5-氮杂-2′-脱氧胞苷逆转RASSF1A基因甲基化对人乳腺癌MCF-7细胞的影响

目的：探讨启动子甲基化对乳腺癌MCF-7细胞RASSF1A基因的作用及5-氮杂-2′-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）干预对启动子甲基化的影响,为临床治疗乳腺癌奠定理论基础.方法：用1,3,5,7,9μmol/L不同浓度的5-Aza-CdR处理MCF-7乳腺癌细胞株,通过MTT检测5-Aza-CdR对MCF-7乳腺癌细胞株存活率的影响;建立5μmol/L,10μmol/L的浓度梯度流式细胞仪检测5-Aza-CdR对MCF-7乳腺癌细胞株生长周期及凋亡率的影响,MSP（甲基化PCR）检测5-Aza-CdR处理前后RASFF1A抑癌基因的甲基化状态,RT-PCR检测处理前后抑癌基因RASSF1A mRNA表达情况.结果：5-Aza-CdR抑制体外培养的人乳腺癌MCF-7细胞,诱导人乳腺癌MCF-7细胞凋亡和细胞周期停滞在G0/G1期,呈浓度依赖性.经5-Aza-CdR处理人乳腺癌MCF-7细胞后,MSP检测RASSF1A基因发生了甲基化,RT-PCR检测RASSF1A mRNA恢复了表达.结论：RASSF1A基因启动子甲基化是导致其失活的主要原因,5-Aza-CdR可以逆转乳腺癌细胞株MCF-7细胞RASSF1A基因启动子甲基化状态,使其重新表达．     

5-Aza-CdR对人肝癌细胞RASSF1 A甲基化的影响

目的：探讨5-氮杂-2ˊ-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）对人肝癌细胞RASSF1A基因启动子甲基化以及mRNA表达的影响。方法体外培养人肝癌细胞株SMMC-7721,分别用0.5、5.0、30.0、50.0μmol/L的5-Aza-CdR与之孵育72 h,甲基化PCR检测处理前后启动子甲基化水平,RT-PCR检测RASSF1A mRNA表达。结果随着药物浓度的增加,甲基化RASSF1A含量逐渐降低,而未甲基化产物逐渐增高;5-Aza-CdR处理后,RASSF1A mRNA的含量随之增高。结论5-Aza-CdR可逆转SMMC-7721细胞株细胞中基因甲基化修饰状态。     

５ 氮杂 ２′ 脱氧胞苷诱导肝癌细胞株ＳＬＩＴ２基因去甲基化的实验研究

目的：观察肝细胞癌（HCC）细胞株SUN449、BEL-7402、SMMC-7721、Hep3B及epG2中SLIT2基因在5-Aza-CdR作用后,其启动子区甲基化状态及表达的变化,探讨HCC细胞株中SLIT2基因调控规律及甲基化调节抑制剂5-Aza-CdR对SLIT2基因转录的影响。方法对上述 HCC 细胞株体外培养,MSP法检测 HCC 细胞株中 SLIT2启动子相关区域的甲基化状况。应用10 mmol／L浓度的5-Aza-CdR处理体外培养的5种HCC细胞后,MSP法检测用药前后细胞中SLIT2基因的甲基化状态,RT-PCR法检测用药前后细胞中SLIT2 mRNA的变化。结果 SLIT2基因在各细胞株中启动子区呈异常高甲基化状态,mRNA低表达。经过5-Aza-CdR处理后,SLIT2基因启动子区呈显著去甲基化状态,其mRNA表达增强。结论启动子区异常甲基化是HCC细胞SLIT2基因失活的主要原因之一,去甲基化制剂5-Aza-CdR能逆转SLIT2基因甲基化状态,从而调控SLIT2基因表达。     

人子宫内膜癌细胞株HEC-1-B中RASSF1A基因的甲基化及其表达

目的:研究Ras相关结构域家族1A基因(RASSF1A)启动子区域在子宫内膜癌细胞株HEC-1-B中的甲基化状态及其与RASSF1A基因表达的关系。方法:采用甲基化特异性PCR(Methylation specialPCR,MSP)技术检测HEC-1-B细胞RASSF1A基因甲基化状态;采用逆转录PCR(RT-PCR)技术检测HEC-1-B细胞RASSF1A mRNA表达;并观察去甲基化药物5-杂氮脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用后RASSF1A基因甲基化状态和RASSF1A mRNA表达。结果:子宫内膜癌细胞株HEC-1-B存在RASSF1A高甲基化,RASSF1A mRNA表达缺失或低表达。结论:子宫内膜癌细胞株HEC-1-B中的RASSF1A基因启动子区域DNA存在高甲基化,可能在子宫内膜癌的发生发展中起作用。     

