外周血单核细胞LIGHT的诱导表达及基因克隆

目的:分析细胞因子对外周血单核细胞LIGHT基因的诱导表达,并克隆人LIGHT基因.方法:采用新鲜健康人外周血单核细胞(PM BC),分别以LPS、TNFα、IL-2、IFN-γ及PMA刺激以诱导LIGHT基因表达,RT-PCR分析P MBC内LIGHT基因转录表达.采用PCR产物直接克隆法克隆人全长LIGHT基因及其胞外区编码基因,并对胞外区编码基因进行大肠杆菌表达.结果:当用IFN-γ和PM A刺激PMBC后48 h,可诱导LIGHT基因的明显表达,而LPS、IL-2和TNFα则不能诱导.克隆的人LIGHT全长基因及LIGHT胞外区编码基因,经过DNA序列测定证实基因序列与文献报道一致.LIGHT基因胞外区在大肠杆菌获得一定程度的表达.结论:本研究对人LIGHT基因及其胞外区编码基因进行了克隆和表达,为进一步研究其功能打下基础.     

钙离子调节亲环素配体及其不同剪接体的克隆及生物信息学分析

目的:克隆钙离子调节亲环素配体(CAML)及其不同剪接体,并应用生物信息学进行分析。方法:以Jurkat、HepG2细胞提取的cDNA为模板,PCR扩增CAML基因,选用pGEM-T-easy载体进行TA克隆,利用VectorNTI9.0软件与CAML基因所在染色体进行比对分析,并对CAML全长基因进行生物信息学分析。结果:CAML基因克隆成功,并证实CAML基因在细胞中存在3种剪接体,分别为缺失全长CAML cDNA序列中634~698、173~633和173~698 bp的CAML序列,大小分别为825、429和363 bp。这些剪接体的组成中均包含了CAML与其他蛋白相互结合的亲水的N末端,以及CAML发挥调节钙离子内流作用所必需的第2、3跨膜结构域,说明这些剪接体均具有发挥CAML基本功能的可能。结论:成功克隆了CAML基因,并首次证实CAML基因在细胞中存在不同剪接体。     

人睾丸细胞中一种新的辅酶Ⅱ依赖性视黄醇脱氢/还原酶mRNA剪接变体

目的:研究辅酶II依赖性视黄醇脱氢/还原酶(NRDR)在生殖细胞中的剪接亚型,并对表达蛋白进行预测分析。方法:用快速cDNA末端扩增法从人睾丸细胞株(Hs 181.Tes)中克隆NRDR全长cDNA序列;对获得的序列进行生物信息学分析,通过查找开放阅读框架(ORF),预测并分析剪接新亚型的蛋白质序列和功能:从Hs 181.Tes中克隆了一种新的全长1 164bp的cDNA片段,序列分析表明其属于NRDR缺失4、5外显子的截短剪接体,其ORF可编码237个氨基酸,拥有短链醇脱氢酶家族的保守模序和过氧化物体定位信号。结论:NRDR在不同细胞的基因转录表达调控具有选择性差异,进而表达不同蛋白,构成SDR家族,该新亚型可能参与生殖系统相关酶类的代谢,控制生殖细胞增殖分化。     

人外周血单核细胞B7.2基因的克隆及其可溶剪接体的发现

目的研究B7.2基因在肿瘤免疫方面作用,从人外周血单核细胞中克隆人B7.2基因的全长基因,并构建含此基因的重组质粒。方法根据人B7.2基因序列设计特异引物,用RT-PCR、巢式PCR方法扩增B7.2基因的全长基因,并构建至PGEM-T载体中,测序鉴定后进行序列分析。结果成功构建B7.2/PGEM-T重组载体,并发现一种新的B7.2异常的剪接体,保留第1,2,3,5外显子,第四外显子全部缺失,共144 bp,其编码蛋白质由此缺少一段跨膜结构。结论新剪接体在灵长类动物中的存在可能是个普遍现象,其对细胞功能有待进一步的研究,为研究B7.2编码蛋白质的结构和生物学功能及其在肿瘤中的作用奠定基础。     

