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相似文献
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1.
应用抑制性消减杂交技术筛选成骨肉瘤转移相关基因   总被引:1,自引:1,他引:0  
陈军  范清宇  张惠中  周勇 《医学争鸣》2003,24(15):1376-1378
目的:探讨与人成骨肉瘤转移相关的基因表达变化.方法:通过抑制性消减杂交技术从一对同一亲本、转移表型不同的人成骨肉瘤细胞株中分别提取细胞总RNA,筛选差异表达基因并测序,将结果与核酸数据库进行同源性比较.结果:获得12个在低转移成骨肉瘤中高表达的、均与已知的人类基因片段有很高同源性的核甘酸片段.结论:差异表达的基因可能与成骨肉瘤细胞转移生物学特性呈密切相关,特别是在维持肿瘤细胞自身稳定、防止转移中起重要作用.  相似文献   

2.
背景:在过去的数十年间,转移性骨肉瘤的治疗一直是亟待解决的临床难题。细胞外基质蛋白作为肿瘤微环境关键组成成份,在骨肉瘤进展过程中发挥着重要作用。在此,我们通过基因芯片技术分析不同转移能力骨肉瘤细胞系基因表达,在编码细胞外基质蛋白基因中寻找与骨肉瘤进展相关的基因,并通过免疫组化技术检测这些基因在骨肉瘤标本中的表达,以评价其与临床预后的关系。 方法:通过基因芯片技术分析骨肉瘤细胞系MG63-wt及其高转移亚系MG63-A1的基因表达差异。对两个细胞系间表达差异达4倍以上的基因通过Gene Ontology方法筛选编码细胞外基质蛋白的基因。通过RT-PCR和western blot验证候选基因的表达水平,免疫组化检测候选基因在骨肉标本中的表达以分析其与临床预后的关系。 结果:基因芯片检测和Gene Ontology分析发现一个重要的细胞外基质蛋白――Tenascin-C的表达在高转移骨肉瘤细胞系MG63-A1中明显降低。RT-PCR和western blot分别在mRNA水平和蛋白质水平证实其表达水平。免疫组化检测发现Tenascin-C在骨肉瘤标本中的阳性表达见于细胞外间隙。Tenascin-C低表达组(<20%)患者的预后较差,差异有统计学意义。 结论:Tenascin-C的表达水平与骨肉瘤患者预后呈正相关。Tenascin-C在骨肉瘤进展中的生物学作用有待进一步的体外细胞模型研究和更大样本临床研究。  相似文献   

3.
粘连蛋白基因在急性白血病中表达的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:探讨粘连蛋白(FN)基因在急性白血病发生和转移中的作用。方法:运用基因芯片和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测18例急性白血病细胞FN基因表达。结果:FN基因在急性白血病表达显增高,并且有白血病细胞浸润患粘连蛋白基因表达高于无浸润患,基因芯片检测结果与RT-PCR结果相同。结论:基因芯片能够为急性白血病的相关基因分析提供特异和可靠的数据。急性白血病的发病和浸润机制可能与骨髓细胞中FN基因表达升高有关。  相似文献   

4.
天花粉蛋白诱导人宫颈癌HeLa细胞调亡的分子机制研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:利用基因芯片技术研究天花粉蛋白对人宫颈癌Hela细胞基因表达谱的影响,以深入探讨其作用的分子机制.方法:提取药物处理前后HeLa细胞RNA并逆转录成cDNA,在获得的cDNA上分别标记CY3和CY5两种荧光物质,然后与BiostarH-I 表达谱芯片杂交,扫描后对获得的数据用GenePix Pro 3.0软件分析.结果:两组间存在差异性表达基因78条,其中与细胞黏附及细胞间相互作用相关的MGST3、LGALS3BP等16条基因表达下降,与细胞凋亡密切相关的NOP56、TNFSF10、CASP9、DFFB等62条基因表达上调.结论:基因芯片技术能高通量分析天花粉蛋白作用于HeLa细胞的相关靶基因,为进一步揭示天花粉蛋白的抗癌机制提供了新的思路.  相似文献   

5.
目的探讨联合运用基因芯片和反义寡核苷酸技术筛选转移相关基因.方法分别提取两种具有不同转移能力的骨肉瘤细胞总RNA,反转录cDNA,用基因芯片筛选差异表达基因;从基因芯片筛选结果中选择适当基因,设计相应的反义寡核甘酸进行体外实验,观测其对细胞生长特性的影响.结果基因芯片筛选出11个差异表达基因,多与肿瘤发生发展有关.BRCA1和BLCAP基因反义寡核苷酸均可引起骨肉瘤细胞生长速度变快、克隆形成率增高、增殖活性增强.结论联合运用基因芯片和反义寡核苷酸技术可以有效地筛选转移相关基因,为进一步研究提供有益的参考.  相似文献   

