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相似文献
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1.
基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究   总被引:24,自引:0,他引:24  
目的:探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理变化中的应用价值。方法:应用含有4096条人类全长基因的cNDA表达谱芯片,对3例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果:在3例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因398条,其中新基因289条,老基因109条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因37条,其中在胰腺癌组织中上调基因20条,下调基因17条。结  相似文献   

2.
基因芯片在筛选宫颈癌相关基因中的应用研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:通过研究宫颈癌组织和正常宫颈组织中差异表达的基因,筛选出与宫颈癌相关的基因群,并进一步研究其表达和初步功能。方法:以含2048条人类全长基因的cDNA基因表达谱芯片,检测3例宫颈癌标本和正常宫颈标本的基因表达谱,计算机分析比较两种组织中差异表达的基因。结果:3例宫颈癌差异表达基因分别有197条、429条和665条,共同差异表达的基因有64条。结论:宫颈癌同其他肿瘤一样,是多种基因结构和功能改变的结果,有关宫颈癌特异性相关基因及其作用有待进一步研究。  相似文献   

3.
目的以基因芯片技术研究Kkay2型糖尿病小鼠的差异表达基因。方法以包含8192条小鼠的cDNA基因表达谱芯片研究Kkay2型糖尿病小鼠肝脏的基因表达谱。结果共筛选出差异表达基因154条,包括全长基因68条,表达序列标识(EST)86条;其中40条基因表达增加,114条表达降低。结论多数已知功能基因的表达异常与以往的研究结论是一致的;cDNA基因芯片技术能够高通量分析糖尿病相关基因。  相似文献   

4.
Kkay小鼠Ⅱ型糖尿病相关基因的表达谱研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的:研究KkayⅡ型糖尿病小鼠与正常小鼠肝脏差异表达的基因,为人类Ⅱ型糖尿病及其慢性并发症的防治提供依据。方法:以包含8192条小鼠的cDNA基因表达谱芯片研究Kkay Ⅱ型糖尿病小鼠肝脏的基因表达谱。结果:共筛选出差异表达基因154条,包括全长基因68条,表达序列标识(EST)86条;其中40条基因表达增加,114条表达降低。结论:Ⅱ型糖尿病发病机制复杂,不仅有糖、脂肪及蛋白质等物质的代谢紊乱,更重要的是由此可能导致了许多功能蛋白质的异常。  相似文献   

5.
目的:采用表达谱芯片对病理性瘢痕组织和正常人皮肤组织进行检测,筛选病理性瘢痕组织的差异表达基因。方法:应用基因表达谱芯片筛选病理性瘢痕组织与正常人皮肤组织的差异表达基因,对差异表达基因数据进行Go和Pathway分析。结果:病理性瘢痕组织与正常人皮肤组织相比,差异表达2倍以上基因5 001个,差异表达5倍以上基因956个,差异表达20倍以上基因144个。结论:病理性瘢痕组织与正常皮肤组织在基因表达上,存在显著差异。病理性瘢痕的发生是由多种基因、多条通路共同参与作用的,基因通路间呈网络样动态连接。  相似文献   

6.
cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法:用含4096个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果:肺鳞癌差异表达基因591个,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因476个,上调的有293个,下调的有183个;肺腺癌差异表达基因524个,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因460个,上调的有214个,下调有246个;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论:肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。  相似文献   

7.
目的:应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法:利用CapitalBio公司基因芯片,对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果:按差异显著性标准,从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个,其中已知基因194个,新基因132个。在筛选出的已知基因中,表达上调113个,表达下调81个,包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。  相似文献   

8.
肿瘤转移相关基因的表达谱研究   总被引:4,自引:1,他引:3  
目的:运用基因表达谱芯片技术对肿瘤转移相关基因的表达谱进行研究。方法:对临床切除的肝癌和胰腺癌组织及相应的对照正常组织进行总RNA抽提,纯化后的mRNA进行逆转录制备杂交探针,应用BioDoor4096和BioDoor12800的全长基因DNA芯片筛选与肝癌和胰腺癌转移相关的基因。杂交后的信号用ScanArray3000扫描,结果用ImaGene3.0软件分析。结果:对肝癌和胰腺癌基因表达谱进行分  相似文献   

9.
基因表达谱芯片筛选强直性脊柱炎差异表达基因的研究   总被引:1,自引:1,他引:0  
目的应用表达谱芯片比较人强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)组织与正常骶髂关节组织的基因表达差异,筛选AS疾病相关基因。方法选取本室采集的3例活动期AS标本为实验组,1例骨折标本为对照组。分别提取标本骶髂关节的滑膜组织与椎旁组织的RNA,制备探针后用于表达谱芯片杂交,筛选AS组织差异表达基因,并采用半定量RT-PCR法验证芯片结果。结果与正常组织样本相比,在AS组织中筛选获得差异表达基因237条,表达上调的已知基因91条,表达下调的已知基因78条;对其中20条基因进行半定量RT-PCR检测,结果与表达谱芯片结果一致。结论筛选出与AS相关的多个差异表达基因。  相似文献   

10.
目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 4 0 96个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果 :肺鳞癌差异表达基因 5 91个 ,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 76个 ,上调的有 2 93个 ,下调的有 183个 ;肺腺癌差异表达基因 5 2 4个 ,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 6 0个 ,上调的有 2 14个 ,下调有 2 4 6个 ;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论 :肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱 ,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。  相似文献   

