甘草中黄酮类化合物的网络药理学研究

目的:分析、预测甘草中黄酮类化合物的潜在药理作用及可能作用机制。方法:采用网络药理学方法,依据中药整合药理学计算平台(TCMSP)等数据库,以化合物的口服药物生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为标准,筛选甘草中的黄酮类化合物。采用药效团匹配与PharmMapper数据库预测其潜在的作用靶点,随后借助生物学信息注释数据库V 6.8(DAVID V 6.8)分析工具对获得的靶点蛋白进行京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路分析和基因本体(GO)生物过程富集分析(以P<0.05为标准判断相关),并运用Cytoscape 3.5.1软件构建甘草中黄酮类化合物-靶点蛋白-信号通路网络图。结果:共从甘草中筛选出了19个黄酮类化合物(如甘草苷、异甘草苷、甘草素等),涉及细胞视黄酸结合蛋白2、脑啡肽酶等78个靶点蛋白(共188次),以及胰岛素信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-Akt)等40条信号通路(其中与癌症相关的通路8条、与内分泌系统相关的通路7条、与信号转导相关的通路6条、与传染病相关的通路5条、与代谢相关的通路3条等);所建黄酮类化合物-靶点蛋白-信号通路网络图显示,甘草中黄酮类化合物可通过多个靶点作用于不同的疾病代谢通路。结论:甘草中黄酮类化合物对癌症、内分泌系统、传染病、代谢系统等方面疾病可能具有治疗作用,且可能有潜在的抗帕金森症作用。     

基于网络药理学探讨连翘治疗呕吐作用机制

目的对连翘的药效物质基础和呕吐的致病靶点进行网络药理学分析,以探讨连翘镇吐止呕的作用机制。方法通过BANTMAN-TCM评分≥20,TCMSP平台以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,并结合文献和中国药典对连翘有效成分进行收集;通过PubChem、SwissTarget Prediction数据库和ALOGPS2.1工具对连翘有效成分的靶点进行收集;通过TTD,DisGeNET和Drugbank数据库对呕吐靶点进行收集;通过STRING,IntAct和GeneMANIA数据库分析连翘治疗呕吐的靶点之间关系;通过DAVID6.8数据库进行GO分析和KEGG分析;通过Cytoscape3.2.1软件绘制"连翘-成分-靶点-通路"关系图并进行网络拓扑参数分析节点重要性。结果获得Bicuculline,Scopine,Gamma-Camphorene和kaempferol等19个连翘治疗呕吐成分;PTGS1,BCHE,HTR1A和CYP1A等20个连翘治疗呕吐重要靶点,且这些靶点中51.79%具有共同蛋白结构域、33.70%共表达、10.87%共定位、3.63%为预测靶点;对子网络"呕吐-GO生物学过程关系图",在GO分析中,生物学过程(BP)和分子功能(MF)不涉及呕吐基因KCNH2,但KCNH2存在于细胞组分(CC)的细胞膜上;在平均节点以上的GO生物学过程有10种:对药物的反应、氧化还原过程、腺苷酸环化酶抑制G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、磷脂酶C激活G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、环氧酶P450途径、药物代谢过程、胆碱能突触传递、异生物质代谢过程、细胞增殖;对子网络"呕吐-KEGG通路关系图",有14条通路,在平均节点以上的通路有11条,分别是:神经活性配体-受体相互作用、肌动蛋白细胞骨架的调节、钙信号通路、胆碱能突触、化学致癌、药物代谢-细胞色素P450、cAMP信号通路、血清素能突触、细胞色素P450对异生物质的代谢、花生四烯酸代谢和亚油酸代谢。结论连翘治疗呕吐的生物学过程和通路非常广泛,钙信号通路和cAMP信号通路可能是连翘止吐作用的重要机制。     

逍遥散治疗抑郁症代谢网络的模块划分与生物学机制研究

逍遥散的抗抑郁作用已经明确,应用代谢网络的功能模块划分方法,从功能模块角度探究逍遥散治疗抑郁症的生物学机制具有重要意义和价值。通过数据库收集逍遥散调节差异代谢物、差异代谢物相关的酶以及与抑郁症相关的蛋白,对逍遥散调节差异代谢物进行通路富集分析和交互分析,利用STRING工具构建差异代谢物相关的酶与抑郁症的蛋白网络,应用CNM分解算法提取网络蛋白功能模块并进行功能模块富集分析。结果发现,逍遥散调节差异代谢物97个、差异代谢物相关酶234个、抑郁症相关蛋白258个。通路交互分析划分为2个子网络,其中一个为神经系统和细胞信号转导相关通路,另一个为内分泌系统和代谢途径相关通路。对蛋白网络以及使用CNM算法从中提取的9个蛋白功能模块进行KEGG通路富集分析,结果发现模块1和模块3属于可用较少的蛋白富集到较多的通路,这些通路对应的功能包括内分泌系统、氨基酸代谢、神经系统和信号转导等。本研究采用通路交互分析和代谢网络模块划分策略阐释逍遥散治疗抑郁症的生物学机制,为从代谢调控角度深入研究中药复方药理作用机制提供思路参考和方法借鉴。     