6.
基因芯片技术在研究中药分子作用机制中的应用   总被引:6,自引:0,他引:6  
目的:探讨罗勒多糖抑瘤作用和机制以及基因芯片技术在中药分子作用机制研究中的应用。方法:建立荷NuTu-19卵巢癌大鼠模型及相应对照,观察中药罗勒多糖对荷瘤鼠肿瘤生长及转移行为的影响;同时提取肿瘤组织总RNA,用RT-PCR逆转录合成cDNA,分别用Cy3-dUTP、Cy5-dUTP标记对照组和药物组cDNA,与含有2000点的大鼠基因表达谱芯片杂交,杂交芯片扫描结果用ImaGene3.0软件进行分析统计。结果:对照组与药物组之间共有168条差异表达基因,经归类分析,表达差异基因主要为:①肿瘤转移相关基因;②与免疫应答有关的基因;③与细胞能量代谢有关的酶类;④与药物代谢及敏感性有关酶类的基因;⑤与信号转导以及转录过程有关的基因等。结论:罗勒多糖可能通过多种作用途径抑制肿瘤生长及转移,基因芯片技术可从基因水平解释中药的可能作用机制,并为进一步确切机制的研究提供重要信息。  相似文献   

7.
目的应用基因芯片技术对小鼠组织细胞肉瘤L-Ⅱ高侵袭转移瘤株和母瘤株的基因表达谱进行对比分析并筛选出差异表达基因,以期从基因水平上探讨肿瘤的转移机制。方法L-Ⅱ瘤细胞接种小鼠胁部皮下,取其肺转移灶制成细胞悬液接种另一小鼠体内,再取其肺转移灶传代,如此数代后,建立L-Ⅱ肺高转移模型,筛选出L-Ⅱ高侵袭转移瘤株。用基因芯片检测筛选前后的L-Ⅱ瘤株表达有差异的基因,并用RT.PCR对部分差异表达基因进行分析鉴定。结果用体内转移灶连续传代法筛选小鼠组织细胞肉瘤L-Ⅱ至第9代,筛选出L一Ⅱ高侵袭转移瘤株。用肿瘤转移基因芯片杂交筛选出传代前后L-Ⅱ瘤细胞的差异表达基因共21个,其中上调基因17个.下调基因4个。对其中有代表意义的基因,如Kras.2、IGF-1、MMP.10、Brms.1进行RT-PCR验证,结果证实所选基因在筛选前后瘤细胞中的表达差异均有统计学意义,与基因芯片的表达情况一致。结论小鼠组织细胞肉瘤L-Ⅱ的侵袭转移是一个涉及Kras.2、IGF.1、MMP.10、Brms-1等重要基因和其他相关基因等多个基因共同参与的复杂过程。  相似文献   

8.
目的:应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法:利用CapitalBio公司基因芯片,对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果:按差异显著性标准,从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个,其中已知基因194个,新基因132个。在筛选出的已知基因中,表达上调113个,表达下调81个,包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论:基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。  相似文献   

9.
目的采用基因芯片技术比较筛选前后的人胃癌细胞母系MKN-28和亚系MKN-28S之间的基因表达谱,利用生物信息学方法筛选出与胃癌侵袭和转移相关的差异基因。方法用肿瘤转移基因芯片筛选出人胃癌细胞MKN-28母亚两系的转移相关基因,对部分有差异表达的基因用RT-PCR和Western blot进行分析鉴定。结果用肿瘤转移基因芯片筛选出两系的差异表达基因共20个,其中上调基因13个,下调基因7个。选择其中有代表意义的2个基因利用RT-PCR和Western blot进行验证,证实所选基因在筛选前后瘤细胞中均有差异表达,与基因芯片的表达情况一致,说明基因芯片结果可信度较高。结论基因芯片技术是筛选胃癌转移相关基因的有效方法;多基因参与了胃癌的侵袭和转移的过程,包括一些基因如Flt-4、SRC等基因和其它相关基因的改变。  相似文献   

