中国华北的汉族人群HLA单倍型

对河北省邻近北京地区的103个多子女家庭进行了HLA-A、B、C、DR、BF、C2、C4A、C4 B等8个位点的等位基因的分型检测,分析了8位点的HLA扩展单倍型,从而首次揭示了中国华北地区人群的HLA单倍型的面貌。本研究证明HLA单倍型在各位点之间的等位基因呈高度的连锁不平衡,并显示出中国人不同于其他人种的特点;本文同时讨论了HLA单倍型分析的重要意义。     

江苏8地市汉族人群HLA⁃A位点等位基因多态性分析

目的：分析来自中华骨髓库江苏分库8地市汉族造血干细胞志愿者HLA?A位点等位基因频率,了解江苏8地市汉族人群HLA?A位点等位基因分布特征。方法：采用聚合酶链反应?直接测序分型（polymerase chain reaction?sequence based typing,PCR?SBT）技术,对中华骨髓库江苏分库共计27 143例汉族志愿者的HLA?A位点进行高分辨分型,按地市统计HLA?A位点等位基因频率并比较分析。结果：江苏8地市汉族人群共检测出85种HLA?A位点等位基因,其中常州55种,南京55种,镇江38种,扬州37种,淮安41种,宿迁44种,徐州42种,盐城41种。经统计分析,南京与镇江、扬州在A*02：01：01G 、11：01、24：02、30：01、33：03等位基因频率上均无显著性差异。南京、镇江非常接近,常见的HLA?A位点等位基因依次为A*11：01、24：02、02：01：01G、33：03、30：01、02：07、02：06、31：01、01：01;常州、扬州非常接近,常见的HLA?A位点等位基因依次为A*11：01、24：02、02：01：01G、33：03、02：07、30：01、02：06、31：01、01：01。盐城、宿迁比较接近,常见的HLA?A位点等位基因大体依次为A*11：01、24：02、02：01：01G、30：01、33：03、02：07、02：06、01：01,仅在A*02：01：01G、30：01的顺序上有所区别。徐州、淮安也比较接近,常见的HLA?A位点等位基因大体依次为A*24：02、11：01、30：01、02：01：01G、33：03,仅在A*30：01、02：01：01G的顺序上有所区别。结论：江苏8地市汉族人群HLA?A位点等位基因频率分布与地域分布基本吻合,徐州、淮安与鲁南地区非常接近,南京、镇江、常州、扬州与上海、浙江有一定相似之处,为研究HLA?A位点等位基因与疾病的相关性以及人类遗传学提供了有意义的基础性资料。     

广东汉族人群人类白细胞抗原-A,B及DRB1基因多态性和单倍型分布

目的分析广东汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1基因和单倍型的分布特征。方法根据3 275名广东汉族无关骨髓供者的HLA基因型数据,采用最大似然性方法计算HLA-A、B、DRB1的基因频率和单倍型频率。结果广东汉族人群中共检出73个HLA基因(或抗原),其中A*02、A*11、A*24、A*33、B*46、B60、B*13、B75、B*58、DRB1*09、DRB1*15、DRB1*04、DRB1*08和DRB1*12最常见;385条A-B单倍型中,20条频率高于0.01并至少有25条单倍型为显著性正连锁不平衡;458条B-DR单倍型中,24条频率高于0.01并至少可见37条单倍型为显著性正连锁不平衡;2 836条A-B-DR单倍型中,仅487条单倍型的频率有价值(大于等于3.05×10-4),36条常见单倍型中A2-B46-DR9和A33-B58-DR17频率最高。结论广东汉族人群HLA-A、B、DRB1基因和HLA单倍型的分布有其自身特点,本研究所获得的HLA-A、B、DRB1基因和单倍型频率可作为广东汉族人群的参考标准。     

