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1.
赵阳  郑景辉  徐文华  赵新望 《中华中医药学刊》2020,(1):105-109,I0022-I0024
目的通过系统药理学和分子对接方法,对薤白治疗冠心病的作用机制进行研究。方法收集薤白的有效化合物;预测这些化合物对冠心病的作用靶点;对这些靶点进行PPI网络图的构建、GO富集分析和KEGG通路注释分析;将这些化合物与靶点进行分子对接。结果薤白共收集到11个有效化合物,作用于30个冠心病相关靶点。PPI网络图显示ALB、ACE、REN、MMP9、MAPK1、NOS3、F2、MMP2、SELE、PPARG为10个联系最多的靶点。GO富集分析显示出66个生物过程、22个分子功能、11个细胞成分,涉及雌激素反应、凝血、冠脉炎症、RAAS系统、抗氧化、稳定粥样斑块6个方面。KEGG通路注释分析显示出13条通路,其中6条通路与冠心病相关,分别是:Estrogen signaling pathway、PPAR signaling pathway、Complement and coagulation cascades、Renin-angiotensin system、HIF-1 signaling pathway and TNF signaling pathway。330组分子对接结果显示233组具有较好的结合活性。结论枳实薤白桂枝汤治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,可能通过抗凝血、稳斑块、抗氧化、抗炎症、降血脂、抑制RASS系统、增加NO保护、促进雌激素分泌8个方面发挥治疗冠心病的作用,且Estrogen signaling pathway是薤白作用冠心病的最主要通路。  相似文献   
2.
目的基于网络药理学探讨葛根素注射液对高血压的作用机制。方法利用CTD数据库筛选葛根素注射液中的作用靶点,构建葛根素注射液作用靶点的蛋白互作网络;基于Genecards数据库筛选高血压相关的靶点,并利用venn工具绘制葛根素注射液药物靶点与高血压疾病靶点的韦恩图,并通过生物信息学手段对葛根素注射液对高血压的作用靶点进行GO分析及KEGG分析。结果经CTD筛选99个靶点,包括与高血压相关30个作用靶点;经Bonferroni校正P值均0.01,经Kappa算法分为活性氧代谢过程、外分泌细胞凋亡、骨髓白细胞分化、细胞对外界刺激的反应等27大类别;得出19条信号通路,经Bonferroni校正P值均0.01。结论研究结果初步预测了葛根素注射液对高血压的基本药理基础及功效机制,与现代药理学研究以及临床用药规律有一定契合,葛根素注射液治疗高血压具有多基因参与的特点,可能与细胞分化凋亡以及活性氧代谢有关。  相似文献   
3.
目的 探讨人参汤的功效物质基础和作用机制。方法 利用TCMSP平台检索人参汤4味中药人参、甘草,干姜,白术的化学成分和作用靶点,并根据口服生物利用度以及药物相似性对潜在的生物活性成分进行筛选。本研究采用David v6.8数据库对交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果 共得出126个活性成分,对应81个靶点,与冠心病相关靶点18个,通过GO分析得出85条生物过程(BP,biological process)、10条细胞组分(CC,cellular component)、14条分子功能(MF,molecular function),通过KEGG通路富集得出23条信号通路。结论 本研究结果初步分析人参汤防治疾病的分子机制,为进一步深入探讨其作用机制提供先导信息和基础。  相似文献   
4.
徐文华  郑景辉  赵阳  赵新望  董音汝  李丽 《中草药》2019,50(5):1131-1140
目的基于网络药理学和生物信息学方法分析丹参酮Ⅱ_A治疗冠心病(CHD)的分子生物学机制。方法利用Pharm Mapper数据库筛选出丹参酮Ⅱ_A的作用靶点,利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选CHD疾病作用相关靶点。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape构建蛋白相互作用网络,利用ClueGO插件进行GO分析和KEGG信号通路富集分析,利用Systemsdock数据库进行系统分子对接,利用i GEMDOCK软件进行分子对接来预测丹参酮Ⅱ_A对CHD作用靶点的结合性。结果筛选出丹参酮Ⅱ_A的潜在靶点173个;与CHD相关的靶点42个;信号通路49条。结论丹参酮Ⅱ_A治疗CHD具有多靶点、多通路作用的特点;其可能作用机制是通过调控CHD发展过程中的血压调节、细胞代谢、血管新生、内分泌、活性氧代谢等过程对CHD进行干预。  相似文献   
5.
目的 通过网络药理学方法,对枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制进行研究。方法 收集枳实薤白桂枝汤中5味药的有效化合物,预测这些化合物对冠心病的作用靶点,对这些靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图构建、基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG通路注释分析,将这些化合物与靶点进行分子对接。结果 枳实薤白桂枝汤共收集到51个有效化合物,作用于31个冠心病相关靶点,PPI网络图显示ALB、ACE、REN、F2、NOS3、MAPK1、MMP9、MMP2、PPARG、SELE为10个联系最多的靶点,联系最密切的3组靶点为凝血组、斑块稳定组、其他保护组。GO富集分析显示出76个生物过程、26个分子功能、14个细胞成分,通路注释分析显示出19条通路,155组分子对接结果显示91组具有较好的结合活性。结论 枳实薤白桂枝汤治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,可能通过抗凝血、稳斑块、抗氧化、抗炎症、降血脂、抑制RASS系统、增加NO保护、促进雌激素保护8个方面发挥治疗冠心病的作用。  相似文献   
6.
目的:通过文献检索、共现分析和聚类分析等文献计量学分析,探讨中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究现状与热点,方便为该领域今后的相关研究提供参考。方法:检索中国知网和PubMed数据库中收录的中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病相关的文献,运用书目共现分析系统软件(BICOMB)、CytoScape3.6.1及SPSS软件对高频词进行共现分析和聚类分析。结果:从中国知网检索到文献116篇,频次≥3的高频词共43个,共有226对共现关系,聚类共分别出7个类别;从PubMed检索到文献44篇,频次≥3的高频词共35个,共有355对共现关系,聚类共分别出8个类别。结论:中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究在2005年之后在世界多个国家开始兴起,中药、益气温阳活血方、三七总皂苷、地黄低聚糖、丹参注射液、丹参6个方面是在中医药范围内的研究热点。  相似文献   
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