10.
不同转移潜能肺癌细胞的基因表达差异   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:了解肺癌转移过程中基因的参与,进而为肺癌诊断、治疗提供依据。方法:选用5个不同转移潜能的体外培养肺癌细胞株H1299、HLAMP、PGCL3、PAa和NiS作为研究对象,以永生化的支气管上皮细胞16HBE为对照,采用含有800个基因探针的肺癌相关基因芯片LUs,研究各细胞株基因表达的差异。结果:5个肺癌细胞株差异表达的基因共有:355个,5株细胞共同上调或下调的基因仅有4个,基因表达的变化在不同细胞株之间明显表现出多态性。其中4个转移株与无转移的NiS间比较,有9个基因表达差异;3个高转移细胞株H1299、HLAMP、PGCL3与和低转移细胞株PAa和无转移NiS之间比较,有13个基因表达差异。这些基因大多是膜蛋白、细胞骨架蛋白,或和细胞信号转导有关,基因功能复习提示和肿瘤转移有可能的关联性。结果还显示和细胞膜陷窝结构有关的蛋白可能在肺癌转移过程中具有较大的意义。结论:基因芯片方法对于筛选肺癌转移相关基因有独特的优势;获得的差异表达基因具有较强的代表性,对这些基因的进一步分析可能会对肿瘤转移机理的研究产生重要的影响。  相似文献   

11.

Objective

To study the expression of osteosarcoma metastasis associated gene using a cDNA microarray, and screen new candidate genes related to the development, progress and osteosarcoma metastasis.

Methods

Total RNA of a low metastatic osteosarcoma and a high metastatic osteosarcoma (M6 and M8 cell lines, respectively) was extracted, purified to mRNA and then reverse transcribed to cDNA. M6 was used as the experimental group and M8 as the control group, and the gene expression of cells from both of these two sublines was investigated using cDNA microarrays containig 8064 cDNA clones. The cDNA of M6 was labeled with cy3 and the cDNA of M8 was labeled with cy5. The two sublines were hybridized with the cDNA microarray. The hybridization signals were scanned with a Generation III array scanner and analyzed by Imagequant 5.0 software.

Results

There were 330 differentially expressed genes between M6 and M8. In the M6 subline,152 genes were up-regulated and 178 genes were down-regulated compared to the M8 subline. These genes could be classified according to their function. Cell growth-related genes that were down-regulated included CCNG1, CDC2, APC10, and RPA3, while expression of the tumor suppressor genes, CDKN1A and CDKN2D, was up-regulated. Other genes that were differentially expressed included those that have been implicated in the regulation of signal transduction, metabolism and apoptosis.

Conclusion

This study exploits a cDNA microarray approach to identifying genes that may be associated with metastasis. The gene expression profiles of osteosarcoma cell lines is a potentially important index in the search of new candidate genes related to tumor occurrence, development and metastasis.  相似文献   

12.
目的应用基因芯片探讨人高、低转移肺巨细胞癌细胞株95D和95C的基因表达差异,筛选肺癌转移相关基因。方法提取人高转移肺巨细胞癌细胞株95D和人低转移肺巨细胞癌细胞株95C的mRNA并反转录为cDNA,分别用Cy5-dUTP和Cy3-dUTP进行标记后与基因芯片杂交,然后用Scan Array 3000扫描仪及Im aGene3.0软件处理杂交信号得到95D和95C的表达差异基因。对部分有差异表达的基因进行RT-PCR分析鉴定。结果在被检测的人高、低转移肺巨细胞癌细胞株95D和95C中,共有466条基因出现表达差异,其中具有同一GenBank ID号的Doub le基因共108对,包括上调基因47对,下调基因61对。有表达差异的F ln29、RUVBL2、C14orf3等基因RT-PCR结果与基因芯片一致。结论多基因参与了肺癌的转移过程,基因芯片技术是筛选肺癌转移相关基因的有效方法。  相似文献   

13.
目的:用基因芯片技术研究高低转移人卵巢癌细胞系(HO-8910PM和HO-8910)基因表达谱差异,筛选与转移相关的基因。方法:按一步法分别抽提高低转移人卵巢癌细胞和对照正常卵巢组织的总RNA并纯化mRNA;分别将等量的高低转移人卵巢癌细胞及对照组织的mRNA逆转录合成以Cy5和Cy3标记的cDNA一链做探针,分别混合后在2张含有4096条双点人类全长基因的芯片上进行杂交。经洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,用ImaGene3.0软件对扫描图像进行数字化处理,计算机分析高低转移人卵巢癌细胞系之间及与正常卵巢上皮基因表达谱差异。结果:人卵巢癌细胞系HO-8910细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有355个基因。高转移人卵巢癌细胞系HO-8910PM细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有323个基因。高转移人卵巢癌细胞系HO-8910PM与母系HO-8910比较差异2倍以上共有165个基因,其中两株细胞系比较差异3倍以上共有21个基因。结论:两株人卵巢癌细胞系与正常卵巢上皮细胞基因表达谱存在差异,提示这些基因与卵巢癌的发生和发展及高转移特性有关。本实验说明利用基因芯片对基因表达谱的检测可以为人体卵巢癌的基因诊断、治疗和预防提供新的方向。  相似文献   

