湖南籍汉族强直性脊柱炎患者IL-1RN基因多态性分析

目的:研究白介素-1受体拮抗因子(IL-1RN)基因多态性与强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的相关性。方法:自150名AS患者及92名健康对照者外周血中提取DNA,采用PCR方法检测IL-1RN基因第二内含子VNTR复等位基因多态性。结果:AS患者中IL-1RN*2等位基因频率显著高于健康对照者。结论:AS与IL-1RN*2等位基因相关联。     

肿瘤坏死因子α受体基因的多态性在类风湿关节炎和强直性脊柱炎中的研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arethritis,RA)是一种以累及双手小关节为主的慢性侵蚀性关节病,随着病情的进展后期可导致关节的破坏、畸形和严重的功能障碍,是致残的主要原因之一。强直性脊柱炎(anky-     

强直性脊柱炎易感基因的研究进展

强直性脊柱炎（ankylosing spondylitis,AS）是由遗传、感染、免疫和环境等多因素共同作用的自身免疫性疾病,其中遗传因素与强直性脊柱炎的发病有着强烈的关联。目前所发现的易感基因与AS的发病机制尚不十分清楚,本文对与之相关的主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex,MHC）基因包括HLA-B27基因、TNF-α基因和IFN-γ基因以及非MHC基因包括ERAP1基因和IL-23/IL-17免疫通路相关基因在AS发病的中的作用进行综述,对于进一步了解易感基因与强直性脊柱炎之间的相关性具有重要意义。     

肿瘤坏死因子α的单核苷酸多态性与中国汉族人强直性脊柱炎的关联分析

目的:在中国汉族强直性脊柱炎(AS)患者中,检测TNF-α基因中的单核苷酸多态性(SNPs).方法:在107例AS患者和116名正常对照中,用直接测序法和实时动态荧光PCR结合等位基因特异扩增,对TNF-α基因中的3个启动子上的SNPs(-1 031T/C,-863C/A, -857C/T)和 2个内含子上的SNPs (内含子1的 123C/T和内含子3的 51A/G)进行基因分型,分析单个位点的等位基因和基因型频率是否与AS相关.用单倍型推测软件计算上述位点单倍体型频率的分布,分析这些单倍体型是否与AS的发病有关.结果:在AS患者中,TNF-α的-857T和-863A的等位基因频率及它们的基因型频率显著性地超过健康对照组,经Bonferroni校正后仍为阳性.对启动子上3个SNPs位点的两两和3个位点组合的单倍体型频率分析表明,其在AS 患者和对照组中也均存在极其显著的差异(P<0.01).在3个位点推测的单倍体型中,AS患者增加最显著的是TNF-1 031T/-863C/-857T单倍体型.结论:TNF-α基因上2个SNPs及单倍体型与中国汉族AS之间存在显著的相关性.     

HLA-B基因rs1058026和rs3819299位点单核苷酸多态性与女性强直性脊柱炎易感性的关系

目的 探讨人类白细胞抗原(HLA)-B基因rs1058026和rs3819299位点单核苷酸多态性与女性强直性脊柱炎(AS)易感性的相关性。方法 选取108例女性AS患者(病例组)及129例体检正常女性(对照组)。比较两组研究对象的一般资料,以及HLA-B基因rs1058026和rs3819299位点基因型和等位基因分布频率。使用Logistic回归模型分析上述基因位点基因型和等位基因与女性AS易感性的相关性。结果 病例组AS家族史比例及HLA-B27阳性比例均高于对照组(均P<0.05),而两组吸烟史比例、饮酒史比例差异均无统计学意义(均P> 0.05)。HLA-B基因rs3819299位点的等位基因G增加女性的AS发病风险(OR=16.172,P<0.05),相比于基因型TT,rs3819299位点的基因型GT增加女性的AS发病风险(OR=113.877,P<0.05);HLA-B基因rs1058026位点的等位基因和基因型与女性的AS发病风险无关(均P>0.05)。结论 HLA-B基因rs3819299位点单核苷酸多态性与女性AS易感性相关,rs38...     

