Smoothened沉默胚胎成纤维细胞 NIH/3T3的mRNA表达谱分析

目的 探讨通过沉默Smoothened(Smo)基因抑制Hedgehog通路后,小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3中mRNA表达谱的变化。方法 提取Smo沉默和对照NIH/3T3细胞的总RNA,并进行测序。与对照组比较,分析差异表达的mRNA,通过BLAST2GO 和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析和预测这些差异表达mRNA的相关功能。选取差异表达mRNA进行实时定量PCR验证。结果 通过测序在Smo沉默的NIH/3T3细胞中发现有2289个mRNA差异表达,其中1646个mRNA在Smo沉默后表达下调,而643个mRNA表达上调。荧光实时定量PCR结果与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异表达mRNA参与细胞过程、单有机体过程、生物学调节。差异表达mRNA富集在轴突导向(ko04360)、癌症通路(ko05200)、癌症中的microRNA(ko05206)等通路。利用GEPIA数据库分析CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10及其受体在食管癌和正常食管组织中的表达情况,和预后的预测分析。结论 在NIH/3T3细胞中沉默Smo抑制Hedgehog通路可能会通过细胞因子CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10影响肿瘤细胞的增殖。     

食管鳞状细胞癌研究模型：细胞系、动物移植模型和3D培养模型

食管癌是常见的消化道恶性肿瘤,易转移及复发的性质常常导致病人呈现出明显的致死性风险。国内一些地区食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）的发病率相对较高,严重威胁着人类的健康和生命而成为肿瘤研究的重要方向。食管鳞状细胞癌的发生发展是一系列因素累积及相互作用的复杂过程,其克隆性增殖会造成肿瘤细胞内微观水平的表达异常和信号传导通路级联反应效应的改变,形成具有不同性质的细胞亚群。肿瘤细胞间不同细胞亚群在细胞分子水平甚至基因表达层面呈现出比较明显的异质性,由此引发肿瘤细胞对药物的敏感性下降及抗药性现象的出现。很多食管癌移植模型被用于了解肿瘤的性质和病理生理学特点,有助于探索肿瘤细胞内的发生机制,为推动肿瘤研究和治疗提供了重要的价值。随着肿瘤类器官培养技术获得突破性进展,肿瘤细胞的3D培养模型能够重现亲代肿瘤细胞的生物学性质,成为探索肿瘤发生机制和基因序列异常表达的工具,为肿瘤的研究提供了重要的平台,并推动肿瘤研究和治疗向前迈进及取得重要进展。本文对常用的ESCC的研究模型作一综述。