中药材龟甲的分子鉴定研究

用PCR产物直接测序法对中药材龟甲(板)进行鉴别。从乌龟 Chinemys revesii 和其他20种产地为中国或东南亚国家的龟类的组织材料中提取DNA,扩增约110bp的线粒体12SrRNA,基因片段并进行序列分析,构建了21种龟类的12SrRNA基因片段序列数据库。序列比较的结果表明乌龟与其它20种龟类的这段序列均有差别,序列差异在3.7～15.7%之间。从江苏省药品检验所提供的19块龟甲检品上各取样0.1～0.5g提取 DNA,扩增与上述相同的基因片段,与构建的数据库进行比较,结果表明19块龟甲中只有3块的原动物为乌龟,其余的龟甲均为混淆品。本文的结果为药材龟甲的鉴定找到了有效、可靠的分子遗传标记方法。     

鹿类中药材的位点特异性PCR鉴定研究

目的　建立一种简便、准确的鹿类中药材鹿茸、鹿鞭、鹿筋、鹿胎的DNA分子标记鉴定方法。方法　在对鹿类中药材的正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物的Cytb基因全序列分析的基础上 ,设计了一对专用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性鉴别引物ILu0 1 L和ILu0 1 H。结果　在 6 4℃的复性温度下 ,用鉴别引物对原动物样品进行鉴别PCR ,仅正品能得到约 36 5bp阳性扩增带 ;对鹿茸、鹿鞭及鹿筋正、伪品药材进行PCR鉴定 ,结果表明 :3批鹿茸仅一批为正品 ,2批鹿鞭皆为伪品 ,鹿筋正、伪品药材PCR鉴定与形态鉴定结果一致。随机选取 2枚鹿茸及一个原动物做Cytb基因片段序列分析 ,其结果与PCR鉴定完全一致。结论　对市售鹿类商品药材需加强质量监督和管理。所设计的鉴别引物对梅花鹿、马鹿有高度特异性 ,可应用于以其为原动物的鹿类中药材的鉴定。     

金钱白花蛇及其伪品的DNA分子诊断鉴别

为建立金钱白花蛇品种的DNA分子标记鉴定方法,本文通过提取金钱白花蛇及其伪品药材和原动物样品的模板DNA,用通用引物扩增样品的Cyt b基因片断。PCR扩增所得产物纯化后直接测序,所得序列经对位排列和比较金钱白花蛇及其伪品的DNA序列,发现Cyt b基因片段的种间差异显著大于种内个体间变异,因此该基因片段是蛇类药材鉴定中一个很好的分子标记。基于所得DNA序列数据,设计了一对高度特异性的鉴别引物用于金钱白花蛇的PCR鉴定。用该对引物对金钱白花蛇进行PCR鉴定。在60℃－65℃的复性温度条件下,样品的误检和漏检率为0,能100％地正确区分出正品与伪品药材,此外该方法还能检测出混合粉末中是否含有正品金钱白花蛇成分。研究结果表明用本鉴定引物对金钱白花蛇的PCR鉴定方法简便、有效,实用性强,该方法还有可能成为中成药复方组分鉴别的一种新手段。     

鹿类中药材的位点特异性PCR鉴定研究

目的　建立一种简便、准确的鹿类中药材鹿茸、鹿鞭、鹿筋、鹿胎的DNA分子标记鉴定方法。方法　在对鹿类中药材的正品原动物梅花鹿、马鹿及其混伪品原动物的Cyt b 基因全序列分析的基础上,设计了一对专用于鉴定正品鹿类药材的位点特异性鉴别引物ILu01-L和ILu01-H。结果　在6 4℃的复性温度下,用鉴别引物对原动物样品进行鉴别PCR ,仅正品能得到约365bp阳性扩增带;对鹿茸、鹿鞭及鹿筋正、伪品药材进行PCR鉴定,结果表明:3批鹿茸仅一批为正品,2批鹿鞭皆为伪品,鹿筋正、伪品药材PCR鉴定与形态鉴定结果一致。随机选取2枚鹿茸及一个原动物做Cyt b 基因片段序列分析,其结果与PCR鉴定完全一致。结论　对市售鹿类商品药材需加强质量监督和管理。所设计的鉴别引物对梅花鹿、马鹿有高度特异性,可应用于以其为原动物的鹿类中药材的鉴定。     

中药材蛇胆的DNA分子标记鉴定研究

目的　运用分子标记技术鉴定药材蛇胆的真伪,以克服目前仅依据形态、显微特征及理化性状进行鉴别的不足。方法　分别从药材蛇胆的胆衣和胆汁、原动物棕黑锦蛇的肌肉和胆汁中提取DNA,经PCR扩增得到约400bp的12SrRNA基因片段,并对该基因片段进行测序研究。结果　从少量药材蛇胆的胆衣和胆汁中可提得足够用于PCR扩增的DNA模板,扩增产物的测序结果表明同一动物的胆衣和胆汁、肌肉和胆汁的碱基序列完全一致。结论　DNA分子标记技术可用于中药材蛇胆和胆汁的鉴定,提示该技术也可用于其他动物分泌物类型药材的鉴别。目前市场上药材蛇胆来源较复杂,需加强质量监督和控制。     

