生物信息学辅助研究乳腺癌转移相关lncRNA进展

长链非编码RNA在肿瘤进展中的研究日益增多,尤其随着二代测序技术的出现和广泛应用,大量数据涌现推动了生物信息学的迅猛发展,为进一步阐明乳腺癌相关lncRNA作用机制提供了很大的帮助.阐述乳腺癌转移相关lncRNA研究现状,可为进一步研究lncRNA在乳腺癌转移中的作用机制、寻找治疗新靶点提供思路.     

lncRNA在肝脏炎症性疾病中作用及其机制的研究进展

长非编码RNA(lncRNA)是一种长度大于200nt的非编码RNA,在细胞增殖、分化和凋亡等生物学过程中起着重要作用。肝脏炎症性疾病的发生率逐年上升,其诱因复杂且发病机制尚未阐明,临床迫切需要明确其作用机制以找到更有效的治疗靶点与药物。目前已发现lncRNA在包括病毒性肝炎、非酒精性脂肪肝、肝纤维化等肝脏疾病中呈差异性表达,可能的调节机制是通过调控下游基因的表达和信号通路的激活,从而参与疾病的发生、发展。通过综述lncRNA参与肝脏炎症性疾病发生、发展的调控机制及靶向机制等方面的研究进展,预测lncRNA作用新靶点,为肝脏炎症性疾病的研究和防治提供研究基础和新思路。     

lncRNA与心血管疾病

非编码RNA(ncRNA)占哺乳动物RNA的98%,既往认为非编码RNA不具备生物学功能,但近些年来的研究发现,非编码RNA可从表观遗传学、转录调控及转录后调控等多个层面实现对基因表达的调控,其表达水平的变化与多种疾病密切相关,亦影响到心血管疾病的发病进程。其中,长链非编码RNA(lncRNA)成为基因组学研究中一颗冉冉升起的新星,其可从转录水平调控疾病相关基因的表达,亦可竞争性结合microRNA,以影响目的基因的表达和功能。文章从非编码RNA的来源、分类、作用机制及lncRNA在心血管疾病中的研究进展进行综述。具有细胞和组织特异性的lncRNA未来则有望成为一类全新的疾病诊断、判断预后的特异标志物和新药作用靶点,为疾病的临床诊断与治疗提供新思路。     

lncRNA XIST海绵吸附miRNA在膀胱癌中作用的研究进展

近年来,研究发现不同种类的RNA之间存在相互作用,共同调节肿瘤进展。长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）XIST可充当微RNA（microRNA,miRNA）的竞争性内源性RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）竞争性抑制miRNA的表达,对下游基因进行调控,从而影响膀胱癌的发生发展。本文对lncRNA XIST通过海绵吸附miRNA在膀胱癌中发挥作用的研究进展进行总结,以期尽可能全面了解lncRNA XIST的ceRNA调控网络在膀胱癌发生发展中的作用机制,为未来膀胱癌的诊断、治疗及预后提供多维度思路。     

乳腺癌组织中lncRNA MALAT1的表达及临床意义

目的 探讨长链非编码RNA MALAT1在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法 采用实时荧光定量聚合酶链反应（quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR）方法检测64例乳腺癌患者癌组织标本及其对应的癌旁组织标本中MALAT1的表达情况,分析其与乳腺癌的临床病理特征关系以及诊断价值。结果 MALAT1在乳腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织（P<0.05）,且癌组织中MALAT1的表达水平与ER、PR表达情况以及淋巴结转移明显相关明显相关（P<0.05）;ROC曲线分析发现AUC为0.706。结论 组织中高表达的MALAT1可作为乳腺癌诊断的一个潜在的新型生物学标志物。     