金荞麦中优效组分的网络药理学研究

目的:研究金荞麦中优效组分的药理作用及可能的分子机制。方法:基于网络药理学,以类药性(DL)>0.18和生物利用度(OB)>30%为标准,借助中药整合药理学计算平台(TCMSP)筛选金荞麦中的优效组分;利用药效基团匹配与潜在识别靶标数据库(PharmMapper)获取金荞麦优效组分的潜在作用靶点;利用生物学信息注释数据库(DAVID)对获得的靶点蛋白进行京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路分析和基因本体(GO)生物过程(包括生物过程、分子功能及细胞组分)富集分析(均以P<0.05为标准)。结果:从金荞麦中共筛选出15种优效组分[如槲皮素、木犀草素、原矢车菊素B_1、(+)儿茶素、β-谷甾醇等]和114个潜在作用靶蛋白[如雌二醇17-β-脱氢酶1、环腺苷酸(cAMP)特异性3,5-环磷酸二酯酶4D、维生素D_3受体、尿苷胞苷激酶2、HRAS基因编码的三磷酸尿苷酶等];涉及34条重要通路,如丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、趋化因子信号通路和胰岛素信号通路,其中与癌症相关的通路11条,与代谢相关的通路7条,与内分泌系统相关的通路4条;涉及的分子功能有类固醇激素受体活性、配体依赖的核受体活性、蛋白激酶活性等,细胞组分有细胞液、细胞碎片、可溶性部分等,生物过程有细胞凋亡的调节、有机物反应的过程、内源性刺激反应的过程等。结论:金荞麦可能通过MAPK信号通路、VEGF信号通路、趋化因子通路、胰岛素信号通路等发挥抗肿瘤、抗炎及调节糖脂代谢的作用。     

Atazanavir对HIV患者显示持久的有效性和良好的血脂水平

随机、双盲、多中心Ⅱ期临床研究开放延伸试验(BMSA142 4 - 0 0 8)中评价了atazanavir治疗HIV的长期疗效 ,4 8周初步研究显示atazanavir的疗效好于奈非那韦 ,并且atazanavir无对血脂参数影响的不良反应 ,以及无临床相关的LDL -胆固醇、甘油三酸酯和总的胆固醇水平上升。对 4 6 9名患者进行随机双盲试验 ,其中 36 9名患者完成了 4 8周治疗并有 346名进行了延伸治疗。最初用奈非那韦治疗的患者 ,改用Atazanavir,4 0 0mg ,每天 1次 (n =6 3) ,并且允许在Ⅱ期临床研究中 ,正在接受atazanavir治疗的患者继续接受atazanavir,4 0 0mg(n=139)和…     

基于网络药理学方法探讨黄芪-半枝莲抗结直肠癌的作用机制

目的基于网络药理学分析方法探讨黄芪-半枝莲抗结直肠癌的有效成分及分子机制。方法运用中药药理学分析平台数据库(TCMSP)检索黄芪与半枝莲的有效成分及作用靶点, 通过GeneCards数据库等筛选结直肠癌相关靶点, 运用Cytoscape(Version 3.9.1)软件构建药物-成分-潜在靶点网络关系图。通过String数据库平台构建蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络图, 并用Metascape数据库对潜在靶点进行功能和信号通路富集分析。结果通过数据库筛选出黄芪有效成分17种, 半枝莲有效成分28种, 黄芪-半枝莲与结直肠癌靶点交集共24个潜在蛋白靶点。基因本体论(gene ontology, GO)富集分析显示黄芪-半枝莲主要与DNA损伤、细胞凋亡、调节酶活性等生物学功能相关, 京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析显示主要通路包括磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TN...     

