多重耐药鲍曼不动杆菌临床分布及变迁趋势

目的分析上海市胸科医院分离的鲍曼不动杆菌(AB)和多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)临床分布特点及变迁趋势,为控制MDR-AB感染提供理论依据。方法采用微生物质谱鉴定系统对上海市胸科医院2015—2017年分离出的499株AB进行菌株鉴定及体外药物敏感性试验,同时分析相关临床资料。结果2015—2017年,AB的检出率逐年递增(χ~2=7.168,P0.05),但MDR-AB的检出率逐年降低(χ~2=35.086,P0.01);男性患者AB和MDR-AB检出率高于女性患者(P0.05);AB和MDR-AB均以60～69岁患者检出率最高,70～79岁患者MDR-AB检出率呈逐年上升趋势(χ~2=6.775,P0.05)。AB和MDR-AB主要分离自痰样本,检出率最高的科室为重症监护病房(ICU)。结论上海市胸科医院AB检出率逐年递增,应加强对MDRAB的监测,做好消毒隔离,控制多重耐药菌株的发展。     

不同浓度二甲基亚砜对白色念珠菌的抑菌作用研究

目的:探讨不同浓度二甲基亚砜(DMSO)对白色念珠菌的抑菌作用。方法:用稀释法在含有0.14、0.42、0.70、0.99、1.27、1.55mol/L6个梯度DMSO的培养基中培养白色念珠菌24h;加入DMSO作为阳性对照组;加入沙保罗液体培养基作为阴性对照组。计算白色念珠菌在不同浓度DMSO中的生长抑制率和芽管萌发抑制率。结果:DMSO浓度为0.14mol/L时,白色念珠菌生长活跃,生长抑制率和芽管萌发抑制率与相应的阴性对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);浓度≥0.42mol/L时,2～4h时90%最小抑菌浓度(MIC90)为0.70mol/L,芽管萌发MIC90为0.70mol/L;浓度达到1.55mol/L时,无活菌体存在(生长抑制率达100%)。DMSO浓度>0.42mol/L时,生长抑制率和芽管萌发抑制率与各自的阴性对照组比较差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:DMSO浓度≥0.42mol/L时对白色念珠菌生长、芽管萌发具有较强的抑制作用,且随着浓度的增加和时间的延长其作用效果越明显。     

Super-ARMS PCR和ddPCR检测晚期肺腺癌患者血浆循环肿瘤DNA EGFR基因T790M突变的临床价值研究

目的探讨超级扩增阻滞突变系统PCR(Super-ARMS PCR)和微滴式数字PCR(ddPCR)检测晚期肺腺癌患者经表皮生长因子受体抑制剂(EGFR-TKI)治疗后血浆循环肿瘤DNA(ctDNA)表皮生长因子受体(EGFR)基因T790M突变情况和应用价值。方法经EGFR-TKI治疗后耐药的124例患者分别应用Super-ARMS PCR法和ddPCR法检测T790M突变情况,比较2种方法检出率,用药时间及突变丰度的相关性。结果2种方法共检出51例T790M突变,诊断结果一致性较好,Kappa=0.756;2种方法阳性符合率为74.00%,阴性符合率98.65%,总符合率88.71%。用药超过12个月的患者采用Super-ARMS PCR法检测T790M突变的检出率高于用药小于12个月的患者(P<0.05)。ddPCR法检测突变丰度为0.01%~68.10%。结论2种方法在晚期肺腺癌患者经EGFR-TKI治疗后T790M突变检测中具有较高的一致性,ddPCR法灵敏度更高且可以提供突变丰度的信息。     

循环肿瘤DNA的研究进展

循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是由肿瘤细胞释放到循环系统中的基因组小片段,其来源于机体所有荷瘤部位,具有含量极低、个体间差异大、半衰期短、匀质性、携带有肿瘤特异性遗传学/表观遗传学变异等特点,与肿瘤的发展进化、休眠耐药、转移复发等密切相关,正逐渐成为肿瘤学分子研究领域的热点.目前针对ctDNA的检测方法和平台种类繁多,主要分为基于PCR和二代测序(next-generation sequence,NGS)的方法,二者各有利弊,需要根据研究目的灵活选择并建立统一标准.随着相关技术的发展和法规的不断完善,ctDNA可作为癌症筛查、早期诊断、个体化治疗及预后评估理想的血源性生物标志物,在肿瘤的精准医疗中必将大放异彩.     

三家宏基因组测序平台的性能评估比较

 目的 对三家宏基因组测序(mNGS)平台开展性能评估。方法 三家平台(A、B和C)对18个参考品和8个临床标本进行mNGS,分析检测灵敏度、特异度、阴性预测值和阳性预测值。结果 A、B和C平台对于参考品的灵敏度分别为97.8%、100%、45.1%,特异度分别为50.0%、100%、100%,阴性预测值分别为25.0%、100%、3.8%,阳性预测值分别为87.3%、75.2%、93.2%。对于临床标本的灵敏度分别为87.0%、82.6%、87.0%,阳性预测值分别为90.9%、65.5%、60.6%。结论 本研究丰富了国内mNGS平台数据,为感染性疾病的诊断新技术的发展提供了一定的建议。