对尿道下裂大鼠生殖结节中lncRNA表达的初步研究

目的 探讨长链非编码RNA(LncRNA)在邻苯二甲酸二丁酯(DBP)诱导的尿道下裂大鼠生殖结节中的表达 方法 在孕鼠孕13-18天时按体重800mg/kg DBP溶于1ml玉米油灌胃,对照组每天给予1ml玉米油。于孕19天时取出胎鼠,分别取下灌药组发生尿道下裂和对照组雄性胎鼠的生殖结节,提取RNA,构建RNA测序文库测序。对测序结果的lncRNA进行筛选、差异分析和功能预测,再随机筛选4条lncRNA用qRT-PCR验证其表达量。结果 与对照组相比,尿道下裂组生殖结节中有195个差异lncRNA,136个差异mRNA,qRT-PCR结果与测序结果一致。差异lncRNA功能最多分布在生长激素释放激素受体的结合;分布最多的的信号通路为金葡菌感染通路 结论 邻苯二甲酸二丁酯诱导的尿道下裂雄性大鼠与正常雄性大鼠相比,其生殖结节中lncRNA和mRNA显著改变,lncRNA可能通过与mRNA相互作用参与到尿道下裂形成过程中生殖结节的发育。     

lncRNA在动脉粥样硬化病变中的作用研究进展

动脉粥样硬化引起的心血管疾病是我国成年人死亡的主要原因,通常是由脂质沉积、内皮功能紊乱、巨噬细胞激活及平滑肌增殖等多种因素和多种细胞相互作用而引起的复杂的病理过程。大规模的哺乳动物转录分析研究已经证明长链非编码RNA(lncRNAs)虽然没有蛋白质编码能力,但lncRNAs在调节细胞增殖、凋亡、自噬和分化等方面均起着重要的作用。因此,阐明lncRNAs在动脉粥样硬化发生发展中的作用可为多种心血管疾病的诊断和治疗提供干预的新靶点。     

lncRNA在动脉粥样硬化中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一种在生物基因转录本中占据多数地位,且能够调节众多生命活动的生物分子,在细胞的增殖、凋亡、分化、衰老及发育等方面具有重要作用。目前人们已经发现,lncRNA在体内与肿瘤疾病、内分泌疾病、神经系统疾病等多种疾病均具有紧密联系。在心血管疾病中,lncRNA不仅在动脉粥样硬化斑块中表达水平出现异常改变,且与内皮功能障碍、平滑肌细胞增殖、泡沫细胞形成、脂质代谢等密切相关,从而参与调节动脉粥样硬化的发生与发展。     

受甲基化调控的lncRNA在乳腺癌中的表达谱及意义

目的：研究乳腺癌细胞去甲基化处理株和亲本株的lncRNA的差异表达情况,并从差异表达谱中筛选lncRNA,探讨受DNA启动子甲基化调控的lncRNA是否参与乳腺癌发生与发展。方法：取乳腺癌BT474细胞株去甲基化处理后,采用高通量lncRNA芯片技术分别检测去甲基化组和亲本组中lncRNA的表达谱,并在BT474、MB231和BT549三株乳腺癌细胞株及乳腺癌组织中应用qRT-PCR技术检测lncRNA的表达。同时寻找lncRNA的基因甲基化位点,并以重亚硫酸盐测序法（BSP）确定甲基化情况。结果：去甲基化株和亲本株lncRNA表达谱发生了显著的变化。qRT-PCR检测结果与芯片检测结果基本一致。qRT-PCR检测发现乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比正常乳腺上皮细胞株表达升高（P＜0.01）,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比癌旁组织表达升高（P＜0.01）。BSP方法显示相比正常乳腺上皮细胞株,乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）;相比癌旁组织,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）。结论：乳腺癌细胞株去甲基化处理后lncRN表达谱发生显著变化,并在差异表达谱中筛选出lncRNA uc003lxs及uc002btf,为研究受甲基化调节的lncRNA调控乳腺癌发生发展奠定前期的研究基础。     