DNA依赖蛋白激酶催化亚基与细胞周期蛋白T2相互结合的鉴定

目的鉴定与DNA依赖蛋白激酶催化亚基(DNAPKcs)相互结合的蛋白,以深入探讨其生理功能。方法通过免疫共沉淀获得DNAPKcs的相互结合蛋白复合物,SDSPAGE电泳分离蛋白,肽质指纹分析和Western印迹鉴定蛋白。结果以DNAPKcs抗体进行免疫共沉淀从HeLa细胞中获得DNAPKcs的相互结合蛋白,对部分结合蛋白进行质谱分析和蛋白数据库检索,发现转录延伸因子PTEFb的亚基细胞周期蛋白(cyclin)T2是其中之一。其后,通过Western印迹检测,进一步证实DNAPKcs与cyclinT2相互结合作用。结论首次发现DNAPKcs与cyclinT2的相互结合,提示DNAPKcs参与基因转录调控或转录偶联修复反应的生物学功能。     

基于网络药理学的四君子汤治疗胃炎的作用机制研究

目的通过网络药理学预测四君子汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库收集四君子汤及其中4味中药党参、白术、茯苓、甘草的化学成分,经口服吸收率(OB)、类药性(DL)、半衰期(HL)3个条件筛选得到药物的有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库进行有效成分靶点预测;同时从TTD、Drugbank和DisGeNET数据库对胃炎的靶点进行检索及筛选;成分靶点与疾病靶点映射后使用Cytoscape 3.2.1软件构建药物有效成分-靶点蛋白相互作用网络,使用String数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络;对靶点蛋白利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG分析,构建核心有效成分-核心靶点-代谢通路网络图。结果从四君子汤中筛选出68个化学成分,涉及治疗胃炎的10个靶点;GO分析结果表明其涉及单孢素代谢过程、杂环代谢过程、药物代谢过程、药物分解过程、类固醇代谢过程等9个生物过程,涉及氧结合、单加氧酶活性、氧化还原酶活性等10个分子功能,包括细胞器膜、内质网膜等6个细胞组成;KEGG分析结果表明其可能通过药物代谢-细胞色素P450、亚油酸代谢、细胞色素P 450对外源性物质代谢的影响、神经活性配体与受体的相互作用、化学致癌、类固醇激素生物合成、视黄醇代谢7个信号通路治疗胃炎。结论四君子汤通过多靶点、多通路治疗胃炎,为今后分子机制的研究奠定一定的基础。     

抗艾滋病中药复方ZYSH对茚地那韦的代谢性增效作用

目的:本文研究抗艾滋病中药复方ZYSH对人肝微粒体CYP3A4的活性抑制和对茚地那韦体外代谢的增效作用,及其对茚地那韦在SD大鼠体内暴露量的增加。方法:中药复方ZYSH总浸膏用磷酸缓冲液(PBS)稀释后与混合人肝微粒体预孵育15 min,加入探针底物睾酮和辅酶β-NADPH孵育30 min,用LC-MS/MS定量检测6β-羟基睾酮的生成,计算ZYSH对CYP3A4的抑制率(IC50)。5 mg.mL-1和10 mg.mL-1的ZYSH在与人肝微粒体共同孵育15 min后加入茚地那韦和β-NADPH分别孵育0,15,30,60,90和120min,检测复方对茚地那韦体外代谢的影响。SD大鼠体内灌胃给予ZYSH 7 d,再经灌胃给予茚地那韦,检测茚地那韦的血药浓度,观察复方ZYSH对茚地那韦的体内暴露的影响。结果:复方ZYSH能明显抑制CYP3A4的活性,IC50为3.21 mg.mL-1。5 mg.mL-1和10 mg.mL-1的ZYSH在体外能明显抑制茚地那韦的代谢,其t1/2由47.5 min变为184和1 404 min,微粒体对茚地那韦的固有清除率由对照组的36.6 mL.min-1.kg-1分别改变为9.4和1.2 mL.min-1.kg-1。灌胃给予ZYSH 7 d后茚地那韦在SD大鼠体内AUC明显增加,为对照组的2.1倍。结论:复方ZYSH能够抑制人肝微粒体CYP3A4的活性,通过代谢性相互作用减缓茚地那韦的体外代谢,增加大鼠体内暴露量。     

Wnt/β-catenin信号通路在多发性骨髓瘤中的机制研究进展

多发性骨髓瘤（MM）是一种以骨髓浆细胞恶性增殖为特征的血液肿瘤,其发生机制与相关的信号通路异常有着密切关系。Wnt/β-catenin信号通路可参与调节细胞的增殖、分化和凋亡等生物学过程,且与细胞癌变相关。在MM中,异常表达的非编码RNAs、转录因子、蛋白酶和分泌蛋白等可激活Wnt/β-catenin信号通路,进而加速MM的发生和发展。因此,Wnt/β-catenin信号通路在MM的发病机制中具有重要地位。整理总结MM中相关非编码RNAs、转录因子、蛋白酶和分泌蛋白等影响Wnt/β-catenin信号通路的研究进展,以期为相关研究提供参考。