白细胞介素-23及其受体基因rs11209032位点单核苷酸多态性与强直性脊柱炎发病的相关性分析

目的探讨白细胞介素-23(IL-23)、IL-23受体(IL-23R)基因rs11209032位点单核苷酸多态性与强直性脊柱炎(AS)的关系。方法选取五邑地区汉族人群AS患者132例和同期健康体检者102名,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测血清中IL-23的表达水平,采用Taq Man探针对IL-23R基因rs11209032位点进行聚合酶链反应(PCR)分型。结果 AS患者外周血IL-23表达水平显著高于对照组(P<0.05);在五邑地区汉族人群中,AA,AG,GG基因型频率在AS中分别为5.3%,91.7%,3.0%,与对照组分布(20.6%,65.7%,13.7%)相比,差异有统计学意义(χ~2=24.63,P<0.05),AS患者和对照组中rs11209032位点A等位基因频率(51.1%,53.4%)和G等位基因频率(48.5%,46.6%)的分布差异无统计学意义(χ2=0.243,P>0.05);其各个基因型组的红细胞沉降率和C反应蛋白水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论 IL-23R单核苷酸多态性rs11209032与本地人群AS发病有一定的相关性。     

强直性脊柱炎KIR3DL1基因多态性及基因环境因素交互作用研究

目的 探讨KIR3DL1基因单核苷酸多态性与强直性脊柱炎(AS)易感性的关系.方法 采用以自然人群为基础的病例对照研究设计,收集125例AS患者和94例对照进行研究,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,对KIR3DL1基因rs1049150位点多态性进行检测.采用χ2检验分析基因多态性与A...     

中国南方地区人群FCGR2A基因多态性与强直性脊柱炎的相关性

[目的]验证中国南方地区人群的FCGR2A基因多态性与强直性脊柱炎(AS)易感性是否相关.[方法]共纳入350例AS患者及295例健康志愿者,采用盐析法全血中抽提样本基因组DNA,分别在患者及健康志愿者中随机抽取58例病人和90例对照者,采用外显子测序法筛选FCGR2A基因单核苷酸多态性(SNP),然后针对筛选出来的SNP在剩余的292例患者及205例健康志愿者中采用飞行质谱方法进行验证.[结果]通过外显子测序,一共在FCGR2A基因外显子区域筛选出了7个SNP位点,其中有5个SNP(rs1801274、rs150991486、rs12046367、rs143182858、rs1542042)在其他文献中已有报道,另外2个是本研究新发现的SNP(1:161488855和1:161481042),但质谱验证有1个SNP(1:161481042)不符合Hardy-Weinberg平衡(P＜ 0.001),其他SNP位点在关联分析中显示,在病例和健康对照者之间没有显著性差异(P＞0.05).连锁不平衡分析结果发现rs150991486和rs12046367之间存在连锁,但是关联分析结果亦显示两组无明显差异性(P值分别为0.917 1、0.861 1、0.972 3).[结论]FCGR2A基因多态性与中国南方地区强直性脊柱炎易感性无关联.     

基因多态性与强直性脊柱炎发病相关性的研究进展

强直性脊柱炎(ankylosingspondylitis,AS)是一种慢性全身性炎症、进行性自身免疫性疾病,临床分类诊断为多基因遗传病。近年来,许多学者利用基因多态性对AS的发病相关性基因进行了研究。其中,与AS发病相关的基因可分为主要组织相容性复合体(MHC)类和非MHC类。MHC类以HLA-B27、TNF-α为代表。HLA-B27是目前公认的与AS密切相关的一类白细胞抗原,已发现B2701-B2723等多个亚型。其中B2705分布最广,在白种人中占绝对优势,在亚洲人中B2704则是与AS直接相关的亚型;其它亚型因样本量太小,还需要作进一步研究。由肿瘤坏死因子(TNF)-α的基因定位和免疫功能,可推测TNF-α的基因多态性与AS的发生和发展相关。TNF-α中研究最多是-308位点,在我国其它位点如-238、-850、-863也有报道。通过全基因扫描和连锁关联分析确定了非MHC类因子,其中具有代表性的是白介素-1(IL-1)家族中的IL-1RN,目前已有通过PCR法、矩阵法对IL-1RN的研究报道。除了上述基因外,还有一些与AS的发病无关的基因,如VEGF,LMP2等。本文综述了与AS发病相关的主要因子的基因多态性的研究进展。     

白癜风易感基因单核苷酸多态性研究进展

白癜风是一种色素脱失性疾病,其发病受多种因素影响,其中遗传因素占据重要地位。单核苷酸多态性是遗传变异中最常见的一种,可通过候选基因分析、全基因组关联分析研究方法进行检测。近年来研究发现多个易感基因在白癜风发生发展中起着重要作用。本文按照基因功能对白癜风易感基因单核苷酸多态性进行了归纳与介绍。     

