肿瘤坏死因子α基因启动子-857 位C →T基因突变与强直性脊柱炎相关性研究

目的探讨中国湖南籍汉族强直性脊柱炎(AS)患者人群中,TNF-α-857位C→T基因突变与AS的相关性,及其致病的可能分子生物学机制。方法在164例AS患者和121名正常对照中,用等位基因特异性扩增的方法,对TNF-α基因启动子-857C/T单核苷酸多态性(single nucleotide polymor-phisms,SNPs)进行基因分型,分析单个位点的等位基因和基因型频率是否与AS相关。结果AS患者组TNF-α-857T的等位基因频率(P=0.002)和基因型频率(P=0.000002)均显著超过正常对照组,经Bon-ferroni校正后仍为阳性。结论本研究显示TNF-α-857基因多态性与AS存在显著的相关性,TNF-α-857T可能增加AS的易感性。     

强直性脊柱炎患者肿瘤坏死因子α-857和-863位点基因多态性分析

目的探讨肿瘤坏死因子（TNF）α-857和-863位点基因多态性与强直性脊柱炎（AS）的相关性。方法用序列特异引物PCR方法对112例AS患者和96例健康对照人群,以及98例HLAB27阳性AS患者和14例阴性AS患者的TNF—α-857（C／T）和-863（C／A）位点基因多态性进行分析。结果AS患者组TNF—α-857位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组有显著统计学差异（P〈0．01）,AS患者的T等位基因频率明显高于对照组,而AS患者TNF-α-863位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组无统计学差异（P〉0．05）。HLA-B27阳性As患者和阴性AS患者TNF—α-857位点基因型频率亦有显著统计学差异（P〈0．01）。结论TNF—α-857位点基因多态性与AS相关,T等位基因可能增加AS的易感性。     

强直性脊柱炎易感基因IL-1RN和TNF-α的单核苷酸多态性的研究

目的检测中国深圳地区汉族强直性脊柱炎(AS)患者IL-1RN和TNF-α基因的单核苷酸多态性(SNPs)。方法在54名AS患者和42名健康对照者中,采用基因芯片技术对IL-1外显子6上SNPs(31017C/G、30735T/C)、TNF-α启动子上的SNPs(-857C/T)进行基因分型,分析单个位点的等位基因频率和基因型频率是否与AS相关,采用SAS软件分析数据。结果AS患者中,IL-1RN的31017C/G的等位基因G频率和30735T/C的等位基因C频率(分别是60.42%vs36.36%,32%vs17.19%)和IL-1RN的31017C/G的基因型GG频率和30735T/C的基因型CT频率(分别是43.75%vs12.12%,64%vs39.39%)显著性高于健康对照者,差异具有统计学意义(P<0.01)。TNF-α的-857C/T的等位基因T频率(25%vs9.52%)和基因型CT频率(42.59%vs19.05%)也显著高于健康对照者(P<0.01)。在健康人中31017CG/857CC基因型组合要显著高于AS患者(P<0.01),在AS患者中31017GG/30735CT/857CT基因型组合要显著高于健康对照者(P<0.05),其差异均具有统计学意义。结论IL-1RN基因的31017C/G和30735T/C的两个SNPs及其基因型频率与中国深圳汉族AS之间存在显著相关性,31017CG/857CC基因组合可能是保护性的基因组合,而31017GG/30735CT/857CT组合可能增加AS患病的易感性。     

贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α基因启动子区的单核苷酸多态性

目的: 了解贵州汉族人群肿瘤坏死因子-α (tumor necrosis factor alpha, TNF-α)基因启动子区的基因多态性.方法: 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) 和序列特异性引物-PCR(SSP-PCR) 方法,对贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率及其组间差异.结果: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,96%;A,4.0%)、-308(G,92%;A,8%)、-857(C,65.0%;T,35.0%)、-863(C,80.0%;A,20.0%)、-1 031(T,48.0%;C,52.0%).结论: 贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料.     

TNF-α -857C/T及-863C/A位点基因多态性与HBV感染转归的关系

目的探讨广西人群肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因启动子-857和-863基因多态性与乙型肝炎病毒（HBV）感染后果的关系。方法慢性乙型肝炎患者74例（CHB组）、HBV感染自愈者64例（SR组）、健康对照组48例,应用同聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法 ,检测SR和CHB患者TNF-α基因启动子-857C/T和-863C/A单核苷酸多态性位点基因型。结果 TNF-α基因启动子区域-857CC在CHB组、SR组、健康对照中分别为54.1%、53.1%、52.1%,-857CT分别为39.2%、40.6%、41.6%,-857TT分别为6.7%、6.3%、6.3%,各组间等位基因及基因型分布频率差异无统计学意义（P〉0.05）。-863CC在CHB组、SR组、健康对照组中分别为67.6%、59.4%、60.4%,-863C/A分别为20.3%、37.5%、37.5%,-863AA分别为12.2%、3.1%、2.1%,各组间分布频率比较差异统计学意义（P〈0.05）,SR组、健康对照组分别和CHB组差异有统计学意义（P〈0.05）。SR组与健康对照组差异无统计学意义（P〉0.05）。结论 TNF-α基因启动子-857C/T位点多态性与中国广西人群HBV感染后的结果没有关系,-863C/A位点基因多态性与中国广西人群HBV感染后的转归有关,其中TNF-α -863AA可能不利于HBV感染的清除。     