带信号肽人血管内皮生长因子基因 VEGF121及VEGF165载体的克隆

目的克隆及构建带信号肽人血管内皮生长因子基因VEGF121及VEGF165表达载体.方法对正常引产胎儿肺组织的总RNA进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),克隆入T载体,测定扩增片段序列,进而克隆入表达质粒pcDNA3 1-,酶切鉴定重组子.结果用一对引物(5'引物为-21～7 bp,3'引物为554～576 bp)可扩增出两个条带,短条带为VEGF121(487 bp),长条带经筛选可得到两个片段,一为正常的VEGF165(619 bp),另一个为新的VEGF mRNA"异常"剪切片段测序结果显示,此"异常"剪切片段扩增长度为639 bp,同样为VEGF165全长核苷酸序列,但在VEGF165的第3和第4外显子之间插入了长度为20 bp的片段.经序列检索发现20 bp的插入序列为滞留的第3内含子终末序列,含内含子剪切信号.结论克隆出带信号肽人血管内皮生长因子基因VEGF121及VEGF165表达载体,同时在正常引产胎儿的肺组织中可能发现了一种新的VEGFmRNA可变剪切形式.     

一个唐氏综合征下调表达基因片段的克隆、鉴定及细胞定位分析

目的:克隆唐氏综合征(Down syndrome,DS)相关新基因,并对其进行组织表达谱和细胞定位分析,探索其在DS脑病变发生中可能参与的环节.方法:在分析前期基因芯片结果的基础上,选取在正常和DS胎儿大脑皮层中差异表达的表达序列标签(expression sequence tags,EST) AI480014,利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA end ,RACE)对其进行末端延伸;利用多组织Northern印迹技术分析其在组织中的表达谱和剪接体情况,用半定量RT-PCR进一步验证其组织表达谱的结果;通过细胞原位杂交技术,对其进行体外原代培养的混合胶质细胞表达定位分析;最后用半定量RT-PCR分析其在DS和正常胎儿脑皮层表达情况.结果:成功地将AI480014的3'端延伸232 bp,得到一个3'端完整、长682 bp的新基因片段(Genbank序列号DQ275636);Northern印迹表明分析其在心、肝、脾、肾、脑组织均有表达,且在脑组织中的表达量最高,而在脑组织中又以额叶、海马的表达量最高,各组织无可变剪接体的存在;在混合培养的胶质细胞中检测到该基因的表达;DQ275636染色体定位为5q14.结论:得到一个新基因片段(DQ275636);其组织来源和在脑组织中的表达特性提示其可能参与DS脑病变发生的某个环节.     

人外周血单个核细胞BLyS127-285的克隆、表达和纯化

目的:从人外周血单个核细胞中克隆出B淋巴细胞刺激因子(B lymphocyte stimulator,BLyS)胞外区片段BLyS127-285,并进行表达和纯化.方法:采用RT-PCR技术,从人外周血单个核细胞中扩增BLyS127-285,测序后构建原核表达载体,经IPTG诱导表达及Ni-NTA纯化,以SDS-PAGE和Western印迹法进行鉴定.结果:RT-PCR扩增出一个480 bp的DNA片段,序列分析与GenBank中报道的人BLyS127-285的cDNA序列一致,该胞外区片段在大肠杆菌中得到高效表达,表达量可达菌体总蛋白的49.8%,纯化后纯度可达97.0%.结论:成功地从人外周血单个核细胞中扩增出人BLyS127-285,并获得高效表达,其纯化产物为进一步研究其功能、开发与临床应用奠定了基础.     

浙南汉族人群短串联重复序列LPL位点的多态性调查

目的:获得STR位点脂蛋白脂肪酶基因(LPL)在浙南汉族群体中的等位基因频率.方法:用Chelex法提取外周血DNA,PCR扩增短串联重复(STR)位点LPL后,用聚丙烯酰胺电泳系统进行分型.结果:在236个无关个体中共发现了四个等位基因,扩增片段为117～129bp,等位基因频率最高为0.6758(117bp),有十个核心重复序列,最低为0.0191(129bp),有十三个核心重复序列.杂合率、个体识别率、非父排除率和多态性信息容量分别为0.4949、0.6996、0.1840、0.4497.家系分析表明按孟德尔规律遗传.结论:结果表明STR位点LPL是一个具有法医应用价值的位点,浙南汉族群体中的等位基因频率与武汉地区相比,差异无显著性.     

