方法 采用时空抽样方法抽样,检测2009-2011年广东分离的24株新型H1N1病毒HA基因核苷酸序列,与GenBank中44株国外相应序列比较;比对HA基因核苷酸序列,分析基因分子变异,构建分子遗传动力学MCMC进化树;同时分析2009-2011年广东毒株HA基因的抗原表位变异情况.结果 68株HA基因进化树显示,广东毒株进化树主干至少分为6大分支;其中2011年毒株聚类为2个(Ⅴ和Ⅵ)主要分支,各具基因特征.变异频率较高的位点包括391、467、202和214位,正向选择位点包括8、145和391;广东毒株抗原表位区发生S145L/P、L208I、Q240R、S160G和G187R位点变异.2009年广东毒株HA基因分支Ⅰ毒株可能于2010年传播到亚洲、欧洲和澳洲地区.结论 广东新型H1N1病毒HA基因变异具有传播特征(Ⅰ)和地区特征(Ⅵ),位于抗原表位Ca、Sa和Sb的氨基酸发生变异,其中位点145等变异频率较高,承受着正向选择压力.     

两种新型冠状病毒免疫学检测方法的应用评价

目的：为有效检测新型冠状病毒特异性抗体（新冠抗体），利用化学发光法和胶体金法分别检测已完成中和试验的92份血清，对两种方法的敏感度和特异度等进行初步比较和评价，为大规模人群免疫后血清SARS-CoV-2抗体水平监测提供参考。方法：采用病毒中和试验、胶体金试剂盒和全自动化学发光分析仪分别对样本开展SARS-CoV-2特异性抗体检测，计算诊断特异度、敏感度、阴阳性预测值和符合率。结果：化学发光法的灵敏度为100.00%，高于胶体金法的71.64%；胶体金法的特异度为92.00%，高于化学发光法的64.00%；胶体金法阴阳性预测值分别为54.76%和96.00%，而化学发光法的阴阳性预测值分别为100.00%和88.16%；胶体金法和化学发光法的Kappa值分别为0.525和0.721。结论：以微量病毒中和抗体试验为金标准，化学发光法的灵敏度和Kappa值较高，适用于SARS-CoV-2病例辅助性快速检测；胶体金法测定SARS-CoV-2特异度总抗体的灵敏度一般，特异度较高，其使用简便快速、成本低廉，在条件限制、需要及时监测等情况下，适用于快速大规模筛查以及阳性样本初步检测。随着新冠疫苗在人...