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1.
基于ISSR的甘肃不同产区栽培当归遗传多样性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
朱田田  晋玲  张裴斯  李应东  杜弢  何子清 《中草药》2015,46(23):3549-3557
目的研究甘肃不同产区栽培当归的遗传多样性。方法应用ISSR分子标记技术对甘肃省41个居群的栽培当归样本进行分析,利用Popgene 32软件分析Nei’s基因多样性指数(H)等遗传信息参数,应用Ntsys软件构建亲缘关系UPGMA聚类图。结果 8条引物共检测到154个位点,其中多态性位点119个,多态位点百分率(PPB)为77.27%。栽培当归居群间的H为0.222 9,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.337 4,种群间基因分化系数(Gst)为0.683 9,基因流(Nm)为0.2311,遗传距离变化范围0.042 9~0.327 8。结论甘肃栽培当归遗传多样性在物种水平上较高;居群间遗传多样性水平明显高于居群内;居群间遗传分化程度大,且基本无基因交流。  相似文献   

2.
戴住波  朱常成  钱子刚  普春霞 《中草药》2007,38(7):1070-1074
目的研究中国西南特有濒危药用植物金铁锁的遗传多样性。方法应用AFLP分子标记技术对具有代表性的7个金铁锁居群,共137个个体进行分析。结果在金铁锁的物种水平上,Nei’s基因多样性指数(He)、Shan-non’s信息指数(I)、多态位点百分率(PPB)分别为0.2434±0.1791、0.3735±0.2485、82.30%;在其居群水平上分别为0.0918±0.1610、0.1402±0.2362、30.48%。居群间Nei遗传分化指数(Gst):0.6244;Shannon’s多样性基因遗传分化系数(Ist):0.6246。聚类表明:地理距离相对远的丽江居群与个旧居群遗传距离最近;昆明居群与其他居群遗传距离较远。统计获得9条可区分各地方居群的特征指纹带。结论金铁锁种内的遗传多样性水平丰富,而居群内遗传多样性水平较低,居群间遗传分化显著;各居群间亲缘关系与地理距离无明显相关性;其种内特征带与各居群特征带结合,可以为AFLP分子标记技术用于其种质资源的鉴定、遗传育种提供重要的依据。  相似文献   

3.
浙江主产区栽培浙贝母种质遗传多样性的AFLP分析   总被引:3,自引:0,他引:3       下载免费PDF全文
目的研究中国浙江省道地药材浙贝母的遗传多样性。方法应用扩增片段长度多态性技术(AFLP)对具有代表性的6个浙贝母居群,共32份个体进行分析。结果在浙贝母的物种水平上,Nei′s基因多样性指数(He)为0.169 0±0.175 7,Shannon′s信息指数(I)为0.269 8±0.245 3,多态位点百分率(PPB)76.85%;总遗传多样性(Ht)0.169 0±0.030 9,其居群水平上遗传多样性(Hs)0.150 8±0.024 0,Shannon′s信息指数(I)0.233 3±0.261 9,多态位点百分率(PPB)50.38%,Nei′s遗传分化指数(Gst)为0.107 6,基因流(Nm)为4.147 0。东阳和永康种群之间的遗传距离最小(0.015 0),而象山与缙云最远(0.032 4)。结论浙江省主产区栽培浙贝母物种的遗传多样性水平丰富,高的遗传多样性能够维持浙贝母的长期生存,居群间的多样性水平明显低于居群内的多样性水平,居群间遗传分化不明显,种植资源相对比较稳定,这些居群适宜作为浙贝母优良品种的选育基地。  相似文献   

4.
基于ISSR和SRAP标记的栀子种质遗传多样性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
姜武  吴志刚  陶正明  蔡胡敏 《中草药》2019,50(2):510-516
目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物和SRAP引物分别扩增出125和80条带数,多态性条带数分别为100和74,多态性比率(PPB)分别为80.00%和92.50%,栀子居群的总体物种水平的等位基因观察数(Na)分别为1.461 3和1.579 2,有效等位基因数(Ne)分别为1.307 7和1.342 1,Nei's基因多样性指数(H)分别为0.173 1和0.197 4,Shannon's指数(I)分别为0.254 5和0.295 9;遗传多样性分析结果表明,ISSR和SRAP标记中3个居群之间的遗传多样性(Ht)分别为0.239 1和0.289 9,种间遗传多样性(Hs)分别为0.173 1和0.197 4,基因分化系数(Gst)分别为0.276 2和0.318 9,即72.38%和68.11%的遗传变异在种群内进行,居群间基因流(Nm)分别为1.310 3和1.068 0,证明居群间存在一定的基因流动(Nm1);UPGMA聚类分析表明,ISSR和SRAP标记将栀子资源分为2个类群,且以SRAP分析的聚类结果更符合实际居群。结论取样栀子种质有丰富的遗传多样性,遗传分化主要发生在居群内,SRAP标记更适合用于栀子遗传多样性分析,对栀子资源的保护和育种提供了参考。  相似文献   