11.
研究基质金属蛋白酶 1 (MMP1 )和基质金属蛋白酶组织抑制物 1 (TIMP1 )基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法 :利用含 4 0 96个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因 ,重点分析MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌与肺腺癌中的表达。结果 :MMP1 ,TIMP1基因在肺鳞癌与肺腺癌中均表达上调。结论 :MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌、肺腺癌中均出现表达上调 ,可作为肺鳞癌、肺腺癌的重要分子标记  相似文献   

12.
应用基因芯片技术筛查肺癌变相关基因的研究   总被引:6,自引:1,他引:5  
Lü JC  Chen JK  Ji WD  Jiang YG  Shi LY  Wu ZL  He M  Zeng BH 《中华医学杂志》2003,83(24):2146-2151
目的 使用基因芯片技术研究肺鳞癌及化学致癌物诱导入气管上皮细胞恶性转化的癌变相关基因。方法 应用含4096条人类全长基因的cDNA芯片分别检测6例肺鳞癌和6例正常肺组织的基因表达谱;并用上述芯片研究苯并(a)芘代谢产物BPDE[anti-Benzo(a)pyrene diolepoxide,BPDE]和结晶型硫化镍所诱导的人支气管上皮细胞恶性转化与正常的人支气管上皮细胞系(16HBE)在基因表达谱上的差异;将3类标本共同的差异表达基因确定为肺癌变的相关基因。结果 在肺鳞癌/正常肺组织之间、BPDE诱导的恶性转化细胞/正常16HBE细胞之间及硫化镍诱导的恶性转化细胞/正常16HBE细胞之间发现差异表达基因分别为171条、143条和151条。通过比较,发现89条与肺癌变相关的共同基因,其中表达显著增加的基因39条,它们是:癌基因6条;细胞周期相关基因4条;细胞增殖基因6条;肿瘤转移基因8条;神经内分泌基因3条;耐药基因1条;凋亡抑制基因1条;氧化基因1条;其他基因9条。表达显著下降的基因50条,它们是:抑癌基因7条;DNA修复基因11条;抗氧化基因1条;GST基因家族3条;细胞骨架基因3条;凋亡诱导基因2条;信号传导基因5条;细胞因子及其受体基因5条;细胞代谢基因7条,细胞外基质基因1条;其他基因5条。结论 cDNA基因芯片技术能有效地研究基因的表达谱,筛查出肺癌变相关基因。  相似文献   

13.
应用cDNA微阵列技术研究MMP1,TIMP1基因在肺癌中的表达   总被引:1,自引:0,他引:1  
研究基质金属蛋白酶-1(MMP1)和基质金属蛋白酶组织抑制物-1(TIMP1)基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法:利用含4 096个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因。重点分析MMP1,TIMPl在肺鳞癌与肺腺癌中的表达。结果:MMP1,TIMPl基因在肺鳞癌与肺腺癌中均表达上调。结论:MMPl,TIMP1在肺鳞癌、肺腺癌中均出现表达上调,可作为肺鳞癌、肺腺癌的重要分子标记。  相似文献   

14.
目的:在TA2小鼠自发乳腺癌肺转移BCML模型上,采用了基因芯片技术,比较TA2小鼠低转移MA737模型与高转移BCML模型基因表达的差异。以期从基因水平上揭示乳腺癌的转移机制并为进一步寻找其新的防治手段打下基础。方法:采用上海联合基因公司提供的含2048个小鼠cDNA的C57BL-6的基因芯片,研究对象为TA2小鼠自发乳腺癌肺转移BCML模型。同时设TA2小鼠自发乳腺癌MA737模型为实验对照组。结果:筛选出包括与DNA结合,转录和转录因子,蛋白翻译,细胞周期,转移等相关的表达差异有基因共457个,其中210个表达上调,247个表达下调。结论:乳腺癌在转移过程中存在许多基因表达调控的改变,对于相关基因的研究有助于认识乳腺癌转移的分子机制。为进一步探讨乳腺癌的预防提供新的思路与实验依据。  相似文献   

15.
不同转移潜能肺癌细胞的基因表达差异   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:了解肺癌转移过程中基因的参与,进而为肺癌诊断、治疗提供依据。方法:选用5个不同转移潜能的体外培养肺癌细胞株H1299、HLAMP、PGCL3、PAa和NiS作为研究对象,以永生化的支气管上皮细胞16HBE为对照,采用含有800个基因探针的肺癌相关基因芯片LUs,研究各细胞株基因表达的差异。结果:5个肺癌细胞株差异表达的基因共有:355个,5株细胞共同上调或下调的基因仅有4个,基因表达的变化在不同细胞株之间明显表现出多态性。其中4个转移株与无转移的NiS间比较,有9个基因表达差异;3个高转移细胞株H1299、HLAMP、PGCL3与和低转移细胞株PAa和无转移NiS之间比较,有13个基因表达差异。这些基因大多是膜蛋白、细胞骨架蛋白,或和细胞信号转导有关,基因功能复习提示和肿瘤转移有可能的关联性。结果还显示和细胞膜陷窝结构有关的蛋白可能在肺癌转移过程中具有较大的意义。结论:基因芯片方法对于筛选肺癌转移相关基因有独特的优势;获得的差异表达基因具有较强的代表性,对这些基因的进一步分析可能会对肿瘤转移机理的研究产生重要的影响。  相似文献   

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