猪基源的肝素粗品及混淆品的AS-PCR及ARMS分子检测

本文建立了一种简便、准确的鉴别猪基源的肝素粗品及其混淆品的DNA分子鉴定方法。在对家猪、野猪及其他7种动物(均用于加工猪肝素粗品的混淆品)的mtDNA D-loop区进行序列分析的基础上，设计了专门用于鉴别猪基源肝素钠的AS-PCR(allele-specific PCR)引物及ARMS(amplification refractory mutation system)引物，对家猪、野猪及其他7种动物来源的肝素、肌肉或血液共49个样品的基源进行了分子检测。结果表明：AS-PCR及ARMS方法均可用于猪基源肝素粗品的快速鉴别。AS-PCR鉴别时的复性温度为54～56 ℃，ARMS引物鉴别时的复性温度更宽，为52～58 ℃。在用两种引物对肝素样品进行鉴别时，仅猪来源的肝素DNA模板能扩增得到约170 bp的扩增条带，而其他动物来源的肝素DNA模板在同样条件下无扩增产物。     

基于Cytb基因对药用昆虫地鳖虫炮制品的分子鉴别研究

目的:建立基于线粒体DNA细胞色素氧化酶b(Cytb)基因的分子标记技术对地鳖虫(地鳖、冀地鳖)及其混伪品炮制药材进行分子鉴定的方法。方法:采用改良的饱和氯化钠法对地鳖虫及其混伪品炮制药材的总DNA进行提取。通过通用引物REVCB2H、REVCBJ对所有样品的Cytb基因进行聚合酶链反应(PCR)扩增;用MEGA 5.1软件对所有样品的Cytb基因序列采用邻接(NJ)法构建系统发育树;并利用DNAMAN软件对得到的所有样品的Cytb基因序列进行比对,分析正品、混淆品间序列差异,在差异较大区域设计特异性引物Esin-F和Esin-R进行分子鉴定。结果:以提取的DNA为模板均能成功扩增出相应的Cytb基因片段;构建的系统发育树与其亲缘关系一致;设计的特异性引物Esin-F和Esin-R在同样的条件下,只有地鳖虫得到了扩增条带。结论:建立了地鳖虫及其混伪品药材炮制品的DNA提取方法;设计的特异性引物对地鳖虫有高度的特异性,能够有效鉴别地鳖虫及其混伪品。     

浙龟甲的PCR鉴别研究

目的 建立聚合酶链式反应（PCR）技术鉴别浙龟甲[来源为龟黄喉水龟Clemmys mutica（Cantor）的背甲及腹甲]真伪的方法。方法 提取浙龟甲及其混淆品的基因组DNA,从NCBI网站上检索黄喉水龟及其混淆品的线粒体基因,进行分析比对,根据黄喉水龟细胞色素b（cytochrome b gene,Cytb）基因上的特异位点应用Oligo软件设计引物,对浙龟甲及其混淆品样本进行PCR扩增。结果 所设计的引物能特异性扩增黄喉水龟,扩增片段长度为357 bp,能有效区分浙龟甲及其混淆品种。结论 建立的PCR技术鉴别浙龟甲方法,具有特异性高、方法简便快捷、实用性较强的特点,在快速准确鉴别浙龟甲方面具有良好的应用前景。     

阳春砂的荧光定量PCR检测与鉴定

摘 要 目的： 分析研究阳春砂基因序列特征,建立基于DNA分子的快速甄别阳春砂的荧光定量PCR技术。方法: 收集阳春砂及同科其他样品,经专家鉴别后,提取DNA。根据阳春砂ITS序列两端相对保守区设计引物和探针,优化反应条件,建立阳春砂的荧光定量PCR检测方案。 结果:基于阳春砂ITS序列两端相对保守区设计了引物和探针,通过条件优化,建立的荧光定量PCR检测方法能成功对阳春砂样品进行检出,而同科其他非阳春砂样品无扩增曲线。结论: 阳春砂药材能够通过除传统专家鉴定方法以外的荧光定量PCR方法快速检出。     

蕲蛇及其混淆品高特异性PCR鉴别

目的：建立一种准确、简便的蕲蛇药材DNA分子标记鉴别方法。方法：用Cytb通用引物对蕲蛇及7种常见混淆品PCR扩增后进行测序，依其序列间差异设计一对专用于中药材蕲蛇的鉴别引物HQSL-1和HQSH-1。用不同的复性温度PCR扩增，确立特异性反应条件。探讨适合中药材动物药的分子标记种类。结果：PCR扩增结果是在50℃复性温度下，正品蕲蛇均得到约220bp的扩增带，而混淆品在同样的条件下无扩增带。结论：所设计的鉴别引物对正品蕲蛇有高度的特异性。PCR方法重复性高，同种不同个体间的种内差异对鉴定结果不会有影响。本方法简单、准确、快速。     