海南地区汉族人群HLA及其单倍型频率分析

目的了解海南地区汉族人群HLA抗原及单倍型的频率。方法采用微量淋巴细胞毒试验，对海南地区209例非血缘关系的汉族正常人进行HLA-A、B抗原分型。结果在209例中检出前9位HLA-A、HIA-B高频率抗原为A11，A2，A24、A33；B40，B46，B57，B13，B62。通过家系抗原遗传分析获得418条海南地区HLA-A／B单倍型，查出6条海南地区高频率出现的单倍型为A33／B57、A2／B46、A11／B60、A11／B13、A24／B60、A11／B62。结论海南地区汉族人群的HLA-A、B抗原频率与广东地区相同，而单倍型频率有所不同。不同种族、不同地区的人群有着不同单倍型频率分布。     

广东汉族人群HLA-Cw多态性及单体型分析

目的检测广东汉族人群HLA．Cw及HLA-A、B、DRB1基因频率，分析该人群HLA-Cw等位基因多态性及其单体型特点。方法骨髓移植供者185例，抗凝血提取DNA，半量全自动PCR-RSSO分型检测HLA-A、B、Cw、DRB1基因型。结果在分辨水平检出Cw等位基因11个，其中分布频率较高的依次为：Cw*03(0．2580)、Cw*07(0．1887)、Cw*01(0．1732)、Cw*08(0．1070)。统计分析呈现显著连锁不平衡的HLA-Cw．A单体型7个，HLA-Cw-B单体型20个，HLA—Cw．DRB1单体型10个。结论广东汉族群体HLA-Cw基因具有较为丰富的多态性，其与HLA-A、B、DRB1间连锁不平衡单体型具有地区性遗传特征。     

重庆地区人群HLA-A,B基因和单倍型的多态性分析

目的 对重庆地区人群HLA-A,B基因座位的单倍型分布特征及基因相关性进行研究.方法 采集重庆地区201名无血缘关系健康个体静脉血,应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对其HLA-A,B基因座位进行等位基因分型,计算HLA-A,B基因型频率及基因频率,统计HLA-A,B单倍型出现情况并做连锁相关性分析.结果 在重庆地区的人群中,最常见的HLA-A-B 单倍型是HLA-A*02-B*46、HLA-A*11-B*13和HLA-A*24-B*46、HLA-A*30-B*13.HLA-A*02-B*46、HLA-A*11-B*60和HLA-A*30-B*13为重庆分库最常见、连锁不平衡最显著的单倍型.与我国北方、南方汉族比较,更接近南方汉族人群.结论 重庆地区人群HLA- A,B基因具有较为丰富的多态性,其分布符合南方汉族的特点,HLA单倍型分布特征与南方汉族人群相近,但也有其自身特点.     

广东汉族人群HLA单倍型遗传中基因重组的研究

目的 分析广东汉族人群人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ、Ⅱ经典5位点A、Cw、B、DRB1及DQB1的连锁单倍型及单倍型遗传中基因重组事件.方法 采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)法及聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)法,分别对2000年8月至2009年12月深圳市血液中心进行HLA配型的198个广东汉族家系共939名个体的外周血样本进行HLA-A、B、DRB1位点及HLA-Cw、DQB1位点的低分辨基因分型,再通过遗传家系分析确定HLA基因重组相关位点;对其中发生基因交换重组的52名家系成员的样本进一步采用基因测序分型(SBT)技术进行序列分析,以判断重组交换是否发生在某基因座位上.结果 198个广东汉族家系543名子一代个体中,发现有9名个体HLA单倍型基因座位发生了交换重组,频率为1.657%.3例为A/Cw座位间的交换,6例为B/DRB1座位间的交换.其中4例重组事件发生在广东汉族人群最常见的单倍型A*3303-Cw*0302-B*5801-DRB1*0301-DQB1*0201上.在9例重组事件中有5例来自母系染色体交换,4例来自父系染色体交换;3例表现为A/Cw座位间交换的个体均为女性,6例表现为B/DRB1座位间交换的个体中5例为男性、1例为女性.结论 HLA连锁单倍型遗传过程中的基因重组主要见于A/Cw座位间及B/DRB1座位间,且基因重组的发生具有单倍型特异性及性别特异性.     

