血清蛋白质指纹图谱诊断模型在肾癌中的应用

目的 检测肾癌患者血清蛋白质,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于肾癌早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型.方法 应用蛋白质芯片CM10及表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术测定168例血清标本(其中肾癌53例,肾良性占位性病变47例,健康志愿者68例)的蛋白质质谱,用随机抽取的118例标本(肾癌38例,肾良性占位病变30例,健康志愿者50例)作为训练组,应用支持向量机进行训练和交叉验证,建立肾癌诊断模型;其余50例标本进行盲法验证.结果 利用质荷比分别为5350、4100、3446、5027和6115的5个蛋白峰建立区分肾癌和正常人的诊断模型,其敏感性为94.74%,特异性为92%.盲法验证显示敏感性为93.33%,特异性为88.89%.区分肾癌和肾良性占位病变的诊断模型,敏感性为92.11%,特异性为90%.区分透明细胞癌和其他病理类型的肾癌的诊断模型对透明细胞癌的判别率为92.84%,对其他病理类型的肾癌的判别率为81.82%.结论 表面增强激光解吸电离/飞行时间质谱技术结合支持向量机建立肾癌血清蛋白质指纹图谱模型对诊断肾癌具有较高的敏感性与特异性.     

表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱在甲状腺癌诊断及临床分期中的应用

目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型.方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标本的蛋白质质谱,其中甲状腺癌 40 例(Ⅰ-Ⅱ期 26 例,Ⅲ-Ⅳ期14 例),正常人32例.应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据,建立甲状腺癌诊断模型并留一法交叉验证.结果:区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性为100%,特异性为86%,总的符合率为93%;区分Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型对Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌检出的敏感性为77%,特异性为86%,对Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌检出的敏感性为86%,特异性为77%,总的符合率为80%.结论:应用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息技术建立的诊断模型为甲状腺癌的早期诊断及临床分期提供了新的手段.     

SELDI—TOF—MS技术建立早期肝硬化患者血清蛋白质谱筛选模型

目的：比较早期肝硬化患者和健康人的血清蛋白质谱并建立相关血清诊断模型。方法：用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱（SELDI-TOF—MS）技术及CM10蛋白芯片对50例早期肝硬化患者、50例健康人血清样本进行分析,将获得的血清蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析。结果：早期肝硬化患者与健康人对照组共有25个差异有统计学意义的蛋白质峰;建立诊断模型的灵敏度为96％（48／50）,特异度为90％（45／50）,准确率为93％（93／100）。结论：两组人的蛋白质谱有明显的差异,建立的诊断模型能够区分早期肝硬化患者与健康人,SELDI—TOF—MS技术在诊断及特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有较好的临床应用价值。     

基于支持向量机对肾母细胞瘤患者血清蛋白质标记物的检测分析

目的 检测肾母细胞瘤患儿血清蛋白质,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于肾母细胞瘤早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型。方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术检测75例血清标本（肾母细胞瘤30例,其他小儿腹腔实体肿瘤25例,正常小儿20例）的蛋白质质谱,并结合生物信息学方法（支持向量机）分析数据。结果筛选出4个质荷比（m／z）位于6984．5、6455．5、6914,0、3256．7的蛋白质标记物,构建肾母细胞瘤早期诊断模型。经留一法交叉验证,区分肾母细胞瘤和正常小儿的血清蛋白质指纹图谱模型特异性为100％,敏感性为100％;区分肾母细胞瘤与其他腹腔实体肿瘤的血清蛋白质指纹图谱模型特异性为100％,敏感性为93．3％。结论表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术结合支持向量机建立肾母细胞瘤血清蛋白质指纹图谱模型是早期诊断肾母细胞瘤的一种特异性强、敏感性高的新方法,可用于肾母细胞瘤早期诊断与肿瘤标志物筛选研究。     