强直性脊柱炎患者肿瘤坏死因子α启动子308位点基因多态性分析

目的:探讨肿瘤坏死因子(TNF)α启动子308位点基因多态性与强直性脊柱炎(AS)的相关性. 方法:用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对112例AS患者和96例健康对照人群,以及98例HLA B27阳性AS患者和14例阴性AS患者的TNF-α启动子308位点基因多态性进行分析.结果:AS患者GG、GA和AA三种基因型频率分别为60.71%、 36.61%和2.68%,G和A的等位基因频率分别为0.790和0.210,对照组三种基因型频率分别为81.25%、 17.71%和1.04%,等位基因频率分别为0.901和0.099,两组基因型和等位基因频率分布有显著性差异(P＜0.01),AS患者的A等位基因频率明显高于对照组.HLA-B27阳性AS患者和阴性AS患者的基因型频率亦有显著性差异(P＜0.01).结论:TNF-α启动子308位点基因多态性与AS相关,A等位基因可能增加AS的易感性.     

AF4/FMR2、IL-10基因多态性与强直性脊柱炎的遗传易感性和免疫浸润相关

目的 探索AF4/FMR2、IL-10基因与强直性脊柱炎（AS）的遗传易感性,发现高危因素及筛选高危人群。方法 共纳入207例AS患者和321例对照者。选择AF4/FMR2家族基因以及IL-10基因的标签SNP(rs340630、rs241084、rs10865035、rs1698105、rs1800896),提取DNA后进行基因分型,分析其基因型、等位基因分布频率,分析不同遗传模型与AS发病的关系,并进行基因-基因、基因-环境的交互作用分析。结果 AS组和对照组在性别、吸烟史、饮酒史、高血压、血沉、C反应蛋白在病例组和对照组均有差异（P<0.05）。AFF1 rs340630的显性模型和隐性模型、AFF3 rs10865035的隐性模型、IL-10 rs1800896的隐性模型在AS组与对照组之间有显著性差异（分别为P=0.031、P=0.010、P=0.031、P=0.019）。基因环境交互分析发现AFF1 rs340630,AFF2rs241084,AFF3 rs10865035,AFF4 rs1698105,IL-10 rs1800896,吸烟史,饮酒史相互作用模型为最佳...     

安徽汉族人群IL-1F10-3基因rs3811058位点单核甘酸多态性与强直性脊柱炎患者遗传易感性研究

目的了解IL-1F10-3基因rs3811058位点的单核苷酸多态性与强直性脊柱炎遗传易感性的关系。方法采用病例对照研究设计,通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对基因型筛查并进行基因组测序验证,检测151例强直性脊柱炎患者和155例正常对照基因型,并分析基因型及等位基因频率在两组中的分布。结果 IL-1F10-3基因rs3811058位点的等位基因频率和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异均无统计学意义。结论安徽地区汉族人群强直性脊柱炎患者遗传易感性可能与IL-1F10-3基因rs3811058位点单核苷酸多态性无关。     

PSORS1C1/CDSN基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性关系的研究

目的 银屑病易感基因1候选基因1(psoriasis susceptibility 1 candidate 1,PSORS1C1,之前的SEEK1)的5’-UTR区域存在角膜锁链蛋白(corneodesmosin,CDSN)基因.本文探讨PSORS1C1/CDSN基因多态性与强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)遗传易感性之间的关系.方法 本研究首先针对PSORS1 C1/CDSN基因区域的16个SNP位点,采用定制的Illumina 96-SNP VeraCode microarray基因芯片,对51例AS患者DNA进行基因分型.初步筛选到AS疾病易感性相关位点后,再使用同样方法增大样本量,对200例AS患者DNA进行基因分型.最后采用Taqman基因分型方法验证两次芯片结果.结果 基因芯片结果表明rs3130983、rs3778638和rs4959053在AS和对照组中等位基因频率和基因型频率有显著差异.Taqman基因分型技术验证了基因芯片结果.说明rs3130983、rs3778638和rs4959053与AS发病有相关性.结论 PSORS1C1和CDSN基因可能是AS的易感基因.     