黑龙江省满族人群HLA分布调查

本文报道了110例满族人群的HLA分布情况,并用其遗传参数与南方汉族和北方汉族人群进行了对比研究。虽然与二者间存在着一定的差异,但还是与北方汉族人群较为接近。     

广东汉族人群HLA-Cw多态性及单体型分析

目的 检测广东汉族人群HLA-Cw及HLA-A、B、DRB1基因频率,分析该人群HLA-Cw等位基因多态性及其单体型特点。方法 骨髓移植供者185例,抗凝血提取DNA,半量全自动PCR-RSSO分型检测HLA-A、B、Cw、DRB1基因型。结果 在分辨水平检出Cw等位基因11个,其中分布频率较高的依次为Cw^*03(0.2580)、Cw^*07(0.1887)、Cw^*01(0.1732)、Cw^*08(0.1070)。统计分析呈现显著连锁不平衡的HLA-Cw-A单体型7个,HLA-Cw-B单体型20个,HLA-Cw-DRB1单体型10个。结论 广东汉族群体HLA-Cw基因具有较为丰富的多态性,其与HLA-A、B、DRB1间连锁不平衡单体型具有地区性遗传特征。     

湖南籍汉族女性HLA—A／B单倍型分析

目的：调查分析湖南籍汉族女性人群中HLA－A,B位点单倍型基因频率。方法：采用微量淋巴细胞毒试验法对50例无血缘关系的湖南籍汉族女性HLA－A,B位点多态性进行检查,通过比较连锁不平衡参数来推测单倍型。结果：居单倍型基因频率前3位的是A11－B60,A2－B60,A24－B48,而A2－B52,A1－B13,A24－B52等5种单倍型有显著的连锁不平衡,结论：湖南籍汉族女性HLA－A,B位点抗原,特别是B抗原的分布与国内其它地区汉族人群及湖南地区汉族人群（男女混合）比较有其特殊性,A2－B52,A11－B13,A24－B52三种单倍型有显著的连锁不平衡,可能为湖南籍汉族女性特有的单倍型。     

广西壮族和汉族人群白细胞介素-18基因单核苷酸多态性及单倍型分析

目的了解白细胞介素-18(IL-18)基因启动子-137G/C,-607C/A多态性及单倍型在广西地区壮族及汉族人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术和DNA测序法检测160名壮族人和150名汉族人的IL-18基因-137G/C,607C/A多态性,比较两组IL-18基因型、等位基因及单倍型的分布频率;并结合文献进行不同种族间的比较分析。结果在广西壮族及汉族人群中IL-18基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率差异均无显著性(P>0·05),但与欧洲人群比较,IL-18基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率均差异有显著性(P<0·05)。结论在广西地区壮族及汉族人群中存在IL-18基因多态性,其基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率差异均无显著性,但与其他种族人群比较差异有显著性,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族间的发病率和临床表现存在显著不同的因素之一。     

重庆地区汉族人群MDR1基因单核苷酸多态性及单倍型分析

目的：研究重庆地区汉族人群多药耐药基因1（MDR1）C1236T,G2677A/T,C3435T单核苷酸多态性（SNP）及单倍型的频率.方法：采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性（PCR-RELP）方法,对重庆地区196（男112,女84）名没有亲缘关系的汉族健康个体MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点进行基因分型.用SHEsis软件分析MDR1基因的连锁不平衡及单倍型频率.结果：重庆地区汉族人群中C1236T位点、等位基因频率1236C为33.7%,1236T为66.3%;G2677T/A位点、等位基因频率2677G为44.4%,2677T为43.1%,2677A为12.5%;C3435T位点、等位基因频率3435C为56.4%,3435T为43.6%.重庆地区汉族人群中MDR1基因1236-2677-3435位点构成的3种主要单倍型率（频率〉10%）TTT为31.1%,TGC为21.7%,CGC为15.5%.结论：重庆地区汉族人群MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率和单倍型频率,为研究该地区MDR1基因单核苷酸多态性与药物效果、药物毒副作用以及疾病易感性之间的相关性提供依据.     