新疆哈萨克民族食管癌淋巴结转移的血清蛋白质组学研究

目的:比较分析新疆哈萨克民族食管癌淋巴结转移患者和健康人血清蛋白质谱的差异,建立新疆哈萨克民族食管癌淋巴结转移的蛋白质指纹诊断模型,并筛选与食管癌淋巴结转移的相关蛋白质。方法:采用弱阳离子交换蛋白芯片(CM10)和表面加强激光解吸离子化飞行时间质谱技术,检测分析了21例食管癌有淋巴结转移,20例食管癌无淋巴结转移的患者和20例正常对照的哈萨克民族血清,用支持向量机方法建立蛋白质指纹图谱诊断模型,用留一法交叉验证作为评估模型判别效果的方法。两组之间的蛋白质峰的比较采用Wilconxon秩和检验。结果:结果显示新疆哈萨克民族食管癌淋巴结转移患者和健康人血清的蛋白质荷比峰值图谱明显不同。比较21例淋巴结阳性患者组与20例淋巴结阴性组食管癌血清蛋白质指纹图谱数据,其中5个峰差异有统计学意义(P0.05)。3个峰在食管癌淋巴结阴性组呈高表达,2个峰呈低表达。结论:建立的诊断模型在区分哈萨克民族食管癌淋巴结转移患者上,具有较高的灵敏度和特异度;筛选出的蛋白标记物可能为新疆哈萨克民族食管癌淋巴结转移提供依据。     

新疆维吾尔族食管癌患者血清蛋白指纹图谱诊断模型的建立

目的:筛选并建立新疆维吾尔族食管癌血清蛋白指纹图谱诊断模型,为食管癌的诊断与临床筛查提供新的途径。方法:采用弱阳离子交换蛋白质芯片(CM10蛋白芯片)及表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对23例新疆维吾尔族食管癌和33例新疆维吾尔族正常对照者血清指纹图谱进行检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统(ZUCI-Protein Chip Data Analyze System)软件包进行分析,通过支持向量机运算建立区分新疆维吾尔族食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,并用留一法交叉验证作用评估模型,判别效果。结果:通过软件包运算,用2个质荷比峰(3269.4621、6056.8714m/z)建立了新疆维吾尔族食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,准确度为92.9%,灵敏度为91.3%,特异度为93.9%,阳性预测值为91.3%。结论:SELDI-TOF-MS技术结合支持向量机建立新疆维吾尔族食管癌血清蛋白质指纹图谱模型为早期筛查及诊断新疆维吾尔族食管癌提供了一种特异性强、灵敏度高的新方法,值得进一步的研究和应用。     

应用SELDI-TOF-MS技术建立胃癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型

目的 应用SELDI蛋白质芯片检测胃癌患者血清蛋白质指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物以建立诊断模型,并探讨其诊断早期胃癌的临床意义.方法 表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SEL-DI-TOF-MS)技术及其配套蛋白质芯片检测40例胃癌患者和30例健康人的血清蛋白质组图谱,运用判别分析处理数据筛选标志物并建立诊断模型.结果 8592m/z、13725m/z、8678m/z等3个蛋白质峰组合所构建的诊断模型能达到鉴别胃癌患者和健康人的最佳诊断效果,灵敏度为90%(36/40),特异性为86.5%(26/30).结论 该方法 在胃癌的诊断尤其是早期诊断、术前分期及候选肿瘤标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步研究.     

应用SELDI-TOF-MS对先天性巨结肠血清蛋白质标记物检测

目的 建立蛋白质芯片技术检测先天性巨结肠患儿血清蛋白质,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于先天性巨结肠患儿早期筛选及普查的血清蛋白质指纹图谱模型.方法 应用蛋白质指纹图谱分析仪(表面增强激光解析-电离-飞行时间质谱仪,SELDI-TOF-MS),测定62例血清标本(先天性巨结肠患儿42例,健康儿童20例),并结合生物信息学方法支持向量机分析数据.结果 筛选出3个m/z位于3221.7、5639.2、6884.2的蛋白质标记物构建用于先天性巨结肠早期筛选及诊断的血清蛋白质指纹图谱模型.经留一法交叉验证,区分先天性巨结肠和正常小儿的血清蛋白质指纹图谱模型的特异性为100%,敏感性为100%.结论 应用SELDI-TOF-MS结合生物信息学方法支持向量机构建的血清蛋白质指纹图谱模型在早期筛选及普查先天性巨结肠患儿的诊断中较以往的传统方法具有较高的敏感性和特异性,值得进一步研究与应用.     

