长链非编码RNA在人类疾病中的研究进展

人类基因组研究计划证实:在人类的基因序列中只有2/3的序列被反转录,其中仅有不到2%的核酸序列用于编码蛋白,非编码RNA数量远远大于编码RNA。而在非编码RNA中,绝大多数是长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA),其在多个层面上参与基因表达和细胞分化,与人类疾病密切相关。现就长链非编码RNA的调节机制及其在人类疾病研究中的最新研究进展做一综述。     

受甲基化调控的lncRNA在乳腺癌中的表达谱及意义

目的：研究乳腺癌细胞去甲基化处理株和亲本株的lncRNA的差异表达情况,并从差异表达谱中筛选lncRNA,探讨受DNA启动子甲基化调控的lncRNA是否参与乳腺癌发生与发展。方法：取乳腺癌BT474细胞株去甲基化处理后,采用高通量lncRNA芯片技术分别检测去甲基化组和亲本组中lncRNA的表达谱,并在BT474、MB231和BT549三株乳腺癌细胞株及乳腺癌组织中应用qRT-PCR技术检测lncRNA的表达。同时寻找lncRNA的基因甲基化位点,并以重亚硫酸盐测序法（BSP）确定甲基化情况。结果：去甲基化株和亲本株lncRNA表达谱发生了显著的变化。qRT-PCR检测结果与芯片检测结果基本一致。qRT-PCR检测发现乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比正常乳腺上皮细胞株表达升高（P＜0.01）,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比癌旁组织表达升高（P＜0.01）。BSP方法显示相比正常乳腺上皮细胞株,乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）;相比癌旁组织,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）。结论：乳腺癌细胞株去甲基化处理后lncRN表达谱发生显著变化,并在差异表达谱中筛选出lncRNA uc003lxs及uc002btf,为研究受甲基化调节的lncRNA调控乳腺癌发生发展奠定前期的研究基础。     

长链非编码RNA在心脏疾病中的研究进展

大规模的哺乳动物转录分析确定了一类相当数量的不编码蛋白质的RNA分子,称为非编码RNA。长链非编码RNA(lncRNA)是一种核苷酸长度>200 nt的功能性RNA分子,没有蛋白质编码能力。lncRNA参与调控机体的生长发育、细胞凋亡、增殖、分化等,广泛地参与机体的生理与病理过程,与多种疾病密切相关。目前lncRNA的数量、功能和作用机制尚不清楚。最近的研究揭示,lncRNA在心脏发育和心脏疾病中起着潜在作用。     

长链非编码RNA EPIC1在肝细胞肝癌中的表达及临床意义

目的：研究长链非编码RNA表观遗传诱发长链非编码RNA1(epigenetically induced long non-coding RNA 1, EPIC1)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达情况及临床价值。方法：收集2013年9月—2018年3月被确诊为HCC患者48例的肿瘤及癌旁组织,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测HCC组织、细胞中EPIC1的表达情况;分析EPIC1表达与患者临床参数的相关性。结果：EPIC1在肝癌组织中平均表达量为(13.28±36.66),显著低于癌旁组织(62.84±108.93)(P=0.006)。相较于正常的肝细胞系L-02,EPIC1在HCC细胞系中低表达(P<0.05)。HCC患者EPIC1表达量与患者的TNM分期相关(P=0.033)。结论：EPIC1在HCC中低表达,可能为潜在的治疗靶点。     

长链非编码RNA在胃癌发生发展中的作用

通过回顾近年来与胃癌相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)研究进展,进一步了解其在胃癌发生、发展调控过程中的作用,对认识lncRNA在胃癌的生物学行为、胃癌诊断及预后中的价值具有重要的意义.lncRNA有希望成为胃癌重要的生物标记物以及诊断和治疗方面的新靶点.     

长链非编码RNA表达失调在糖尿病肾病发病机制中的研究进展

糖尿病肾病(DN)是糖尿病最常见和严重的微血管并发症,其发病机制复杂,疾病进展迅速,最终导致不可逆的肾衰竭.DN防治一直是世界性难题,西医常规治疗包括饮食、运动等生活方式管理和严格的血糖、血压控制,但疗效十分有限,虽然有钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂等新药不断出现,但并不能有效阻止DN的进展.近年来,长链非编码RNA(...     

lncRNA与心血管疾病

非编码RNA(ncRNA)占哺乳动物RNA的98%,既往认为非编码RNA不具备生物学功能,但近些年来的研究发现,非编码RNA可从表观遗传学、转录调控及转录后调控等多个层面实现对基因表达的调控,其表达水平的变化与多种疾病密切相关,亦影响到心血管疾病的发病进程。其中,长链非编码RNA(lncRNA)成为基因组学研究中一颗冉冉升起的新星,其可从转录水平调控疾病相关基因的表达,亦可竞争性结合microRNA,以影响目的基因的表达和功能。文章从非编码RNA的来源、分类、作用机制及lncRNA在心血管疾病中的研究进展进行综述。具有细胞和组织特异性的lncRNA未来则有望成为一类全新的疾病诊断、判断预后的特异标志物和新药作用靶点,为疾病的临床诊断与治疗提供新思路。     