5-氮杂-2’-脱氧胞苷调控RASSF1A基因表达对子宫内膜癌HEC-1-B细胞增殖及凋亡的影响

目的：探讨甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-2’-deoxycytidine,5-Aza-CdR）对人子宫内膜癌（Hu－man endometrial cancer,HEC）-1-B细胞增殖和凋亡的作用及其可能机制。方法：应用不同浓度的 5-Aza-CdR处理HEC-1-B细胞,甲基化特异 PCR（Methylation-specific polymerase chain reaction,MSP）法检测处理前后RAS相关域家族1A（RAS association domain family 1A,RASSF1A）基因甲基化状态,应用 RT-PCR方法检测 RASSF1A基因 mRNA表达,MTT法检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡率。结果：HEC-1-B细胞 RASSF1A基因启动子区呈高甲基化状态,经过 5-Aza-CdR处理后,RASSF1A基因启动子区呈去甲基化状态,其 mRNA重新表达,细胞生长受到抑制,细胞凋亡增加。结论：5-Aza-CdR能够逆转RASSF1A基因甲基化状态,调控RASSF1A基因表达,并能有效地抑制HEC-1-B细胞的增殖和诱导细胞调亡。     

5-Aza-CdR体外诱导人肺癌细胞株p16基因去甲基化

目的观察人肺癌细胞株H719p16基因启动子区甲基化状态,并探讨去甲基化制剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)诱导H719细胞株高甲基化失活的pl6基因重新表达的可能性。方法MSP法检测体外培养的人肺癌细胞株p16基因启动子区甲基化状态,并应用不同浓度的5-Aza-CdR处理人肺癌细胞株H719,MSP法检测用药后细胞中p16基因的甲基化状态,并用RT-PCR方法及Western Blot方法检测用药前后细胞中p16基因mRNA和蛋白水平变化。结果p16基因在人肺癌细胞株H719中启动子区呈甲基化状态,经过5-Aza-CdR处理后,p16基因启动子区呈去甲基化状态,并且其mRNA及蛋白恢复表达。结论启动子区异常甲基化是人肺癌细胞株p16基因失活的可能原因,5-Aza-CdR能逆转p16基因甲基化状态。     

5’-氮杂-2’-脱氧胞苷对 HT-29 和 LoVo 结直肠癌细胞株中 Wif-1 基因甲基化状态、mRNA 表达及蛋白表达的影响

目的：探讨甲基化酶抑制剂5’-氮杂-2’-脱氧胞苷（5’-Aza-2’-deoxycytidine,5’-Aza-CdR）对结直肠癌细胞株HT-29和LoVo中W if-1基因甲基化水平及蛋白表达的影响。方法用不同浓度（0.5、1.0、1.5μmol/L）5’-Aza-CdR处理结直肠癌细胞株HT-29和LoVo。应用TaqMan探针为基础的实时定量PCR（Methylight）方法、SYBR Green PCR方法及蛋白印迹实验（Western blot）检测药物处理前后HT-29和LoVo细胞中W if-1基因的甲基化状态、mRNA和蛋白表达。结果 Methylight检测HT-29和LoVo细胞中Wif-1蛋白在药物作用后异常甲基化得到逆转;实时荧光定量PCR和Western Blot检测到0.5、1.0、1.5μmol/L 5’-Aza-CdR处理后W if-1基因mRNA和蛋白重新表达,实时荧光定量PCR检测DMSO对照组和不同浓度5’-Aza-CdR（0.5、1.0、1.5μmol/L）在HT-29细胞株相对表达量分别为（1.000±0.000）、（1.207±0.052）、（1.790±0.033）和（2.016±0.123）;在LoVo细胞株相对表达量分别为（1.000±0.000）、（1.294±0.048）、（1.893±0.061）和（2.204±0.041）。Western blot检测Wif-1蛋白检测DMSO对照组和不同浓度5’-Aza-CdR在HT-29细胞株相对表达量分别为（0.456±0.040）、（0.511±0.025）、（0.857±0.031）和（0.934±0.047）;LoVo细胞株相对表达量分别为（0.842±0.032）、（0.844±0.044）、（0.854±0.037）和（0.856±0.034）。以上作用均呈时间、剂量±赖性,W if-1基因mRNA在HT-29细胞株表达和LoVo细胞株表达差异均有高度统计学意义（F=144.823,P=0.000;F=476.195,P=0.000）。Wif-1蛋白表达在HT-29细胞株表达差异有高度统计学意义（F=129.674,P=0.000）,但Wif-1蛋白表达在LoVo细胞株表达差异无统计学意义（F=0.117,P=0.948）。结论结直肠癌细胞株HT-29和LoVo中W if-1启动子甲基化可能是导致该基因表达下调甚至失活的主要原因。5’-Aza-CdR能够较成功地逆转结直肠癌细胞株HT-29和LoVo中W if-1基因的甲基化状态?     