长链非编码RNA CBR3⁃AS1在骨肉瘤中的表达及意义

目的：探讨长链非编码RNA CBR3?AS1（LncRNA CBR3?AS1）在骨肉瘤患者中的表达及意义。方法：回顾性收集2012年1月—2014年1月本院收治的66例骨肉瘤患者组织标本和临床资料,qRT?PCR法检测组织中LncRNA CBR3?AS1表达情况,并将患者分为高表达组和低表达组,卡方检验分析LncRNA CBR3?AS1表达与临床参数的关系,Kaplan?Meier 法比较LncRNA CBR3?AS1的表达与总生存率的关系。将U?2 OS细胞系分成LncRNA CBR3?AS1沉默表达组（si?CBR3?AS1组）和阴性对照组（si?NC组）,经LipofectamineTM 3000分别转染LncRNA CBR3?AS1 siRNA和si?NC序列,MTT和集落形成试验测定细胞增殖,细胞迁移和侵袭试验测定细胞迁移和侵袭能力,流式细胞术测定细胞凋亡。qRT?PCR和Western blot法检测羧基还原酶3（CBR3）的表达。结果：LncRNA CBR3?AS1在骨肉瘤组织和细胞系中高表达（P < 0.001）。LncRNA CBR3?AS1高表达与Enneking分期（P < 0.001）、远处转移（P=0.004）和组织学分级（P=0.036）显著相关;LncRNA CBR3?AS1高表达与骨肉瘤患者总生存率呈负相关（P < 0.01）,是骨肉瘤患者的不良预后因素（HR=1.558,95％CI：1.041~2.641,P=0.013）。si?CBR3?AS1组细胞增殖﹑集落形成能力、细胞迁移和侵袭能力显著低于si?NC组,si?CBR3?AS1组细胞凋亡率高于si?NC组。LncRNA CBR3?AS1和CBR3 mRNA表达呈正相关（r=0.44,P=0.036）,si?CBR3?AS1组CBR3 mRNA和蛋白表达量显著低于si?NC组（P < 0.001）。结论：LncRNA CBR3?AS1在骨肉瘤中高表达,LncRNA CBR3?AS1下调表达抑制细胞增殖、迁移及侵袭,促进凋亡,是影响骨肉瘤预后的独立危险因素。     

大鼠骨质疏松模型的建立及其骨髓间充质干细胞内差异lncRNA初步分析

目的：分析骨质疏松模型大鼠骨髓间充质干细胞（bone marrow mesenchymal stem cell, BMSC）内差异长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）及相关功能。方法：SD大鼠分为骨质疏松模型组和对照组,每组6只,用切除卵巢的方法制备骨质疏松模型,通过双能X线骨密度检测仪测定两组大鼠手术前及3个月后的骨密度。取SD大鼠股骨内骨髓体外培养BMSC,利用基因芯片技术检测骨质疏松模型组（3只）和对照组（3只）大鼠BMSC内lncRNA的表达差异,通过GO功能分析及KEGG通路富集,分析差异lncRNA的生物学功能及相关信号通路。结果：骨质疏松模型组SD大鼠骨密度［（157.33±6.28）mg/cm2］,较对照组［（183.33±4.50）mg/cm2］显著降低。两组大鼠BMSC内检测出基因片段共计32 759个,差异有统计学意义的有8 454个（P < 0.05）,其中上调3 593个,下调4 861个。检测到的lncRNA基因片段4 992个,差异有统计学意义的共116个（P < 0.05）,其中上调35个,下调81个。差异lncRNA主要参与细胞生长发育生物学过程,并调控蛋白的转运通路。结论：骨质疏松模型大鼠的BMSC内lncRNA表达和正常大鼠存在差异,差异表达的lncRNA参与对BMSC生长发育过程及蛋白转运通路的调控。     