钩端螺旋体膜表面蛋白LipL41基因的克隆、序列分析及表达

目的:进一步分析钩端螺旋体LipL41的免疫原性.方法:通过PCR的方法,以我国特有的钩端螺旋体流感伤寒群临海型lin6株(56609)的DNA 为模板,扩增目的基因LipL41,克隆至pcDNA3载体上,以自动测序仪测序后进行序列分析,然后克隆至原核表达载体pGEX-5T进行原核表达,Western印迹分析其免疫原性.结果:获得长1 068 bp的片段,DNA序列分析表明该菌株的LipL41基因与文献报道具有很高的同源性(95.0％～99.4％),在大肠杆菌中获得了表达,并与抗钩端螺旋体血清反应.结论:该抗原为致病性钩端螺旋体所具有的保守性抗原成分,可能在钩端螺旋体病的诊断和预防中发挥作用.     

表皮生长因子受体胞外区的原核表达和鉴定

目的 克隆表皮生长因子受体(EGFR)胞外区段基因序列(EGFR ECD),构建重组融合表达载体.方法 采用常规PCR方法 扩增EGFR的胞外区DNA序列,并将扩增产物克隆入GST融合表达载体pGEX-4T-1中,构建重组质粒pGEX-4T-1/EGFRECD,转化BL21(DE3)宿主菌;采用Sal Ⅰ和Not Ⅰ双酶切和序列分析鉴定插入序列的正确性:并用IPTG诱导工程菌,SDS-PAGE及Western blotting分析融合蛋白的表达.结果 双酶切鉴定表明,EGFR胞外区序列已经正确克隆到GST融合表达载体中,测序结果证实插入DNA序列与EGFR胞外区序列完全一致.SDS-PAGE电泳显示,融合蛋白在BL21(DE3)中以包涵体形式表达,重组融合蛋白GST-EGFRECD的表达量占菌体总蛋白的12%左右.经Western blotting分析证实,重组融合蛋白可以被EGFR特异性抗体所识别.结论 本试验成功克隆了EGFR胞外区DNA序列,构建了融合表达载体,并进行了融合蛋白的诱导表达和鉴定,可进一步用于EGFR功能及免疫学研究.     

Dnmt3b cDNA及其在小鼠胚胎组织中选择剪接异构体的克隆

目的 克隆与小鼠胚胎发育相关的新的新的全长ｃＤＮＡ。方法 从小鼠胚胎ｃＤＮＡ文库中筛选出一个新的ＥＳＴ,以８～９ｄ齿小鼠胚胎组织ｍＲＮＡ为模板进行ＲＡＣＥ（ｒａｐｉｄ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｃＤＮＡ ｅｎｄｓ）,结合ＰＣＲ筛选ｃＤＮＡ文库,获得共全长ｃＤＮＡ序列后进行序列同源检索、结构分析和功能预测。整合后的ｃＤＮＡ两上物进行ＲＴ－ＰＣＲ,克隆ＰＣＲ产物,并对产物进行全序列测定,验证整     

一种新的人血管内皮生长因子基因的剪切形式

目的：检测人胚胎肺组织中新的血管内皮生长因子（VEGF）基因的可变剪切形式。方法：对胎儿肺组织的总RNA进行逆转录聚合酶链反应,克隆并测定扩增片段的序列。结果：用一对引物（引物5′端－21－7,3′端554－576）可扩增出3条片段,1条长度为正常的VEGF165（619bp) ,1条为正常的VEGF121（487bp),第3条为新的VEGF mRNA“异常”剪切片段,测序结果显示,此片段扩增长度为639bp,同样为VEGF165全长核苷酸序列,但在VEGF165的第三和第四外显子之间插入了长度为20bp的片段,经序列检索发现20bp的插入序列为滞留的第Ⅲ内含子终末序列,含内含子剪切信号,上述移码突变导致VEGF基因的阅读框架发生变化,在第四外显子中游出现终止密码子,结论：在一引产胎儿的肺组织中发现了新的VEGFmRNA可变剪切形式,其生物学意义有待进一步研究。     