对TRAIL耐药的肝癌细胞caspase-8基因甲基化状态及其mRNA表达

目的研究肝癌细胞株HepG2和SMMC 7721对肿瘤坏死因子相关与凋亡诱配体(tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand, TRAIL)的敏感性与caspase-8基因启动子区5′CpG岛的甲基化状态和mRNA表达的关系及5′-氮-2′-杂脱氧胞苷(5-Aza-CdR)对TRAIL抗癌活性的影响.方法采用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR method, MSP)方法检测caspase-8基因5′CpG岛甲基化状态;采用RT-PCR方法检测caspase-8 mRNA表达;采用吖啶橙/溴化乙锭(AO/EB)染色方法检测细胞凋亡.结果 2株肝癌细胞均属TRAIL耐药细胞,caspase-8基因5′CpG岛均为非甲基化状态; 5-Aza-CdR即不能增加caspase-8 mRNA表达,亦不能提高肝癌细胞对TRAIL的敏感性.结论肝癌细胞对TRAIL的敏感性与caspase-8基因的甲基化状态及mRNA表达无关,5-Aza-CdR不能提高肝癌细胞对TRAIL的敏感性.     

人食管鳞癌细胞株中RIZ1基因启动子区甲基化状态的研究

目的:探讨6种人食管鳞癌细胞株KYSE150,KYSE510,TE13,EC9706,CaEs17和EC109中RIZ1基因启动子区的甲基化状态;观察特异性DNA甲基转移酶抑制剂5-Aza-CdR对存在甲基化的细胞株RIZ1基因的转录调控作用及其对该细胞生长增殖的影响。方法:甲基化特异PCR(MSP)法检测6种人食管鳞癌细胞株中RIZ1基因启动子区的甲基化状态;实时定量PCR法检测5-Aza-CdR处理前后RIZ1基因启动子区CpG岛高度甲基化的人食管鳞癌细胞株TE13中RIZ1 mRNA表达量的变化;MTT法检测5-Aza-CdR对TE13细胞生长增殖的影响。结果:(1)6种人食管鳞癌细胞株中TE13,CaEs17,EC109三株细胞RIZ1基因启动子区存在甲基化;(2)5-Aza-CdR处理细胞株TE13后,RIZ1 mRNA表达量上调;(3)5-Aza-CdR能抑制TE13的生长增殖,并随时间的延长和浓度的增加抑制作用变明显。结论:启动子区CpG岛高度甲基化是人食管鳞癌细胞株TE13 RIZ1基因表达沉默的重要原因;5-Aza-CdR能使TE13 RIZ1 mRNA表达上调;并能抑制TE13细胞的生长增殖,并呈时间和浓度依赖性。     

胃癌中IRX1的表达与启动子区甲基化的相关性

目的 探讨胃癌中同源盒基因IRX1的表达与启动子区甲基化修饰之间的关系.方法 生物信息学软件分析IRX1基因启动子区;RT-PCR检测胃癌细胞株及手术切除胃癌组织IRX1基因mRNA表达水平;MSP及BSP法检测启动子区甲基化状态;检测去甲基化试剂5-杂氮-2'-脱氧胞苷的干预对胃癌细胞IRX1基因表达的逆转效应.结果 经生物信息学预测IRX1基因转录起始点上游启动子区富含CpG岛;胃癌细胞株及胃癌组织IRX1基因表达有不同程度下调;MSP及BSP检测显示所有胃癌细胞株启动子区呈高甲基化状态;经5-Aza-CdR处理的细胞株IRX1基因的表达有不同程度上调.结论 胃癌中IRX1基因的表达下调与启动子区甲基化修饰有一定关系,为探讨IRX1基因作为去甲基化治疗靶点的可能性提供了实验数据.     