Icariin and its emerging role in the treatment of osteoporosis

To the editor:I read with great interest the recent article by Liu et al.1 Icariin exerts its beneficial effects in osteoporosis in a number of ways. Icariin accentuates osteoblast maturation.Icariin increases the activity of alkaline phosphatase and up regulates receptor activator of nuclear factor κ-B ligand (RANKL) expression thereby enhancing bone formation.2 It also affects the bone morphogenic protein-2 (BMP-2)/Smad4 pathway and thereby up regulates both BMP-2 and Smad4 expression leading to the formation of calcified nodules in bone tissue.In fact,icariin exhibits greater efficacy in increasing osteogenic differentiation in comparison to other natural flavonoids such as genistein.3 Besides the above mentioned effects,up regulation of osteoprogeterin is another of the effects of icariin.     

急性脑梗死发生过程中lncRNA TALNEC2的作用与机制

目的 分析长链非编码RNA TALNEC2在大脑中动脉阻塞(MCAO)模型和缺氧-葡萄糖剥夺(OGD)模型中的表达情况,并探讨其在急性脑梗死发生过程中的调节机制.方法 建立MCAO小鼠模型和OGD细胞模型.采用qRT-PCR检测TALNEC2、miR-19a-3p和c-Jun氨基末端激酶(JNK)的表达.通过神经功能评...     

糖皮质激素性骨质疏松症发病机理研究进展

骨质疏松症（osteopomsis,OP）是以低骨量和骨组织微结构退变为特征的一种全身性骨骼疾病伴有骨脆性增加、易于发生骨折,是目前世界上发病率、死亡率及保健费用消耗较大的疾病之一。OP可分为三类,一类为原发性OP,主要是由于增龄所致的性激素突然减少及生理性退变所致,包括绝经后OP和老年性OP;第二类为继发性OP,它是由于疾病或药物所诱发的;第三类为特发性OP,多见于青少年,一般伴有遗传病史,女性多见,妇女哺乳和妊娠期所致的OP往往也归入特发性OP。     

浅谈施工企业实施低成本战略问题

通过对目前施工企业实施低成本战略中存在问题的分析,探讨了针对这些问题的应对措施,并提出了较为科学的解决办法。     

老年人骨质疏松影响因素的病例对照研究

①目的探讨老年人骨质疏松的影响因素。②方法某医院老年门诊就诊的60岁及以上老年人703例,按照非匹配病例对照研究形式,将确诊为骨质疏松的303例作为病例组,未发生骨质疏松的400例作为对照组,进行骨密度测定、一般人口学及影响因素调查。③结果单因素分析显示,性别、年龄、婚姻、学历、既往病史、现病史、钙剂使用情况、运动情况、吸烟、饮酒、膳食结构等与老年人骨质疏松相关,差异具有统计学意义（ P ＜0．05）;多因素分析显示,年龄、学历、婚姻状况、钙剂使用情况、骨折史、牙齿脱落情况、吸烟情况是老年人骨质疏松的主要影响因素（ P ＜0．05）;年龄＞65岁、低学历、丧偶或离异、未服用钙剂、有骨折史、牙齿脱落、吸烟的老年人骨质疏松的发生率高。④结论年龄大、丧偶或离异、有骨折史、有牙齿松动脱落、吸烟是老年骨质疏松的危险因素,而高学历、服用钙剂则是其保护因素。     

糖尿病增加老年患者骨质疏松的发生分析

目的：探讨老年糖尿病患者骨质疏松的发生率。方法：应用超声成像骨密度测量仪对133例糖尿病踝中部骨密度(BMD)及155例正常对照组进行检测，并同时检测空腹血糖(FBG)、血钙(CA)、血磷(P)、骨钙素(BGP)、碱性磷酸酶(AKP)、24h尿钙(U-CA)，尿磷(U-P)。结果：糖尿病组骨质疏松发生率高于正常组，两组空腹血糖、尿钙、尿磷有显著差异，血钙、磷、碱性磷酸酶则无显著差异。结论：糖尿病可加快骨质疏松症的进程。