SELDI-TOF-MS蛋白芯片技术在宫颈癌早期诊断和鉴别诊断中的应用

目的 采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术检测宫颈浸润癌和原位癌患者血清蛋白质指纹图谱,通过差异蛋白组学筛选特有的蛋白标记物.方法 应用SELDI-TOF-MS技术和WCX2(弱阳离子)芯片采集74例宫颈癌(44例宫颈浸润癌和30例宫颈原位癌)患者和51例健康人血清蛋白质指纹图谱,采用Biomarker Wizard软件筛选差异蛋白,应用Biomarker patternsoftware 5.0.2版建立诊断模型,并盲法验证其诊断效率.结果 宫颈癌患者与对照组血清蛋白质指纹图谱有12个差异表达的蛋白质峰(P<0.05),筛选出分子量分别为5642、5912、5905、5660、2288和8700 Da 6个标志蛋白,将125例血清随机分为30例宫颈癌和30例健康人血清作为训练组用于建立人工神经网络(ANN)模型,44例宫颈癌和21例健康人血清作为验证组,其对宫颈癌的诊断敏感性为95.45%,特异性为95.23%.宫颈浸润癌与原住癌血清蛋白质谱有16个差异表达的蛋白质(P<0.01),筛选出分子量分别为13776、2796、2697、2070、2768和9222 Da 6个标志蛋白,随机将15例宫颈浸润癌和15例原位癌血清分为训练组,29例浸润癌和15例原位癌作为验证组,其鉴别宫颈浸润癌的敏感性为93.10%.特异性为93.33%.宫颈原位癌患者与对照组血清蛋白质谱比较有6个差异表迭的蛋白质(P<0.05),分别随机选取15例宫颈原位癌和15例健康人血清作为训练组,15例原位癌和36例健康人血清作为验证组,其诊断宫颈原位癌的敏感性为60%,特异性为98.08%.结论 血清蛋白质谱技术可望用于宫颈浸润癌和原位癌的鉴别,标志蛋白的鉴定可能对宫颈癌浸润机制的探讨和新的治疗手段的开展具有重要的指导意义.     

血清蛋白质指纹图谱结合生物信息学在大肠癌早期诊断中的应用

目的:应用SELDI质谱仪建立大肠癌血清蛋白质指纹图谱的诊断模型.方法:测定182例血清标本(其中55例大肠癌、35例大肠腺瘤、92例健康人)的蛋白质指纹图谱,结合人工神经网络及支持向量机对这些数据进行处理,建立相应的指纹图谱诊断模型.结果:运用生物信息学方法从大肠癌与健康对照中筛选出了4个质荷比位于5 911 Da、8 922 Da、8 943 Da、8 817 Da(M/Z)峰,用它们建立的诊断模型的特异性为93.3%,敏感度为90.9%,Youden指数为0.84242.从大肠癌与大肠腺瘤中筛选出7个质荷比位于17 247 Da、18 420 Da、5 911 Da、9 294 Da、4 654 Da、21 694 Da、21 742 Da的峰值,建立模型的特异性为83.2%,敏感度为89.3%,Youden指数为0.72484.结论:该方法在大肠癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性.     

应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱方法检测喉鳞状细胞癌及淋巴结转移的血清蛋白质标志物

目的 应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）方法筛选喉鳞癌（LSCC）血清蛋白质标志物,建立喉癌诊断预测模型。并检测喉癌淋巴结转移相关的血清蛋白标志物。方法收集252例血清标本,其中喉癌患者血清142例,正常对照110例。其中89例喉癌血清,30例有淋巴结转移的喉癌血清和65例正常对照为试验组,53例喉癌血清及45例正常对照为盲法验证组。应用弱阳离子交换芯片（WCX2）经SELDI-TOF-MS测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard和Biomarker Pattern（BIaS）软件分析喉癌和正常人血清的蛋白质谱差异,建立喉癌诊断预测模型并进行盲法验证。寻找喉癌转移相关蛋白标志物。结果 在质荷比（M／Z）2000～50000范围内,弱阳离子（WCX2）芯片共检测出18个差异蛋白峰,可以鉴别喉癌和正常对照。BIaS自动选用其中一个差异蛋白质峰（4176）建立决策树模型,灵敏性为86．52％,特异性为84．62％（32／36）。盲法验证的灵敏性为84．91％,特异性为82．22％。伴或不伴淋巴结转移的喉癌患者之间检测到14个差异蛋白峰。结论应用SELDI-TOF-MS方法可以从血清中筛选出喉癌及淋巴结转移相关的标志蛋白。建立的喉癌诊断预测模型可能对早期发现早期诊断喉癌具有重要的临床意义。     