5.
分析中药黄芩道地性与遗传多样性。方法:用随机扩增的DNA多态性分析(RAPD)方法,对13个居群62个黄芩Scutellariabaicalensis和并头黄芩S.scordifolia样本,进行遗传多样性及黄芩居群遗传变异测定。结果:用14个随机引物,共获得114个条带,其中多态性条带112条。黄芩在物种水平上的多态性条带比率(PPB)值为95.5%,居群水平的平均PPB值为41.9%。黄芩样本RAPD聚类分析(UPGMA)没有表现出明显的分支,但显示出与地理位置有关三个类群。分子方差分析(AMOVA)显示,黄芩居群间的遗传变异占总变异的18.83%,居群内变异占81.17%。结论:首次在分子水平上证明黄芩道地性与遗传变异和地理环境有关系,并提出黄芩栽培选种的策略应该是最大限度地保持其遗传多样性。  相似文献   

6.
朱欣  蒋晓颖  金魏佳  吕奕  何佳  范灵希  高松  蒋明 《中草药》2018,49(13):3116-3121
目的以药用植物细叶石仙桃为材料,利用SRAP分子标记技术进行遗传多样性研究,为进一步开展该物种的保护奠定基础。方法从81对SRAP引物组合中,共筛选出7对用于SRAP-PCR,对浙江省境内5个自然居群的68份细叶石仙桃进行了遗传多样性分析。结果共获得197个电泳谱带,其中多态性条带为190条,每对引物平均提供27.29个标记信息,平均有效等位基因数目(N_e)为1.238 1。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为96.45%,N_ei’s基因多样性指数(H)为0.188 2,Shannon’s信息指数(I)为0.312 5;在居群水平上,PPB为30.46%~46.19%,平均为40%,H为0.089 1~0.155 9,平均0.120 8,I为0.138 7~0.234 9,平均0.186 4;5个居群的基因分化系数(G_(st))为35.81%,基因流(N_m)为0.896 3。UPGMA聚类结果表明,68份样品可分成5组,同一居群的细叶石仙桃聚于同一分支。结论细叶石仙桃具有较高的遗传多样性水平,居群间也存在一定的遗传分化和基因交流,但大部分遗传变异存在于居群内。  相似文献   

7.
贵州头花蓼遗传多样性的ISSR分析   总被引:5,自引:2,他引:3  
目的:对贵州头花蓼48个居群的遗传多样性进行分析。方法:采用ISSR分子标记技术研究贵州省48个居群240个个体的遗传多样性。结果:11条引物共检测到8 293个位点,其中7 962个为多态位点。在居群水平上,头花蓼各居群的多态位点百分率(PPB)差异较大(69.78%~93.13%),平均值为79.09%,Nei′s基因多样性指数(He)为0.245 8,Shannon多样性指数(I)为0.396 2,基因分化系数(Gst)为0.722 3,居群内Nei′s基因多样性(Hs)为0.080 4,Shannon′s多样性基因遗传分化系数(Ist)为0.044 2。UPGMA聚类分析显示48个居群可分为3大类,贵州境内西部、西南部与东南部的头花蓼表现为交叉聚类,Meantel检测居群间的遗传距离与地理距离之间无显著的正相关关系(r=0.262 9)。结论:头花蓼种群遗传变异多存在于居群间,居群内的遗传分化较小,居群间存在基因流(Nm)受阻,聚类显示部分迁徙居群没有出现随地理变化的遗传变异趋势。  相似文献   

8.
目的:对新疆阿魏连进行遗传多样性研究。方法:通过ISSR技术对4个新疆阿魏居群共90个个体进行遗传多样性分析。结果:用3个随机引物共扩增出9条清晰条带,其中8条具多态性,物种水平上的多态位点百分比为97.22%,Shannon's信息指数I为0.6221,Neil's基因多态性指数H为0.4313;居群水平的多态位点百分比为97.25%,Shannon's信息指数I为0.5987,Neil's基因多态性指数H为0.4142。居群间的遗传分化系数Gst为0.0407。结论:新疆阿魏物种水平上具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群间。结果说明遗传多样性水平与物种本身特性有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低。  相似文献   

