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目的:基于TCGA数据库筛选预后相关的高尔基体相关基因,进一步构建喉癌预后的风险模型。方法:根据分子特征数据库获取高尔基体相关基因图谱。筛选TCGA数据库中喉癌和癌旁组织转录组数据中高尔基体相关基因表达谱,采用limma法对癌和癌旁数据进行差异分析。高尔基体相关基因表达谱结合临床数据进行单因素独立预后分析获取与预后相关的基因。差异基因与预后基因进行交叉分析,获得的基因再进行LASSO回归构建模型。Kaplan-Meier法分析高低风险组预后。ROC曲线验证该预测模型的可靠性。利用实时荧光定量PCR和免疫印迹实验鉴定喉癌和癌旁组织中基因表达的差异。结果:从MSigDB数据库获得1 659个高尔基体相关基因,结合TCGA数据库中喉癌数据,共获得1 084个高尔基体基因表达矩阵,通过差异分析共得到77个上调和190个下调高尔基体相关基因。通过对1 084个高尔基体相关基因进行单因素预后分析,得到了8个喉癌预后抑制因子和15个喉癌预后促进因子。通过交叉分析,最终得到1个在喉癌癌旁组织中高表达的预后抑制因子和5个喉癌组织中高表达的预后促进因子。对获得的6个基因进行LASSO回归分析构建模型,Kaplan-Meier法分析结果显示高风险组比低风险组预后差(P<0.05)。ROC曲线验证该预测模型的可靠性较好。实时荧光定量PCR和免疫印迹实验验证TMC8在喉癌中表达低于癌旁组织,SLC35C1、PDGFA、GALNT2、ITGA5在喉癌中表达高于癌旁组织。结论:采用生物信息学分析方法结合实验验证,筛选并构建了一个喉癌预后的预测模型,为该疾病的研究和诊治提供新的思路和方法。 相似文献
12.
目的探索一种更加有效的通过尿液细胞中多基因甲基化分析诊断膀胱癌的方法。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测37例膀胱癌患者和31例非膀胱癌对照患者尿液中P14、RASSF1A、SLIT2、RASAL1基因启动子区的甲基化状态。结果尿液细胞中通过P14、RASSF1A、SLIT2、RASAL1基因启动子区的甲基化状态检测膀胱癌的敏感性分别为75.7%、75.7%、62.2%、37.8%,与此相对它们的特异性为77.4%、90.3%、90.3%、93.5%。当4个基因中只有一个出现甲基化就诊断为膀胱癌时的敏感性为89.2%。结论膀胱癌患者尿液中多基因甲基化联合分析可能是一种高效的诊断膀胱癌的方法。 相似文献
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目的:探讨思维导图联合流程图这一可视化的新型教学工具在血管外科急诊教学改革中的应用价值。方法:通过该教学工具在血管外科急诊教学的课前准备环节、课堂实施、课后归纳复习、课程评价维护中的具体应用,评价该模式的教学效果。结果:思维导图联合流程图可将医学理论知识可视化,培养医学生的抽象临床思维,最终建立完整的知识架构。结论:结合血管外科急诊疾病的病情危急、疾病谱广、实践性及时间性强等特点,思维导图联合流程图可作为一种新型教学工具,应用于血管外科急诊教学改革中。 相似文献