下咽癌相关血清蛋白质分子标志物的初步研究

目的筛选下咽癌血清蛋白质分子标志物,并建立决策诊断模型。方法48例下咽癌病人血清,其中36例为建模组,12例为盲法验证组。52例正常对照的血清,其中36例为建模组,16例为盲法验证组。应用弱阳离子交换芯片（WCX2）及固定金属亲和芯片（IMAC3）,经表面加强激光解析电离飞行时间质谱测定得到蛋白质谱,分析下咽癌和正常人血清的蛋白质谱差异,建立分类树模型并进行盲法验证。结果在质荷比（M／Z）2～50范围内,WCX2芯片共检测出11个差异蛋白峰。IMAC3芯片共检测19个差异蛋白峰（P值以10^-5为界）。自动选用7796、4216、5927、5361（M／Z）建立决策树模型,灵敏性为94．44％（34／36）,特异性为88．89％（32／36）。盲法验证的灵敏性为91．67％,特异性为81．25％。结论应用该方法可以从病人血清中筛选出下咽癌相关的标志蛋白。建立的决策树模型可能对早期发现早期诊断下咽癌具有重要的临床意义。     

血清蛋白质指纹图谱与人工神经网络模型在肺癌诊断中的应用

目的筛选肺癌相关标志物并建立诊断肺癌的蛋白质谱模型。方法应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测了86例肺癌、80例健康对照样本的血清蛋白质质谱，结合人工神经网络建立肺癌诊断模型。结果从肺癌组与健康对照组中筛选出了4个蛋白质荷比峰建立肺癌诊断模型，该诊断模型的特异性为 100％（95％的置信区间为93.9％～100.0％），敏感性为93.6％（87.6％～96.4％），准确率为96.7%（88.1％～98.3％）。结论成功建立了肺癌诊断模型，该模型在肺癌的诊断中具有较高的敏感性和特异性。     

血清glactin-3、HMGB-1和TSGF联合检测在甲状腺癌诊断中的价值

目的:探讨血清半乳糖血凝素-3(glactin-3)、高迁移率族蛋白(HMGB-1)和肿瘤特异性生长因子(TSGF)联合检测在甲状腺癌诊断中的价值.方法:选取甲状腺癌病人60例、甲状腺腺瘤病人60例作为研究对象,另选取同期甲状腺组织正常的健康体检者60名作为对照组.采用 ELISA 法检测3组血清中glactin-3、HMGB-1和TSGF水平,比较三项指标单独检测和联合检测对甲状腺癌的诊断率.结果:甲状腺癌组病人血清glactin-3、HMGB-1和TSGF水平均明显高于甲状腺腺瘤组和对照组(P<0.01),而甲状腺腺瘤组三项指标水平亦均明显高于对照组(P<0.01).甲状腺癌组glactin-3、HMGB-1和TSGF检测阳性率均明显高于甲状腺腺瘤组(P<0.01),甲状腺癌组三项指标联合检测阳性率亦明显高于甲状腺腺瘤组(P<0.01).与单项检测相比,血清glactin-3、HMGB-1和TSGF联合检测诊断甲状腺癌效果最佳,其受试者工作特征曲线下面积和灵敏度、特异度分别为0.86和93.3%、91.7%.结论:血清glactin-3、HMGB-1和TSGF联合检测对甲状腺癌诊断率较高,敏感性较好.     

CT对甲状腺腺瘤的诊断价值研究

目的探讨超声与螺旋CT对甲状腺腺瘤的诊断效力。方法选择41例甲状腺腺瘤及52例甲状腺癌患者为研究对象,均接受螺旋CT检查,观察螺旋CT对甲状腺腺瘤及甲状腺癌的诊断效力。包括诊断灵敏度、特异度、阳性预测率、阴性预测率、正确率及诊断符合率。结果甲状腺腺瘤及甲状腺癌在边缘中断、病灶数量、增强后边缘模糊、瘤体边缘不规则、细颗粒样钙化及囊变方面,差异具有统计学意义(P0.05)。以病理结果为标准,螺旋CT共正确诊断甲状腺腺瘤51例,甲状腺癌42例,其诊断敏感性90.4%、特异性90.2%、阳性预测率92.2%、阴性预测率88.1%、正确率80.6%及诊断符合率90.3%。结论在甲状腺腺瘤的的定性诊断中,螺旋CT诊断效力高,适合临床广泛应用。     