9.
我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析   总被引:2,自引:2,他引:0       下载免费PDF全文
目的从分子水平研究我国仙茅属(Curculigo Gaertn.)植物的遗传关系。方法对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.493 7,Nei’s基因多样性指数(H)为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数Hsp为0.457 7。在种内水平上,PPB=5.09%,Ne=1.036 6,H=0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数(Hpop)为0.029 8。Nei’s基因多样性指数计算的种间遗传分化系数(Gst=0.931 3)与Shannon’s分化系数(0.934 9)基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流(Nm)为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.520 8~0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。  相似文献   

10.
张明宇  虞泓  袁峰 《中国中药杂志》2013,38(22):3866-3870
对云南7个金钗石斛居群和1个喇叭唇石斛居群,用5组DALP引物扩增得到140条清晰条带,其中102条为多态位点,多态比率72.86%,平均每组引物扩增所得多态条带为20.4。金钗石斛居群水平平均多态位点47.96%,多态位点在22.86%~68.57%;物种水平多态位点72.86%。DALP分析显示,金钗石斛物种水平的遗传多样性指数分别为PPB 72.86%,H 0.288 9,I 0.424 2;居群水平遗传多样性指数分别为PPB 47.96%,H 0.186 1,I 0.273 9。金钗石斛基因遗传分化系数Gst为0.338 6,即66.14%的遗传变异来自居群内,33.86%的遗传变异来自居群间,居群间存在较高水平的遗传分化。  相似文献   

11.
云南黄连自然资源及其保护问题的研究   总被引:13,自引:0,他引:13       下载免费PDF全文
黄骥  裴盛基  王元忠 《中草药》2005,36(1):112-115
目的系统调查研究云南黄连的资源分布、生物学和生态学特性、利用历史和现状,为科学保护和合理开发利用这一传统地道药材提供基础资料。方法室内文献资料和标本查阅、药用民族植物学调查和野外考察相结合的方法。结果研究报道云南黄连的生物学和生态学特性、生长发育规律、自然分布特点和利用历史及现状。结论应加强保护野生种质资源和合理开发利用这一药用植物。  相似文献   

12.
红景天属4种植物RAPD分析与分类鉴定   总被引:18,自引:1,他引:18  
胡挺松  陆一鸣  马兰青  李彦舫 《中草药》2004,35(11):1286-1289
目的 用RAPD技术对红景天属(Rhodiola L.)的大花红景天R.crenulata、长鞭红景天R.fastigiata、狭叶红景天R.kirilowii和高山红景天R.sachalinensis 4种药用植物进行分子水平鉴定。方法 CATB法提取红景天属原植物总DNA,以200条随机引物进行随机扩增。结果 用OPA4(AATCGGGCTG)、OPB7(GGTGACGCAG)、OPB18(CCACAGCAGT)、OPX14(ACAGGTGCTG)和OPZ13(GACTAAGCCC)作随机扩增引物进行随机扩增时,可得到识别这些物种基因组DNA的多态片段。结论 RAPD法能有效地鉴别红景天类药材,把大花红景天、长鞭红景天、狭叶红景天和高山红景天区分开。  相似文献   

13.
ObjectiveAs a medicinal plant, the resource of Rhodiola dumulosa is deficient along with the large collection. For the protection and utilization of R. dumulosa, the influence of plant growth regulators (PGRs) on callus induction and adventitious shoots differentiation, polysaccharide production and the antioxidant activity were tested.MethodsInternodes of R. dumulosa were used as explants and cultured on MS medium plus different plant growth regulators (PGRs). The anti-oxidative activities of polysaccharides were evaluated using radical scavenging assays.ResultsBy response surface plot, 0.85 mg/L N6-benzyladenine (BA), 0.34 mg/L naphthaleneacetic acid (NAA) and 0.33 mg/L 2,4-dicholorophenoxyacetic acid (2,4-D) were the optimal factors for callus induction (90.03%) from internodes explants on MS medium. The fresh weight of green callus increased 47.26 fold, when callus was inoculated on MS + thidiazuron (TDZ) 0.5 mg/L + NAA 2.0 mg/L. Adventitious buds regenerated from callus on the media of MS were fortified with BA 1.0 mg/L plus NAA 0.5 mg/L, and the induction rate was 40.00%. MS plus indole-3-butyric acid (IBA) 1.0 mg/L produced the highest rooting rate with 10 to 15 roots in a length of 2–3 cm per shoot. The content of total polysaccharides in callus developed on MS + TDZ 0.5 mg/L + NAA 2.0 mg/L and MS + BA 1.0 mg/L + NAA 0.5 mg/L was as high as 1.72%−2.15%. At the dose of 0.5 mg/mL polysaccharides extracted from different callus induced on MS + NAA 2.0 mg/L + TDZ 0.5 mg/L or MS + BA 1.0 mg/L + NAA 0.5 mg/L or MS + BA 0.5 mg/L + 2,4-D 0.5 mg/L, the ABTS radical eliminating percentages were 82.78%, 80.18% and 68.59%, respectively, much higher than that of wild plant.ConclusionA rapid micropropagation system for R. dumulosa has been developed. The combination of TDZ and NAA or BA and NAA can increase the yield of the total polysaccharides. The polysaccharides isolated from callus and whole wild plants had stronger free radicals scavenging activities, indicating that polysaccharides from R. dumulosa are the potential pharmaceutical supplements.  相似文献   