胶质瘤组织和细胞系中 Nanog 基因启动子区甲基化检测

目的：检测胶质瘤组织和细胞系中 Nanog 基因启动子区甲基化状态与 Nanog 基因的表达,并探讨其在胶质瘤发展中的作用。方法采用甲基化特异性 PCR(MSP)法分别检测正常脑组织、胶质瘤组织、胶质瘤癌旁组织、胶质瘤细胞系 U87和 U251中 Nanog 基因启动子区甲基化状态,实时定量 PCR(RT-PCR)法检测相应组织和细胞系中 Nanog 表达情况。结果 MSP 法检测胶质瘤组织 Nanog 基因启动子区呈非甲基化状态,且非甲基化检出率(58．82%)高于癌旁组织(13．63%),差异有统计学意义(χ2=14．852,P <0．01)。对MSP 法检测结果行灰度值分析,高级别胶质瘤中 Nanog 基因启动子区非甲基化程度高于低级别组。 U87和 U251细胞系中 Nanog 基因启动子区呈非甲基化状态。 RT-PCR 结果显示高级别胶质瘤中 Nanog mRNA 相对表达量高于低级别组, U87和 U251细胞系中 Nanog mRNA 的转录明显增多。结论胶质瘤中 Nanog 基因启动子区呈非甲基化状态,且可能促进 Nanog 基因的转录,影响胶质瘤的发生与发展。     

卵巢上皮性癌中RIZ1基因表达缺陷的意义及其与甲基化的关系

目的:研究抑癌基因RIZ1在卵巢上皮性癌组织及卵巢癌细胞系中的表达变化,分析其表达变化与甲基化的关系。方法:以卵巢癌组织及卵巢癌细胞系为研究对象。RT-PCR检测RIZ1 mRNA水平;MSP检测RIZ1基因甲基化状况;蛋白印迹检测RIZ1蛋白表达。结果:卵巢癌组织、卵巢癌细胞系及正常卵巢组织中RIZ1 mRNA相对含量的平均值分别为0.32±0.14,0.26±0.11和1.17±0.08。RIZ1蛋白相对含量的平均值分别为0.38±0.11,0.34±0.06和1.56±0.14。卵巢癌组织及卵巢癌细胞系中RIZ1的甲基化率分别为25.8%、20%。卵巢癌组织、卵巢癌细胞系分别与正常卵巢组织比较,RIZ1基因的表达差异均有统计学意义(P<0.05);存在甲基化的卵巢癌组织及细胞系中,RIZ1基因表达缺失或下降。5-杂氮-2′-脱氧胞苷处理RIZ1基因发生甲基化的卵巢癌细胞系后,RIZ1基因重表达;且去甲基化处理后,卵巢癌细胞生长均减慢。结论:RIZ1基因表达缺陷与卵巢癌的发生有关,DNA甲基化是其表达缺陷的原因之一;去甲基化处理可使RIZ1基因重表达,并抑制卵巢癌细胞的增殖。     

CpG island methylation of TMS1/ASC and CASP8 genes in cervical cancer

Background

Gene silencing associated with aberrant methylation of promoter region CpG islands is an acquired epigenetic alteration that serves as an alternative to genetic defects in the inactivation of tumor suppressor and other genes in human cancers.

Aims

This study describes the methylation status of TMS1/ASC and CASP8 genes in cervical cancer. We also examined the prevalence of TMS1/ASC and CASP8 genes methylation in cervical cancer tissue and none - neo plastic samples in an effort to correlate with smoking habit and clinicopathological features.

Method

Target DNA was modified by sodium bisulfite, converting all unmethylated, but not methylated, cytosines to uracil, and subsequently amplified by Methylation Specific (MS) PCR with primers specific for methylated versus unmethylated DNA. The PCR product was detected by gel electrophoresis and combined with the clinical records of patients.

Results

The methylation pattern of the TMS1/ASC and CASP8 genes in specimens of cervical cancer and adjacent normal tissues were detected [5/80 (6.2%), 3/80 (3.75%)-2/80 (2.5%), 1/80 (1.2%) respectively]. No statistical differences were seen in the extent of differentiation, invasion, pathological type and smoking habit between the methylated and unmethylated tissues (P > 0.05).