14.
目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA一链做探针,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的量,获得的荧光信号图像用计算机分析。结果按差异显著性标准,从14 000条基因中筛选出在胰腺癌组织中共同差异表达基因189条,其中已知基因101条,新基因88条。在筛选出的已知基因中,有50条表达上调,51条表达下调,包括原癌及抑癌基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架和运动蛋白相关基因、细胞凋亡和应激反应相关基因、DNA合成和修复相关基因、转录因子类基因、细胞受体相关基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因等。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胰腺癌相关基因,并高效对基因功能进行研究。胰腺癌基因表达谱的分析有助于认识肿瘤发病机制。  相似文献   

15.
高低转移人大肠癌细胞系基因表达谱差异   总被引:4,自引:1,他引:3  
目的 用自制肿瘤转移相关基因cDNA微阵列研究人大肠癌高转移细胞系Lovo、SW620及低转移细胞系SW480、LS174T的基因表达谱差异,筛选与大肠癌转移相关的特异基因。方法 分别提取4种大肠癌细胞系及对照的正常大肠上皮组织的mRNA,逆转录成cDNA探针,经cy3和cy5标记后分别与含有399个肿瘤转移相关基因的微阵列杂交.用专用软件分析杂交信号强度。结果 高转移细胞系与低转移细胞系的基因表达谱有显著差异,其中有104个基因的表达值有意义,包括上调基因44个、下调基因60个。结论 大肠癌转移是由其发生过程中多个基因表达的复杂变化决定的,高转移细胞系与低转移细胞系比较存在差异的基因可能与高转移特性有关。  相似文献   

16.
高低转移人大肠癌细胞系基因表达谱差异   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的用自制肿瘤转移相关基因cDNA微阵列研究人大肠癌高转移细胞系Lovo、SW620及低转移细胞系SW480、LS174T的基因表达谱差异,筛选与大肠癌转移相关的特异基因。方法分别提取4种大肠癌细胞系及对照的正常大肠上皮组织的mRNA,逆转录成cDNA探针,经cy3和cy5标记后分别与含有399个肿瘤转移相关基因的微阵列杂交,用专用软件分析杂交信号强度。结果高转移细胞系与低转移细胞系的基因表达谱有显著差异,其中有104个基因的表达值有意义,包括上调基因44个、下调基因60个。结论大肠癌转移是由其发生过程中多个基因表达的复杂变化决定的,高转移细胞系与低转移细胞系比较存在差异的基因可能与高转移特性有关。  相似文献   

17.
目的:探索与鼠同源的人类已知基因在苯妥英钠耐药和非耐药癫痫鼠脑中的差异表达,了解难治性癫痫形成(PHT)机制。方法:建立耐药和非耐药组癫痫大鼠模型,成功后,处死动物,取出脑组织,常规抽提,逆转录生成PHTmRNAcDNA后,应用含有条人类基因的表达谱芯片,检测两者间基因表达谱的差异。4096cDNA结果:发现耐和治疗有效癫痫PHTPHT鼠与神经元突触可塑性有关的基因有条存在差异表达。18结论:突触可塑性增强可能是难治性癫痫形成的重要原因。  相似文献   

18.
目的:研究理冲生髓饮对人卵巢浆液性乳头状囊腺癌细胞株SKOV3的抑制作用,并利用基因表达谱芯片探索其作用机制。方法:Wistar大鼠随机分组,灌胃给药,采血制备含药血清。提取对照组及理冲生髓饮组肿瘤细胞mRNA,制备cDNA探针并分别用Cy3和Cy5两种荧光染料标记,与基因表达谱芯片进行杂交,经扫描、分析,得出药物作用后表达有差异的基因。结果:共筛选出显著表达差异基因136种,其中16种基因表达水平下调,120种基因表达上调。结论:理冲生髓饮对SKOV3生长有抑制作用,调节癌基因及其相关的信号传导、改变肿瘤细胞蛋白合成等可能是其作用机制。  相似文献   

19.
Gene expression profile changes in NB4 cells induced by realgar   总被引:5,自引:0,他引:5  
Wang H  Liu S  Lu X  Zhao X  Chen S  Li X 《中华医学杂志(英文版)》2003,116(7):1074-1077
  相似文献   

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