14.
李涛  苏趁  李立新  李冲  司梦鑫 《中草药》2018,49(16):3918-3925
目的建立基于核磁共振技术~1H-NMR指纹图谱-化学模式识别的四裂红景天和大花红景天的品种分类和鉴别方法。方法采用高分辨(600 MHz)的核磁共振(NMR)指纹图谱技术,测定四裂红景天和大花红景天的全成分信息~1H-NMR指纹图谱,结合相似性分析、层次聚类分析、主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行化学模式识别分析。结果 ~1H-NMR指纹图谱-化学模式识别方法是一种有效的区分、鉴别四裂红景天和大花红景天的方法。四裂红景天和大花红景天的~1H-NMR指纹图谱差异性较明显,能够真实、全面地反映红景天中的特征性成分和内在品质,四裂红景天和大花红景天主要差异成分为萜类、黄酮类,尤其萜类成分大花红天素是鉴别四裂红景天和大花红景天的特征性成分,可作为四裂红景天和大花红景天的分类和鉴别指标。结论 ~1H-NMR指纹图谱-化学模式识别方法是一种有效的红景天品种分类和鉴别方法,为红景天属药用植物的品种鉴别和品质评价奠定基础。  相似文献   

15.
目的 优化大花红景天再生体系并建立抗性筛选最佳条件,为建立大花红景天高效遗传转化体系奠定基础。方法 以大花红景天叶片为外植体,观察再生过程各阶段在不同配比的6-BA、NAA、IBA诱导下的诱导率及生长状况,并利用梯度筛选出外植体对卡那霉素(Kan)和抗潮霉素(Hyg)的抗性。结果 MS+3.0 mg/L 6-BA+1.0 mg/L NAA+700 mg/L L-Pro为叶片不定芽分化的最佳培养基,分化率达到92%;MS+700 mg/L L-Pro为根培养基;200 mg/L Kan、10 mg/L Hyg为大花红景天遗传转化的最佳筛选压;培养过程中添加10 mg/L Vc能有效抑制酚类物质的外泌。结论 优化了大花红景天植株再生体系,筛选出适宜于大花红景天遗传转化体系的Kan和Hyg筛选压。  相似文献   

16.
赵晟  孙同兴  李秉滔  吴鸿 《中草药》2002,33(3):258-260
目的 哥纳香属植物是重要的抗癌药物资源,研究叶的结构有利于正确识别该属植物。方法 利用离析法和石蜡切片法研究金平哥纳香、大花哥纳香和云南哥纳香3种植物的叶表皮和结构。结果 3种植物叶的形态结构非常相似,但仍存在着许多差别。金平哥纳香叶的表皮细胞内不含晶体,叶肉组织中含许多纤维状石细胞;而大花哥纳香和云南哥纳香叶的表皮细胞内含晶体,叶肉组织中不含纤维状石细胞。大花哥纳香的单列表皮毛通常为3个细胞,且其叶远轴面不具败育气孔器,每毫米叶宽含7个油细胞和25个粘液细胞,主脉中的维管束组织由10个小的维管束构成,而云南哥纳香的单列表皮毛为2个细胞,叶远轴面具许多败育气孔器,每毫米叶宽含4个油细胞和16个粘液细胞,主脉中的维管组织由12个小的维管束构成。结认 利用叶的表皮特征和内部结构可以鉴别上述3种植物。  相似文献   