Conclusion

The present study conclude that the frequency of TMS1/ASC and CASP8 genes methylation in cervical cancer are rare (< 6%), and have no any critical role in development of cervical cancer.     

星形细胞瘤中环氧化酶-2 mRNA及蛋白表达的意义

目的 :探讨星形细胞瘤组织中环氧化酶 2 (COX2 )蛋白、mRNA的表达及其与病理级别的相关性。方法 :用原位杂交的方法检测星形细胞瘤组织中COX2mRNA的表达情况 ;用免疫组化SP法检测同等标本中COX2蛋白的表达情况 ;并将表达情况与星形细胞瘤病理级别作相关性分析。结果 :COX2蛋白在星形细胞瘤表达的染色积分为 4 .5 6± 2 .32 ,正常脑组织染色积分为 1.2 1± 1.18,二者相比较有显著性差异 (P <0 .0 1) ;低度恶性组(Ⅰ ,Ⅱ级 )染色积分为 1.84± 1.4 6 ,高度恶性组 (Ⅲ ,Ⅳ级 )染色积分为 6 .37± 3.6 2 ,二者相比较有显著性差异 (P <0 .0 1)。COX2mRNA在星形细胞瘤表达率为 6 2 .6 9% ,在正常脑组织中呈阴性表达 ,二者比较有显著性差异 (P <0 .0 1) ;COX2mRNA在低度恶性组和高度恶性组中表达率分别为 37.14 % ,87.5 % ,二者比较有显著性差异 (P <0 .0 1)。结论 :COX2蛋白、mRNA在星形细胞瘤组织中高度表达 ,且表达率与病理级别密切相关 ;从基因水平和蛋白水平说明COX2基因在星形细胞瘤的生长和病理进程中发挥着重要作用。     

过氧化物酶体增殖物激活受体γ在胶质瘤中的表达

目的 探讨胶质瘤组织及细胞株中过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)的表达及其意义.方法 应用免疫组化检测40例胶质瘤中PPARγ蛋白的表达;Western blotting检测3株胶质瘤细胞SWO-38、U251和SHG-44中PPARγ及神经胶质酸性蛋白蛋白的表达;RT-PCR检测3株胶质瘤细胞PPARγ mRNA的表达.结果 PPARγ在胶质瘤组织中阳性表达率为37.5%,与肿瘤的分化程度无明显相关性(P=0.154);PPARγ蛋白及mRNA在SWO-38和U251中表达,而SHG-44不表达:神经胶质酸性蛋白则在SHG-44中高表达.结论 PPARγ可能与胶质瘤的发生相关,可为胶质瘤治疗提供新的靶点.     

Influence of all-trans retinoic acid(ATRA) on the expression of NANOG in Glioma cell lines

Objective To investigate the effects of all-trans retinoic acid(ATRA) on the expression of NANOG in glioma cell lines.Methods Each cell line was divided into the experimental group which was treated with ATRA for 5 days,and the control group which was cultured normally without ATRA treatment.Immunocytochemistry and RT-PCR were adopted to detect the expression of NANOG at protein and mRNA level among the three kinds of cell lines.Results Positive rates of NANOG protein in glioma cell lines SHG-44,U87 MG and U251 in control groups were(65.5±3.0)%,(64.8±8.0)% and(64.5±1.2)%,respectively,and the difference was not statistically significant(F=0.190,P=0.829).NANOG mRNA of the three cell lines in the relative content were 0.636 8±0.039 9,0.642 1±0.063 7,0.651 6±0.044 4,and the difference was not statistically significant(F=0.427,P=0.662).However,5 days after application of ATRA-induced NANOG protein in the three cell lines,the positive rates of NANOG protein of experimental groups were(36.5±7.3)%,(35.5±7.9)%,(35.2±6.1)%,respectively,compared with the control groups,the differences were statistically significant(FSHG-44=259.1,FU87=129.5,FU251= 431.8,PSHG-44=0.0,PU87=0.0,PU251=0.0),and the relative level of NANOG mRNA in these groups were 0.458 3±0.079 1,0.255 1±0.079 3 and 0.333 1±0.054 0,respectively,compared with the control groups,the difference was significant(FSHG-44=77.8,FU87=277.9,FU251=398.1,PSHG-44=0.0,PU87=0.0,PU251=0.0).Conclusion NANOG which highly expressed in glioma cell line SHG-44,U87 MG and U251 can be reduced by ATRA.