北方汉族慢性HBV感染者TNF-α启动子区基因多态性分析

目的：探讨北方汉族人群TNF-α启动子区基因多态性与乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）感染不同慢性化结局的关系。方法：用病例-对照研究方法,以362例慢性乙型肝炎患者作为病例组,204例慢性无症状HBV携带者作为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对TNF-α基因启动子区-238G/A、-857C/T、-863C/A位点进行基因分型。结果：TNF-α-857 CC基因型在慢性乙肝组为79.8%,高于无症状HBV携带者组的68%,-857 TT基因型则低于HBV携带组;-863 CC基因型在慢性乙肝组为8.7%,低于HBV携带组的16.4%（P均〈0.05）;3位点组成-238G/-857C/-863A单体型频率在慢性乙肝组显著高于HBV携带者组,-238G/-857T/-863C低于HBV携带组（P均〈0.05）。结论：TNF-α启动子区基因多态性可能是影响HBV感染慢性化结局的宿主遗传因素之一。     

肿瘤坏死因子α基因启动子区多态性位点与阿尔茨海默病的相关性研究

目的:探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因启动子区-857C/T和-1031T/C位点多态性与阿尔茨海默病发生的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-PFLP)方法检测98例阿尔茨海默病、122例健康对照各个多态性位点的基因型,采用SPSS13.0进行统计学分析。结果:TNF-α基因-857C/T位点的基因型及等位基因频率分布在AD组与正常对照组均存在显著性差异(P<0.05),T等位基因的频率在AD组显著高于对照组(χ2=10.178,P=0.001,OR=2.081,95%CI=1.320-3.280)。结论:TNF-α基因-857C/T位点可能与阿尔茨海默病的发病存在关系,其中C等位基因可能是易感基因,携带C的个体可能更易患有AD。     

TNF-α启动子基因多态性对北方汉族HBV感染者结局的影响

目的探讨TNF-α启动子区基因多态性是否与宿主感染乙型肝炎病毒（hepatitis Bvirus,HBV）后形成不同的结局相关联。方法采用病例-对照研究方法,以362例慢性乙型肝炎患者作为病例组,212例乙型肝炎病毒自限性感染者作为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对TNF-α基因启动子区-238G/A、-857C/T、-863C/A位点进行基因分型。结果慢性乙肝组携带TNF-α-238GA基因型36例（10.0%）、-857CC基因型289例（79.8%）,自限性感染组分别为-238GA基因型11例（5.2%）、-857CC基因型149例（70.3%）,慢性乙肝组均显著高于自限性感染组（P〈0.05）。3个位点组成的单体型-238G/-857C/-863A的频率在慢性乙肝组显著高于HBV自限感染组（64.36%vs.58.26%）。单体型-238G/-857T/-863A在慢性乙肝组显著低于HBV自限感染组（7.32%vs.12.26%）。结论 TNF-α启动子区基因多态性可能与宿主感染HBV后形成慢性化结局相关联。     

河南省汉族人群肿瘤坏死因子α基因启动子区单核苷酸多态性

目的研究河南省汉族人群无关个体217例肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因启动子区的-238G/A、-308G/A、-850C/T、-863C/A共4个单核苷酸多态性(SNPs)位点的遗传多态性。方法采用限制性酶切片段长度多态性(RFLP),结合质量分数6%聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染法对SNPs位点进行分型。结果选择的TNF基因上4个SNPs位点等位基因和基因型频率分布在河南省汉族人群均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,各等位基因频率均大于5%,等位基因最小频率分布在5.8%～14.1%。4个SNPs位点共观察到21种组合基因型,杂合度为0.461。根据SHEsis软件推测出11种单体型,单体型多样性为0.608。结论河南省汉族人群TNF基因4个SNPs位点及其组成的单体型具有较高的多态性,在法医学实践中有一定的应用价值,同时为人类遗传学的研究提供基础资料。     

用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性

 【目的】了解中国人群肿瘤坏死因子α（the tumour necrosis factor α，TNF-α）基因启动子区多态性。【方法】 随机选取20名深圳地区汉族健康体检者，采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区（-1389nt～＋125nt），对PCR产物进行序列分析，寻找单核苷酸多态性位点（single nueleofide polymorphisms，SNPs）。采用Taqman MGB探针建立了-857nt（C／T）位点的实时定量PCR（thereal-time PCR）分型方法，并对中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体共l108份样本进行了基因分型。【结果】在启动子区（-1322nt～＋67at），发现6个SNP位点，即-885（A／G）、-863（C／A）、-646（G／A）、-648（G/A）、-568（G／C）和-857（C/T），其中位点-646nt（G→A）为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同，但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt（C／T）位点基因型频率分别为0．79（CC），0．19（CT）和0．02（TT），中国汉族、壮族、布依族，水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0．116，与文献报道的韩国人群相同，但比日本人群低。【结论】中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用Taqman MGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确，易于自动化，为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。