17.
RP-HPLC法测定不同品种和产地红景天中指标成分的含量   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的 建立快速、有效的反相高效液相(RP-HPLC)检测方法,测定不同品种和产地红景天中红景天苷、红景天芬、酪醇、红景天素、红景天任的含量,以评价红景天的质量。方法 方法Ⅰ:甲醇-水(0.5 mmol/L SDS的1%醋酸水溶液)检测红景天苷;方法Ⅱ:乙腈-水检测红景天芬;方法Ⅲ:乙腈-磷酸水溶液梯度洗脱同时检测5个有效成分。结果 红景天苷的含量为0.021%~1.420%;红景天芬除在蔷薇红景天和高山红景天中含量较高外,在其他品种中均非常低或低于检测限;5个有效成分的含量因品种或产地的不同而有很大的变化。结论 建立的3种RP-HPLC方法可同时测定红景天苷、红景天芬等5个有效成分。综合考虑不同品种中5个有效成分的含量,以产自新疆的蔷薇红景天和吉林的高山红景天为国内较好的品种。  相似文献   

18.
范芳芳  张雯  余羊羊  杨露  李轩豪  张艺  孟宪丽 《中草药》2021,52(22):6911-6922
目的 基于中药质量标志物(quality marker,Q-Marker)核心理论,结合文献研究与网络药理学分析,预测藏药红景天传统功效关联性Q-Marker。方法 通过文献整理、TCMID数据库收集构建红景天化学成分库,利用FAFDrugs4网站计算各成分吸收、分布、代谢、排泄和毒理性(ADMET)属性,筛选得到类药性化合物;采用BATMAN-TCM平台预测并收集红景天类药性化合物靶点,将靶点导入DAVID数据库和CTD平台富集分析得到红景天作用组织和疾病;根据Q-Marker定义,结合红景天类药性化合物与传统功效主治的关联性,分析红景天潜在的Q-Marker。结果 红景天中67个类药性化合物共作用407个靶点;主要靶向作用于肝、肺、肾、心、脑等组织,涉及癌症、高血压、脑缺血、心肌缺血、动脉粥样硬化、心衰、哮喘等1060种疾病;结合《晶珠本草》1986年版等典籍记载藏药红景天"归肺心经,清肺热,治脉病"的传统功效主治与现代文献研究,揭示了类药性成分没食子酸乙酯、没食子酸、红景天苷、草质素、咖啡酸、儿茶素、原儿茶酸、香草酸等可作为红景天传统功效关联性Q-Marker。结论 以Q-Marker"有效性"为核心要素,辅以其他原则分析,有效预测了红景天功效关联性Q-Marker。建议后期可开展功效相关药理学及病理状态下药动学等研究,进一步确定其Q-Marker,为制定全面科学的红景天质量控制标准提供参考。  相似文献   

19.
目的 克隆大花红景天Rhodiola crenulata尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶基因组DNA,并利用生物信息学对其编码区与启动子进行分析.方法 以大花红景天为样品,采用优化的CTAB法提取大花红景天基因组DNA,并利用hiTAIR-PCR 技术经过3次步移获得大花红景天UDPGT (RcUDPGT)基因DNA序列,并利用生物信息学对其进行分析.结果 克隆得到RcUDPGT基因的DNA序列2 977 bp,其中包含1 499 bp的编码区域(包括82 bp的内含子序列)和1500 bp的编码区5,上游侧翼域序列(包括启动子区域).生物信息学分析证明该序列为UDPGT基因且与其他植物UDPGT同源,具有亲水性且定位于细胞质中,三级结构预测表明该基因编码的蛋白具有UDPGT功能结合位点.启动子分析表明其存在光响应、厌氧响应、热响应、低温响应、压力与防御响应和花色素苷合成响应元件等.结论 克隆的RcUDPGT基因结构完整,具有典型的功能结合位点,为红景天分子生物学与代谢工程研究提供参考.  相似文献   

20.
丽江山慈菇RAPD遗传变异初探   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的研究丽江山慈菇Iphigenia indica遗传变异及遗传结构。方法采用RAPD技术,对产自云南的3个居群进行DNA指纹检测。结果筛选出20个随机引物,对3居群扩增共产生120条DNA片段,在0.2~3kb,其中71条谱带具有遗传多态性,约占59.17%,平均每个引物扩增的DNA带数是3.55。Shannon index在丽江玉龙雪山居群(Ca)为0.1994,大理宾川鸡足山居群(Cb)为0.2007,丽江永胜片角镇居群(Cc)为0.2548;居群平均水平为0.2183,物种水平为0.2886。Nei’sgeneticidentity在Ca和Cb居群间为0.9309;在Ca和Cc居群间为0.9327;在Cb和Cc居群间为0,9466。居群间基因分化系数Gst为0.2044。结论RAPD分析可为丽江山慈菇保护对策和措施的制定,遗传育种和GAP种植方法及标准的制定,提供理论依据和基础资料。  相似文献   

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