血清蛋白质质谱与支持向量机模型在胰腺癌检测上的应用

目的:为提高胰腺癌的早期检测率筛选新的标志物,应用蛋白芯片结合表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术建立胰腺癌的血清蛋白质质谱模型。方法:用弱阳离子交换芯片(CM10)结合SELDI-TOF-MS技术检测了73例血清样本,其中31例胰腺癌,22例胰腺炎,20例健康人。用支持向量机方法建立胰腺癌和健康人以及胰腺癌和胰腺炎的辨别模型。结果:胰腺癌和健康人辨别模型用了3个蛋白质峰,辨别的敏感性和特异性均为100%,而胰腺癌和胰腺炎辨别模型用了5个蛋白质峰,辨别的特异性和敏感性分别为95.5%和93.5%。结论:SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法检测胰腺癌具有较高的敏感性和特异性。     

Applied research on serum protein fingerprints for prediction of Qi deficiency syndrome and phlegm and blood stasis in patients with non-small cell lung cancer

OBJECTIVE:This study screened serum tumor biomarkers by surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry(SELDI-TOF-MS) to establish a subset which could be used for the prediction of Qi deficiency syndrome and phlegm and blood stasis in patients with non-small cell lung cancer;and as diagnostic model of Chinese medicine.METHODS:Serum samples from 63 lung cancer patients with Qi deficiency syndrome and phlegm and blood stasis,and 28 lung cancer patients with non-Qi deficiency syndrome and phlegm and blood stasis were analyzed using SELDI-TOF-MS with a PBS II-C protein chip reader.Protein profiles were generated using immobilized metal affinity capture(IMAC3) protein chips.Differentially-expressed proteins were screened.Protein peak clustering and classification analyses were performed using Biomarker Wizard and Biomarker Pattern software packages,respectively.RESULTS:A total of 268 effective protein peaks were detected in the 1,000-10,000 Da molecular range for the 15 serum proteins screened(P<0.05).The decision tree model was M 2284.97,with a sensitivity of 96.2% and a specificity of 66.7%.CONCLUSION:SELDI-TOF-MS techniques,combined with a decision tree model,can help identify serum proteomic biomarkers related to Qi deficiency syndrome and phlegm and blood stasis in lung cancer patients;and the predictive model can be used to discriminate between Chinese medicine diagnostic models of disease.     

蛋白质质谱在声门上型喉鳞癌早期诊断中的研究

目的探讨应用血清蛋白质谱建立声门上型喉鳞癌患者的诊断模型,提高声门上型喉鳞癌早期诊断率。方法应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱（Surface-enhaneed desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF—MS）技术及其配套的蛋白质芯片对30例声门上型喉鳞癌患者和30例健康人血清中的蛋白质组图谱进行检测,结合相关软件建立决策分类树诊断模型,并评估该模型的诊断价值。结果两组间有9个差异性表达蛋白峰,其中3个在声门上型喉鳞癌患者血清中高表达,m／z（质荷比）分别是9194．06,11681．15和51370．19,应用数据建立分类树模型,获得了一个由7个蛋白9194．06,51370．1,15879．1,6624．57,8929．80,11681．1,1013．77组成的标志蛋白组合模式。在训练组中,该模型的敏感性和特异性分别为86．66％和90％。结论该模型对诊断声门上型喉鳞癌具有较高的灵敏度和特异度,值得临床推广应用。     

CT、彩超联合诊断甲状腺癌的价值研究

目的研究断层扫描(CT)与彩色多普勒超声联合诊断甲状腺癌的应用价值。方法回顾性分析收集我院自2014年1月至2015年9月收治的98例疑似甲状腺癌患者作为研究对象,本组患者均行CT薄层扫描及颈部彩超检查,以病理诊断结果为金标准,对比联合CT、彩超与单一诊断方法的诊断价值。结果 98例疑似甲状腺癌患者确诊为TC的患者有82例;CT对乳头状甲状腺癌诊断的准确率显著高于彩超(χ2=3.521,P0.05)。CT对甲状腺癌诊断的灵敏度,特异性,阳性预测值和阴性预测值分别为89.2%,27.3%,70.7%和56.25%;彩超对甲状腺癌诊断的灵敏度,特异性,阳性预测值和阴性预测值分别为88.3%,21.2%,54.8%和62.5%;CT联合彩超对甲状腺癌诊断的灵敏度,特异性,阳性预测值和阴性预测值分别为96.2%,68.4%,92.7%和81.25%。结论对甲状腺癌患者联合计算机断层扫描(CT)与彩色多普勒超声(彩超)进行诊断较单一方法更可靠,具有较好的临床应用价值。