一种新的人血管内皮生长因子基因的剪切体(英文)

目的探索人胚胎肺组织中是否存在一种新的血管内皮生长因子(VEGF)基因可变剪切形式。方法对1例4月龄引产胎儿肺组织的总RNA进行逆转录聚合酶链反应、克隆并测定扩增片段的序列。结果用一对引物(引物5’端-21~7 bp,3’端554~576 bp)可扩增出3条片段,一条为长度正常的VEGF16(5619 bp)全长序列,另一条为长度正常的VEGF12(1487 bp)全长序列,第三条为新的VEGF mRNA异常剪切片段。测序检测显示,此扩增片段长度为639 bp,同样为VEGF165全长核苷酸序列,但在VEGF165的第3和第4外显子之间插入了长度为20 bp的碱基片段。序列分析显示此插入序列为滞留的第Ⅲ内含子终末序列,含内含子剪切信号。上述移码突变导致VEGF基因阅读框架发生改变,在第4外显子中游出现终止密码,故仅含VEGF165外显子1~3及4部分序列,在蛋白水平上可能编码含97个氨基酸的新肽链。结论在一引产胎儿的肺组织中发现了新的VEGF mRNA可变剪切形式,其生物学意义有待进一步研究。     

比格犬雌激素受体β四个剪接异构体的发现

目的在比格犬下丘脑-垂体-性腺轴上筛查雌激素受体13的剪接异构体。方法针对ERβmRNACDS序列的八个外显子,两两外显子依次组合设计引物,运用PCR法,以比格犬下丘脑、垂体、卵巢、子宫组织cDNA为模板扩增相应序列,测序后在NCBI网站比对,确定是目的基因后,用DNAMAN软件比对分析及手工校对,获得ERβ的剪接异构体。结果获得到了比格犬ERβ的四个剪接异构体,分别是第4外显子完整缺失的ERβ剪接异构体（缺失300bp）,部分第4与部分第5外显子组合缺失的两个组合型缺失的ERβ剪接异构体（各缺失334bp,265bp）,以及第七外显子完整缺失的ERβ剪接异构体（缺失181bp）。第4外显子完整缺失的剪接异构体和第7外显子完整缺失的剪接异构体获得了全长编码序列,另两个剪接异构体为部分编码序列。结论研究获得了比格犬ERβ的四个剪接异构体,为后续研究其在比格犬生殖调控中的作用机制打下了基础。     

带信号肽人血管内皮生长因子基因VEGF121及VEGF165载体的克隆

目的 克隆及构建带信号肽人血管内皮生长因子基因VEGF121及VEGF165表达载体。方法 对正常引产胎儿肺组织的总RNA进行逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR），克隆入T载体，测定扩增片段序列，进而克隆入表达质粒pcDNA3.1^-,酶切鉴定重组子。结果 用一对引物（5′引物为-21-7bp,3′引物为554-576bp)可扩增出两个条带，短条带为VEGF121（487bp)，长条带经筛选可得到两个片段，一为正常的VEGF165（619bp)，另一个为新的VEGFmRNA“异常”剪切片段。测序结果显示，此“异常”剪切片段扩增长度为639bp，同样为VEGF165全长核苷酸席子邓列，但在VEGF165的第3种和4外显子之间插入了长度为20bp的片段，经序列检索发现20bp的插入序殓为滞留的第3内含子终末序列，含内含子剪切信号。结论 克隆出带信号肽人血管内皮生长因子基因VEGF121及VEGF165表达载体。同时在正常引产胎儿的肺组织中可能发现了一种新的VEGFmRNA可变剪切形式。     

基因新异构体的剪接特征及其生物学意义

目的 探讨基因新异构体的剪接特征及生物学意义。方法 对人肾上腺组织cDNA文库作大规模DST分析及全长cDNA克隆。结果 发现7条由不同剪接方式形成的新的异构体,其中4个剪接特点不符合经典的gt-ag规律,且剪接方式多样,人类固醇5α还原酶跨越两个外显子,KIAA0971的异构体与KIAA0971比较,有两段缺失,且造成编码框架移动,均按gt-at方式。人17．9kd蛋白与从基因组序列预测的cDNA比较增加一个新外显子,人甲状腺素受体相互作用蛋白15的第5号外显子端具有2个－ag的接点。结论 表明体内mRNA成熟过程中剪接方式呈现多样性及复杂性。     