中国河北地区汉族人群 HLA －E基因多态性分析

目的：通过调查中国河北地区汉族人群人类白细胞抗原－E（ HLA－E）等位基因多态性分布情况,为探讨HLA－E基因多态性与疾病的关联奠定基础。方法 HLA－E等位基因多态性分析采用聚合酶链反应－序列特异性引物（ PCR－SSP）方法,调查285例中国河北地区汉族正常人群。结果 HLA－E的2个等位基因在这一人群中检测到,分别是HLA－E倡0101和HLA－E倡0103,分布频率分别是41.05％和58.95％。而HLA－E倡0104等位基因未检测到。结论中国河北地区汉族人群中共有2个HLA－E等位基因分布,分别为HLA－E倡0101和HLA－E倡0103,其分布频率相近,分别是41.05％和58.95％。     

广州地区汉族人群8个Y-STR基因座单倍型的多态性

目的：调查广州地区汉族人群8个Y—STR基因座单倍型的多态性。方法：用PCR及ABI377测序仪检测111例广州地区汉族男性DYSl9、DYS389Ⅰ／Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393及DYS385等位基因及单倍型分布状况。结果：111例广州地区汉族男性中观察到110种单倍型，只有1种单倍型为2个个体所共有，单倍型多样性为0．991。结论：8个Y—STR基因座的单倍型具有高度的多态性，是男性个体识别的良好标记。     

宁夏回族HLA-A，B，DRB1基因座遗传多态性和单倍型分析

目的:研究宁夏回族自治区地区回族人群HLA-A,B,DRB1基因座的等位基冈及其组成的单倍型频率分布特征.方法:采集宁夏回族122名无关健康个体静脉血,应用聚合酶链反应一序列特异性引物方法对其HLA-A,B和DRB1基因座进行基冈分型.直接计数法统计基因频率,采用最大数学预期值算法计算HLA单体型频率.结果:122名宁夏回族个体的HLA-A,B,DRB1基因座分别检出14,29,13个等位基因.高频等位基因分别为HLA-A*02;HLA-A*11:HLA-A*24;HLA-A*03,HLA-B*35;HLA-B*46;HLA-B*13;HLA-B*51,HLA-DRB1*15;HLA-DRB1*09;HLA-DRB1*07;HIA-DRB1*12.高频单倍型分别为HLA-A*02-B*46:HLA-A*11-B*60;HLA-A*02-B*51;HLA-B*46-DRB1*09;HLA-B*13-DRB1*07;HLA-B*58-DRB1*17;HLA-A*02-B*46-DRB1*09;HLA-A*02-B*58-DRB1*17;HIJA-A*02-B*13-DRB1*12.结论:宁夏回族自治区回族人群HLA基凶座的等位基因和单倍型具有较高的遗传多态性.HLA-A*01-B*37,HLA-A*30-B813,HLA-A* 02-B*50,HLA-B*31-DRB1-10在该民族具有极强的连锁不平衡.     

湖南籍汉族女性HLA-A/B单倍型分析

目的 :调查分析湖南籍汉族女性人群中HLA -A ,B位点单倍型基因频率。方法 :采用微量淋巴细胞毒试验法对 5 0例无血缘关系的湖南籍汉族女性HLA -A ,B位点多态性进行检查 ,通过比较连锁不平衡参数来推测单倍型。结果 :居单倍型基因频率前 3位的是A11-B6 0 ,A2 -B6 0 ,A2 4-B48,而A2 -B5 2 ,A11-B13 ,A2 4-B5 2等 3种单倍型有显著的连锁不平衡。结论 :湖南籍汉族女性HLA -A ,B位点抗原 ,特别是B抗原的分布与国内其它地区汉族人群及湖南地区汉族人群 (男女混合 )比较有其特殊性。A2 -B5 2 ,A11-B13,A2 4-B5 2三种单倍型有显著的连锁不平衡 ,可能为湖南籍汉族女性特有的单倍型。     