非编码RNA在动脉粥样硬化性心脏病中的研究进展

哺乳动物基因组存在有大量不编码蛋白质的RNA序列,称为非编码RNA(ncRNA),起初被认为基因组学的暗物质,但近年来研究提示,非编码RNA可从多个生物学层面实现对基因表达的调控,并与多种疾病密切相关。小分子RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)是隶属于ncRNAs的主要组成部分并成为研究热点,可从炎性反应、细胞增殖等多方面调控动脉粥样硬化性疾病的病理生理进程;二者均可稳定表达于外周血并具有组织表达特异性,是可靠的生物学标志物,可作为疾病诊断、治疗及判断预后的靶点。此外,ncRNAs或可从基因水平揭示中医证型的物质基础,为中医证型的鉴别和诊断提供客观的证据支持。本文从ncRNAs的来源、分类、作用机制、在动脉粥样硬化性心脏病中的研究进展及其作为生物学标志物的临床应用进行综述,以阐释ncRNAs在心血管疾病中潜在的生物学机制和应用前景。     

长链非编码RNA与微RNA相互作用在血管生成中的研究进展

血管生成参与维持正常的生理过程。糖尿病视网膜病变、类风湿性关节炎和癌症等多种疾病的发病机制均与血管生成失衡有关。血管生成刺激物和抑制物的共同作用,使血管生成保持平衡。此外,越来越多的证据表明,非编码RNA,特别是长链非编码RNA (lncRNA)和微RNA (miRNA)在血管生成的调控中发挥着重要作用。近年来,大量研究发现,lncRNA可能作为内源性海绵调节miRNA的表达和功能,miRNA与lncRNA结合的同时也可以调节其稳定性。本文对与血管生成发生发展相关的lncRNA进行综述,并讨论其潜在的作用机制和联系。     

Mir-106b对阿尔茨海默病昼夜节律调控的初步研究

目的探讨mir-106b在阿尔茨海默病发病中的作用。方法取6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织,进行microRNA芯片的检测;利用real-time PCR对芯片检测结果进行验证;构建mir-106b表达载体,将其转染至SH-SY5Y细胞中构建mir-106b稳定转染的稳转细胞系。用Targetsan、Pictar、miRanda等靶基因预测软件,对mir-106b的靶基因进行预测,根据靶基因的功能选择可能与AD发病相关的靶基因,并用Western blot对所选择的靶基因在稳转细胞中的表达进行验证。用双荧光素酶报告检测系统检测mir-106b与其靶基因的结合位点。结果芯片结果显示,与野生型小鼠相比,6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织中mir-106b的表达下降,经real-time PCR验证,mir-106b的表达在APPswe/PSΔE9小鼠脑组织中的表达较野生型小鼠升高,差别具有统计学意义(P=0.03)。mir-106b稳转细胞系较对照mir-106b的表达升高2～5倍。神经PAS结构域蛋白2(neuronal PAS domain protein2,NPAS2)在mir-106b稳转细胞中的表达明显下降。双荧光素酶报告实验证实:与对照相比,带有NPAS2的3'UTR的荧光素酶报告载体与mir-106b表达载体共转染,海肾荧光素酶/萤火虫荧光素酶的相对活性降低;荧光素酶报告载体的NPAS2-3'UTR突变后与mir-106b表达载体共转染,海肾荧光素酶/萤火虫荧光素酶的相对活性升高。结论mir-106b可能通过调节机体生物钟基因NPAS2的表达,影响阿尔茨海默病人的生活节律,参与阿尔茨海默病的发生。     

MicroRNAs及其对生长发育调控的研究进展

小分子RNA家族中的一员—microRNA是一段非常短的非编码RNA序列,其对细胞周期及个体发育过程调控等功能的研究工作正处于快速的进展之中。本文对miRNA分子及其对动物生长发育调控的研究进展作一综述。     

microRNA与肿瘤相关性研究进展

microRNA（miRNA）是真核生物中一类长度约为22个核苷酸、参与基因转录后水平调控的非编码小分子RNA。近年来研究发现，miRNA除了具有调控细胞增殖、死亡、细胞分化、个体发育等生物学功能以外，与肿瘤的发生也有着密切的关系。该文作者试图从miRNA的生物学特性、形成、生理功能、作用机制及与肿瘤的关系等方面的研究进展作一综述。     