龟板中脂肪酸的GC—MS分析

目的：采用ＧＣ－ＭＳ法对乌龟板和黄喉拟水龟板中的脂肪酸进行分析。方法：分别对２种龟板提取的甲酯化学样品进行ＧＣ－ＭＳ分析,质谱图用ＮＢＳ谱库检索,鉴定各种脂肪酸,并用色谱峰面积归一化测定其相对百分含量。结果：发现乌龟板中含有３２种脂肪酸,其中不饱和脂肪酸相对含量占４９％。黄喉拟水龟板中有２８种脂肪酸,其中不饷脂肪酸相对含量占６６％。１０－十八碳烯酸是二者中所含的相对含量最高的脂肪酸。结论：该法简便     

Patent Evaluation: Direct Cloning of PCR Amplified Nucleic Acids

Summary

Novelty: A vector is described which allows the direct cloning of PCR amplified DNA containing a single dAMP residue, which is attatched to the 3′-end of the fragment. This direct cloning allows the efficient recovery of PCR generated DNA for diagnostic purposes and for construction.

Biology: Several thermostable DNA polymerases used for PCR add a single dAMP residue at the 3′-end of the DNA fragment. A vector which contains a single dT residue at the 3′-ends, complementary to the dAMP residues on the PCR fragment are revealed. The two can then be efficiently ligated together. The vector contains two Xcm I sites in the multiple cloning site. These sites can be cleaved to give a linearized vector with a single dT at each 3′-end. The use of Hph I for the same purpose is also reported.     

地鼠多瘤病毒PCR检测方法的建立

目的  建立地鼠多瘤病毒（hamster polyomavirus, HaPyV）PCR检测方法,并应用于乙型脑炎减毒活疫苗生产过程中地鼠肾细胞的感染检测。方法  设计针对HaPyV衣壳蛋白VP1基因片段的特异引物,以含HaPyV VP1片段的质粒PMD19T-HaPyV688为模板进行PCR扩增并测序确认扩增产物。以多种病毒DNA为模板进行PCR扩增并对扩增产物进行斑点杂交鉴定以验证PCR方法的特异性。将定量的质粒PMD19T-HaPyV688 10倍系列稀释后进行PCR敏感性检测。以小鼠多瘤病毒(murine polyomavirus, MuPyV)检验PCR法对质粒DNA和病毒DNA检测的一致性。应用建立的方法对生产用地鼠肾细胞悬液进行HaPyV DNA检测。结果  仅含有质粒PMD19T-HaPyV688和MuPyV DNA的样品能够扩增出600 bp的片段,经斑点杂交及测序证明其分别为HaPyV和MuPyV的VP1特异基因片段。PCR所能检出的PMD19T-HaPyV688和MuPyV 的最少DNA拷贝数分别为5300和590。7个亚批生产用地鼠肾细胞悬液的HaPyV检测结果均为阴性。结论  建立的PCR方法具有较高的敏感性和特异性,可用于生产用地鼠肾细胞HaPyV感染的检测。     

中药材乌梢蛇及其混淆品的DNA序列分析鉴别

ＤＮＡ序列分析鉴别是中药材品种鉴定的新方法［１］,已应用于海马、龟甲、鳖甲等中药材的鉴定［２～７］。目前商品流通中乌梢蛇（ＺＡＯＣＹＳ）药材的混淆品种类较多,游蛇科（Ｃｏｌｕｂｒｉｄａｅ）的常见种类都有可能被当作乌梢蛇制成药材,品种鉴定困难［８］。而...     

Simple and rapid identification of low level hepatitis B virus DNA by the nested polymerase chain reaction

A rapid and sensitive method has been developed to detect hepatitis B virus DNA (HBV) by nested polymerase chain reaction (PCR) technique with primers specific for the surface and core regions in capillary thermal cycler within 80 min. The lower limit for detection by present PCR method is 10⁻⁵ pg of recombinant HBV DNA which is equivalent to that determined by one round of PCR amplification and Southern blot hybridization analysis. When boiled HBV positive serum was serially diluted 10-fold, HBV DNA was successfully determined in 1 μl≈10⁻³ μl of serum. HBV DNA was detected by present method in 69 clinical samples including HBsAg positives and negatives by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). When serum samples were amplified by nested PCR using surface and core region primers, HBV DNAs were detected in 37 of 69 samples (53.6%) and 18 of 69 samples (26.1%), respectively. These results can inform the infectious state of HBsAg positive pateints. A simple and rapid nested PCR protocol by using boiled serum as DNA template has been described for the clinical utility to determine HBV DNA in human serum.     

球花石斛的位点特异性PCR鉴别研究

为建立球花石斛的DNA分子标记鉴别方法，本文根据测定及GenBank上登录的109种共计164个石斛样本的rDNA ITS序列，设计了特异性鉴别引物QH-JB1 和QH-JB2，并对球花石斛进行了位点特异性PCR鉴别研究。结果表明，当复性条件为63.5 ℃，1 min时，只有球花石斛的模板DNA能被扩增出约300 bp的阳性扩增带，而其他种石斛均为阴性。证明用本法鉴别球花石斛简便、省时，也适用于干燥球花石斛药材的鉴别，具有广泛的应用前景。