ADRB2基因多态性/单倍型与中国汉族人群哮喘的相关性

目的:研究中国汉族人群β2肾上腺素能受体(beta-2 adrenergic receptor,ADRB2)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)/单倍型与哮喘的相关性?方法:采用Taqman探针法对379例哮喘患者和435例健康对照者ADRB2基因6个位点(-2 387?-47?46?79?491和523位)进行基因分型,并通过SHEsis在线平台确定其单倍型?结果:-47位等位基因分布频率在哮喘组与对照组间差异有统计学意义(OR:0.687,95%CI:0.497~0.951,P < 0.05),CT?CC + CT基因型分别与TT基因型相比,在两组间差异有统计学意义(OR分别为0.685?0.672,95%CI分别为0.480~0.976?0.474~0.952,P均< 0.05)?79位等位基因在哮喘组与对照组之间的频率分布差异有统计学意义(OR:0.687,95%CI:0.497~0.951,P < 0.05)?CG?GG + CG基因型分别与CC基因型相比较,在两组间差异均有统计学意义(OR分别为0.685 和0.672,95%CI分别为0.480~0.976?0.474~0.952,P均< 0.05)?-2 387位?46位和523位各基因型频率和等位基因频率在哮喘组与对照组之间差异无统计学意义(P均>0.05),哮喘组与对照组491位点均为野生纯合基因型,未发现突变型等位基因?-47位与79位间存在强烈的连锁不平衡(D＇ = 0.987,r2 = 0.974),46位与523位存在较强的连锁不平衡(D＇ = 0.996,r2 = 0.593)?哮喘组单倍型Ⅲ(CCGGC)分布频率在两组间差异有统计学意义(OR = 0.696,95%CI:0.502~0.966,P < 0.05)?结论:ADRB2基因-47位?79位多态性和单倍型Ⅲ(CCGGC)可能与中国汉族人群哮喘的易感性相关?-2 387?46?491和523位多态性/单倍型与哮喘易感性无关?     

Y染色体单倍型在贵州苗族人群中的多态性分布

目的：调查Y染色体单倍型在贵州省苗族人群中的分布，从父系历史探寻贵州省苗族人的起源和迁移及其与其他民族间的亲缘关系。方法：采用PCR—RFLP法观察了由13个单核苷酸多态位点(SNPs)组成的Y染色体单倍型在贵州省苗族人群中的多态性分布，并将结果与我国其他民族及世界各大洲人群进行比较。结果：贵州省苗族人群中具有我国南方人群特异性的H7、H11和H12单倍型出现，其单倍型分布与我国南方汉族、土家族、彝族、布依族等较为接近，尤以M122(H5 H6)的频率较高。结论：提示贵州省苗族人属于我国南方群体，与南方汉族人及土家族、彝族人有一定的亲缘关系。     

广东汉族人群HLA-ABDR基因频率分析

目的　检测广东汉族人群HLA -A ,B ,DRB1基因频率 ,分析该人群HLA等位基因多态性及其特点。方法　肾移植、骨髓移植供者 4 0 4例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR -RSSO分型检测HLA -A ,B ,DRB1基因型。结果　在中分辨水平检出HLA -A等位基因 15个 ,HLA -B等位基因 31个 ,HLA -DRB1等位基因 13个。广东汉族人群HLA -A 11(0 .3342 ) ,A 0 2 (0 . 30 87) ,A 2 4 (0 . 2 2 16 ) ;HLA -B 6 0 (0 16 81) ,B 4 6 (0 . 16 81) ;HLA-DRB1 0 9(0. 175 5 ) , DRB1 15 (0 .14 90 ) ,DRB1 12 (0 . 1192 ) ,DRB1 14 (0 1192 ) ,DRB1 0 4 (0 .10 6 7)具有较高的基因频率分布 (>0. 10 )。Hardy -Weinberg平衡检验 :HLA -A(χ2 =6 0 .35 ,υ =5 4 ,P >0 1) ,B(χ2 =173. 6 7,υ =4 6 5 ,P >0 . 1) ,DRB1(χ2 =78. 4 6 ,υ =78,P >0 . 5 ) ,期望值和观察值吻合良好。结论　广东汉族群体HLA基因具有较为丰富的多态性 ,该人群HLA -A、B、DRB1等位基因处于遗传平衡状态 ,其基因频率分布具有地区性遗传特征。