MicroRNA在阿尔茨海默病发病机制中的作用

microRNA通过转录后水平调控细胞的蛋白质表达,在神经系统的发育、分化及功能行使中发挥着重要作用。阿尔茨海默病是一种以进行性认知功能障碍为特征的神经退行性疾病,患者脑内microRNA的表达发生改变,异常表达的microRNA可从多种途径影响疾病的发生与发展,对microRNA在阿尔茨海默病中作用的研究不仅有利于疾病发病机制的诠释也有利于microRNA调控机制的探讨。     

鼻咽癌差异表达miRNAs筛选研究

 【目的】应用miRNAs芯片筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs，并寻找差异表达miRNAs调控的靶基因，为进一步研究其在鼻咽癌发病机制中的作用打下基础。【方法】运用miRNAs芯片技术筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs，同时运用miRNAs特异的引物组对差异表达的miRNAs进行荧光定量RTPCR验证。运用靶基因预测软件并结合全基因组表达谱芯片结果预测差异表达miRNAs可能调控的靶基因，并利用westernblot技术检测预测的靶基因在原代培养的鼻咽癌细胞中的表达。【结果】miRNAs芯片结果显示，鼻咽癌中miR-203、miR-503、miR-424、miR-141和miR-148a表达下调，而miR-25、miR-195和miR-15a表达上调，其差异表达均在2倍以上；荧光定量RTPCR结果与miRNAs芯片的结果较符合；其中miR-203的预测靶基因为CCNG1和SPARC，Western blot结果显示，其在原代培养的鼻咽癌细胞亦高表达。【结论】miR-203、miR-503、miR-424、miR-141、miR-148a、miR-25、miR-195、miR-15a在原代培养的鼻咽癌细胞与正常鼻咽上皮细胞中存在差异表达；CCNG1和SPARC可能是miR-203调控的靶基因，可能参与了鼻咽癌的发生发展。     

阿尔茨海默病中mir-222作用机制的初步研究

目的探讨mir-222在阿尔茨海默病发病机制中的作用。方法取6月龄APPswe／PSAE9小鼠脑组织，进行microRNA芯片的检测；利用real—timePCR对芯片检测结果进行验证；构建mir-222表达载体，将其转染至SH-SY5Y细胞中，转染后48小时提取蛋白检测p27kipl的表达情况。结果芯片结果显示，与野生型C57BL／6J小鼠相比，6月龄APPswe／PSAE9小鼠脑组织中mir-222表达明显下降，经real-timePCR验证，差别具有统计学意义（P=O．012）；将mir-222表达载体转染至SH—SY5Y细胞后，p27kipl表达减少。结论mir-222可能通过调节细胞周期抑制因子p27kipl的表达参与阿尔茨海默病的发生。     

microRNA调控NK细胞KIR3DL1表达初探

目的初步探寻人外周血自然杀伤细胞（Nature Killer,NK）杀伤细胞免疫球蛋白样受体（Killer Cell Immnoglobulin-Like Receptor,KIR3DL1）表达可能存在的microRNA（miR）调控机制。方法利用生物信息学方法,从miR信息库中筛选出可能与KIR3DL1相关的miRs,构建含KIR3DL1 3’非翻译区（UTR）的PGL3质粒,分别将含相应miR的PcDNA3.0质粒与前者共转染293T细胞,通过荧光素酶报告实验及之后的突变实验筛选出可能调控KIR3DL1的miR。结果通过TARGET SCAN信息库筛选了miR-146b等10个miR;转染miR-146b后,荧光素酶活性下降最多（61.3%）,突变其KIR3DL1 3’UTR靶位点后荧光素酶活性恢复（91.4%）。结论 miR-146b可与KIR3DL1’UTR在靶位点特异结合,很可能参与KIR3DL1表达的调控。     

耐药乳腺癌细胞株MCF-7/ADR中microRNA的分析

目的 本研究通检测乳腺癌细胞株MCF-7及其阿霉索耐药株MCF-7/ADR的microRNA的表达差异,探讨microRNA与乳腺癌化疗耐药的关系.方法 MTT法检测MCF-7/ADR相对于其亲本细胞MCF-7的耐药性和耐药倍数;microRNA芯片和RT-PCR的方法比较阿霉素耐药细胞株MCF-7/ADR与其对应的MCF-7乳腺癌细胞株microRNA表达差异.结果 乳腺癌的阿霉素耐药株MCF-7/ADR相对于其亲本细胞系MCF-7对阿霉素的耐药倍数为33.2倍.microRNA芯片的结果显示耐药株MCF-7/ADR与亲本细胞系MCF-7比较有16个microRNA高表达,20个microRNA低表达:RT-PCR的结果进一步证实mir-221、mir222、mir-130a、mir-155在MCF-7/ADR中显著上调.而mir200a、mir-200b、mir-200c、mir-421在MCF-7/ADR中显著下调.结论 MCF-7/ADR与MCF-7的microRNA的表达存在着差异,提示mieroRNA参与乳腺癌化疗耐药,为进一步研究microRNA在乳腺癌耐药机制中的作用打下基础.