甲型流感易感基因单核苷酸多态性的研究进展

甲型流感病毒是造成季节性流感及历史上流感大流行的主要病毒类型,受到国内外研究者的广泛关注,中国也被公认为新型流感病毒的首发地、多发地,是世界流感监测的前哨,我国流感监测工作在全球起着举足轻重的作用。研究人员利用功能基因组学筛选及病例对照研究,发现多种基因通过不同致病机制影响人类感染流感病毒或加重流感患者病情,宿主基因变异会影响甲型流感的毒性及传播能力,对流感易感性有很大影响。开展甲型流感相关易感基因的研究,从宿主遗传水平探讨甲型流感的发病机制,有助于进一步探索流感病毒入侵宿主的致病机制,从而促进对流感的研究和防治工作的开展。     

ALDH2基因第12外显子(G/A)多态性在北京汉族人群的检测

目的了解与酒精代谢密切相关的乙醛脱氢酶2(ALDH2)基因第12外显子G/A多态性在北京汉族人群的分布。方法采集102名无相关个体末稍血,提取DNA。用等位基因特异引物PCR方法,扩增靶等位基因DNA片段。结果ALDH2*1和ALDH2*2等位基因的频率分别为:0.89和0.11。ALDH2*1/ALDH2*1;ALDH2*1/ALDH2*2;ALDH2*2/ALDH2*2三种基因型频率分别为:0.79,0.20,0.01。χ2检验表明,检测样本分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。杂合度(H):0.34。结论北京地区汉族人群ALDH2*2等位基因频率低于洛阳汉族人群,而日本人群的该等位基因频率明显高于中国人群。     

NPEPPS基因在强直性脊柱炎发病机制中的功能基因组学分析

目的：探讨NPEPPS基因的单个核苷酸多态性（SNP）位点对该基因表达及在强直性脊柱炎（AS）发病机制中的调控作用。方法：选取温州医科大学附属第一医院风湿免疫科收治的54例AS患者（AS组）与78例健康对照者（对照组）的外周血单个核细胞（PBMC）,提取DNA和RNA,分别用Illumina平台进行SNP微阵列的基因定型检测和RNA测序。用PLINK提取包含NPEPPS的染色体区域的SNPs,用IMPUTE2进行缺失基因型的补缺,用PLINK计算免疫芯片的基因型。将RNA测序获得的read定位比对到人类基因组,产生每个基因的read计数,根据参考转录组计算不同转录本的表达水平,用DESeq2进行组间比较,并与基因型进行回归分析,对该SNPs和附近1 MB范围内的基因进行eQTL分析。结果：SNP rs9901869位点不管是纯合等位基因还是杂合等位基因,AS组NPEPPS表达与对照组间差异无统计学意义（P＞0.05）;AS组与对照组中不同的转录本的表达水平各不相同,其中TCONS_00206150、TCONS_00206153和TCONS_00206137的表达水平差异有统计学意义（P＜0.05）;AS组与对照组中SNP rs9901869不同基因型所对应的NPEPSS基因及其转录本的表达水平各不相同,其中部分转录本的表达水平差异有统计学意义（P＜0.05）;AS组与对照组中NPEPPS基因及其转录本的表达水平也因SNP rs9901869附近SNP rs180677251基因型的不同而差异有统计学意义（P＜0.05）。结论：NPEPPS基因位点多态性影响了NPEPPS的表达水平,可能与AS发病之间有一定的相关性。     

强直性脊柱炎患者肿瘤坏死因子α-857和-863位点基因多态性分析

目的探讨肿瘤坏死因子（TNF）α-857和-863位点基因多态性与强直性脊柱炎（AS）的相关性。方法用序列特异引物PCR方法对112例AS患者和96例健康对照人群,以及98例HLAB27阳性AS患者和14例阴性AS患者的TNF—α-857（C／T）和-863（C／A）位点基因多态性进行分析。结果AS患者组TNF—α-857位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组有显著统计学差异（P〈0．01）,AS患者的T等位基因频率明显高于对照组,而AS患者TNF-α-863位点基因型和等位基因频率分布与健康对照组无统计学差异（P〉0．05）。HLA-B27阳性As患者和阴性AS患者TNF—α-857位点基因型频率亦有显著统计学差异（P〈0．01）。结论TNF—α-857位点基因多态性与AS相关,T等位基因可能增加AS的易感性。     

ERAP1与强直性脊柱炎患者肺炎衣原体感染的关联性

目的 探究ERAP1基因是否与强直性脊柱炎患者肺炎衣原体感染存在关联.方法 提取强直性脊柱炎患者外周血DNA,采用测序法对ERAP1两个单核苷酸多态性位点(rs30187和rs27044)进行基因分型.ELISA法检测强直性脊柱炎患者外周血肺炎衣原体抗体IgG.检测强直性脊柱炎患者血沉和C反应蛋白水平.结果 强直性脊柱炎患者肺炎衣原体感染率高于健康人.rs27044位点C等位基因提高AS患者肺炎衣原体感染的危险(OR=1.932,95%CI:0.852~4.377,P=0.042).结论 ERAP1 rs27044位点单核苷酸多态性与强直性脊柱炎患者衣原体感染率存在关联,等位基因C提高患者感染率.