FMR1基因在人胚胎组织中的选择剪接表达

本实验分析了6月龄胚胎心、肝、肾、脾4种组织中FMR1基因的选择剪接表达。在所分析的胚胎组织中，FMR1mRNA主要异构体与该胚胎大脑皮层的主要异构体相同，与成人大脑皮层的主要异构体完全不同。这一差异提示FMR1基因的选择剪接表达存在发育转换。FMR1基因的选择剪接表达在胚胎和成人组织中的主要差别表现在外显子12和外显子17编码多肽的去留上，对这两段多肽功能的研究将具有重要意义。     

选择性剪接变异体的RT-PCR检测及结果分析

目的 利用RT-PCR方法检测并分析mRNA选择性剪接变异体.方法 针对糖原合成酶激酶(GSK)3β和B细胞转位基因( BTG)3基因变异体差别设计引物,利用RT-PCR扩增后进行电泳和克隆DNA测序.结果 GSK3β和BTG3的RT-PCR产物电泳均出现3条带,经过电泳和克隆DNA测序发现GSK-3β中上面2条带为同一产物.对BTG3上(位于319 bp)、下(位于70 bp)2条带进一步PCR扩增后测序,结果发现3个条带均为同一产物.结论 RT-PCR法检测选择性剪接产物操作方便,对Western蛋白印迹结果评价具有指导意义,但是产生的非特异条带可能是由于某种特殊原因造成,如选择性剪接部位的特异核酸序列,需DNA测序做进一步确定.     

肝癌相关基因的分子克隆和可变剪切分析

目的: 获取肝癌相关基因(hepatoma associated gene,HTA)的mRNA分子全长序列并对其可变剪接进行分析,检测其转录本在各肝癌细胞系中的表达,为进一步研究该基因在肝癌发生、发展中的作用奠定基础。方法: 用3'RACE 和5'RACE方法扩增HTA基因的全长序列并对其序列信息和可变剪接进行扩增和测序分析,用Northern印迹检测该基因转录本在不同肝癌和正常肝细胞系中的表达。结果: HTA基因全长序列为1414 bp,经分析该序列包含3个外显子,2个内含子,其中2号内含子在可变剪接中被作为外显子表达。Northern印迹显示HTA基因1.7 kb转录本和1.4 kb转录本均表达于恶性肝癌细胞系,而不表达于正常细胞系。结论: 成功获得了HTA基因的全长序列并对其可变剪接进行了分析,2个大小不同的转录本均在肝癌细胞系中特异性表达,作为一个肝癌相关基因值得进一步深入研究。     

人受精促进肽受体(TCP11c)基因的克隆、表达及选择性剪接

目的 分离、克隆人受精促进肽受体TCP11基因1个新的转录本TCP11c的全长cDNA,研究其表达的阶段性、组织特异性及TCP11c基因3种转录本的剪接方式。方法 运用BLAST方法获得与TCP11a同源的ESTs,以逆转录的人睾丸cDNA为模板进行PCR扩增,将PCR扩增片段克隆入p哪M—TeMy载体并516序;采用BLAST、ClustalW及RT—PCR方法分析各转录本的基因组结构及剪接方式;RT—PCR方法分析其组织表达的特异性和阶段性。结果 获得1个新的全长cDNA,它编码440个氨基酸的蛋白质,与TCP11a、b相比,在基因组的5′—端存在复杂的外显子剪接现象。RT—PCR结果显示该转录本在正常睾丸中表达,而其他组织、无精症患者及胎儿睾丸组织中未见该基因表达。结论 从人睾丸组织中分离到人受精促进肤受体TCP11基因1个新的转录本TCP1c,结合mTcp-11的功能提示,TCP11基因a、b、c这3种转录本对精于发生和人受精过程可能起重要作用。